More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SO_A0099 on replicon NC_004349
Organism: Shewanella oneidensis MR-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004349  SO_A0099  hypothetical protein  100 
 
 		 577 aa  1190    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.119429  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3889  Amidohydrolase 3  39.57 
 
 		 624 aa  390  1e-107  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2078  hypothetical protein  36.14 
 
 		 576 aa  367  1e-100  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2000  twin-arginine translocation pathway signal  36.86 
 
 		 638 aa  359  7e-98  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2836  amidohydrolase 3  35.09 
 
 		 597 aa  353  2.9999999999999997e-96  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00214714 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4359  Amidohydrolase 3  34.96 
 
 		 552 aa  288  2e-76  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.747715 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5757  amidohydrolase:amidohydrolase-like  32.62 
 
 		 547 aa  277  3e-73  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.691063  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6052  amidohydrolase 3  33.63 
 
 		 555 aa  277  5e-73  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.863749  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7627  amidohydrolase-like  33.45 
 
 		 555 aa  275  2.0000000000000002e-72  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.137819 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0108  Amidohydrolase 3  33.63 
 
 		 547 aa  263  6e-69  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.134206  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0134  amidohydrolase-like  34.15 
 
 		 547 aa  263  8.999999999999999e-69  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.900918  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4766  amidohydrolase 3  32.56 
 
 		 545 aa  262  1e-68  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1985  amidohydrolase 3  32.03 
 
 		 554 aa  260  4e-68  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4295  amidohydrolase 3  31.05 
 
 		 557 aa  255  2.0000000000000002e-66  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.4347 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5666  amidohydrolase 3  31.63 
 
 		 554 aa  248  2e-64  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.498872  normal  0.0259745 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3250  amidohydrolase 3  31.95 
 
 		 542 aa  239  9e-62  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.383305  normal  0.632693 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4287  amidohydrolase 3  31.16 
 
 		 544 aa  237  4e-61  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.275898  normal  0.90981 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0736  amidohydrolase 3  27.73 
 
 		 536 aa  190  5.999999999999999e-47  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0656369  normal  0.367651 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0742  amidohydrolase 3  27.73 
 
 		 536 aa  190  5.999999999999999e-47  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.838024  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0756  amidohydrolase 3  27.73 
 
 		 536 aa  190  5.999999999999999e-47  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.398429  normal  0.248868 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10562  hypothetical protein  27.22 
 
 		 537 aa  183  8.000000000000001e-45  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.036236 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0005  twin-arginine translocation pathway signal  28.44 
 
 		 584 aa  175  1.9999999999999998e-42  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1124  amidohydrolase 3  26.74 
 
 		 625 aa  170  8e-41  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.70056  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3404  Amidohydrolase 3  28.23 
 
 		 586 aa  163  8.000000000000001e-39  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00000897209  hitchhiker  0.00001315 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2885  amidohydrolase 3  27.78 
 
 		 569 aa  159  1e-37  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  decreased coverage  0.00571861  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0597  twin-arginine translocation pathway signal sequence domain-containing protein  26.8 
 
 		 575 aa  155  1e-36  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0635  twin-arginine translocation pathway signal sequence domain-containing protein  26.12 
 
 		 575 aa  154  5e-36  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3968  amidohydrolase 3  23.86 
 
 		 560 aa  153  7e-36  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3353  amidohydrolase 3  26.27 
 
 		 583 aa  148  2.0000000000000003e-34  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.742336  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3333  amidohydrolase 3  27.72 
 
 		 538 aa  144  3e-33  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.827227 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4036  amidohydrolase 3  23.67 
 
 		 601 aa  141  3.9999999999999997e-32  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0100  hypothetical protein  25.3 
 
 		 604 aa  139  2e-31  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0803  Amidohydrolase 3  25.22 
 
 		 564 aa  137  4e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.379476 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1096  Amidohydrolase 3  26.1 
 
 		 525 aa  135  1.9999999999999998e-30  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3625  amidohydrolase 3  26.77 
 
 		 556 aa  134  5e-30  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.433177  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2366  Amidohydrolase 3  25.87 
 
 		 553 aa  130  8.000000000000001e-29  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.662277  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6181  putative amidohydrolase  25.09 
 
 		 542 aa  130  9.000000000000001e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0743865  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3171  amidohydrolase 3  24.42 
 
 		 539 aa  130  9.000000000000001e-29  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.180837  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1885  Amidohydrolase 3  24.37 
 
 		 587 aa  129  1.0000000000000001e-28  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.5166  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3458  hypothetical protein  25.65 
 
 		 601 aa  129  1.0000000000000001e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.55725  normal  0.0698709 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0420  amidohydrolase-like  25.5 
 
 		 581 aa  128  3e-28  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1574  Amidohydrolase 3  26.94 
 
 		 540 aa  127  5e-28  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2780  amidohydrolase  26.97 
 
 		 576 aa  125  2e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1793  hypothetical protein  25.09 
 
 		 539 aa  124  6e-27  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1491  Amidohydrolase 3  25.83 
 
 		 537 aa  122  1.9999999999999998e-26  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0764832 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1072  Amidohydrolase 3  23.91 
 
 		 505 aa  121  3.9999999999999996e-26  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.185661  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1746  Amidohydrolase 3  24.87 
 
 		 552 aa  120  4.9999999999999996e-26  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.717309  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3443  amidohydrolase 3  23.64 
 
 		 556 aa  120  6e-26  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.6586 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1013  Amidohydrolase 3  24.83 
 
