More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SO_4252 on replicon NC_004347
Organism: Shewanella oneidensis MR-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008345  Sfri_3832  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  72.05 
 
 
659 aa  1019  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0322  peptidase S9, prolyl oligopeptidase active site region  66.92 
 
 
653 aa  944  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0395751  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3774  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  93.35 
 
 
661 aa  1290  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.455998 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0381  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  62.54 
 
 
654 aa  878  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.217468  unclonable  1.77281e-10 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0398  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  86.1 
 
 
662 aa  1208  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  3.16056e-10 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0355  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  93.66 
 
 
662 aa  1278  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.824077 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4252  prolyl oligopeptidase family protein  100 
 
 
662 aa  1372  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4565  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  62.69 
 
 
657 aa  882  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00542478  unclonable  5.39912e-08 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3841  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  62.54 
 
 
654 aa  883  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3833  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  54.16 
 
 
649 aa  723  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0323  prolyl oligopeptidase family protein  65.11 
 
 
649 aa  904  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0373  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  85.35 
 
 
662 aa  1199  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.265704  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3601  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  93.5 
 
 
661 aa  1266  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00624  prolyl oligopeptidase  49.62 
 
 
653 aa  699  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0384  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  86.1 
 
 
662 aa  1209  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.290431  normal  0.0110983 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0372  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  86.1 
 
 
662 aa  1209  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3485  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  66.16 
 
 
654 aa  937  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0048  prolyl oligopeptidase family protein  40.27 
 
 
642 aa  500  1e-140  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.436282  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0834  hypothetical protein  38.82 
 
 
648 aa  483  1e-135  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.386873  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0594  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  39.94 
 
 
623 aa  456  1e-127  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1087  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  35.05 
 
 
650 aa  417  1e-115  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.393964  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0844  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  34.61 
 
 
646 aa  402  1e-111  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06914  prolyl oligopeptidase  31.1 
 
 
655 aa  315  2e-84  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000910  putative peptidase  30.7 
 
 
640 aa  311  3e-83  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.982884  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0706  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  29.97 
 
 
656 aa  294  3e-78  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.155251 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1350  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  35.19 
 
 
655 aa  264  3e-69  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6730  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  29.06 
 
 
632 aa  264  5e-69  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.907657  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0702  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  31.43 
 
 
665 aa  260  6e-68  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.0827659 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2643  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  31.34 
 
 
644 aa  257  5e-67  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0003  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  28.13 
 
 
665 aa  254  5e-66  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1112  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  29.08 
 
 
656 aa  248  2e-64  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.245577  normal  0.568355 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0365  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  28.38 
 
 
632 aa  244  4e-63  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5159  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  29.5 
 
 
666 aa  241  3e-62  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.017012  decreased coverage  0.000228688 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1930  peptidase S9, prolyl oligopeptidase  28.17 
 
 
646 aa  240  7e-62  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG1004  prolyl oligopeptidase family protein  30.54 
 
 
759 aa  237  6e-61  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1646  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  28.51 
 
 
705 aa  231  3e-59  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.106603  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0529  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  29.21 
 
 
634 aa  231  4e-59  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3201  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  32.41 
 
 
924 aa  226  1e-57  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.243991 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0246  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  27.64 
 
 
644 aa  223  7e-57  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4618  prolyl oligopeptidase family protein  27.88 
 
 
645 aa  221  4e-56  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3803  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  27.15 
 
 
645 aa  219  2e-55  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.6032 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2025  prolyl oligopeptidase family protein  27.51 
 
 
636 aa  218  3e-55  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00251963  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0129  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  32.47 
 
 
665 aa  215  2e-54  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.286088 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1195  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  27.73 
 
 
645 aa  212  2e-53  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.430413  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4261  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  26.28 
 
 
652 aa  209  1e-52  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.111222 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1193  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  31.19 
 
 
642 aa  208  2e-52  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2049  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  28.77 
 
 
907 aa  206  9e-52  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.564098  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1266  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  32.35 
 
 
631 aa  204  4e-51  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.211135  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5922  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  38.33 
 
 
626 aa  204  6e-51  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2052  peptidase S9, prolyl oligopeptidase active site region  28.77 
 
