More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SO_4317 on replicon NC_004347
Organism: Shewanella oneidensis MR-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_004347  SO_4317  RTX toxin, putative  100 
 
 
2768 aa  5356    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3905  outer membrane adhesin like proteiin  70.01 
 
 
6779 aa  1201    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1227  cadherin domain-containing protein  61.37 
 
 
2251 aa  1410    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4098  outer membrane adhesin like proteiin  69.43 
 
 
6662 aa  1168    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0384  putative outer membrane adhesin like protein  84.78 
 
 
5442 aa  1295    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3642  putative outer membrane adhesin like protein  82.85 
 
 
4791 aa  1264    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3982  putative outer membrane adhesin like proteiin  69.91 
 
 
6683 aa  1199    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0382  putative outer membrane adhesin like proteiin  84.54 
 
 
5839 aa  1303    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0313  putative outer membrane adhesin like proteiin  65.67 
 
 
4836 aa  565  1.0000000000000001e-159  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.971398 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0491  outer membrane adhesin like proteiin  70.27 
 
 
7149 aa  549  1e-154  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4139  putative outer membrane adhesin like proteiin  61.84 
 
 
4122 aa  541  9.999999999999999e-153  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0384  hypothetical protein  65.14 
 
 
4285 aa  541  1e-151  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0436  putative outer membrane adhesin like proteiin  63.11 
 
 
5787 aa  531  1e-149  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2342  putative outer membrane adhesin like proteiin  58.76 
 
 
2812 aa  490  1e-136  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000136287 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3591  putative outer membrane adhesin like proteiin  58.31 
 
 
4220 aa  437  1e-120  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4004  putative outer membrane adhesin like proteiin  57.92 
 
 
2239 aa  394  1e-107  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.328168  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3258  putative outer membrane adhesin like protein  32.81 
 
 
4214 aa  379  1e-103  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.523735 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0477  outer membrane adhesin like proteiin  70.49 
 
 
16322 aa  349  5e-94  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0160  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  42.27 
 
 
2156 aa  305  8.000000000000001e-81  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1854  hemolysin-type calcium-binding region  42.67 
 
 
5171 aa  294  2e-77  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  unclonable  0.0000000611986 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0675  Pyrrolo-quinoline quinone  43.89 
 
 
3066 aa  274  2e-71  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00895028 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0368  cadherin  63.86 
 
 
5444 aa  244  2.9999999999999997e-62  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01400  RTX toxin, putative  43.07 
 
 
606 aa  215  1e-53  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1974  hypothetical protein  38.98 
 
 
7434 aa  209  8e-52  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1357  outer membrane protein  37.53 
 
 
4830 aa  209  8e-52  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.381537 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4143  outer membrane protein  38.11 
 
 
3864 aa  206  7e-51  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1976  outer membrane protein  32.06 
 
 
1196 aa  188  1.0000000000000001e-45  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.839593  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0105  VCBS  34.02 
 
 
1597 aa  178  1.9999999999999998e-42  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  unclonable  0.00289742  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3623  outer membrane adhesin like protein  34.17 
 
 
5745 aa  177  2.9999999999999996e-42  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  unclonable  0.0000000322965 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4137  putative outer membrane adhesin like proteiin  48.5 
 
 
1599 aa  169  8e-40  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0529  hypothetical protein  39.58 
 
 
4697 aa  165  1e-38  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3608  hypothetical protein  31.62 
 
 
918 aa  163  5e-38  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.886331  normal  0.889402 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4138  hypothetical protein  42.2 
 
 
3182 aa  159  9e-37  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2658  hypothetical protein  35.41 
 
 
4689 aa  150  4.0000000000000006e-34  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3203  outer membrane protein  30.89 
 
 
954 aa  142  1e-31  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0378  outer membrane protein  37.17 
 
 
860 aa  136  6.999999999999999e-30  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.906993  normal  0.228365 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1039  Fibronectin type III domain protein  32.5 
 
 
2927 aa  135  7.999999999999999e-30  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.761605 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000465  fibronectin type III domain protein  28.42 
 
 
2839 aa  132  1.0000000000000001e-28  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0581  PKD domain protein  29.82 
 
 
1461 aa  131  2.0000000000000002e-28  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3622  conserved repeat domain protein  35.03 
 
 
4978 aa  123  6e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00000013093 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5060  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  50 
 
 
5962 aa  122  9.999999999999999e-26  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.943676 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4144  hypothetical protein  32.46 
 
 
781 aa  121  1.9999999999999998e-25  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.612931  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3952  hypothetical protein  38.1 
 
 
3191 aa  121  1.9999999999999998e-25  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.627694  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4342  outer membrane protein  33.44 
 
 
790 aa  119  1.0000000000000001e-24  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.302573  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0168  surface adhesion protein, putative  44.64 
 
 
8682 aa  117  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.810778 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0133  von Willebrand factor, type A  50.4 
 
 
5218 aa  118  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.809343 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1215  type 1 secretion target domain protein  31.68 
 
 
2542 aa  117  2.0000000000000002e-24  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4344  hypothetical protein  28.83 
 