 		 548 aa  120  7e-26  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.668342  normal  0.733638 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1018  amidohydrolase-like  24.64 
 
 		 541 aa  119  1.9999999999999998e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.121748 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2185  Amidohydrolase 3  25.08 
 
 		 563 aa  119  1.9999999999999998e-25  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2245  amidohydrolase 3  23.18 
 
 		 596 aa  118  3e-25  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.320188  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3053  amidohydrolase family  22.74 
 
 		 574 aa  117  7.999999999999999e-25  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3185  amidohydrolase 3  24.82 
 
 		 560 aa  116  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.214251  normal  0.510937 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1362  Amidohydrolase 3  23.85 
 
 		 569 aa  115  2.0000000000000002e-24  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4035  Amidohydrolase 3  25.48 
 
 		 556 aa  115  2.0000000000000002e-24  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.787006  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4740  amidohydrolase 3  24.83 
 
 		 589 aa  115  2.0000000000000002e-24  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.185447 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2070  amidohydrolase 3  24.65 
 
 		 560 aa  115  3e-24  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09378  Predicted metal-dependent amidohydrolase with the TIM-barrel fold  24.01 
 
 		 540 aa  114  4.0000000000000004e-24  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3052  amidohydrolase 3  25.23 
 
 		 546 aa  114  6e-24  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.35545  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0253  amidohydrolase 3  25.26 
 
 		 551 aa  114  6e-24  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1934  Amidohydrolase 3  25.44 
 
 		 557 aa  114  7.000000000000001e-24  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1290  Amidohydrolase 3  24.66 
 
 		 603 aa  113  8.000000000000001e-24  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0346185  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1950  amidohydrolase 3  23.54 
 
 		 530 aa  112  1.0000000000000001e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0927  amidohydrolase 3  24.87 
 
 		 582 aa  112  2.0000000000000002e-23  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0760  amidohydrolase 3  31.52 
 
 		 592 aa  111  3e-23  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3243  amidohydrolase 3  25.22 
 
 		 573 aa  110  8.000000000000001e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.262757  normal  0.0106893 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1541  putative amidohydrolase 3  23.97 
 
 		 648 aa  109  1e-22  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.260198  normal  0.229672 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2426  amidohydrolase 3  24.46 
 
 		 549 aa  109  1e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0987019 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1904  Amidohydrolase 3  22.55 
 
 		 520 aa  109  1e-22  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1040  amidohydrolase 3  24.47 
 
 		 590 aa  108  2e-22  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.80433  normal  0.260287 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2637  Amidohydrolase 3  25.54 
 
 		 533 aa  108  3e-22  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1053  hypothetical protein  25.29 
 
 		 583 aa  107  5e-22  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3370  Amidohydrolase 3  24.24 
 
 		 558 aa  106  1e-21  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.000202317  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3204  amidohydrolase 3  24.87 
 
 		 580 aa  106  2e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0492365  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0992  hypothetical protein  25.12 
 
 		 583 aa  105  2e-21  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00778  predicted metal-dependent amidohydrolase with the TIM-barrel fold protein  23.05 
 
 		 546 aa  105  3e-21  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2802  hypothetical protein  25.51 
 
 		 580 aa  104  4e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.992935  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2075  putative lipoprotein  23.53 
 
 		 585 aa  104  5e-21  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.860152  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1631  Amidohydrolase 3  24.95 
 
 		 537 aa  103  6e-21  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.0506733 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004324  metal-dependent hydrolase  24.51 
 
 		 581 aa  103  7e-21  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3154  amidohydrolase-like  26.4 
 
 		 585 aa  103  7e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0032  Amidohydrolase 3  22.74 
 
 		 527 aa  103  7e-21  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0333  Amidohydrolase 3  23.4 
 
 		 526 aa  103  1e-20  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3836  putative metal-dependent hydrolase  25.09 
 
 		 550 aa  102  2e-20  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3832  amidohydrolase 3  23.06 
 
 		 556 aa  102  2e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.988411 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_32950  hypothetical protein  24.8 
 
 		 580 aa  102  2e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000236745 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2609  amidohydrolase 3  29.92 
 
 		 548 aa  101  4e-20  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.506547 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0426  Amidohydrolase 3  23.09 
 
 		 539 aa  100  9e-20  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1693  hypothetical protein  23.95 
 
 		 533 aa  100  9e-20  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.0357056 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3132  metal-dependent amidohydrolase with the TIM-barrel fold  31.68 
 
 		 565 aa  100  1e-19  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1184  amidohydrolase 3  24.87 
 
 		 544 aa  99.8  1e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_10795  conserved hypothetical protein  26 
 
 		 549 aa  99.4  2e-19  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7493  amidohydrolase family  25.61 
 
 		 564 aa  99.4  2e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0605616  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2765  amidohydrolase  29.46 
 
 		 543 aa  99  2e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.270794  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3532  amidohydrolase 3  23.91 
 
 		 550 aa  99.4  2e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1214  Amidohydrolase 3  23.73 
 
 		 527 aa  97.8  4e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4653  putative metal-dependent amidohydrolase with the TIM-barrel fold  31.1 
 
 		 560 aa  98.2  4e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.707824  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2556  Amidohydrolase 3  26.41 
 
 		 556 aa  97.8  4e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.12202 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3329  amidohydrolase 3  23.64 
 
 		 583 aa  97.1  8e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.842  normal  0.159954 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>