19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene STER_0017 on replicon NC_008532
Organism: Streptococcus thermophilus LMD-9



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008532  STER_1759  transposase  99.12 
 
 		 339 bp  648    Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0017    100 
 
 		 339 bp  672    Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.159602  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1754    99.12 
 
 		 5389 bp  648    Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1209    98.53 
 
 		 1354 bp  632  1e-179  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0364    96.87 
 
 		 588 bp  553  1e-155  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0102    96.21 
 
 		 264 bp  444  1e-123  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0056    91.98 
 
 		 609 bp  252  5e-65  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0255    100 
 
 		 279 bp  155  1e-35  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.384648  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0806    95.92 
 
 		 609 bp  155  1e-35  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0500044  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0900    96.15 
 
 		 796 bp  115  8.000000000000001e-24  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00475035  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0290  transposase  94.67 
 
 		 147 bp  111  1e-22  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.174922  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1373    94.74 
 
 		 189 bp  89.7  5e-16  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1359  transposase  81.03 
 
 		 837 bp  83.8  0.00000000000003  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00136296  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1417  IS861, transposase (orf2), IS3 family, truncated  89.83 
 
 		 639 bp  69.9  0.0000000004  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0365  transposase  100 
 
 		 189 bp  50.1  0.0004  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1758  transposase  100 
 
 		 189 bp  50.1  0.0004  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1068  IS861, transposase OrfB  83.95 
 
 		 834 bp  50.1  0.0004  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.000365841  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0016  transposase  100 
 
 		 537 bp  50.1  0.0004  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1527  IS861, transposase OrfB  83.95 
 
 		 834 bp  50.1  0.0004  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.019488  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>