More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SO_4654 on replicon NC_004347
Organism: Shewanella oneidensis MR-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_004347  SO_4654  sulfate ABC transporter, permease protein  100 
 
 
283 aa  562  1e-159  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0731  sulfate ABC transporter, inner membrane subunit CysW  92.58 
 
 
283 aa  529  1e-149  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2959  sulfate ABC transporter, inner membrane subunit CysW  67.04 
 
 
297 aa  383  1e-105  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0125  ABC type transporter  63.74 
 
 
304 aa  362  3e-99  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  decreased coverage  3.64812e-05 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1222  sulfate ABC transporter, inner membrane subunit CysW  68.03 
 
 
326 aa  358  5e-98  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.917674  normal  0.204361 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1545  sulfate ABC transporter, inner membrane subunit CysW  64.44 
 
 
302 aa  355  7e-97  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1377  sulfate ABC transporter permease protein CysW  65.07 
 
 
305 aa  354  1e-96  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.370471  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2378  Sulfate ABC transporter, permease protein CysW  64.44 
 
 
339 aa  353  2e-96  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1346  putative sulfate transport ABC transporter protein  66.3 
 
 
326 aa  353  2e-96  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.525914  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1285  sulfate ABC transporter, inner membrane subunit CysW  65.7 
 
 
328 aa  352  3e-96  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.109375  normal  0.212711 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1969  sulphate transport system permease protein 2:Sulfate ABC transporter, permease protein CysW  64.58 
 
 
307 aa  351  6e-96  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2064  sulfate ABC transporter, inner membrane subunit CysW  66.67 
 
 
291 aa  350  1e-95  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.409607  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0610  Sulfate ABC transporter, permease protein CysW  62.27 
 
 
298 aa  344  1e-93  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1182  sulfate ABC transporter, permease protein  67.66 
 
 
295 aa  343  2e-93  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.27298  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1098  sulfate ABC transporter, inner membrane subunit CysW  62.87 
 
 
293 aa  343  2e-93  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3558  Sulfate ABC transporter, permease protein CysW  60.87 
 
 
292 aa  343  3e-93  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1640  sulfate ABC transporter, inner membrane subunit CysW  58.24 
 
 
319 aa  341  8e-93  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.259928  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3892  sulfate ABC transporter, inner membrane subunit CysW  65.06 
 
 
294 aa  341  9e-93  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.441604  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4588  sulfate ABC transporter, inner membrane subunit CysW  64.44 
 
 
335 aa  340  2e-92  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5391  sulfate ABC transporter permease protein CysW  63.14 
 
 
289 aa  337  1e-91  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.93873  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2074  sulfate ABC transporter, inner membrane subunit CysW  59.85 
 
 
277 aa  335  4e-91  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0230332  hitchhiker  6.41396e-23 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1521  sulfate ABC transporter, inner membrane subunit CysW  65.93 
 
 
303 aa  335  5e-91  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.561471  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2547  sulfate ABC transporter, inner membrane subunit CysW  65.93 
 
 
315 aa  333  2e-90  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.0126104 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2108  sulfate ABC transporter, inner membrane subunit CysW  62.36 
 
 
312 aa  332  5e-90  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.464713  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0558  sulfate ABC transporter, inner membrane subunit CysW  61.19 
 
 
300 aa  332  5e-90  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.501901 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3806  sulfate ABC transporter, inner membrane subunit CysW  65.2 
 
 
337 aa  331  8e-90  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.742669 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2533  sulfate ABC transporter, inner membrane subunit CysW  58.36 
 
 
294 aa  330  1e-89  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00678647  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2198  sulfate ABC transporter, inner membrane subunit CysW  63.04 
 
 
283 aa  330  2e-89  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.118309  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2336  sulfate ABC transporter, inner membrane subunit CysW  65.93 
 
 
303 aa  328  5e-89  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.131408  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1580  sulfate ABC transporter, inner membrane subunit CysW  62.55 
 
 
314 aa  328  6e-89  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.43573  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1123  Sulfate ABC transporter, permease protein CysW  62.55 
 
 
314 aa  328  6e-89  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1603  sulfate ABC transporter, inner membrane subunit CysW  62.55 
 
 
314 aa  328  6e-89  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1904  Sulfate ABC transporter, permease protein CysW  65.68 
 
