287 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SO_4615 on replicon NC_004347
Organism: Shewanella oneidensis MR-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004347  SO_4615  SCO1/SenC family protein  100 
 
 		 213 aa  435  1e-121  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3800  electron transport protein SCO1/SenC  86.85 
 
 		 219 aa  387  1e-107  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3873  electron transport protein SCO1/SenC  86.85 
 
 		 219 aa  387  1e-107  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3999  electron transport protein SCO1/SenC  86.38 
 
 		 219 aa  385  1e-106  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4189  electron transport protein SCO1/SenC  83.96 
 
 		 210 aa  369  1e-101  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0146  electron transport protein SCO1/SenC  83.49 
 
 		 210 aa  367  1e-101  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4320  electron transport protein SCO1/SenC  83.49 
 
 		 210 aa  368  1e-101  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4121  electron transport protein SCO1/SenC  83.49 
 
 		 210 aa  368  1e-101  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3790  electron transport protein SCO1/SenC  80.42 
 
 		 210 aa  328  4e-89  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0169  electron transport protein SCO1/SenC  55.66 
 
 		 214 aa  244  9e-64  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0249  electron transport protein SCO1/SenC  54.41 
 
 		 204 aa  237  1e-61  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0189  electron transport protein SCO1/SenC  52.11 
 
 		 218 aa  235  3e-61  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0116  electron transport protein SCO1/SenC  55.83 
 
 		 211 aa  231  9e-60  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4007  electron transport protein SCO1/SenC  50.49 
 
 		 209 aa  229  3e-59  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.612084  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3525  electron transport protein SCO1/SenC  51.2 
 
 		 217 aa  223  2e-57  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3492  electron transport protein SCO1/SenC  49.29 
 
 		 211 aa  209  2e-53  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.1904 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0228  SCO1/SenC family protein  38.84 
 
 		 222 aa  162  4.0000000000000004e-39  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0515497  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04004  uncharacterized secreted protein of SCO1/SenC/PrrC family  38.6 
 
 		 214 aa  157  8e-38  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4237  electron transport protein SCO1/SenC  44.44 
 
 		 212 aa  157  1e-37  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1235  hypothetical protein  41.87 
 
 		 226 aa  154  1e-36  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.392676  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0865  electron transport protein SCO1/SenC  40.11 
 
 		 207 aa  138  7.999999999999999e-32  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0109  electron transport protein SCO1/SenC  42.58 
 
 		 212 aa  132  3e-30  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.157437  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00930  Electron transport protein SCO1/SenC  38.92 
 
 		 211 aa  122  4e-27  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.330102  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1191  SCO1/SenC family protein  35.32 
 
 		 220 aa  119  3e-26  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0364424  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0045  GGDEF  35.94 
 
 		 219 aa  118  7.999999999999999e-26  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.986314 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1973  electron transport protein SCO1/SenC  37.41 
 
 		 239 aa  111  1.0000000000000001e-23  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.00159059  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4652  electron transport protein SCO1/SenC  41.67 
 
 		 197 aa  109  3e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.753044  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5259  Sco1/SenC family protein  32.07 
 
 		 210 aa  108  5e-23  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0151  electron transport protein SCO1/SenC  37.32 
 
 		 210 aa  108  6e-23  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0111  electron transport protein SCO1/SenC  36.36 
 
 		 210 aa  107  1e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.00321796  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0128  electron transport protein SCO1/SenC  36.36 
 
 		 210 aa  107  1e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0284  electron transport protein SCO1/SenC  36.62 
 
 		 210 aa  107  1e-22  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01390  hypothetical protein  36.67 
 
 		 211 aa  107  2e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0480  hypothetical protein  34.05 
 
 		 213 aa  105  3e-22  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0131  electron transport protein SCO1/SenC  36.36 
 
 		 210 aa  105  4e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.801805  normal  0.912872 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0126  electron transport protein SCO1/SenC  36.18 
 
 		 210 aa  104  8e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.12558  normal  0.034967 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0189  hypothetical protein  36.67 
 
 		 211 aa  104  1e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2400  electron transport protein SCO1/SenC  39.86 
 
 		 211 aa  103  2e-21  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0456  hypothetical protein  33.51 
 
 		 213 aa  103  2e-21  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0014  Classical-complement-pathway C3/C5 convertase  35.83 
 
 		 203 aa  103  2e-21  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.143116  hitchhiker  0.00194121 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3360  electron transport protein SCO1/SenC  37.14 
 
 		 210 aa  101  9e-21  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0070  electron transport protein SCO1/SenC  34.52 
 
 		 211 aa  100  1e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0135  electron transport protein SCO1/SenC  37.5 
 
 		 197 aa  96.7  2e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1577  electron transport protein SCO1/SenC  41.74 
 
 		 200 aa  97.1  2e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01258  SCO1/SenC superfamily  34.64 
 
 		 216 aa  96.7  2e-19  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2858  electron transport protein SCO1/SenC  33.77 
 
 		 216 aa  96.3  3e-19  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1565  electron transport protein SCO1/SenC  42.11 
 
 		 208 aa  95.5  5e-19  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000402596  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2426  electron transport protein SCO1/SenC  34.9 
 
 		 221 aa  94.7  8e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0897177  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0042  electron transport protein SCO1/SenC  33.15 
 
 		 215 aa  95.1  8e-19  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1066  electron transport protein SCO1/SenC  33.93 
 
 		 224 aa  94.4  1e-18  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.262024  normal  0.435541 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2918  electron transport protein SCO1/SenC  38.17 
 
 		 213 aa  93.6  2e-18  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00907715  normal  1 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3956  electron transport protein SCO1/SenC  34.33 
 