 
846 aa  118  2.0000000000000002e-24  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  decreased coverage  0.000873034  normal  0.549716 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0186  hypothetical protein  49.29 
 
 
6753 aa  118  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.306412 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4987  outer membrane protein  33.44 
 
 
763 aa  118  2.0000000000000002e-24  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0188  hypothetical protein  44.64 
 
 
9030 aa  117  3e-24  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0220008 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1978  outer membrane protein  30.43 
 
 
770 aa  117  3e-24  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.206942  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2847  cadherin domain-containing protein  33.18 
 
 
1699 aa  117  4.0000000000000004e-24  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4145  hypothetical protein  32.99 
 
 
756 aa  116  5e-24  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.686732  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1167  putative outer membrane adhesin like proteiin  31.98 
 
 
1884 aa  116  6e-24  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0563  type 1 secretion C-terminal target domain protein  32.9 
 
 
1706 aa  112  1e-22  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1524  outer membrane protein  30.27 
 
 
777 aa  111  2e-22  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.312083  normal 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0054  hypothetical protein  29.03 
 
 
2353 aa  111  2e-22  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003404  putative RTX toxin  34.02 
 
 
4848 aa  111  2e-22  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0314  putative outer membrane adhesin like proteiin  36.09 
 
 
1553 aa  111  2e-22  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0526571  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3205  hypothetical protein  34.29 
 
 
873 aa  110  3e-22  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0479  outer membrane adhesin like proteiin  41.36 
 
 
3229 aa  107  2e-21  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0478  outer membrane adhesin like proteiin  29.02 
 
 
3259 aa  107  3e-21  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2587  outer membrane protein  29.45 
 
 
889 aa  107  4e-21  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00407649 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3766  hemolysin-type calcium-binding protein  45.7 
 
 
1166 aa  105  2e-20  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.234003  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0798  hypothetical protein  35.33 
 
 
3474 aa  104  2e-20  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0369  putative outer membrane adhesin like proteiin  35.71 
 
 
2067 aa  103  3e-20  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.936845  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4139  outer membrane protein  29.14 
 
 
764 aa  103  6e-20  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.609816  normal  0.559542 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3063  VCBS  33.23 
 
 
1269 aa  102  9e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0506  putative outer membrane adhesin like protein  42.07 
 
 
2816 aa  102  1e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1152  putative outer membrane adhesin like proteiin  31.74 
 
 
3363 aa  102  1e-19  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS05070  putative hemagglutinin/hemolysin-related protein  32.94 
 
 
4106 aa  100  3e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1294  polyhydroxyalkanoate synthesis repressor PhaR  43.93 
 
 
8321 aa  101  3e-19  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.359322 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3161  outer membrane adhesin-like protein  35.6 
 
 
1269 aa  100  3e-19  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3808  outer membrane adhesin like proteiin  32.43 
 
 
2524 aa  100  4e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000355585 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2886  large repetitive protein  28.73 
 
 
3824 aa  100  5e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.659132 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0251  outer membrane autotransporter  30.78 
 
 
1359 aa  100  6e-19  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0490823  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4141  hypothetical protein  32.66 
 
 
819 aa  100  6e-19  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.166079  normal  0.580525 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1980  outer membrane protein  29.53 
 
 
768 aa  98.6  1e-18  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3060  von Willebrand factor type A  42.86 
 
 
4678 aa  99  1e-18  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4520  putative Ig domain protein  34.24 
 
 
5561 aa  97.1  4e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4606  large repetitive protein  27.14 
 
 
5559 aa  97.1  4e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4605  putative Ig domain family protein  27.14 
 
 
5561 aa  97.1  4e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4512  large repetitive protein  34.24 
 
 
5561 aa  97.1  4e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4656  hypothetical protein  27.14 
 
 
5559 aa  97.1  4e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3199  VCBS  35 
 
 
4854 aa  96.3  8e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0994  hypothetical protein  27.27 
 
 
4874 aa  96.3  9e-18  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2903  large repetitive protein  28.9 
 
 
3721 aa  95.5  1e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2094  outer membrane adhesin like proteiin  35.03 
 
 
1428 aa  95.1  2e-17  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1087  putative outer membrane adhesin like proteiin  28.12 
 
 
5098 aa  94.7  2e-17  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000320164 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1877  hypothetical protein  40.2 
 
 
1699 aa  94.4  3e-17  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.070874 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2905  large repetitive protein  28.26 
 
 
3824 aa  94.4  3e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1130  hypothetical protein  33.23 
 
 
768 aa  94  3e-17  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.541884 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02378  hypothetical protein  29.68 
 
 
814 aa  93.2  7e-17  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3256  outer membrane adhesin like proteiin  31.82 
 
 
1268 aa  93.2  7e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3017  VCBS repeat-containing protein  29.92 
 
 
3739 aa  93.2  7e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2835  VCBS repeat-containing protein  28.29 
 
 
3824 aa  92.8  8e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0006  von Willebrand factor type A  45.38 
 
 
2452 aa  92.4  1e-16  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_43897  predicted protein  42.42 
 
 
2125 aa  90.9  3e-16  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4113  hypothetical protein  33.22 
 
 
3562 aa  91.3  3e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0537133 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>