More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SO_4220 on replicon NC_004347
Organism: Shewanella oneidensis MR-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010506  Swoo_4534  cell division protein FtsW  80.35 
 
 
404 aa  662    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00214714 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4220  cell division protein FtsW  100 
 
 
403 aa  808    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3812  cell division protein FtsW  83.33 
 
 
405 aa  681    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0400  cell division protein FtsW  92.06 
 
 
403 aa  733    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0409  cell division protein FtsW  81.59 
 
 
410 aa  657    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00146554 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3571  cell division protein FtsW  97.02 
 
 
403 aa  787    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000791404 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0385  cell division protein FtsW  96.77 
 
 
403 aa  788    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.0110798 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3454  cell division protein FtsW  82.92 
 
 
404 aa  686    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00477404 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0412  cell division protein FtsW  92.06 
 
 
403 aa  733    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000811354 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0426  cell division protein FtsW  92.06 
 
 
403 aa  734    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000000798632 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3744  cell division protein FtsW  96.77 
 
 
403 aa  788    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000784985 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0486  cell division protein FtsW  94.79 
 
 
403 aa  777    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0353  cell division protein FtsW  78.36 
 
 
402 aa  637    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000708854 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0401  cell division protein FtsW  92.06 
 
 
403 aa  733    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0354  phosphopantetheine attachment site  74.42 
 
 
404 aa  588  1e-167  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3805  cell division protein FtsW  71.64 
 
 
404 aa  588  1e-167  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03259  cell division protein FtsW  60.94 
 
 
470 aa  459  9.999999999999999e-129  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0143  cell division protein FtsW  57.81 
 
 
414 aa  431  1e-119  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.247505 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1980  cell division protein FtsW  57.03 
 
 
398 aa  431  1e-119  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0139  cell division protein FtsW  57.81 
 
 
414 aa  431  1e-119  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.919378 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0139  cell division protein FtsW  57.81 
 
 
414 aa  431  1e-119  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.571731  hitchhiker  0.000000336901 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0144  cell division protein FtsW  57.81 
 
 
414 aa  431  1e-119  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0378146  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0635  cell division protein FtsW  57.81 
 
 
414 aa  430  1e-119  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.146996  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0136  cell division protein FtsW  57.81 
 
 
414 aa  431  1e-119  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.931456 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00090  integral membrane protein involved in stabilizing FstZ ring during cell division  57.29 
 
 
414 aa  426  1e-118  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3511  cell division protein FtsW  57.29 
 
 
414 aa  426  1e-118  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0760  cell division protein FtsW  57.14 
 
 
400 aa  426  1e-118  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.682655  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0095  cell division protein FtsW  57.29 
 
 
414 aa  426  1e-118  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.747639  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00089  hypothetical protein  57.29 
 
 
414 aa  426  1e-118  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0091  cell division protein FtsW  57.29 
 
 
414 aa  426  1e-118  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00890066  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3568  cell division protein FtsW  57.29 
 
 
414 aa  426  1e-118  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00655548 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3520  cell division protein FtsW  56.17 
 
 
487 aa  426  1e-118  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0094  cell division protein FtsW  57.29 
 
 
414 aa  426  1e-118  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.251291  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0097  cell division protein FtsW  57.29 
 
 
414 aa  426  1e-118  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.301255  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004491  cell division protein FtsW  55.7 
 
 
398 aa  421  1e-117  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4466  cell division protein FtsW  53.61 
 
 
437 aa  419  1e-116  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00901  hypothetical protein  55.09 
 
 
398 aa  418  9.999999999999999e-116  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3593  cell division protein FtsW  55.84 
 
 
400 aa  412  1e-114  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0609  cell division protein FtsW  57.62 
 
 
400 aa  413  1e-114  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.637682  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0647  cell division protein FtsW  56.99 
 
 
400 aa  414  1e-114  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.159842  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2645  cell division protein FtsW  57.53 
 
 
400 aa  414  1e-114  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0082  cell division protein FtsW  57.03 
 
 
414 aa  410  1e-113  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2919  cell division protein FtsW  55.64 
 
 
400 aa  408  1.0000000000000001e-112  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3388  cell division protein FtsW  55.64 
 
 
400 aa  408  1.0000000000000001e-112  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3519  cell division protein FtsW  55.64 
 
 
400 aa  408  1.0000000000000001e-112  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3781  cell division protein FtsW  57.07 
 
 
400 aa  406  1.0000000000000001e-112  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1146  cell division protein FtsW  50.93 
 
 
406 aa  360  2e-98  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0357  cell division protein  46.55 
 
 
394 aa  340  2e-92  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.891735  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2668  cell division protein ftsW  45.6 
 
