More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene STER_0095 on replicon NC_008532
Organism: Streptococcus thermophilus LMD-9



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010001  Cphy_2619  DNA polymerase III, alpha subunit  44.15 
 
 		 1527 aa  1050    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.768829  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0360  DNA polymerase III PolC  44.14 
 
 		 1367 aa  1013    Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0831  DNA polymerase III PolC  49.45 
 
 		 1436 aa  1421    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0685824  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1965  DNA polymerase III, alpha subunit  46.69 
 
 		 1426 aa  1149    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3859  DNA polymerase III, alpha subunit  43.67 
 
 		 970 aa  838    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3640  DNA polymerase III PolC  49.38 
 
 		 1433 aa  1449    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1911  DNA polymerase III PolC  76.36 
 
 		 1468 aa  2348    Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1721  DNA polymerase III PolC  43.51 
 
 		 1390 aa  981    Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.670328  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3669  DNA polymerase III PolC  49.25 
 
 		 1433 aa  1457    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3830  DNA polymerase III PolC  49.25 
 
 		 1433 aa  1457    Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  8.80742e-56 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3865  DNA polymerase III PolC  49.46 
 
 		 1433 aa  1459    Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00985865  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3559  DNA polymerase III PolC  49.32 
 
 		 1433 aa  1460    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl288  DNA polymerase III alpha subunit  38.4 
 
 		 1493 aa  968    Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0420  DNA polymerase III PolC  36.75 
 
 		 1442 aa  823    Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3577  DNA polymerase III PolC  49.25 
 
 		 1433 aa  1457    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0452  DNA polymerase III PolC  45.63 
 
 		 1433 aa  1149    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.2678  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0694  DNA polymerase III PolC  49.83 
 
 		 1443 aa  1496    Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0739447  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1350  DNA polymerase III PolC  49.59 
 
 		 1438 aa  1406    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3916  DNA polymerase III PolC  49.29 
 
 		 1433 aa  1453    Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.111889  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2042  DNA polymerase III PolC  51.71 
 
 		 1444 aa  1510    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2090  DNA polymerase III, alpha subunit  40.44 
 
 		 1421 aa  1019    Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.591044  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3955  DNA polymerase III PolC  49.25 
 
 		 1433 aa  1457    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0154434  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1011  DNA polymerase III, alpha subunit  41.79 
 
 		 1447 aa  1079    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.939055  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1483  DNA polymerase III PolC  42.5 
 
 		 1388 aa  987    Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0339  DNA polymerase III, alpha subunit  37.46 
 
 		 1479 aa  996    Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1045  DNA polymerase III, alpha subunit  48.11 
 
 		 1214 aa  847    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0186954  unclonable  0.0000000541415 
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf732  DNA polymerase III PolC  37.15 
 
 		 1438 aa  888    Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1439  DNA polymerase III, alpha subunit  49.89 
 
 		 1210 aa  870    Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.476857  normal  0.05643 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1039  DNA polymerase III PolC  43.61 
 
 		 1362 aa  986    Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.195059  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0598  DNA polymerase III, alpha subunit  37.25 
 
 		 1365 aa  933    Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1650  DNA polymerase III PolC  47.33 
 
 		 1407 aa  1159    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.00795258  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2470  DNA polymerase III PolC  49.9 
 
 		 1433 aa  1466    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1150  DNA polymerase III PolC  52.19 
 
 		 1435 aa  1516    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0319687  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1945  DNA polymerase III PolC  43.17 
 
 		 1449 aa  1167    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1663  DNA polymerase III PolC  43.45 
 
 		 1449 aa  1173    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.351996  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07800  DNA polymerase III, alpha subunit  46.35 
 
 		 1397 aa  1136    Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0996  DNA polymerase III PolC  46.67 
 
 		 1442 aa  1127    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0895  DNA-directed DNA polymerase  47.32 
 
 		 1212 aa  811    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.210067  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1806  DNA polymerase III, alpha subunit  46.49 
 
 		 1402 aa  1124    Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2429  DNA polymerase III PolC  65.81 
 
 		 1635 aa  1736    Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0983  DNA polymerase III, alpha subunit ( type)  44.81 
 
 		 1437 aa  1228    Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0809  DNA polymerase III, alpha subunit ( type)  46.78 
 
 		 1432 aa  1353    Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00164061 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0689  DNA polymerase III catalytic subunit, PolC type  46.48 
 
 		 1437 aa  1333    Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1324  DNA polymerase III PolC  49.59 
 
 		 1438 aa  1406    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0095  DNA polymerase III PolC  100 
 
 		 1464 aa  3038    Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0332  DNA polymerase III, alpha subunit  41.16 
 
 		 1465 aa  938    Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1328  DNA polymerase III PolC  49.15 
 
 		 1433 aa  1447    Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0462488  hitchhiker  0.0000648048 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1427  DNA polymerase III, alpha subunit  45.62 
 
 		 1440 aa  1194    Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0342  DNA polymerase III PolC  44.14 
 
 		 1367 aa  1013    Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3856  DNA polymerase III, alpha subunit  60.54 
 
 		 483 aa  621  1e-176  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.307747  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1808  DNA-directed DNA polymerase  38.27 
 
 		 989 aa  587  1e-166  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0349481  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1391  DNA polymerase III, alpha subunit  23.6 
 
 		 1127 aa  146  3e-33  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0675  DNA polymerase III, alpha subunit  24.05 
 
 		 1148 aa  146  3e-33  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0036  DNA polymerase III, alpha subunit  23.81 
 
 		 1240 aa  142  7e-32  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2196  DNA polymerase III, alpha subunit  24.13 
 
 		 1165 aa  141  7.999999999999999e-32  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2507  DNA polymerase III, alpha subunit  23.9 
 
