More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SO_4423.1 on replicon NC_004347
Organism: Shewanella oneidensis MR-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004347  SO_4423.1  ferric aerobactin receptor  100 
 
 		 332 aa  689    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0286  TonB-dependent receptor  92.64 
 
 		 723 aa  628  1e-179  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000335146  unclonable  0.000000000154672 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3733  TonB-dependent receptor  92.64 
 
 		 723 aa  626  1e-178  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000345554  unclonable  0.000038397 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0286  TonB-dependent receptor  92.02 
 
 		 723 aa  625  1e-178  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.00000746849  unclonable  0.000000000233468 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0401  TonB-dependent receptor  88.04 
 
 		 723 aa  610  9.999999999999999e-175  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.000000584805  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0291  TonB-dependent receptor  88.99 
 
 		 725 aa  591  1e-168  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000897487  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0299  TonB-dependent receptor  88.99 
 
 		 725 aa  592  1e-168  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.00020356  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0303  TonB-dependent receptor  88.99 
 
 		 725 aa  592  1e-168  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00017573  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0298  TonB-dependent receptor  88.99 
 
 		 725 aa  591  1e-168  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000594671  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0977  TonB-dependent receptor  77.68 
 
 		 718 aa  524  1e-148  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1522  TonB-dependent receptor  42.99 
 
 		 701 aa  268  1e-70  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2941  TonB-dependent receptor  42.06 
 
 		 701 aa  261  1e-68  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.80569  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2678  TonB-dependent receptor  42.06 
 
 		 704 aa  250  2e-65  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00160385  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1044  TonB-dependent receptor  39.57 
 
 		 721 aa  248  9e-65  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06011  hypothetical protein  42.17 
 
 		 713 aa  244  1.9999999999999999e-63  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0468  TonB-dependent receptor  40.3 
 
 		 700 aa  237  2e-61  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2145  TonB-dependent receptor  39.8 
 
 		 809 aa  214  9.999999999999999e-55  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.085277  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3918  TonB-dependent receptor  34.74 
 
 		 728 aa  197  3e-49  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.665207  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0029  TonB-dependent receptor  35.79 
 
 		 716 aa  194  2e-48  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.241491  normal  0.0713753 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4213  putative ferric aerobactin receptor  34.5 
 
 		 721 aa  187  2e-46  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1688  TonB-dependent receptor  34.82 
 
 		 710 aa  177  3e-43  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.00738992  normal  0.0180451 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2402  TonB-dependent receptor, plug  35.78 
 
 		 724 aa  166  4e-40  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.000227129  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1496  TonB-dependent receptor  35.89 
 
 		 716 aa  166  4e-40  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1430  TonB-dependent receptor  33.02 
 
 		 738 aa  164  2.0000000000000002e-39  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0763  TonB-dependent receptor plug  32.66 
 
 		 783 aa  160  2e-38  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.945699  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2840  TonB-dependent siderophore receptor  34.58 
 
 		 849 aa  154  2e-36  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.0000068938  normal  0.338102 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2885  histidine kinase  34.1 
 
 		 704 aa  151  2e-35  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00000018886  decreased coverage  0.000177766 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0392  TonB-dependent receptor, plug  33.45 
 
 		 717 aa  150  3e-35  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.829697  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46640  siderophore receptor  31.96 
 
 		 813 aa  149  5e-35  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.010692  hitchhiker  0.000000903307 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4019  siderophore receptor  33.45 
 
 		 816 aa  149  6e-35  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.752702  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1394  TonB-dependent receptor, plug  36.07 
 
 		 713 aa  147  3e-34  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.0833322 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1118  TonB-dependent siderophore receptor  29.69 
 
 		 839 aa  143  5e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.220964  normal  0.940906 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1820  TonB-dependent receptor  32.52 
 
 		 697 aa  137  4e-31  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.0000291802  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0558  TonB-dependent receptor plug  32.21 
 
