More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SO_4733 on replicon NC_004347
Organism: Shewanella oneidensis MR-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004347  SO_4733  lysophospholipase L2  100 
 
 		 329 aa  691    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3914  alpha/beta hydrolase fold  93.51 
 
 		 337 aa  655    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.281436 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_4006  alpha/beta hydrolase fold  92.63 
 
 		 337 aa  649    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4119  alpha/beta hydrolase fold  93.51 
 
 		 337 aa  655    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0044  alpha/beta hydrolase fold  85.67 
 
 		 327 aa  596  1e-169  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4299  alpha/beta hydrolase fold protein  85.67 
 
 		 327 aa  596  1e-169  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000200396 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4354  alpha/beta hydrolase fold  85.37 
 
 		 327 aa  595  1e-169  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4496  alpha/beta hydrolase fold  85.67 
 
 		 327 aa  595  1e-169  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.494887 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3916  alpha/beta hydrolase fold  84.5 
 
 		 327 aa  589  1e-167  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0051  lysophospholipase  61.51 
 
 		 333 aa  408  1e-113  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.18197 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3723  alpha/beta hydrolase fold  62.3 
 
 		 329 aa  394  1e-108  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.211444 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0094  alpha/beta hydrolase fold  60.25 
 
 		 324 aa  390  1e-107  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0088  lysophospholipase  56.05 
 
 		 330 aa  370  1e-101  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0146319 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0039  alpha/beta hydrolase fold  53.16 
 
 		 324 aa  360  2e-98  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.302219  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0083  alpha/beta hydrolase fold  56.11 
 
 		 317 aa  340  1e-92  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.902685  normal  0.481524 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3669  alpha/beta hydrolase fold  51.69 
 
 		 329 aa  337  1.9999999999999998e-91  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00537  lysophospholipase L2  41.69 
 
 		 322 aa  244  1.9999999999999999e-63  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00300  lysophospholipase  39.47 
 
 		 329 aa  231  2e-59  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0989  alpha/beta hydrolase fold  42.41 
 
 		 302 aa  229  4e-59  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0786107  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2385  lysophospholipase L2  42.01 
 
 		 338 aa  229  6e-59  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002122  lysophospholipase L2  40.33 
 
 		 335 aa  228  1e-58  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3995  lysophospholipase L2  38.66 
 
 		 331 aa  225  6e-58  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.745904  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0558  lysophospholipase L2  38.66 
 
 		 337 aa  225  7e-58  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0196  lysophospholipase L2  39.03 
 
 		 345 aa  221  1.9999999999999999e-56  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.951636  normal  0.0550864 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0245  lysophospholipase L2  39.62 
 
 		 330 aa  220  3e-56  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.200156  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2931  lysophospholipase L2 LypA  37.46 
 
 		 322 aa  218  1e-55  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0221  lysophospholipase L2  38.02 
 
 		 331 aa  217  2e-55  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3961  lysophospholipase L2  37.06 
 
 		 345 aa  214  1.9999999999999998e-54  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0496396  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4049  lysophospholipase L2  37.22 
 
 		 340 aa  211  9e-54  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03704  lysophospholipase L(2)  37.22 
 
 		 340 aa  211  1e-53  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4154  Lysophospholipase  37.22 
 
 		 340 aa  211  1e-53  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4192  lysophospholipase L2  37.22 
 
 		 340 aa  211  1e-53  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00143921 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4346  lysophospholipase L2  37.22 
 
 		 340 aa  211  1e-53  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5266  lysophospholipase L2  37.22 
 
 		 340 aa  211  1e-53  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.308584 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03653  hypothetical protein  37.22 
 
 		 340 aa  211  1e-53  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4183  lysophospholipase L2  37.22 
 
 		 340 aa  211  1e-53  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.251713 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4292  lysophospholipase L2  37.22 
 
 		 340 aa  211  1e-53  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4151  lysophospholipase L2  36.1 
 
 		 345 aa  210  2e-53  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.000408546  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4384  lysophospholipase L2  37.88 
 
 		 334 aa  207  1e-52  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3290  alpha/beta hydrolase fold  39.21 
 
 		 364 aa  207  2e-52  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.255418 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4190  lysophospholipase L2  36.27 
 
 		 338 aa  205  9e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4169  lysophospholipase L2  36.27 
 
 		 338 aa  205  9e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4241  lysophospholipase L2  36.27 
 
 		 338 aa  205  9e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.194167  normal  0.797648 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4348  lysophospholipase L2  36.27 
 
 		 338 aa  205  9e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.904338  normal  0.869466 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4288  lysophospholipase L2  36.27 
 
 		 338 aa  204  1e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.605073  normal  0.224615 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3971  lysophospholipase L2  35.9 
 
 		 331 aa  202  4e-51  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.461737  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0196  lysophospholipase L2  36.1 
 
 		 330 aa  196  5.000000000000001e-49  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00636994  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1204  putative phospholipase  35.45 
 
 		 638 aa  194  2e-48  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0775  lysophospholipase L2  33.8 
 
 		 318 aa  157  2e-37  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.145213  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0871  alpha/beta hydrolase fold  37.29 
 
 		 314 aa  149  8e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.863233 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4534  alpha/beta hydrolase fold  36.61 
 
 		 314 aa  145  7.0000000000000006e-34  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0764  alpha/beta hydrolase fold  35.52 
 
 		 315 aa  142  5e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2819  alpha/beta hydrolase fold  34.46 
 