 		 208 aa  93.2  2e-18  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0454728  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3618  electron transport protein SCO1/SenC  34.33 
 
 		 208 aa  93.2  2e-18  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0565663  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2379  electron transport protein SCO1/SenC  37.96 
 
 		 204 aa  93.2  3e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.778887  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1389  electron transport protein SCO1/SenC  32.82 
 
 		 206 aa  92.4  4e-18  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.324761  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2982  electron transport protein SCO1/SenC  30 
 
 		 197 aa  92.4  4e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0335697  hitchhiker  0.000767579 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0888  electron transport protein SCO1/SenC  31.31 
 
 		 210 aa  92.8  4e-18  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.147718  normal  1 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_57701  Putative cytochrome C oxidase assembly protein  34.44 
 
 		 297 aa  91.7  7e-18  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0857845  normal  0.0569846 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3526  electron transport protein SCO1/SenC  30.1 
 
 		 203 aa  91.7  7e-18  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.23458  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0628  electron transport protein SCO1/SenC  36.62 
 
 		 191 aa  91.7  7e-18  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000013207  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3662  electron transport protein SCO1/SenC  30.07 
 
 		 209 aa  91.3  9e-18  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.392982  normal  0.146749 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0514  electron transport protein SCO1/SenC  34.53 
 
 		 219 aa  91.3  9e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2625  electron transport protein SCO1/SenC  41.82 
 
 		 204 aa  90.9  1e-17  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00219906  normal  1 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04842  copper-binding protein of the mitochondrial inner membrane (Eurofung)  33.33 
 
 		 287 aa  90.1  2e-17  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3419  electron transport protein SCO1/SenC  35.25 
 
 		 196 aa  90.5  2e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1992  electron transport protein SCO1/SenC  31.36 
 
 		 220 aa  90.1  2e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3172  putative lipoprotein  34.05 
 
 		 198 aa  89.7  3e-17  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0416881  normal  0.34002 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3080  hypothetical protein  32.67 
 
 		 310 aa  89.4  4e-17  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2820  electron transport protein SCO1/SenC  31.47 
 
 		 206 aa  89  4e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.439098  normal  0.0955603 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4131  electron transport protein SCO1/SenC  33.93 
 
 		 197 aa  89  4e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.229515  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0997  electron transport protein SCO1/SenC  34.31 
 
 		 199 aa  88.6  7e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.995366  normal  0.775153 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2858  cytochrome c oxidase assembly factor transmembrane protein  34.1 
 
 		 199 aa  88.2  8e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3279  electron transport protein SCO1/SenC  33.15 
 
 		 211 aa  87.4  1e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.508145  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1472  electron transport protein SCO1/SenC  35.66 
 
 		 192 aa  87.8  1e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0337  putative SCO1/SenC family protein  36.15 
 
 		 197 aa  87.8  1e-16  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.769347  normal  0.0226866 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1393  electron transport protein SCO1/SenC  35 
 
 		 210 aa  87.8  1e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.210991  normal  0.211501 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1998  electron transport protein SCO1/SenC  36.03 
 
 		 221 aa  87  2e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2849  electron transport protein SCO1/SenC  30.53 
 
 		 187 aa  87  2e-16  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5935  electron transport protein SCO1/SenC  34.39 
 
 		 215 aa  86.7  2e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0192  electron transport protein SCO1/SenC  36.15 
 
 		 205 aa  86.3  3e-16  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3622  electron transport protein SCO1/SenC  42.71 
 
 		 200 aa  86.3  3e-16  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.847452  normal  1 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3960  electron transport protein SCO1/SenC  42.71 
 
 		 200 aa  86.3  3e-16  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.105512  n/a   
 
 
-
 
NC_009373  OSTLU_42287  predicted protein  31.17 
 
 		 291 aa  86.3  3e-16  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1892  electron transport protein SCO1/SenC  31.79 
 
 		 202 aa  86.7  3e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006693  CNH02680  h-sco1, putative  32.05 
 
 		 286 aa  85.9  4e-16  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.648737  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0229  electron transport protein SCO1/SenC  34.46 
 
 		 203 aa  85.9  4e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3423  electron transport protein SCO1/SenC  38.28 
 
 		 198 aa  85.5  5e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.118762 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3224  electron transport protein SCO1/SenC  33.61 
 
 		 226 aa  85.1  6e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.533734  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0071  electron transport protein SCO1/SenC  28.22 
 
 		 218 aa  85.5  6e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.420398  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3205  electron transport protein SCO1/SenC  32.3 
 
 		 206 aa  85.5  6e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0248  electron transport protein SCO1/SenC  34.46 
 
 		 203 aa  85.5  6e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0520152 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3548  electron transport protein SCO1/SenC  33.61 
 
 		 200 aa  85.5  6e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.230336  normal  0.675478 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1061  electron transport protein SCO1/SenC  34.11 
 
 		 201 aa  85.1  7e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.099105  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2379  electron transport protein SCO1/SenC  31.58 
 
 		 223 aa  84  0.000000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.229264  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3791  electron transport protein SCO1/SenC  36.23 
 
 		 264 aa  84.3  0.000000000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1986  electron transport protein SCO1/SenC  31.58 
 
 		 202 aa  84  0.000000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.963654 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3316  electron transport protein SCO1/SenC  31.58 
 
 		 223 aa  84  0.000000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.189227 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3431  regulatory protein SenC  31.95 
 
 		 206 aa  84.3  0.000000000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03961  conserved hypothetical protein  36.96 
 
 		 706 aa  83.6  0.000000000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.5989  normal  0.49745 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0787  putative electron transport protein  33.33 
 
 		 197 aa  84  0.000000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00305145 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>