247 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene STER_0100 on replicon NC_008532
Organism: Streptococcus thermophilus LMD-9



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008532  STER_0100  hypothetical protein  100 
 
 
183 aa  371  1e-102  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.000132763  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1202  NADPH-dependent FMN reductase  40.76 
 
 
182 aa  132  3e-30  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1473  NADPH-dependent FMN reductase  37.5 
 
 
187 aa  113  1.0000000000000001e-24  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1278  NADPH-dependent FMN reductase  34.57 
 
 
187 aa  99.8  2e-20  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.203021  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2349  NADPH-dependent FMN reductase  36.31 
 
 
186 aa  90.5  1e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2073  NAD(P)H dehydrogenase (quinone):NADPH-dependent FMN reductase  40.68 
 
 
192 aa  85.9  3e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.614853  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2190  NADPH-dependent FMN reductase  38.24 
 
 
189 aa  80.9  0.00000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04797  NADPH-dependent fmn reductase  35.21 
 
 
184 aa  79.7  0.00000000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2506  hypothetical protein  38.3 
 
 
183 aa  77  0.0000000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4144  NADPH-dependent FMN reductase  29.89 
 
 
188 aa  77  0.0000000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4031  NADPH-dependent FMN reductase  34.75 
 
 
184 aa  77  0.0000000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4143  NADPH-dependent FMN reductase  34.75 
 
 
184 aa  77  0.0000000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.269863  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2360  hypothetical protein  38.3 
 
 
183 aa  77  0.0000000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3020  NADPH-dependent FMN reductase  31.15 
 
 
185 aa  75.5  0.0000000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.24182  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4238  hypothetical protein  30.43 
 
 
194 aa  75.5  0.0000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0673986  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4181  hypothetical protein  30.43 
 
 
188 aa  75.1  0.0000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4059  YieF  30.43 
 
 
188 aa  75.1  0.0000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.553888  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4131  hypothetical protein  30.43 
 
 
188 aa  75.1  0.0000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.116669  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4074  YieF  30.43 
 
 
188 aa  75.1  0.0000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.996766  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1539  NADPH-dependent FMN reductase  29.67 
 
 
206 aa  74.7  0.0000000000006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.740647  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0038  NADPH-dependent FMN reductase  35.88 
 
 
193 aa  74.3  0.0000000000009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13071  hypothetical protein  34.97 
 
 
184 aa  73.6  0.000000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.230913 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2638  NADPH-dependent FMN reductase  34.75 
 
 
186 aa  73.2  0.000000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.334684 
 
 
-
 
NC_003296  RS03046  hypothetical protein  32.2 
 
 
184 aa  72  0.000000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0443536  normal  0.798242 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20290  predicted flavoprotein  39.67 
 
 
184 aa  72.4  0.000000000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.690539  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03597  chromate reductase, Class I, flavoprotein  28.8 
 
 
188 aa  72  0.000000000005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4254  NADPH-dependent FMN reductase  28.8 
 
 
188 aa  72  0.000000000005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4281  NADPH-dependent FMN reductase  28.8 
 
 
188 aa  72  0.000000000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0009  NADPH-dependent FMN reductase  28.49 
 
 
184 aa  72  0.000000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000000000508373  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3927  NADPH-dependent FMN reductase  28.8 
 
 
188 aa  72  0.000000000005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03541  hypothetical protein  28.8 
 
 
188 aa  72  0.000000000005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5144  NADPH-dependent FMN reductase  28.8 
 
 
188 aa  72  0.000000000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.0905647 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4080  NADPH-dependent FMN reductase  28.8 
 
 
188 aa  72  0.000000000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.952282 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4222  NADPH-dependent FMN reductase  28.8 
 
 
188 aa  72  0.000000000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4209  NADPH-dependent FMN reductase  28.8 
 
 
188 aa  71.6  0.000000000006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2299  NADPH-dependent FMN reductase  29.89 
 
 
181 aa  71.2  0.000000000007  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000197396  hitchhiker  0.00422295 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2685  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  29.51 
 
 
187 aa  71.2  0.000000000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4645  NADPH-dependent FMN reductase  36.3 
 
 
220 aa  71.2  0.000000000007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.218505  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5720  NADPH-dependent FMN reductase  29.75 
 
 
197 aa  71.2  0.000000000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4569  NADPH-dependent FMN reductase  34.75 
 
 
186 aa  71.2  0.000000000008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.561148  normal  0.29894 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5513  NADPH-dependent FMN reductase  35.85 
 
 
184 aa  70.9  0.000000000009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.000000000482376  normal  0.178166 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3166  NADPH-dependent FMN reductase  28.25 
 
 
183 aa  70.9  0.00000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000892563  normal  0.961569 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3495  NADPH-dependent FMN reductase  28.42 
 
 
183 aa  70.5  0.00000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3192  NADPH-dependent FMN reductase  38.3 
 
 
183 aa  70.9  0.00000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.271184  normal  0.196437 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0672  hypothetical protein  33.68 
 
 
178 aa  69.7  0.00000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.524204  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4960  NADPH-dependent FMN reductase  34.91 
 
 
184 aa  69.3  0.00000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00000000098219  normal  0.0174202 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4071  NADPH-dependent FMN reductase  30.83 
 
 
182 aa  69.3  0.00000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.401653 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4789  NADPH-dependent FMN reductase  29.27 
 
 
180 aa  68.9  0.00000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.165976  normal  0.0635371 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_48740  hypothetical protein  37.63 
 
 
185 aa  68.6  0.00000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000127911 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02783  redicted flavoprotein  30.34 
 
 
188 aa  68.6  0.00000000005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.690393  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2403  NADPH-dependent FMN reductase  37.5 
 