 		 817 aa  132  1.0000000000000001e-29  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00000000727933  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5381  putative TonB-dependent receptor  31 
 
 		 764 aa  130  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61850  putative TonB-dependent receptor  31.33 
 
 		 742 aa  131  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00865386 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0587  TonB-dependent receptor  31.06 
 
 		 753 aa  130  2.0000000000000002e-29  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.210295 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0075  TonB-dependent receptor  32.09 
 
 		 751 aa  130  3e-29  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.612436  normal  0.5792 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3260  TonB-dependent receptor  29.54 
 
 		 739 aa  129  7.000000000000001e-29  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0582  TonB-dependent receptor, plug  28.53 
 
 		 709 aa  127  3e-28  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.000000470025  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01762  hypothetical protein  32.41 
 
 		 714 aa  127  4.0000000000000003e-28  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5892  TonB-dependent siderophore receptor  31.53 
 
 		 843 aa  125  8.000000000000001e-28  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0279  ferric aerobactin receptor precursor  32.96 
 
 		 723 aa  123  4e-27  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.652222  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0951  TonB-dependent siderophore receptor  28.61 
 
 		 732 aa  121  1.9999999999999998e-26  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000078  aerobactin siderophore receptor iutA  29.06 
 
 		 723 aa  120  3e-26  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.709087  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4630  ferric aerobactin receptor IutA  30 
 
 		 732 aa  120  3e-26  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3089  TonB-dependent receptor  29.37 
 
 		 758 aa  119  7e-26  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.329983  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1056  TonB-dependent receptor  28.43 
 
 		 698 aa  117  1.9999999999999998e-25  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0304  TonB-dependent siderophore receptor  28.35 
 
 		 745 aa  115  1.0000000000000001e-24  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0244305  normal  0.816396 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0299  TonB-dependent siderophore receptor  28.05 
 
 		 745 aa  115  1.0000000000000001e-24  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.00000445581  hitchhiker  0.000163743 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3720  TonB-dependent siderophore receptor  29.1 
 
 		 745 aa  114  2.0000000000000002e-24  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.00118596  normal  0.0278628 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3544  TonB-dependent siderophore receptor  34.93 
 
 		 808 aa  113  5e-24  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3178  ferric aerobactin receptor IutA  28.12 
 
 		 733 aa  112  8.000000000000001e-24  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.911837 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2193  TonB-dependent siderophore receptor  34.5 
 
 		 817 aa  112  9e-24  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.819603  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1817  TonB-dependent siderophore receptor  34.06 
 
 		 808 aa  111  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.673878  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0587  hemin uptake system outer membrane receptor  30.6 
 
 		 771 aa  106  5e-22  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.75575  normal  0.678568 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1106  TonB-dependent receptor, plug  26.94 
 
 		 755 aa  101  2e-20  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0918  TonB-dependent siderophore receptor  27.61 
 
 		 746 aa  101  2e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0782  TonB-dependent siderophore receptor  28.47 
 
 		 726 aa  100  5e-20  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0710  TonB-dependent siderophore receptor  28.47 
 
 		 726 aa  98.6  1e-19  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0194  TonB-dependent siderophore receptor  28.47 
 
 		 726 aa  95.9  8e-19  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0233266 
 
 
-
 
NC_003296  RS00873  ferric siderophore receptor outer membrane signal peptide protein  25.8 
 
 		 812 aa  94.4  3e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.193176  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2469  TonB-dependent receptor  30.3 
 
 		 891 aa  77.4  0.0000000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1237  TonB-dependent receptor  33.95 
 
 		 736 aa  76.3  0.0000000000008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3327  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  29.21 
 
 		 688 aa  75.5  0.000000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0926253  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3717  TonB-dependent siderophore receptor  34.78 
 
 		 726 aa  72.8  0.000000000007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3675  TonB-dependent receptor  30.25 
 
