More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene STER_0074 on replicon NC_008532
Organism: Streptococcus thermophilus LMD-9



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008532  STER_0074  Holliday junction DNA helicase RuvA  100 
 
 
196 aa  397  9.999999999999999e-111  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.000176454  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2096  Holliday junction DNA helicase RuvA  77.04 
 
 
196 aa  315  4e-85  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2516  Holliday junction DNA helicase RuvA  59.39 
 
 
197 aa  239  2e-62  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0527  Holliday junction DNA helicase RuvA  45.23 
 
 
199 aa  178  4e-44  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0616  Holliday junction DNA helicase RuvA  46.23 
 
 
196 aa  177  1e-43  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  decreased coverage  0.00649233  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0414  Holliday junction DNA helicase RuvA  43.15 
 
 
192 aa  164  9e-40  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1206  Holliday junction DNA helicase RuvA  42.71 
 
 
200 aa  158  4e-38  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.000238701  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0577  Holliday junction resolvasome, DNA-binding subunit  42.13 
 
 
194 aa  157  8e-38  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4540  Holliday junction DNA helicase RuvA  40.59 
 
 
205 aa  156  2e-37  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000252775  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4268  Holliday junction DNA helicase RuvA  40.59 
 
 
205 aa  156  2e-37  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00764236  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0695  Holliday junction DNA helicase RuvA  40.59 
 
 
205 aa  155  3e-37  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000711774  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2522  Holliday junction DNA helicase RuvA  39.3 
 
 
201 aa  155  4e-37  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000919135  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3138  Holliday junction DNA helicase RuvA  40.59 
 
 
205 aa  155  4e-37  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000000211786  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4506  Holliday junction DNA helicase RuvA  40.59 
 
 
205 aa  154  6e-37  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0564328  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4316  Holliday junction DNA helicase RuvA  40.59 
 
 
205 aa  154  6e-37  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00104076  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4154  Holliday junction DNA helicase RuvA  40.59 
 
 
205 aa  154  6e-37  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000374115  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4165  Holliday junction DNA helicase RuvA  40.59 
 
 
205 aa  154  6e-37  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.00000000000436229  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4651  Holliday junction DNA helicase RuvA  40.59 
 
 
205 aa  154  6e-37  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00216004  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4500  Holliday junction DNA helicase RuvA  40.59 
 
 
541 aa  154  6e-37  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000049576 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4555  Holliday junction DNA helicase RuvA  40.59 
 
 
205 aa  154  6e-37  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00127574  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1699  Holliday junction DNA helicase RuvA  40.5 
 
 
200 aa  151  5.9999999999999996e-36  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.81438  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1732  Holliday junction DNA helicase RuvA  40.5 
 
 
200 aa  151  5.9999999999999996e-36  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.25398  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0926  Holliday junction DNA helicase RuvA  38.97 
 
 
194 aa  146  2.0000000000000003e-34  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0269  Holliday junction DNA helicase RuvA  34.65 
 
 
204 aa  119  1.9999999999999998e-26  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1661  Holliday junction DNA helicase RuvA  37.76 
 
 
199 aa  119  3e-26  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.133352  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2212  Holliday junction DNA helicase RuvA  32.66 
 
 
204 aa  119  3.9999999999999996e-26  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0811  Holliday junction DNA helicase RuvA  37.93 
 
 
202 aa  117  9.999999999999999e-26  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3999  Holliday junction DNA helicase RuvA  32.02 
 
 
205 aa  117  9.999999999999999e-26  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01600  Holliday junction DNA helicase RuvA  32.84 
 
 
223 aa  117  9.999999999999999e-26  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1847  Holliday junction DNA helicase subunit RuvA  32.52 
 
 
206 aa  117  9.999999999999999e-26  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0445343  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2945  Holliday junction DNA helicase RuvA  33.18 
 
 
209 aa  117  9.999999999999999e-26  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.016551  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1251  Holliday junction DNA helicase RuvA  32.14 
 
 
199 aa  117  1.9999999999999998e-25  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1251  Holliday junction DNA helicase RuvA  32.14 
 