 
185 aa  68.2  0.00000000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.420707  normal  0.039915 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2371  NADPH-dependent FMN reductase  33.33 
 
 
183 aa  67  0.0000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.74887  normal  0.96964 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5170  NADPH-dependent FMN reductase  28.49 
 
 
184 aa  67.4  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.000000106598  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0023  NADPH-dependent FMN reductase  26.63 
 
 
188 aa  67  0.0000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.335563 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5689  NADPH-dependent FMN reductase  28.49 
 
 
184 aa  67.4  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000053398  decreased coverage  0.000226287 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4547  NADPH-dependent FMN reductase  28.49 
 
 
184 aa  67.4  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000635846  normal  0.888906 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1767  NADPH-dependent FMN reductase  34.92 
 
 
189 aa  66.2  0.0000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7777  putative NADPH-dependent FMN reductase  33.33 
 
 
182 aa  66.2  0.0000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0234688  normal  0.192756 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0004  hypothetical protein  34.78 
 
 
184 aa  67  0.0000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00000000785497  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4595  NADPH-dependent FMN reductase  35.04 
 
 
182 aa  66.2  0.0000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.970822  normal  0.947838 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1727  NADPH-dependent FMN reductase  32.77 
 
 
186 aa  66.6  0.0000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.267087  normal  0.569907 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3710  NADPH-dependent FMN reductase  33.61 
 
 
186 aa  66.6  0.0000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4308  NADPH-dependent FMN reductase  35.71 
 
 
183 aa  66.6  0.0000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1466  NADPH-dependent FMN reductase  34.19 
 
 
183 aa  66.2  0.0000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7021  NADPH-dependent FMN reductase  35.87 
 
 
184 aa  66.6  0.0000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0223037  hitchhiker  0.00000135463 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4138  NADPH-dependent FMN reductase  32.77 
 
 
186 aa  65.9  0.0000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4174  hypothetical protein  35.48 
 
 
186 aa  65.9  0.0000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.469146  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3463  NADPH-dependent FMN reductase  32.77 
 
 
186 aa  65.5  0.0000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.654683  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5184  NADPH-dependent FMN reductase  28.48 
 
 
190 aa  65.1  0.0000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.521338  normal  0.194966 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2505  NADPH-dependent FMN reductase  35.42 
 
 
186 aa  65.5  0.0000000005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0079  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  34.86 
 
 
181 aa  65.1  0.0000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.768632  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5453  NADPH-dependent FMN reductase  33.71 
 
 
190 aa  64.7  0.0000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.033171 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1666  NADPH-dependent FMN reductase  36.73 
 
 
216 aa  64.3  0.000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.210753  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3069  NADPH-dependent FMN reductase  30.3 
 
 
185 aa  64.3  0.000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.255478  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2828  NADPH-dependent FMN reductase  31.1 
 
 
194 aa  63.5  0.000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1677  NADPH-dependent FMN reductase  36.13 
 
 
180 aa  64.3  0.000000001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2192  NADPH-dependent FMN reductase  31.71 
 
 
185 aa  63.2  0.000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4467  hypothetical protein  29.89 
 
 
185 aa  63.5  0.000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.248815 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1895  NADPH-dependent FMN reductase  33.05 
 
 
183 aa  63.2  0.000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0898095  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0968  NADPH-dependent FMN reductase  32.31 
 
 
165 aa  63.5  0.000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.150186  normal  0.201653 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1480  NADPH-dependent FMN reductase  31.09 
 
 
179 aa  63.2  0.000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.109308 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3708  FMN reductase, NADPH-dependent  34.13 
 
 
194 aa  62.8  0.000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2966  NADPH-dependent FMN reductase  34.19 
 
 
185 aa  62.4  0.000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.267455  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4056  NADPH-dependent FMN reductase  32.77 
 
 
184 aa  62.8  0.000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34430  predicted flavoprotein  35.81 
 
 
188 aa  62.8  0.000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.111686  normal  0.581519 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3197  NADPH-dependent FMN reductase  33.71 
 
 
190 aa  62.8  0.000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3367  NADPH-dependent FMN reductase  34.19 
 
 
184 aa  62.4  0.000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3796  NADPH-dependent FMN reductase  29.7 
 
 
185 aa  62.8  0.000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0636316  normal  0.371173 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2187  NADPH-dependent FMN reductase  29.65 
 
 
179 aa  62  0.000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.171107  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2018  NAD(P)H dehydrogenase (quinone):NADPH-dependent FMN reductase  32.52 
 
 
187 aa  62  0.000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2039  NADPH-dependent FMN reductase  37.01 
 
 
195 aa  62  0.000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.343608 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5357  NADPH-dependent FMN reductase  36.17 
 
 
185 aa  62  0.000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4146  NADPH-dependent FMN reductase  34.78 
 
 
183 aa  62  0.000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00000287053  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0263  NADPH-dependent FMN reductase  34.41 
 
 
202 aa  61.6  0.000000005  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.478273  normal  0.331111 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3311  NADPH-dependent FMN reductase  33.71 
 
 
190 aa  62  0.000000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3810  NADPH-dependent FMN reductase  35.54 
 
 
185 aa  61.6  0.000000006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0156  NADPH-dependent FMN reductase  33.33 
 
 
188 aa  61.6  0.000000006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0309229 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3359  NADPH-dependent FMN reductase  33.33 
 
 
183 aa  61.6  0.000000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.767416  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3283  NADPH-dependent FMN reductase domain-containing protein  33.98 
 
 
185 aa  61.2  0.000000007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.000000000258349  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3976  NADPH-dependent FMN reductase  32.58 
 
 
190 aa  61.2  0.000000008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>