184 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene STER_0008 on replicon NC_008532
Organism: Streptococcus thermophilus LMD-9



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008532  STER_0008  S4 domain-containing protein  100 
 
 		 91 aa  178  2.9999999999999997e-44  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.340534  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0010  S4 domain-containing protein  91.01 
 
 		 90 aa  163  5.9999999999999996e-40  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0012  ribosome-associated heat shock protein implicated in the recycling of the 50S subunit S4-like protein  75 
 
 		 89 aa  131  3e-30  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0400  ribosome-associated heat shock protein implicated in the recycling of the 50S subunit S4-like protein  66.67 
 
 		 93 aa  115  1.9999999999999998e-25  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0055  S4 domain-containing protein  56.82 
 
 		 91 aa  113  6.9999999999999995e-25  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.28078  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0056  S4 domain-containing protein  56.82 
 
 		 91 aa  113  6.9999999999999995e-25  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0052  heat shock protein 15  56.82 
 
 		 91 aa  113  6.9999999999999995e-25  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000120975  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0052  heat shock protein 15  56.82 
 
 		 91 aa  113  6.9999999999999995e-25  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.69267  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0062  S4 domain protein  56.82 
 
 		 91 aa  113  6.9999999999999995e-25  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.244767  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0056  s4 domain-containing protein  56.82 
 
 		 91 aa  113  6.9999999999999995e-25  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00178771  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0066  S4 domain protein  56.82 
 
 		 91 aa  113  6.9999999999999995e-25  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0453623  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5254  S4 domain protein  56.82 
 
 		 91 aa  113  6.9999999999999995e-25  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00238131  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0063  S4 domain protein  56.82 
 
 		 91 aa  113  6.9999999999999995e-25  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0052  RNA-binding S4 domain-containing protein  56.82 
 
 		 91 aa  111  3e-24  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0054  RNA-binding S4 domain protein  56.67 
 
 		 90 aa  111  4.0000000000000004e-24  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0449701  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0052  RNA-binding S4 domain-containing protein  56.82 
 
 		 91 aa  109  2.0000000000000002e-23  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.052055  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0052  RNA-binding S4 domain protein  56.63 
 
 		 93 aa  106  1e-22  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0263  RNA-binding S4 domain-containing protein  56.18 
 
 		 90 aa  100  7e-21  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0144  S4 domain-containing protein  55.95 
 
 		 87 aa  100  8e-21  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0272  ribosome-associated heat shock protein implicated in the recycling of the 50S subunit S4-like protein  56.96 
 
 		 91 aa  96.7  1e-19  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2801  S4 domain-containing protein  56.96 
 
 		 86 aa  94.7  4e-19  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  unclonable  0.000000000568506  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0184  ribosome-associated heat shock protein implicated in the recycling of the 50S subunit S4-like protein  53.75 
 
 		 86 aa  94.4  5e-19  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2487  S4 domain-containing protein  56.96 
 
 		 86 aa  92.8  1e-18  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  unclonable  0.0000000000325164  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0528  RNA-binding S4 domain-containing protein  55.26 
 
 		 87 aa  90.9  5e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.0000233006  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0541  RNA-binding S4 domain-containing protein  55.26 
 
 		 87 aa  90.9  5e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000262722  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0116  RNA-binding S4 domain-containing protein  51.9 
 
 		 80 aa  88.6  3e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0688  RNA-binding S4 domain-containing protein  51.85 
 
 		 81 aa  87  8e-17  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0948167  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0134  RNA-binding S4 domain-containing protein  50.63 
 
 		 79 aa  86.3  1e-16  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000111292  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0649  RNA-binding S4 domain protein  49.37 
 
 		 80 aa  86.3  1e-16  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000000916676  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0187  RNA-binding S4 domain protein  45.05 
 
 		 100 aa  84.7  4e-16  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3084  RNA-binding S4 domain protein  48.68 
 
 		 79 aa  84.3  6e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000350444  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0084  hypothetical protein  51.9 
 
 		 80 aa  81.6  0.000000000000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0620  RNA-binding S4 domain protein  51.85 
 
 		 81 aa  80.1  0.000000000000009  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.215008  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2658  RNA-binding S4  47.44 
 
 		 79 aa  79.3  0.00000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000195193  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0086  RNA-binding S4  44.94 
 
 		 89 aa  77.8  0.00000000000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0510355  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0136  RNA-binding S4 domain protein  48.1 
 
 		 90 aa  77  0.00000000000009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.170322  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0076  RNA-binding S4 domain-containing protein  44.71 
 
 		 88 aa  76.3  0.0000000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0220  RNA-binding S4 domain protein  41.18 
 
 		 86 aa  76.6  0.0000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.126994  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1221  RNA-binding S4 domain protein  42.05 
 
 		 89 aa  74.3  0.0000000000006  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.000000180321  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0093  RNA-binding S4 domain protein  46.91 
 
 		 82 aa  72.8  0.000000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.0000000000415805  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1262  RNA-binding S4 domain protein  44.3 
 
 		 83 aa  70.5  0.000000000007  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0965  RNA-binding S4 domain-containing protein  41.57 
 
 		 79 aa  61.2  0.000000004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1380  RNA-binding S4 domain-containing protein  40 
 
 		 77 aa  61.2  0.000000005  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.278565  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0791  RNA-binding S4 domain protein  35.96 
 
 		 133 aa  56.2  0.0000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0343  RNA-binding S4 domain protein  40.62 
 
 		 87 aa  55.1  0.0000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.343465  normal  0.703045 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0164  S4 domain protein  40.62 
 
 		 87 aa  55.1  0.0000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2068  RNA-binding S4 domain protein  39.51 
 
 		 81 aa  54.7  0.0000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1066  S4 domain-containing protein  34.92 
 