 
199 aa  117  1.9999999999999998e-25  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2144  Holliday junction DNA helicase RuvA  32.84 
 
 
204 aa  115  5e-25  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0379489  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2421  Holliday junction DNA helicase RuvA  32.84 
 
 
204 aa  115  5e-25  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0480934  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2031  Holliday junction DNA helicase RuvA  32.84 
 
 
204 aa  115  5e-25  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000338953  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2204  Holliday junction DNA helicase RuvA  34.95 
 
 
201 aa  115  5e-25  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4542  Holliday junction DNA helicase RuvA  31.66 
 
 
201 aa  114  7.999999999999999e-25  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51790  Holliday junction DNA helicase RuvA  31.66 
 
 
201 aa  114  7.999999999999999e-25  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000465402 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1754  Holliday junction DNA helicase RuvA  30.46 
 
 
200 aa  114  8.999999999999998e-25  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000623811  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1409  Holliday junction DNA helicase RuvA  31.16 
 
 
202 aa  114  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.103613  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0420  Holliday junction DNA helicase RuvA  30.46 
 
 
200 aa  114  1.0000000000000001e-24  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1915  Holliday junction DNA helicase RuvA  34.95 
 
 
201 aa  113  1.0000000000000001e-24  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003923  holliday junction DNA helicase RuvA  32.84 
 
 
203 aa  114  1.0000000000000001e-24  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00197305  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1271  Holliday junction DNA helicase RuvA  31.44 
 
 
202 aa  113  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0682991  normal  0.630495 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2572  Holliday junction DNA helicase RuvA  35.58 
 
 
205 aa  113  2.0000000000000002e-24  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0232474  hitchhiker  0.00151008 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1216  Holliday junction DNA helicase RuvA  32.02 
 
 
205 aa  112  3e-24  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.210399  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1245  Holliday junction DNA helicase RuvA  32.02 
 
 
205 aa  112  3e-24  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.738267  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2033  Holliday junction DNA helicase RuvA  35.58 
 
 
205 aa  112  4.0000000000000004e-24  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.00030841  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1437  Holliday junction DNA helicase RuvA  33.01 
 
 
204 aa  112  4.0000000000000004e-24  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000146819  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1248  Holliday junction DNA helicase RuvA  34.65 
 
 
200 aa  111  6e-24  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0788  Holliday junction DNA helicase RuvA  35.33 
 
 
200 aa  111  8.000000000000001e-24  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.128261  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1347  Holliday junction DNA helicase RuvA  32.84 
 
 
199 aa  111  9e-24  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.0000000119387  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4408  Holliday junction DNA helicase RuvA  30.85 
 
 
202 aa  110  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0615399  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4202  Holliday junction DNA helicase RuvA  31.53 
 
 
205 aa  110  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.173502  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2189  Holliday junction DNA helicase RuvA  32.5 
 
 
200 aa  110  1.0000000000000001e-23  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000251944  normal  0.355786 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1453  Holliday junction DNA helicase RuvA  37.5 
 
 
187 aa  110  1.0000000000000001e-23  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.112528  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01832  Holliday junction DNA helicase motor protein  30.85 
 
 
203 aa  109  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.263475  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01820  hypothetical protein  30.85 
 
 
203 aa  109  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.22815  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2337  Holliday junction DNA helicase RuvA  34.5 
 
 
197 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.194735  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3978  Holliday junction DNA helicase RuvA  30.35 
 
 
202 aa  109  3e-23  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0282687  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2671  Holliday junction DNA helicase RuvA  33.33 
 
 
198 aa  109  3e-23  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.103257  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2076  Holliday junction DNA helicase RuvA  33.64 
 
 
205 aa  108  4.0000000000000004e-23  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.438835  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1771  Holliday junction DNA helicase RuvA  31 
 
 
203 aa  108  4.0000000000000004e-23  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0290161  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1954  Holliday junction DNA helicase RuvA  31 
 
 
203 aa  108  4.0000000000000004e-23  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.165373  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1888  Holliday junction DNA helicase RuvA  30.33 
 
 
206 aa  108  5e-23  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.949715  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36700  Holliday junction DNA helicase RuvA  32.5 
 
