242 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SO_4465 on replicon NC_004347
Organism: Shewanella oneidensis MR-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012918  GM21_0053  protein of unknown function DUF323  54.47 
 
 
701 aa  783    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000456443 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0605  hypothetical protein  52.13 
 
 
747 aa  757    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4465  hypothetical protein  100 
 
 
699 aa  1462    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0416  protein of unknown function DUF323  53.36 
 
 
702 aa  756    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.592351  hitchhiker  0.000236625 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0271  protein of unknown function DUF323  86.33 
 
 
704 aa  1271    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1078  protein of unknown function DUF323  54.75 
 
 
700 aa  785    Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1543  hypothetical protein  55.35 
 
 
709 aa  769    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0477  hypothetical protein  49.5 
 
 
701 aa  718    Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2257  hypothetical protein  56.47 
 
 
726 aa  792    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3577  protein of unknown function DUF323  52.54 
 
 
727 aa  759    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.296354  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0055  protein of unknown function DUF323  55.19 
 
 
701 aa  785    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3663  hypothetical protein  53.29 
 
 
722 aa  776    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.793757  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0017  hypothetical protein  55.17 
 
 
702 aa  796    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0264  hypothetical protein  90.84 
 
 
699 aa  1335    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000755342 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3757  hypothetical protein  91.85 
 
 
699 aa  1353    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.62382  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0275  hypothetical protein  86.62 
 
 
704 aa  1270    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0265  hypothetical protein  91.42 
 
 
699 aa  1347    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000228556 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0267  hypothetical protein  86.62 
 
 
704 aa  1270    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3422  hypothetical protein  73.43 
 
 
709 aa  1089    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.813696  normal  0.647593 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2592  hypothetical protein  53.23 
 
 
703 aa  775    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.249838 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0386  hypothetical protein  55.44 
 
 
716 aa  790    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.172977  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0240  hypothetical protein  53.36 
 
 
702 aa  756    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0381  hypothetical protein  86.04 
 
 
705 aa  1265    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1749  protein of unknown function DUF323  51.64 
 
 
696 aa  728    Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0275  hypothetical protein  86.33 
 
 
704 aa  1269    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.171892  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2978  protein of unknown function DUF323  53.26 
 
 
553 aa  608  9.999999999999999e-173  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_44876  predicted protein  37.93 
 
 
933 aa  494  9.999999999999999e-139  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0090  hypothetical protein  41.14 
 
 
449 aa  347  3e-94  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.841072 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3409  hypothetical protein  39.33 
 
 
455 aa  315  2.9999999999999996e-84  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0361  methyltransferase type 12  52.48 
 
 
252 aa  254  4.0000000000000004e-66  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2910  methyltransferase type 11  46.28 
 
 
252 aa  232  2e-59  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4432  hypothetical protein  29.77 
 
 
430 aa  189  2e-46  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4271  protein of unknown function DUF323  28.41 
 
 
439 aa  182  2e-44  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.728513  normal  0.506774 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0605  hypothetical protein  28.9 
 
 
447 aa  181  2.9999999999999997e-44  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.396702 
 
 
-
 
NC_006679  CNJ01670  conserved hypothetical protein  26.81 
 
 
1020 aa  142  9.999999999999999e-33  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.840484  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1747  Methyltransferase type 11  33.85 
 
 
280 aa  123  9.999999999999999e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.044533  normal  0.0419558 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4693  protein of unknown function DUF323  27.84 
 
 
446 aa  105  4e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.522761 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4280  hypothetical protein  26.7 
 
 
412 aa  104  5e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3640  protein of unknown function DUF323  27.19 
 
 
442 aa  103  9e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.530686  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2548  methyltransferase  26.17 
 
 
766 aa  103  1e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0331  hypothetical protein  25.11 
 
 
433 aa  102  3e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.188129  normal  0.943613 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1589  hypothetical protein  25.66 
 
 
429 aa  101  5e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0217234  normal  0.353044 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1511  hypothetical protein  25.98 
 
 
432 aa  100  7e-20  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.92317  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22460  conserved hypothetical protein TIGR03440  27.68 
 
 
468 aa  100  8e-20  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.599861 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0564  hypothetical protein  25.49 
 
 
424 aa  100  1e-19  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1440  hypothetical protein  24.71 
 
 
429 aa  99.8  2e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2029  hypothetical protein  24.64 
 
 
437 aa  99  2e-19  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0638  protein of unknown function DUF323  27.35 
 
 
446 aa  99.8  2e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.749121 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2380  protein of unknown function DUF323  27.03 
 
 
417 aa  97.4  8e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0687  hypothetical protein  25 
 
 
437 aa  97.4  8e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2434  hypothetical protein  27.27 
 
 
425 aa  96.7  1e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2650  hypothetical protein  26.79 
 