 
630 aa  202  2e-50  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.55137  normal  0.714509 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4323  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  32.19 
 
 
645 aa  201  3e-50  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1353  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  29.44 
 
 
629 aa  201  3e-50  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.262385  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0143  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  32.19 
 
 
645 aa  201  3e-50  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3064  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  28.96 
 
 
755 aa  201  4e-50  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.366531  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4124  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  32.19 
 
 
645 aa  201  4e-50  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0476  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  29.45 
 
 
688 aa  201  5e-50  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4393  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  30.46 
 
 
626 aa  200  7e-50  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0493  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  30.87 
 
 
662 aa  197  6e-49  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0179177  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2658  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  30.86 
 
 
642 aa  197  8e-49  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.55127  normal  0.367777 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1669  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  29.98 
 
 
629 aa  195  2e-48  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3063  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  27.8 
 
 
688 aa  194  5e-48  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4483  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  28.66 
 
 
682 aa  192  2e-47  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0952  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  29.98 
 
 
706 aa  192  2e-47  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.630914  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0494  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  27.23 
 
 
685 aa  191  3e-47  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0656758  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03802  dipeptidyl anminopeptidase  26.69 
 
 
694 aa  191  4e-47  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0766  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  31.62 
 
 
641 aa  190  9e-47  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8147  hypothetical protein  30.44 
 
 
634 aa  188  3e-46  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.675914 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0078  prolyl oligopeptidase family protein  24.42 
 
 
665 aa  183  9e-45  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1886  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  29.3 
 
 
636 aa  173  1e-41  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0377  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  25.73 
 
 
626 aa  172  2e-41  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.280031  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0495  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  31.3 
 
 
692 aa  171  3e-41  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.468891  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3714  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  27.9 
 
 
650 aa  169  1e-40  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0345  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  25.57 
 
 
626 aa  169  1e-40  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0301  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  25.57 
 
 
626 aa  169  1e-40  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.111113 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4772  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  27.76 
 
 
632 aa  167  6e-40  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0482  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  27.58 
 
 
686 aa  165  2e-39  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0061  prolyl oligopeptidase family protein  30.39 
 
 
653 aa  164  6e-39  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.101557  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_17781  hypothetical protein  30.72 
 
 
681 aa  162  1e-38  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.46714 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3884  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  25.23 
 
 
686 aa  162  2e-38  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.913505  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1803  peptidase S9, prolyl oligopeptidase active site region  27.07 
 
 
731 aa  161  5e-38  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.184836  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6348  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  30 
 
 
629 aa  151  4e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2873  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  26.15 
 
 
677 aa  142  2e-32  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2498  dipeptidyl aminopeptidases/acylaminoacyl-peptidases-like protein  30.36 
 
 
867 aa  138  4e-31  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2303  peptidase S9, prolyl oligopeptidase active site region  25.2 
 
 
615 aa  138  4e-31  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0148  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  25.04 
 
 
617 aa  137  9e-31  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.554216 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0194  peptidase S9, prolyl oligopeptidase active site region  26.81 
 
 
638 aa  132  2e-29  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1709  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  25.55 
 
 
594 aa  131  5e-29  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1675  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  34.46 
 
 
683 aa  130  6e-29  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.270345  hitchhiker  0.000408122 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0581  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  26.97 
 
 
628 aa  130  8e-29  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.402001 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3798  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  27.64 
 
 
634 aa  129  2e-28  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0132  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  30.48 
 
 
674 aa  128  3e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4185  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  27.32 
 
 
655 aa  127  4e-28  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0448  peptidase  26.88 
 
 
678 aa  128  4e-28  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.547634 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0114  peptidase S9, prolyl oligopeptidase  29.19 
 
 
674 aa  128  4e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1310  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  24.66 
 
 
588 aa  126  1e-27  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0407114  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0121  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  30.48 
 
 
674 aa  125  2e-27  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1497  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  30.45 
 
 
682 aa  125  3e-27  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1503  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  30.45 
 
 
682 aa  125  3e-27  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2848  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  30.45 
 
 
682 aa  125  3e-27  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  2.37688e-06 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1533  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  30.45 
 
 
682 aa  125  3e-27  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>