More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SO_A0048 on replicon NC_004349
Organism: Shewanella oneidensis MR-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_004349  SO_A0048  prolyl oligopeptidase family protein  100 
 
 
642 aa  1321  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.436282  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0594  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  65.76 
 
 
623 aa  860  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0372  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  40.72 
 
 
662 aa  509  1e-143  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0384  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  40.72 
 
 
662 aa  509  1e-143  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.290431  normal  0.0110983 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0398  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  40.57 
 
 
662 aa  508  1e-142  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  3.16056e-10 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3774  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  40.63 
 
 
661 aa  503  1e-141  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.455998 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0373  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  40.52 
 
 
662 aa  502  1e-141  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.265704  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3485  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  42.28 
 
 
654 aa  501  1e-140  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4252  prolyl oligopeptidase family protein  40.27 
 
 
662 aa  500  1e-140  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3832  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  39.18 
 
 
659 aa  497  1e-139  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3833  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  41.08 
 
 
649 aa  493  1e-138  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3601  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  40.79 
 
 
661 aa  495  1e-138  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0355  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  40.27 
 
 
662 aa  491  1e-137  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.824077 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4565  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  40.99 
 
 
657 aa  491  1e-137  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00542478  unclonable  5.39912e-08 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00624  prolyl oligopeptidase  41.92 
 
 
653 aa  491  1e-137  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0323  prolyl oligopeptidase family protein  40.18 
 
 
649 aa  490  1e-137  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0322  peptidase S9, prolyl oligopeptidase active site region  39.45 
 
 
653 aa  482  1e-135  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0395751  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0381  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  40.1 
 
 
654 aa  483  1e-135  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.217468  unclonable  1.77281e-10 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3841  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  39.73 
 
 
654 aa  483  1e-135  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0834  hypothetical protein  38.29 
 
 
648 aa  464  1e-129  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.386873  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1087  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  35.88 
 
 
650 aa  386  1e-106  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.393964  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0844  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  32.25 
 
 
646 aa  339  1e-91  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6730  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  29.28 
 
 
632 aa  285  2e-75  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.907657  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0706  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  31.66 
 
 
656 aa  276  6e-73  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.155251 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06914  prolyl oligopeptidase  31.02 
 
 
655 aa  276  1e-72  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000910  putative peptidase  30.67 
 
 
640 aa  275  1e-72  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.982884  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0003  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  29.89 
 
 
665 aa  267  6e-70  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4261  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  29.84 
 
 
652 aa  249  2e-64  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.111222 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0702  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  30.46 
 
 
665 aa  246  8e-64  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.0827659 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0246  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  28.7 
 
 
644 aa  238  2e-61  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1112  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  29.17 
 
 
656 aa  232  2e-59  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.245577  normal  0.568355 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1930  peptidase S9, prolyl oligopeptidase  26.88 
 
 
646 aa  228  3e-58  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2643  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  28.21 
 
 
644 aa  226  8e-58  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0476  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  28.59 
 
 
688 aa  226  1e-57  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1350  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  29.62 
 
 
655 aa  224  3e-57  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1266  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  27.83 
 
 
631 aa  223  8e-57  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.211135  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4483  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  27.17 
 
 
682 aa  219  1e-55  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0529  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  25.9 
 
 
634 aa  219  2e-55  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG1004  prolyl oligopeptidase family protein  27.14 
 
 
759 aa  218  3e-55  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0365  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  28.17 
 
 
632 aa  218  4e-55  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4393  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  28.55 
 
 
626 aa  217  7e-55  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5922  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  27.62 
 
 
626 aa  216  9e-55  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3201  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  37.14 
 
 
924 aa  216  1e-54  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.243991 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4618  prolyl oligopeptidase family protein  27.13 
 
 
645 aa  215  2e-54  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1353  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  27.84 
 
 
629 aa  214  3e-54  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.262385  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0766  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  28.78 
 
 
641 aa  210  5e-53  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0952  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  27.17 
 
 
706 aa  209  1e-52  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.630914  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3803  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  26.9 
 
 
645 aa  207  6e-52  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.6032 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03802  dipeptidyl anminopeptidase  27.54 
 
 
694 aa  207  7e-52  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8147  hypothetical protein  26.83 
 
 
634 aa  205  2e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.675914 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3064  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  25.6 
 