 
439 aa  96.7  1e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.112589  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3177  protein of unknown function DUF323  25.71 
 
 
416 aa  95.5  3e-18  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6100  protein of unknown function DUF323  30 
 
 
398 aa  95.5  3e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.877105  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4037  hypothetical protein  25.89 
 
 
427 aa  95.1  4e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7301  hypothetical protein  26.87 
 
 
506 aa  94.7  4e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0388032 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2940  Non-specific serine/threonine protein kinase  25.71 
 
 
416 aa  94.7  5e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.279621  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1619  hypothetical protein  25.9 
 
 
398 aa  94  8e-18  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.302981  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0657  hypothetical protein  22.13 
 
 
436 aa  92.4  2e-17  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.568956 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3454  hypothetical protein  25.64 
 
 
444 aa  92.4  2e-17  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2123  protein of unknown function DUF323  28.37 
 
 
442 aa  92  3e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2475  protein of unknown function DUF323  26.21 
 
 
385 aa  90.1  1e-16  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1461  protein of unknown function DUF323  24.71 
 
 
434 aa  88.6  3e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.851366  normal  0.0136368 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4834  hypothetical protein  26.11 
 
 
430 aa  88.6  4e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2054  protein of unknown function DUF323  28.29 
 
 
416 aa  88.2  4e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.254941  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1725  hypothetical protein  27.33 
 
 
409 aa  88.6  4e-16  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000255242 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2836  hypothetical protein  28.17 
 
 
423 aa  87  0.000000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3833  hypothetical protein  28.42 
 
 
395 aa  87  0.000000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.219039  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19140  hypothetical protein  24.23 
 
 
425 aa  86.3  0.000000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.500437  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4964  protein of unknown function DUF323  24.78 
 
 
383 aa  86.3  0.000000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.24016  normal  0.238732 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2445  hypothetical protein  25.55 
 
 
427 aa  86.3  0.000000000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1886  Methyltransferase type 11  30.99 
 
 
313 aa  85.5  0.000000000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000470548  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1081  protein of unknown function DUF323  27.37 
 
 
447 aa  85.5  0.000000000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4512  hypothetical protein  26.65 
 
 
487 aa  85.5  0.000000000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.720233  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5169  hypothetical protein  28.74 
 
 
437 aa  85.9  0.000000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1789  hypothetical protein  23.46 
 
 
434 aa  85.1  0.000000000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.078937 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1420  protein of unknown function DUF323  24.42 
 
 
434 aa  84.7  0.000000000000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.350616 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4563  hypothetical protein  24.42 
 
 
432 aa  84.7  0.000000000000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.51165  normal  0.286886 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0785  hypothetical protein  25.87 
 
 
428 aa  84  0.000000000000008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.449509  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1022  hypothetical protein  27.04 
 
 
386 aa  83.6  0.00000000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00177871 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1251  protein of unknown function DUF323  24.56 
 
 
385 aa  82.8  0.00000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.499599  normal  0.335829 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4881  hypothetical protein  25.12 
 
 
436 aa  80.9  0.00000000000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.546495  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4970  hypothetical protein  25.12 
 
 
436 aa  80.9  0.00000000000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5249  hypothetical protein  25.12 
 
 
436 aa  80.9  0.00000000000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0611  protein of unknown function DUF323  24.56 
 
 
425 aa  80.1  0.0000000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6244  Methyltransferase type 11  29.69 
 
 
326 aa  80.1  0.0000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.099736  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0997  hypothetical protein  27.11 
 
 
430 aa  80.1  0.0000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0142804  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3265  hypothetical protein  25.26 
 
 
437 aa  80.1  0.0000000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.618561  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0115  hypothetical protein  25.79 
 
 
386 aa  79.3  0.0000000000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.280848  normal  0.0377747 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2565  hypothetical protein  28.07 
 
 
418 aa  79.3  0.0000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0900  hypothetical protein  27.01 
 
 
313 aa  78.6  0.0000000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2572  hypothetical protein  28.65 
 
 
313 aa  79  0.0000000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.134075  normal  0.851171 
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_33230  predicted protein  29.7 
 
 
303 aa  79  0.0000000000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  decreased coverage  0.0061924  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8029  protein of unknown function DUF323  27.51 
 
 
446 aa  78.6  0.0000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.217933  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1640  hypothetical protein  26.05 
 
 
433 aa  78.6  0.0000000000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.923068  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1598  hypothetical protein  24.62 
 
 
419 aa  78.2  0.0000000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.785472  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1281  hypothetical protein  25.07 
 
 
428 aa  77.8  0.0000000000006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1245  methyltransferase type 11  28.57 
 
 
322 aa  77.8  0.0000000000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.240532  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2927  hypothetical protein  24.08 
 
 
437 aa  77.4  0.0000000000007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3535  hypothetical protein  26.36 
 
 
438 aa  77.4  0.0000000000008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>