 
278 aa  328  8e-89  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  1.47228e-07  hitchhiker  1.52704e-11 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0583  sulfate ABC transporter, inner membrane subunit CysW  61.45 
 
 
300 aa  327  2e-88  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.501211  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1775  sulfate ABC transporter, inner membrane subunit CysW  65.16 
 
 
350 aa  327  2e-88  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0521176  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0594  sulfate ABC transporter, inner membrane subunit CysW  61.45 
 
 
300 aa  326  3e-88  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.472245 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1047  sulfate ABC transporter, permease protein CysW  60.93 
 
 
306 aa  325  6e-88  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1348  sulfate ABC transporter, permease protein  66.3 
 
 
276 aa  325  6e-88  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1634  sulfate ABC transporter, inner membrane subunit CysW  64.53 
 
 
315 aa  325  6e-88  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4741  Sulfate ABC transporter, inner membrane subunit CysW  60.87 
 
 
316 aa  325  7e-88  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.00402264  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1127  sulfate ABC transporter, permease protein CysW  62.92 
 
 
285 aa  325  7e-88  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1198  sulfate ABC transporter, permease protein  62.92 
 
 
285 aa  324  8e-88  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1499  sulfate ABC transporter, inner membrane subunit CysW  64.1 
 
 
315 aa  324  9e-88  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.462658  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1519  sulfate ABC transporter, inner membrane subunit CysW  64.1 
 
 
315 aa  324  1e-87  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.172218  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4008  Sulfate ABC transporter, permease protein CysW  60.29 
 
 
298 aa  324  1e-87  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.627167 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2468  ABC sulfate/thiosulfate transporter, innermembrane subunit, CysW  64.75 
 
 
346 aa  323  2e-87  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.579343  normal  0.422444 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03670  sulfate transport protein CysW  60.46 
 
 
289 aa  321  9e-87  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0616363  hitchhiker  6.87295e-09 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1013  sulfate ABC transporter, inner membrane subunit CysW  62.5 
 
 
285 aa  320  2e-86  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.136311  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6975  sulfate/thiosulfate permease W  60.66 
 
 
301 aa  320  2e-86  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5076  sulfate ABC transporter, inner membrane subunit CysW  58.85 
 
 
290 aa  320  2e-86  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.10666  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0965  sulfate ABC transporter, inner membrane subunit CysW  66.05 
 
 
292 aa  319  3e-86  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0504  sulfate ABC transporter, permease protein CysW  65.43 
 
 
293 aa  319  3e-86  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2758  Sulfate ABC transporter, permease protein CysW  59.29 
 
 
289 aa  318  5e-86  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.680873 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3313  ABC transporter related protein  60.82 
 
 
283 aa  318  5e-86  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.857976  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1627  sulfate ABC transporter, inner membrane subunit CysW  63.32 
 
 
334 aa  318  9e-86  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.21378  normal  0.486831 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0293  sulfate ABC transporter, inner membrane subunit CysW  58.46 
 
 
290 aa  316  2e-85  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.500562 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5229  sulfate ABC transporter, inner membrane subunit CysW  58.46 
 
 
290 aa  316  2e-85  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.587413  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1158  Sulfate ABC transporter, permease protein CysW  60.81 
 
 
305 aa  315  5e-85  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.662915 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5169  sulfate ABC transporter, inner membrane subunit CysW  58.08 
 
 
290 aa  314  9e-85  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.635775 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1079  sulfate ABC transporter, inner membrane subunit CysW  64.68 
 
 
292 aa  314  1e-84  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.871457 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0623  sulfate ABC transporter, inner membrane subunit CysW  65.66 
 
 
302 aa  314  1e-84  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3691  sulphate transport system permease protein 2:Sulfate ABC transporter, permease protein CysW  60.22 
 
 
287 aa  314  1e-84  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1392  sulfate ABC transporter, inner membrane subunit CysW  60.97 
 
 
307 aa  313  3e-84  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.979503 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1760  Sulfate ABC transporter, permease protein CysW  62.96 
 
 
288 aa  312  4e-84  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.595537  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4116  sulfate ABC transporter, inner membrane subunit CysW  59.63 
 
 
286 aa  312  4e-84  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.943743  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3092  sulfate ABC transporter, inner membrane subunit CysW  53.07 
 