 
755 aa  204  4e-51  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.366531  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0345  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  27.56 
 
 
626 aa  203  6e-51  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1669  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  27.13 
 
 
629 aa  203  7e-51  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0301  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  27.56 
 
 
626 aa  203  9e-51  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.111113 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1886  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  28.62 
 
 
636 aa  203  1e-50  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0482  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  25.56 
 
 
686 aa  202  1e-50  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2658  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  26.13 
 
 
642 aa  202  1e-50  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.55127  normal  0.367777 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1195  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  28.32 
 
 
645 aa  202  1e-50  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.430413  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2025  prolyl oligopeptidase family protein  27.27 
 
 
636 aa  201  4e-50  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00251963  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0143  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  25.42 
 
 
645 aa  201  4e-50  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0377  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  27.56 
 
 
626 aa  200  6e-50  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.280031  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3884  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  26.24 
 
 
686 aa  200  7e-50  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.913505  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4124  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  25.42 
 
 
645 aa  200  7e-50  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4323  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  25.3 
 
 
645 aa  199  1e-49  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1646  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  27.23 
 
 
705 aa  198  2e-49  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.106603  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5159  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  26.7 
 
 
666 aa  198  2e-49  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.017012  decreased coverage  0.000228688 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2049  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  26.53 
 
 
907 aa  197  4e-49  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.564098  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1193  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  31.91 
 
 
642 aa  196  2e-48  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2052  peptidase S9, prolyl oligopeptidase active site region  25.97 
 
 
630 aa  187  4e-46  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.55137  normal  0.714509 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0078  prolyl oligopeptidase family protein  25.22 
 
 
665 aa  184  4e-45  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0129  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  25.72 
 
 
665 aa  184  5e-45  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.286088 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3063  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  25.93 
 
 
688 aa  183  7e-45  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4772  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  26.91 
 
 
632 aa  182  2e-44  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0061  prolyl oligopeptidase family protein  25.56 
 
 
653 aa  181  5e-44  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.101557  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1803  peptidase S9, prolyl oligopeptidase active site region  25.25 
 
 
731 aa  178  2e-43  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.184836  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0493  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  30.89 
 
 
662 aa  176  1e-42  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0179177  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_17781  hypothetical protein  30.59 
 
 
681 aa  174  4e-42  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.46714 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0494  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  27.61 
 
 
685 aa  173  1e-41  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0656758  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3714  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  32.35 
 
 
650 aa  165  2e-39  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6348  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  30.41 
 
 
629 aa  151  3e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2910  peptidase S9, prolyl oligopeptidase active site region  31.14 
 
 
606 aa  144  4e-33  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3959  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  33.96 
 
 
646 aa  143  8e-33  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1709  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  28.25 
 
 
594 aa  142  2e-32  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0114  peptidase S9, prolyl oligopeptidase  29.05 
 
 
674 aa  142  2e-32  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0121  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  32.69 
 
 
674 aa  141  3e-32  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0495  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  27.84 
 
 
692 aa  142  3e-32  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.468891  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0148  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  22.62 
 
 
617 aa  141  4e-32  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.554216 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0132  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  32.69 
 
 
674 aa  141  4e-32  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0897  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  29.45 
 
 
600 aa  139  1e-31  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.835581  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0469  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  30.33 
 
 
638 aa  139  2e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2303  peptidase S9, prolyl oligopeptidase active site region  29.28 
 
 
615 aa  136  1e-30  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4518  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  25.42 
 
 
652 aa  135  3e-30  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.164406 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3511  prolyl oligopeptidase family protein  28.83 
 
 
638 aa  135  3e-30  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4185  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  30.6 
 
 
655 aa  134  7e-30  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0312  peptidase S9, prolyl oligopeptidase active site region  29.1 
 
 
588 aa  132  2e-29  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0748  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  31.03 
 
 
644 aa  132  3e-29  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.049006  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3234  acylamino-acid-releasing enzyme  31.58 
 
 
596 aa  131  4e-29  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3798  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  27.97 
 
 
634 aa  130  5e-29  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0561  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  32.91 
 
 
668 aa  130  6e-29  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0194  peptidase S9, prolyl oligopeptidase active site region  23.47 
 
 
638 aa  130  7e-29  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>