 		 737 aa  70.1  0.00000000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0831004  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3064  TonB-dependent siderophore receptor  32.4 
 
 		 712 aa  69.3  0.00000000008  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1105  TonB-dependent haemoglobin/transferrin/lactoferrin receptor:TonB-dependent haem/haemoglobin receptor  26.57 
 
 		 859 aa  67.8  0.0000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1315  TonB-dependent receptor plug  29.51 
 
 		 821 aa  66.6  0.0000000006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.0000529097  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1342  TonB-dependent receptor plug  29.51 
 
 		 820 aa  66.2  0.0000000006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00424571  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3044  TonB-dependent receptor plug  29.51 
 
 		 821 aa  66.2  0.0000000007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.00000527887  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1306  TonB-dependent receptor plug  29.51 
 
 		 820 aa  66.2  0.0000000007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00000196501  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1237  TonB-dependent receptor, plug  30.34 
 
 		 814 aa  65.9  0.0000000008  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.115199  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1206  putative TonB-dependent receptor  28.99 
 
 		 688 aa  65.9  0.0000000009  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4004  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  26.74 
 
 		 681 aa  65.5  0.000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.371484 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1493  putative TonB-dependent receptor  30.41 
 
 		 697 aa  64.7  0.000000002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.404893  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4379  TonB-dependent haemoglobin/transferrin/lactoferrin receptor  24.57 
 
 		 861 aa  64.7  0.000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.237409 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1741  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  29.46 
 
 		 661 aa  65.1  0.000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  unclonable  0.0000016514  normal  0.0458944 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3503  enterobactin receptor protein  29.52 
 
 		 666 aa  64.7  0.000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.00217636  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3338  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  29.59 
 
 		 696 aa  64.7  0.000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.000000719833  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62350  putative haem/haemoglobin uptake outer membrane receptor PhuR precursor  26.18 
 
 		 764 aa  64.3  0.000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0936  TonB-dependent receptor  31.55 
 
 		 750 aa  63.9  0.000000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05789  hypothetical protein  26.32 
 
 		 712 aa  63.9  0.000000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0492  TonB-dependent receptor  30.26 
 
 		 762 aa  63.9  0.000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.23992 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0471  TonB-dependent receptor, putative, degenerate  31.98 
 
 		 704 aa  63.9  0.000000004  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5070  TonB-dependent hemoglobin/transferrin/lactoferrin family receptor  22.93 
 
 		 762 aa  63.5  0.000000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.565094  normal  0.157746 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5426  outer membrane hemin receptor  25.82 
 
 		 764 aa  63.5  0.000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3043  TonB-dependent siderophore receptor  34.64 
 
 		 746 aa  63.2  0.000000006  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0305175  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0778  TonB-dependent receptor  29.94 
 
 		 742 aa  63.2  0.000000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1006  TonB-dependent hemoglobin/transferrin/lactoferrin family receptor  26.25 
 
 		 759 aa  62.8  0.000000008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0249  TonB-dependent receptor  31.93 
 
 		 688 aa  62.8  0.000000009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00550  iron-enterobactin outer membrane transporter  34.08 
 
 		 746 aa  62  0.00000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.0000104738  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0602  outer membrane receptor FepA  34.08 
 
 		 746 aa  62.4  0.00000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4241  enterobactin receptor protein  29.73 
 
 		 666 aa  62  0.00000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0112255  hitchhiker  0.000515179 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0540  TonB-dependent siderophore receptor  30.98 
 
 		 718 aa  62  0.00000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0667  outer membrane receptor FepA  34.08 
 
 		 746 aa  62.4  0.00000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1859  TonB-dependent receptor plug  28.76 
 
 		 686 aa  62  0.00000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.00000014407  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0603  outer membrane receptor FepA  34.08 
 
 		 746 aa  62.4  0.00000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2944  TonB-dependent receptor  27.17 
 
 		 823 aa  62  0.00000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.0000178601  normal  0.742035 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>