144 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SO_4360 on replicon NC_004347
Organism: Shewanella oneidensis MR-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004347  SO_4360  decaheme cytochrome c  100 
 
 		 304 aa  624  1e-178  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3126  cytochrome C family protein  49.68 
 
 		 333 aa  315  5e-85  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00631921  hitchhiker  0.0000243395 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2526  cytochrome C family protein  48.92 
 
 		 329 aa  313  2.9999999999999996e-84  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2149  cytochrome c family protein  49.17 
 
 		 304 aa  311  1e-83  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0950345  normal  0.491991 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2766  cytochrome C family protein  49.7 
 
 		 333 aa  310  2e-83  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0218266  hitchhiker  0.000000422231 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1577  cytochrome C family protein  49.7 
 
 		 333 aa  310  2e-83  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000354628  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1611  cytochrome C family protein  49.7 
 
 		 333 aa  310  2e-83  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.173927  normal  0.248798 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2511  cytochrome C family protein  49.84 
 
 		 329 aa  310  2.9999999999999997e-83  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.115309  hitchhiker  0.00672893 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2677  cytochrome C family protein  49.84 
 
 		 329 aa  309  2.9999999999999997e-83  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.376662  normal  0.0163011 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2579  cytochrome C family protein  52.72 
 
 		 329 aa  308  6.999999999999999e-83  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.069167  normal  0.0206665 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1777  decaheme cytochrome c MtrA  52.38 
 
 		 333 aa  307  1.0000000000000001e-82  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2638  cytochrome C family protein  48.18 
 
 		 329 aa  308  1.0000000000000001e-82  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.838087  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0231  cytochrome C family protein  49.35 
 
 		 316 aa  307  1.0000000000000001e-82  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1588  cytochrome C family protein  49.39 
 
 		 333 aa  307  2.0000000000000002e-82  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00373932  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1524  cytochrome c family protein  49.19 
 
 		 333 aa  306  3e-82  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.462693  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2699  cytochrome C family protein  51.36 
 
 		 328 aa  304  1.0000000000000001e-81  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.840713  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2820  cytochrome C family protein  49.19 
 
 		 312 aa  304  1.0000000000000001e-81  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1207  decaheme cytochrome c MtrA  47.24 
 
 		 326 aa  303  2.0000000000000002e-81  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0298799  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0268  cytochrome C family protein  49.67 
 
 		 314 aa  302  4.0000000000000003e-81  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3675  cytochrome C family protein  50.34 
 
 		 315 aa  301  1e-80  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0227  cytochrome c family protein  48.2 
 
 		 316 aa  300  1e-80  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1477  cytochrome C family protein  48.02 
 
 		 334 aa  300  2e-80  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000779097  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2230  cytochrome C family protein  48.39 
 
 		 309 aa  298  5e-80  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0468166  decreased coverage  0.000802637 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0352  cytochrome c family protein  47.63 
 
 		 317 aa  298  8e-80  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.101331 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3130  cytochrome C family protein  47.62 
 
 		 317 aa  298  1e-79  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.849943  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3686  cytochrome C family protein  49 
 
 		 314 aa  297  1e-79  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1402  cytochrome c family protein  51.42 
 
 		 316 aa  294  1e-78  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1427  decaheme cytochrome c  48.04 
 
 		 318 aa  294  2e-78  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1305  cytochrome c family protein  49.84 
 
 		 310 aa  293  2e-78  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000952698 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2925  cytochrome c family protein  47.3 
 
 		 315 aa  290  3e-77  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1582  cytochrome C family protein  47.37 
 
 		 321 aa  283  2.0000000000000002e-75  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000911408  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1530  cytochrome c family protein  46.15 
 
 		 321 aa  283  3.0000000000000004e-75  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.892773  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2692  cytochrome C family protein  45.16 
 
 		 319 aa  281  1e-74  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2574  cytochrome C family protein  45.9 
 
 		 321 aa  280  2e-74  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.448859  hitchhiker  0.00699839 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2519  cytochrome C family protein  47.68 
 
 		 322 aa  280  2e-74  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.589751  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1616  cytochrome C family protein  47.04 
 
 		 321 aa  280  2e-74  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.093642  normal  0.713619 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1782  decaheme cytochrome c MtrD  46.38 
 
 		 306 aa  280  3e-74  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2761  cytochrome C family protein  46.71 
 
 		 319 aa  279  4e-74  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.309572  hitchhiker  0.000367908 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2672  cytochrome C family protein  47.04 
 
 		 321 aa  278  6e-74  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.655979  normal  0.0486911 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2506  cytochrome C family protein  45.57 
 
 		 321 aa  278  7e-74  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.365224  hitchhiker  0.00105775 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1593  cytochrome C family protein  46.71 
 
 		 321 aa  278  7e-74  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000481816  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1213  decaheme cytochrome c MtrD  47.74 
 
 		 318 aa  276  4e-73  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.766107  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3859  cytochrome C family protein  48.56 
 
 		 287 aa  267  2e-70  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.00158078  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0361  decaheme cytochrome c MtrA  49.35 
 
 		 286 aa  265  5e-70  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.162857  hitchhiker  0.000223849 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003777  decaheme cytochrome c MtrA  43.99 
 
 		 326 aa  262  4e-69  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4082  hypothetical protein  36.99 
 
 		 307 aa  189  4e-47  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0556738  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1402  double CXXCH motif-containing protein  36.93 
 