 		 315 aa  142  6e-33  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0540505  normal  0.169347 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2747  alpha/beta hydrolase fold  32.04 
 
 		 323 aa  140  3e-32  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.11769  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0956  alpha/beta hydrolase fold  34.14 
 
 		 314 aa  139  3.9999999999999997e-32  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2951  lysophospholipase  35.03 
 
 		 344 aa  139  7.999999999999999e-32  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1140  alpha/beta hydrolase fold  34.27 
 
 		 314 aa  137  2e-31  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1374  putative lysophospholipase L2, (lecithinase B)  35.52 
 
 		 315 aa  134  9.999999999999999e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.397005  normal  0.301111 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1981  alpha/beta hydrolase fold  33.58 
 
 		 303 aa  132  1.0000000000000001e-29  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.404656  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3641  lysophospholipase  35.4 
 
 		 333 aa  130  4.0000000000000003e-29  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.00212243  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3322  alpha/beta hydrolase fold  35.19 
 
 		 324 aa  129  7.000000000000001e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.694233 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4281  lysophospholipase  31.74 
 
 		 330 aa  129  8.000000000000001e-29  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0046  lysophospholipase L2, putative  32.31 
 
 		 331 aa  127  2.0000000000000002e-28  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0044  putative lysophospholipase L2  32.31 
 
 		 331 aa  127  3e-28  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0570  alpha/beta hydrolase fold  30.58 
 
 		 315 aa  124  2e-27  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0339831  hitchhiker  0.00000518617 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0780  alpha/beta hydrolase fold protein  32.34 
 
 		 314 aa  124  2e-27  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0399291  normal  0.0368265 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3621  Lysophospholipase  34.84 
 
 		 324 aa  121  9.999999999999999e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.121067  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3314  alpha/beta hydrolase  28.35 
 
 		 320 aa  121  9.999999999999999e-27  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.0011221  normal  0.0691996 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5017  alpha/beta hydrolase fold protein  35.23 
 
 		 330 aa  119  7.999999999999999e-26  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.122553  normal  0.0843943 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4557  alpha/beta hydrolase fold  35.23 
 
 		 330 aa  119  9e-26  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.225271  normal  0.0125982 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5072  alpha/beta hydrolase fold  33.57 
 
 		 329 aa  119  9e-26  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1727  alpha/beta hydrolase fold protein  33.8 
 
 		 333 aa  118  9.999999999999999e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3740  lysophospholipase  33.11 
 
 		 332 aa  116  5e-25  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.594037  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1188  putative lysophospholipase  29 
 
 		 329 aa  110  3e-23  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.273666  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1563  alpha/beta hydrolase fold  28.62 
 
 		 320 aa  109  6e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.202721  normal  0.40239 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2716  alpha/beta hydrolase fold  32.13 
 
 		 337 aa  108  1e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.112719  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1219  alpha/beta hydrolase fold  31.09 
 
 		 320 aa  108  1e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.903294  normal  0.362699 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1375  Lysophospholipase  30.8 
 
 		 363 aa  106  4e-22  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1114  alpha/beta hydrolase fold  30.07 
 
 		 347 aa  106  4e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1082  alpha/beta hydrolase fold  28.96 
 
 		 317 aa  105  1e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3878  alpha/beta hydrolase fold protein  30.74 
 
 		 345 aa  103  3e-21  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.31752 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1831  alpha/beta hydrolase fold  30.03 
 
 		 314 aa  103  5e-21  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.600925 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2418  putative esterase/lipase/thioesterase  29.45 
 
 		 317 aa  102  1e-20  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.473748  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0411  alpha/beta hydrolase fold  30.68 
 
 		 333 aa  96.3  6e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.026116 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1082  lysophospholipase L2  28.06 
 
 		 330 aa  95.5  1e-18  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2799  alpha/beta hydrolase fold  28.25 
 
 		 284 aa  89.7  7e-17  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.61266  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2956  alpha/beta hydrolase fold  27.08 
 
 		 277 aa  89.4  8e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2752  lysophospholipase L2, putative  27.67 
 
 		 355 aa  82.4  0.000000000000009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.319017  hitchhiker  0.00474393 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3693  alpha/beta hydrolase fold  26.19 
 
 		 288 aa  80.5  0.00000000000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.249037  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1387  alpha/beta hydrolase fold  29.12 
 
 		 275 aa  79  0.0000000000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.062595  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2772  alpha/beta hydrolase fold protein  28.67 
 
 		 263 aa  78.2  0.0000000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000235341  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0374  Acylglycerol lipase  27.95 
 
 		 279 aa  75.1  0.000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3430  alpha/beta hydrolase fold  25.78 
 
 		 267 aa  73.9  0.000000000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2528  alpha/beta hydrolase fold protein  25.26 
 
 		 327 aa  72  0.00000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.757367  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3544  alpha/beta hydrolase fold  27.96 
 
 		 317 aa  71.2  0.00000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.941882  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3712  alpha/beta hydrolase fold protein  26.33 
 
 		 290 aa  70.9  0.00000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1494  alpha/beta hydrolase fold  25.61 
 
 		 326 aa  70.9  0.00000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0365671  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2790  alpha/beta hydrolase fold protein  27.34 
 
 		 276 aa  70.9  0.00000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.067584  normal  0.84932 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_6038  alpha/beta hydrolase fold  24.83 
 
 		 294 aa  70.9  0.00000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1409  alpha/beta hydrolase fold protein  25.36 
 
 		 278 aa  69.7  0.00000000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.539385 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>