 		 81 aa  54.7  0.0000004  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0263  RNA-binding S4  35.38 
 
 		 135 aa  53.9  0.0000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.935864  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0747  RNA-binding S4 domain-containing protein  35.38 
 
 		 135 aa  53.9  0.0000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.503491  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1237  uroporphyrinogen decarboxylase  45.1 
 
 		 81 aa  53.5  0.0000009  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2419  RNA-binding S4 domain-containing protein  48.28 
 
 		 139 aa  53.5  0.0000009  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.676645  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0717  RNA-binding S4 domain-containing protein  35.38 
 
 		 135 aa  53.1  0.000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2075  RNA-binding S4 domain protein  39.76 
 
 		 134 aa  53.1  0.000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.142935  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0753  S4 RNA-binding domain protein  36.51 
 
 		 82 aa  53.1  0.000001  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0330  RNA-binding S4 domain protein  34.52 
 
 		 135 aa  53.1  0.000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0496107 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0665  RNA-binding S4 domain-containing protein  33.85 
 
 		 135 aa  52.8  0.000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0641  RNA-binding S4 domain-containing protein  33.85 
 
 		 157 aa  52.8  0.000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1639  RNA-binding S4 domain-containing protein  38.55 
 
 		 141 aa  52.4  0.000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.290258 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2637  RNA-binding S4 domain-containing protein  33.85 
 
 		 135 aa  52  0.000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0176  RNA-binding S4 domain-containing protein  34.62 
 
 		 135 aa  51.2  0.000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.905823  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3737  heat shock protein 15  34.62 
 
 		 135 aa  51.6  0.000004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2515  RNA-binding S4 domain-containing protein  46.55 
 
 		 149 aa  51.6  0.000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.165462  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1304  heat shock protein 15  35.38 
 
 		 135 aa  51.6  0.000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3625  putative heat shock protein  32.95 
 
 		 128 aa  51.6  0.000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.679676 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2496  putative heat shock protein  35.16 
 
 		 137 aa  51.6  0.000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.416109 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3976  heat shock protein 15  34.62 
 
 		 135 aa  51.2  0.000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1468  RNA-binding S4  39.62 
 
 		 146 aa  50.8  0.000006  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.369867  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0725  RNA-binding S4 domain-containing protein  39.29 
 
 		 77 aa  50.4  0.000007  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.149399  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05160  heat shock protein implicated in 50S component recycling (S4 paralogue)  32.26 
 
 		 130 aa  50.8  0.000007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0946751  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0701  RNA-binding S4 domain-containing protein  39.29 
 
 		 77 aa  50.4  0.000007  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00584893  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0768  S4 domain-containing protein  33.33 
 
 		 81 aa  50.4  0.000009  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.515789  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3836  RNA-binding S4  32.31 
 
 		 135 aa  50.4  0.000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1332  S4 domain-containing protein  33.33 
 
 		 81 aa  50.4  0.000009  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1980  S4 domain-containing protein  39.22 
 
 		 81 aa  50.1  0.00001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2104  RNA-binding S4 domain protein  40.91 
 
 		 128 aa  49.7  0.00001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1231  RNA-binding S4 domain-containing protein  36.14 
 
 		 138 aa  50.1  0.00001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.984155  normal  0.301013 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0693  S4 domain-containing protein  39.22 
 
 		 81 aa  50.1  0.00001  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4593  heat shock protein 15  32.22 
 
 		 134 aa  49.3  0.00002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3894  RNA-binding S4 domain protein  31.11 
 
 		 136 aa  49.7  0.00002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4615  RNA-binding S4 domain-containing protein  34.62 
 
 		 135 aa  49.3  0.00002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2640  RNA-binding S4  42.31 
 
 		 141 aa  49.7  0.00002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.414836  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0734  RNA-binding S4 domain protein  29.41 
 
 		 135 aa  49.3  0.00002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.20304  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4071  RNA-binding S4 domain protein  30 
 
 		 136 aa  48.9  0.00002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2572  RNA-binding S4 domain-containing protein  34.83 
 
 		 153 aa  49.3  0.00002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000329633 
 
 
-
 
NC_002950  PG0165  heat shock protein 15  29.79 
 
 		 145 aa  48.5  0.00003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0119  RNA-binding S4  32.53 
 
 		 132 aa  48.5  0.00003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0359647  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0206  RNA-binding S4  40.82 
 
 		 122 aa  48.1  0.00004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0103  RNA-binding S4 domain-containing protein  31.33 
 
 		 132 aa  48.1  0.00004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0850  S4 domain-containing protein  39.22 
 
 		 81 aa  47.8  0.00005  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.00127812  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0328  RNA-binding S4 domain protein  30.77 
 
 		 137 aa  47.4  0.00006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1002  RNA-binding S4  42.55 
 
 		 131 aa  47.4  0.00007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.320344 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3964  putative heat shock protein 15  29.41 
 
 		 135 aa  47.4  0.00008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0551076 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1408  RNA-binding S4 domain protein  30.43 
 
 		 141 aa  47.4  0.00008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2006  RNA-binding S4  33.33 
 
 		 142 aa  47  0.00009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.654471  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1162  RNA-binding S4 domain protein  30.49 
 
 		 135 aa  47  0.00009  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0154  RNA-binding S4 domain-containing protein  32.95 
 
 		 132 aa  46.6  0.0001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.29084  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3698  RNA-binding S4 domain-containing protein  27.66 
 
 		 130 aa  46.2  0.0001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0151  RNA-binding S4 domain-containing protein  42.31 
 
 		 132 aa  46.6  0.0001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.245693 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0147  RNA-binding S4 domain-containing protein  42.31 
 
 		 132 aa  46.6  0.0001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.834314  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>