 		 1157 aa  140  2e-31  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00161108  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1192  DNA polymerase III DnaE  23.67 
 
 		 1145 aa  139  3.0000000000000003e-31  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1264  DNA polymerase III DnaE  24.77 
 
 		 1181 aa  139  5e-31  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.756254  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1050  DNA polymerase III, alpha subunit  24.67 
 
 		 1075 aa  138  8e-31  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.558692  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2984  hypothetical protein  43.87 
 
 		 560 aa  138  8e-31  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03140  DNA polymerase III catalytic subunit, DnaE type  23.63 
 
 		 1122 aa  138  9e-31  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.677635  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1464  DNA polymerase III, alpha subunit  23 
 
 		 1170 aa  137  1.9999999999999998e-30  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1265  DNA polymerase III catalytic subunit, DnaE type  23.43 
 
 		 1170 aa  136  1.9999999999999998e-30  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1242  DNA polymerase III, alpha subunit  22.63 
 
 		 1170 aa  135  3.9999999999999996e-30  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1715  DNA polymerase III, alpha subunit  22.84 
 
 		 1175 aa  135  6e-30  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.49916  normal  0.677237 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_09341  DNA polymerase III subunit alpha  24.2 
 
 		 1172 aa  135  6e-30  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.146562 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0434  DNA polymerase III, alpha subunit  24.38 
 
 		 1139 aa  134  1.0000000000000001e-29  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1169  DNA polymerase III, alpha subunit  24.17 
 
 		 1155 aa  133  2.0000000000000002e-29  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.34494e-16 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1459  DNA polymerase III DnaE  24.09 
 
 		 1159 aa  133  2.0000000000000002e-29  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00150549  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1401  DNA polymerase III, alpha subunit  22.76 
 
 		 1155 aa  132  4.0000000000000003e-29  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.67909  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0650  hypothetical protein  23.8 
 
 		 1148 aa  132  4.0000000000000003e-29  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.394104 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0831  DNA polymerase III, alpha subunit  22.84 
 
 		 1132 aa  132  5.0000000000000004e-29  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2319  DNA polymerase III DnaE  22.81 
 
 		 1225 aa  131  1.0000000000000001e-28  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.511943  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0265  DNA polymerase III subunit alpha  23.84 
 
 		 1172 aa  130  2.0000000000000002e-28  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.309989  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3092  DNA polymerase III, alpha subunit  24.27 
 
 		 1156 aa  130  2.0000000000000002e-28  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.00110918  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2043  DNA polymerase III DnaE  23.95 
 
 		 1130 aa  130  2.0000000000000002e-28  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0866  DNA polymerase III, alpha subunit  23.08 
 
 		 1476 aa  130  2.0000000000000002e-28  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00672697 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2723  DNA polymerase III, alpha subunit  23.24 
 
 		 1179 aa  129  4.0000000000000003e-28  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1300  DNA polymerase III subunit epsilon  34.65 
 
 		 574 aa  128  8.000000000000001e-28  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.872341 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1215  DNA polymerase III, alpha subunit  22.45 
 
 		 1155 aa  128  9e-28  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00000331804  hitchhiker  0.00000568126 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1378  hypothetical protein  40.1 
 
 		 578 aa  126  2e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_15831  DNA polymerase III subunit alpha  23.36 
 
 		 1171 aa  126  3e-27  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2068  DNA polymerase III, alpha subunit  21.58 
 
 		 1184 aa  125  5e-27  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00797778  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0632  DNA polymerase III, alpha subunit  23.65 
 
 		 1165 aa  122  3.9999999999999996e-26  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3068  DNA polymerase III, epsilon subunit  36 
 
 		 605 aa  122  4.9999999999999996e-26  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0177257  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1158  DNA polymerase III subunit alpha  23.86 
 
 		 1172 aa  122  4.9999999999999996e-26  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.304661  normal  0.960715 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1310  DNA polymerase III, alpha subunit  22.52 
 
 		 1510 aa  122  4.9999999999999996e-26  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2682  DNA-directed DNA polymerase  33.6 
 
 		 574 aa  122  6e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.649175  normal  0.224749 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04615  putative DNA polymerase III alpha subunit  22.99 
 
 		 1454 aa  121  9e-26  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3141  DNA polymerase III, epsilon subunit  36 
 
 		 595 aa  121  9e-26  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1633  DNA polymerase III, epsilon subunit  35.87 
 
 		 721 aa  121  9.999999999999999e-26  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1074  DNA polymerase III, alpha subunit  23.58 
 
 		 1180 aa  121  9.999999999999999e-26  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1050  DNA polymerase III, alpha subunit  24.04 
 
 		 1153 aa  120  1.9999999999999998e-25  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  unclonable  0.000216104  hitchhiker  0.00986832 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0809  DNA polymerase III DnaE  23.17 
 
 		 1145 aa  120  3e-25  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000123157  decreased coverage  0.00151258 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1900  hypothetical protein  38.24 
 
 		 590 aa  119  3.9999999999999997e-25  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.207393  hitchhiker  0.00000867939 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1747  DNA polymerase III, alpha subunit  22.95 
 
 		 1122 aa  119  3.9999999999999997e-25  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2958  hypothetical protein  35.94 
 
 		 617 aa  119  5e-25  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.154785  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2071  DNA polymerase III, epsilon subunit  36.84 
 
 		 631 aa  118  6.9999999999999995e-25  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1480  DNA polymerase III, alpha subunit  23.98 
 
 		 1159 aa  118  7.999999999999999e-25  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.563322  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15750  exonuclease, DNA polymerase III, epsilon subunit family  37.84 
 
 		 616 aa  117  1.0000000000000001e-24  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.270349  normal  0.534773 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>