219 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SO_4281 on replicon NC_004347
Organism: Shewanella oneidensis MR-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004347  SO_4281  potassium uptake protein KtrA, putative  100 
 
 		 214 aa  438  9.999999999999999e-123  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001288  potassium uptake protein integral membrane component KtrA  73.73 
 
 		 217 aa  333  1e-90  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.91889  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4480  TrkA domain-containing protein  70.83 
 
 		 217 aa  322  2e-87  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000127966 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0050  TrkA domain-containing protein  65.09 
 
 		 232 aa  317  1e-85  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00293665 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0058  TrkA domain-containing protein  65.09 
 
 		 232 aa  317  1e-85  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000170567 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0052  TrkA domain-containing protein  65.09 
 
 		 232 aa  315  4e-85  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000156349 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0047  TrkA domain-containing protein  65.52 
 
 		 232 aa  314  6e-85  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4304  TrkA domain-containing protein  65.52 
 
 		 232 aa  307  9e-83  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.333456  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0054  TrkA-N domain protein  65.52 
 
 		 232 aa  306  1.0000000000000001e-82  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0055  TrkA domain-containing protein  60.78 
 
 		 232 aa  295  2e-79  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000827601 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0050  TrkA domain-containing protein  60.78 
 
 		 232 aa  293  1e-78  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0058  potassium uptake protein, putative  61.64 
 
 		 232 aa  293  2e-78  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0750  TrkA domain-containing protein  39.73 
 
 		 217 aa  157  9e-38  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.803573  normal  0.253071 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3550  hypothetical protein  38.5 
 
 		 220 aa  148  6e-35  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3557  TrkA-N domain protein  44.81 
 
 		 223 aa  136  2e-31  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.647516  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0375  K+ transporter  37.38 
 
 		 220 aa  135  3.0000000000000003e-31  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.506643  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2087  TrkA domain-containing protein  36.02 
 
 		 222 aa  134  9e-31  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.798772 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1781  TrkA domain-containing protein  35.71 
 
 		 222 aa  132  3.9999999999999996e-30  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.08127  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1148  TrkA domain-containing protein  37.04 
 
 		 220 aa  129  2.0000000000000002e-29  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.967319  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1170  TrkA domain-containing protein  37.04 
 
 		 220 aa  129  2.0000000000000002e-29  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.241712  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0267  TrkA-N domain protein  32.55 
 
 		 233 aa  129  4.0000000000000003e-29  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1380  TrkA domain-containing protein  32.39 
 
 		 215 aa  128  6e-29  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000226197  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2142  putative potassium uptake protein  31.16 
 
 		 221 aa  126  2.0000000000000002e-28  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.897368  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1854  potassium uptake protein  31.16 
 
 		 221 aa  126  2.0000000000000002e-28  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0461191  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0458  potassium uptake protein KtrA  35.75 
 
 		 220 aa  125  4.0000000000000003e-28  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36690  K+ transport system, NAD-binding component  33.17 
 
 		 224 aa  125  5e-28  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.164115  normal  0.724398 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4027  TrkA family potassium uptake protein  35.44 
 
 		 221 aa  124  7e-28  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.426006  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3888  TrkA family potassium uptake protein  35.44 
 
 		 221 aa  124  7e-28  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.475517  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3720  Trk family potassium uptake protein  35.44 
 
 		 221 aa  124  7e-28  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.430715  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3736  Trk family potassium uptake protein  35.44 
 
 		 221 aa  124  7e-28  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4191  TrkA family potassium uptake protein  35.44 
 
 		 221 aa  124  7e-28  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.841712  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4081  potassium uptake protein, TrkA family  35.44 
 
 		 221 aa  124  7e-28  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1159  potassium uptake protein, TrkA family  35.44 
 
 		 221 aa  124  7e-28  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.10257  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4098  potassium uptake protein, TrkA family  35.44 
 
 		 221 aa  124  7e-28  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00103413  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3993  potassium uptake protein, TrkA family  35.44 
 
 		 221 aa  124  7e-28  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3805  TrkA domain-containing protein  35.44 
 
 		 221 aa  124  8.000000000000001e-28  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0251033  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0430  TrkA-N domain protein  34.62 
 
 		 217 aa  124  1e-27  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00150602  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2680  TrkA domain-containing protein  34.95 
 
 		 221 aa  123  2e-27  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.0000338081  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01407  hypothetical protein  33.49 
 
 		 220 aa  122  5e-27  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1754  hypothetical protein  30.66 
 
 		 227 aa  122  6e-27  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0169137  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11690  TrkA-N domain protein  31.13 
 
 		 215 aa  121  8e-27  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00343321  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0674  potassium uptake protein TrkA  34.95 
 
 		 219 aa  121  9e-27  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004055  potassium uptake protein integral membrane component KtrA  33.82 
 
 		 220 aa  121  9e-27  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.248543  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0104  TrkA-N domain protein  29.95 
 
 		 220 aa  119  3e-26  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000000200527  hitchhiker  0.0000000000000167844 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1826  TrkA-N domain protein  33.02 
 
 		 220 aa  117  9e-26  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0064  K+ transport systems, NAD-binding component  31.86 
 
 		 221 aa  115  5e-25  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4249  TrkA-N domain protein  30.48 
 
 		 213 aa  114  1.0000000000000001e-24  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0523  TrkA-N domain protein  33.17 
 
 		 223 aa  114  1.0000000000000001e-24  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0141  TrkA domain-containing protein  30.41 
 