 
293 aa  311  5e-84  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2478  sulfate ABC transporter, permease protein  64.53 
 
 
340 aa  311  9e-84  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.251004  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0868  sulfate ABC transporter, inner membrane subunit CysW  61.11 
 
 
332 aa  310  2e-83  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1696  sulfate/thiosulfate ABC transporter, permease protein CysW  64.1 
 
 
352 aa  309  4e-83  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0434814  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0310  sulfate ABC transporter, permease protein CysW  56.92 
 
 
290 aa  308  4e-83  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0808  sulfate/thiosulfate ABC transporter, permease protein CysW  64.1 
 
 
352 aa  309  4e-83  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1849  sulfate/thiosulfate ABC transporter, permease protein CysW  64.1 
 
 
348 aa  309  4e-83  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2016  sulfate transport system permease protein  64.1 
 
 
344 aa  308  5e-83  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1207  sulfate ABC transporter, permease protein  64.1 
 
 
292 aa  308  5e-83  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0476312  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1863  sulfate/thiosulfate ABC transporter, permease protein CysW  64.1 
 
 
344 aa  308  5e-83  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.424992  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0352  sulfate/thiosulfate ABC transporter, permease protein CysW  64.1 
 
 
348 aa  308  6e-83  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.387041  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0082  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  56.92 
 
 
290 aa  307  1e-82  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.518926  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0372  sulfate transport protein CysW  60.84 
 
 
288 aa  305  5e-82  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4347  sulfate ABC transporter, inner membrane subunit CysW  60.92 
 
 
290 aa  304  1e-81  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6757  sulfate ABC transporter, inner membrane subunit CysW  65.42 
 
 
290 aa  303  2e-81  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.52576  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1738  sulfate ABC transporter, inner membrane subunit CysW  61.57 
 
 
293 aa  303  3e-81  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1185  sulfate ABC transporter, inner membrane subunit CysW  54.98 
 
 
293 aa  300  1e-80  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3402  sulfate ABC transporter, permease protein CysW  62.29 
 
 
297 aa  300  1e-80  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0309805  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5845  sulfate ABC transporter, inner membrane subunit CysW  65.89 
 
 
290 aa  301  1e-80  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.35985  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_31740  sulfate ABC transporter, permease protein CysW  61.47 
 
 
290 aa  300  2e-80  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1797  sulfate ABC transporter, inner membrane subunit CysW  61.98 
 
 
292 aa  300  2e-80  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0541213  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0122  sulfate ABC transporter, inner membrane subunit CysW  60.43 
 
 
294 aa  300  3e-80  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1135  sulfate ABC transporter, inner membrane subunit CysW  54.84 
 
 
312 aa  299  4e-80  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1554  Sulfate ABC transporter, permease protein CysW  54.33 
 
 
289 aa  298  7e-80  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2194  sulfate ABC transporter, inner membrane subunit CysW  61.51 
 
 
286 aa  297  1e-79  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.908554  normal  0.306467 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0106  sulfate ABC transporter, permease protein CysW  58.74 
 
 
288 aa  296  3e-79  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0196  Sulfate ABC transporter, permease protein CysW  56.54 
 
 
290 aa  296  4e-79  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1388  Sulfate ABC transporter, permease protein CysW  56.05 
 
 
310 aa  295  6e-79  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1046  sulfate ABC transporter, inner membrane subunit CysW  59.09 
 
 
294 aa  295  6e-79  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0109  sulfate ABC transporter, permease protein  58.74 
 
 
288 aa  294  9e-79  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5477  sulfate ABC transporter, inner membrane subunit CysW  62.5 
 
 
285 aa  293  2e-78  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.265729  normal  0.0160657 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2258  sulfate ABC transporter, inner membrane subunit CysW  65.25 
 
 
306 aa  293  2e-78  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.623956  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2801  sulfate ABC transporter, inner membrane subunit CysW  57.83 
 
 
294 aa  293  3e-78  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0620  sulfate ABC transporter, inner membrane subunit CysW  58.3 
 
 
319 aa  292  5e-78  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.242055  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1073  ABC sulfate/thiosulfate transporter, inner membrane subunit CysW  55.65 
 
 
310 aa  291  8e-78  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0403376  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>