 		 317 aa  184  2.0000000000000003e-45  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0638375 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0397  cytochrome C family protein  35.56 
 
 		 299 aa  183  3e-45  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.265526 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3626  cytochrome C family protein  37.5 
 
 		 299 aa  176  4e-43  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0817  cytochrome C family protein  36.63 
 
 		 540 aa  162  5.0000000000000005e-39  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2960  cytochrome  35.16 
 
 		 577 aa  161  1e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.992406  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2381  cytochrome C family protein  38.7 
 
 		 315 aa  161  1e-38  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.300688  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2203  cytochrome c family protein  31.63 
 
 		 363 aa  139  6e-32  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3118  cytochrome C family protein  29.54 
 
 		 334 aa  138  1e-31  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1228  cytochrome c family protein  29.47 
 
 		 337 aa  137  3.0000000000000003e-31  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0933631  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1144  cytochrome C family protein  30.37 
 
 		 334 aa  135  9.999999999999999e-31  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1744  cytochrome c family protein  29.1 
 
 		 337 aa  135  9.999999999999999e-31  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.740978 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2291  cytochrome C family protein  30.36 
 
 		 335 aa  134  9.999999999999999e-31  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3828  multiheme cytochrome  32.37 
 
 		 307 aa  120  3e-26  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.326628 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1995  cytochrome C family protein  29.39 
 
 		 658 aa  96.3  6e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.279857  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2583  cytochrome C family protein  31.68 
 
 		 259 aa  95.5  1e-18  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2759  cytochrome C family protein  31.03 
 
 		 449 aa  82.8  0.000000000000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2495  cytochrome c family protein  28.95 
 
 		 646 aa  82  0.00000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3163  cytochrome C family protein  29.81 
 
 		 442 aa  79.3  0.00000000000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0615  hypothetical protein  33.86 
 
 		 154 aa  77.4  0.0000000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3156  hypothetical protein  29.41 
 
 		 154 aa  73.6  0.000000000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3518  cytochrome C family protein  28.7 
 
 		 331 aa  71.6  0.00000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000517887 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3261  cytochrome C family protein  26.67 
 
 		 656 aa  72  0.00000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2902  hypothetical protein  27.5 
 
 		 153 aa  71.6  0.00000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3563  hypothetical protein  28.99 
 
 		 166 aa  71.2  0.00000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0518  hypothetical protein  25 
 
 		 156 aa  70.9  0.00000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3166  cytochrome C family protein  26.51 
 
 		 650 aa  69.3  0.00000000007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3967  formate-dependent nitrite reductase  30.59 
 
 		 156 aa  68.9  0.0000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1836  cytochrome C family protein  31.12 
 
 		 658 aa  68.2  0.0000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1124  cytochrome C family protein  27.78 
 
 		 658 aa  67.8  0.0000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.932844  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3165  cytochrome C family protein  30.1 
 
 		 436 aa  67.4  0.0000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3260  cytochrome C family protein  30.1 
 
 		 436 aa  67.4  0.0000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0241  hypothetical protein  31.2 
 
 		 157 aa  67.4  0.0000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3067  cytochrome c family protein  29.27 
 
 		 436 aa  66.6  0.0000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0313  formate-dependent nitrite reductase  28.76 
 
 		 154 aa  67  0.0000000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0934  cytochrome C family protein  29.8 
 
 		 337 aa  66.2  0.0000000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3068  cytochrome c family protein  26.17 
 
 		 650 aa  65.1  0.000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3840  cytochrome C family protein  30.3 
 
 		 331 aa  63.9  0.000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000859924  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2494  cytochrome c family protein  25.24 
 
 		 434 aa  62  0.00000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3218  cytochrome c family protein  24.9 
 
 		 480 aa  61.6  0.00000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0562793  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1837  cytochrome C family protein  26.69 
 
 		 429 aa  62  0.00000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3110  hypothetical protein  23.95 
 
 		 916 aa  62.4  0.00000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0615  cytochrome c family protein  28.8 
 
 		 362 aa  61.6  0.00000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.131648  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2899  cytochrome c family protein  26.69 
 
 		 374 aa  61.6  0.00000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.167025  normal  0.604733 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0182  formate-dependent nitrite reductase  25 
 
 		 153 aa  60.8  0.00000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0181  formate-dependent nitrite reductase  26.98 
 
 		 153 aa  59.7  0.00000006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4153  formate-dependent nitrite reductase  26.98 
 
 		 153 aa  59.7  0.00000006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4285  formate-dependent nitrite reductase  26.98 
 
 		 153 aa  59.7  0.00000006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.128151 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1125  cytochrome C family protein  25.96 
 
 		 426 aa  58.5  0.0000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.4798  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0747  multiheme cytochrome  28.33 
 
 		 487 aa  58.9  0.0000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.568299  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3114  cytochrome C family protein  25.7 
 
 		 440 aa  57.8  0.0000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2431  cytochrome c nitrite reductase pentaheme subunit  30.99 
 
 		 189 aa  57  0.0000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3921  cytochrome c nitrite reductase, pentaheme subunit  28.57 
 
 		 188 aa  56.6  0.0000006  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5576  cytochrome c nitrite reductase pentaheme subunit  28.57 
 
 		 188 aa  56.6  0.0000006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03903  hypothetical protein  28.57 
 
 		 188 aa  56.6  0.0000006  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>