 		 217 aa  114  1.0000000000000001e-24  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00479404  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0214  TrkA-N  27.01 
 
 		 224 aa  112  3e-24  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1584  TrkA-N  31.16 
 
 		 219 aa  112  3e-24  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.514465  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0459  TrkA-N domain protein  34.59 
 
 		 231 aa  110  1.0000000000000001e-23  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.821137  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1273  TrkA-N  30.52 
 
 		 224 aa  111  1.0000000000000001e-23  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.600058  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3574  TrkA domain-containing protein  29.81 
 
 		 230 aa  110  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.458769 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7573  TrkA-N domain protein  32.16 
 
 		 224 aa  110  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.879249  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0398  TrkA-N  31.66 
 
 		 224 aa  110  2.0000000000000002e-23  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.81484  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4247  TrkA-N domain protein  38.36 
 
 		 225 aa  110  2.0000000000000002e-23  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.61262 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18040  K+ transport system, NAD-binding component  29.52 
 
 		 225 aa  109  4.0000000000000004e-23  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1513  TrkA-N domain-containing protein  39.39 
 
 		 224 aa  107  9.000000000000001e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.621068 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0443  TrkA domain-containing protein  28.5 
 
 		 222 aa  107  1e-22  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000103493 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0627  TrkA-N domain protein  29.56 
 
 		 224 aa  107  2e-22  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1711  TrkA-N domain protein  30.77 
 
 		 220 aa  107  2e-22  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.382687  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1617  TrkA domain-containing protein  29.17 
 
 		 217 aa  107  2e-22  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.0000000138787  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1043  hypothetical protein  41.56 
 
 		 221 aa  107  2e-22  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2303  putative cation transporter  30.95 
 
 		 222 aa  106  3e-22  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14840  K+ transport system, NAD-binding component  32.23 
 
 		 229 aa  106  3e-22  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.289305  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0372  TrkA domain-containing protein  27.75 
 
 		 222 aa  106  3e-22  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.849541  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3882  TrkA-N  34.55 
 
 		 232 aa  104  1e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.94887  decreased coverage  0.00720211 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3209  TrkA-N domain protein  36.97 
 
 		 231 aa  104  1e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.580767  normal  0.652247 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1081  hypothetical protein  30.19 
 
 		 233 aa  103  3e-21  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00425328 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0249  TrkA-N domain protein  33.33 
 
 		 219 aa  103  3e-21  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.00172297  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0529  hypothetical protein  28.04 
 
 		 217 aa  102  4e-21  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1476  potassium uptake protein TrkA, putative  30.59 
 
 		 216 aa  101  7e-21  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1301  potassium uptake protein TrkA, putative  30.59 
 
 		 216 aa  101  7e-21  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0439  putative potassium uptake protein TrkA  30.59 
 
 		 216 aa  101  8e-21  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6144  TrkA-N  31.5 
 
 		 220 aa  101  9e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.674267  normal  0.153677 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3347  TrkA domain-containing protein  36.36 
 
 		 228 aa  101  9e-21  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3145  TrkA-N domain protein  36.36 
 
 		 228 aa  101  9e-21  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.436065 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1392  TrkA-N domain protein  34.87 
 
 		 227 aa  101  1e-20  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.643107  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0416  TrkA domain-containing protein  30.05 
 
 		 217 aa  101  1e-20  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000130553  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0137  TRK system potassium uptake protein TrkA, putative  33.33 
 
 		 213 aa  100  2e-20  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1642  hypothetical protein  28.57 
 
 		 216 aa  99.4  4e-20  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0139  TrkA-N domain protein  26.05 
 
 		 218 aa  99  4e-20  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0505  TrkA-N domain protein  31.43 
 
 		 254 aa  98.6  7e-20  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.0590826 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0339  TrkA-N domain protein  30.88 
 
 		 218 aa  97.1  2e-19  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  decreased coverage  0.00738023  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2522  TrkA domain-containing protein  36.43 
 
 		 221 aa  95.9  4e-19  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  decreased coverage  0.000136868  normal  0.0316786 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1353  TrkA-N domain protein  33.12 
 
 		 217 aa  95.5  5e-19  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0952  TrkA-N domain protein  33.99 
 
 		 217 aa  95.1  7e-19  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2841  TrkA-N domain protein  38.64 
 
 		 222 aa  94  1e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.208198  normal  0.066626 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0566  potassium uptake protein TrkA, putative  28.64 
 
 		 218 aa  94.4  1e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1541  TrkA-N domain protein  33.11 
 
 		 221 aa  94.4  1e-18  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3465  TrkA-N domain-containing protein  32.73 
 
 		 231 aa  93.6  2e-18  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0630  TrkA-N domain protein  33.11 
 
 		 219 aa  94  2e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.208337  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3270  TrkA-N domain protein  29.05 
 
 		 230 aa  93.6  2e-18  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.588488  normal  0.0361185 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24440  K+ transport system, NAD-binding component  34.25 
 
 		 222 aa  92.8  4e-18  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.800738  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06980  K+ transport system, NAD-binding component  28.57 
 
 		 232 aa  92  6e-18  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1557  TrkA domain-containing protein  28.05 
 
 		 222 aa  92  7e-18  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.176981  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2828  TrkA-N domain protein  28.77 
 
 		 250 aa  90.9  1e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0119084 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0728  TrkA-N domain protein  35.25 
 
 		 221 aa  90.9  1e-17  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.439731  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0012  TrkA-N domain protein  30.97 
 
 		 216 aa  90.9  1e-17  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>