 
204 aa  108  6e-23  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2049  Holliday junction DNA helicase RuvA  31 
 
 
203 aa  108  6e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.774525  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2181  Holliday junction DNA helicase RuvA  33.82 
 
 
205 aa  107  8.000000000000001e-23  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.613402  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1222  Holliday junction DNA helicase RuvA  33.82 
 
 
201 aa  107  1e-22  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.550433  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2116  Holliday junction DNA helicase RuvA  29.38 
 
 
211 aa  107  1e-22  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2430  Holliday junction DNA helicase RuvA  32.37 
 
 
205 aa  107  1e-22  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1779  Holliday junction DNA helicase RuvA  30.5 
 
 
203 aa  107  2e-22  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00140889  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3825  Holliday junction DNA helicase RuvA  32.16 
 
 
195 aa  106  2e-22  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.790434  normal  0.237667 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1325  Holliday junction DNA helicase RuvA  30.5 
 
 
203 aa  107  2e-22  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.24557  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2597  Holliday junction DNA helicase RuvA  30.5 
 
 
203 aa  107  2e-22  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.110942  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2305  Holliday junction DNA helicase RuvA  32.16 
 
 
196 aa  107  2e-22  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.765847 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0957  Holliday junction DNA helicase RuvA  30.5 
 
 
203 aa  107  2e-22  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00202612  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2266  Holliday junction DNA helicase RuvA  32.16 
 
 
196 aa  107  2e-22  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2235  Holliday junction DNA helicase RuvA  30.05 
 
 
201 aa  106  2e-22  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1901  Holliday junction DNA helicase RuvA  31.94 
 
 
205 aa  106  2e-22  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000334634  hitchhiker  0.000124168 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2091  Holliday junction DNA helicase RuvA  30.5 
 
 
203 aa  107  2e-22  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000143296  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2313  Holliday junction DNA helicase RuvA  32.16 
 
 
196 aa  107  2e-22  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0718  Holliday junction DNA helicase RuvA  32.86 
 
 
207 aa  106  2e-22  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.157437  normal  0.726711 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1705  Holliday junction DNA helicase RuvA  30.14 
 
 
209 aa  106  2e-22  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.275173  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0457  Holliday junction DNA helicase RuvA  33.83 
 
 
204 aa  105  3e-22  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4725  Holliday junction DNA helicase RuvA  31.47 
 
 
202 aa  105  3e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.453465 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2077  Holliday junction DNA helicase RuvA  31.48 
 
 
205 aa  105  3e-22  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.0000433363  hitchhiker  0.00159664 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1956  Holliday junction DNA helicase RuvA  31.48 
 
 
205 aa  105  3e-22  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.00381182  normal  0.897117 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2054  Holliday junction DNA helicase RuvA  30.29 
 
 
203 aa  105  4e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.292031  normal  0.142265 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0904  Holliday junction DNA helicase RuvA  33.33 
 
 
195 aa  105  4e-22  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1353  Holliday junction DNA helicase RuvA  30.29 
 
 
203 aa  105  4e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.760741  hitchhiker  0.00521266 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2109  Holliday junction DNA helicase RuvA  30.29 
 
 
203 aa  105  4e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.434147  normal  0.12473 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2494  Holliday junction DNA helicase RuvA  28.23 
 
 
208 aa  105  4e-22  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07040  Holliday junction DNA helicase, RuvA subunit  35.67 
 
 
197 aa  105  4e-22  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00385536  normal  0.295964 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1229  Holliday junction DNA helicase RuvA  30.29 
 
 
203 aa  105  4e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0100145  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4502  Holliday junction DNA helicase RuvA  33.67 
 
 
198 aa  105  5e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0530  Holliday junction DNA helicase RuvA  35.15 
 
 
206 aa  105  5e-22  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1161  Holliday junction DNA helicase RuvA  28.44 
 
 
214 aa  104  6e-22  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.981458 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0477  Holliday junction DNA helicase subunit RuvA  34.33 
 
 
204 aa  105  6e-22  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00171  normal  0.61451 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>