 
391 aa  323  3e-87  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2538  cell division protein ftsW  45.6 
 
 
391 aa  323  4e-87  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4985  cell division protein FtsW  48.85 
 
 
399 aa  321  1.9999999999999998e-86  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.348028  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57360  cell division protein FtsW  48.85 
 
 
399 aa  321  1.9999999999999998e-86  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1974  cell division protein  47.52 
 
 
372 aa  306  5.0000000000000004e-82  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0222  cell division protein FtsW  47.23 
 
 
372 aa  304  2.0000000000000002e-81  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0768  cell division protein FtsW  46.92 
 
 
400 aa  300  4e-80  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.626093  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2092  cell division protein FtsW  47.49 
 
 
395 aa  299  5e-80  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2430  cell division protein FtsW  45.81 
 
 
398 aa  298  9e-80  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0943  cell division protein FtsW  45.98 
 
 
404 aa  298  1e-79  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.717668  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2194  cell division protein FtsW  48.36 
 
 
401 aa  298  1e-79  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.689364  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0601  cell division protein FtsW  44.47 
 
 
441 aa  296  5e-79  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.190924  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0921  cell division protein FtsW  46.96 
 
 
402 aa  296  5e-79  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.524737  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4674  cell cycle protein  44.25 
 
 
405 aa  292  7e-78  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  0.000737984  normal  0.479047 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4513  cell division protein FtsW  46.26 
 
 
404 aa  291  1e-77  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.444721  normal  0.6393 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2270  cell cycle protein  41.71 
 
 
392 aa  291  1e-77  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.011941 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1336  cell division protein FtsW  46.26 
 
 
404 aa  291  2e-77  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.820801  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0166  cell division protein FtsW  42.82 
 
 
423 aa  290  2e-77  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.582847  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4388  cell division protein FtsW  46.26 
 
 
404 aa  291  2e-77  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.503964  normal  0.17369 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2202  cell division protein FtsW  44.96 
 
 
400 aa  290  3e-77  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.244408  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2191  cell cycle protein  44.56 
 
 
394 aa  290  3e-77  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.506626  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2674  cell division protein FtsW  41.42 
 
 
427 aa  290  3e-77  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04368  cell division protein FtsW  45.4 
 
 
457 aa  289  7e-77  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3644  cell cycle protein  42.51 
 
 
427 aa  288  1e-76  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.951225 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4103  cell cycle protein  45.82 
 
 
404 aa  287  2e-76  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.715571 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0076  cell division protein FtsW  42.51 
 
 
427 aa  287  2e-76  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0558  cell division protein FtsW  42.51 
 
 
427 aa  287  2e-76  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2862  cell cycle protein, FtsW  48.12 
 
 
384 aa  287  2.9999999999999996e-76  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00502116  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2837  cell division protein FtsW  42.51 
 
 
427 aa  286  2.9999999999999996e-76  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.202196  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0529  cell division protein FtsW  42.23 
 
 
427 aa  286  4e-76  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.704536  normal  0.739964 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4409  cell division protein FtsW  44.38 
 
 
404 aa  286  5e-76  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.309058  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0487  cell division protein FtsW  42.51 
 
 
427 aa  285  7e-76  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.564923  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0462  cell division protein FtsW  42.51 
 
 
427 aa  285  7e-76  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.526617  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2615  cell division protein FtsW  40 
 
 
397 aa  284  2.0000000000000002e-75  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  unclonable  0.00000000000584566 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0485  cell division transmembrane protein, FtsW  40.87 
 
 
426 aa  283  3.0000000000000004e-75  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.302923  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3471  cell division protein FtsW  41.14 
 
 
425 aa  283  3.0000000000000004e-75  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.162796  normal  0.0152175 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2845  cell division FtsW transmembrane protein  42.01 
 
 
413 aa  282  9e-75  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2049  cell division protein  44.85 
 
 
423 aa  282  9e-75  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0247231  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1970  cell division protein FtsW  44.85 
 
 
423 aa  281  1e-74  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.212582  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3526  cell division protein FtsW  41.42 
 
 
430 aa  281  2e-74  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1332  cell division protein FtsW  41.42 
 
 
430 aa  280  3e-74  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2552  cell division protein FtsW  41.42 
 
 
430 aa  280  3e-74  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3231  cell division protein FtsW  41.42 
 
 
430 aa  280  3e-74  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3551  cell division protein FtsW  41.42 
 
 
430 aa  280  3e-74  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0473  cell division protein FtsW  41.42 
 
 
430 aa  280  3e-74  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0180  cell division protein FtsW  41.19 
 
 
423 aa  280  4e-74  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.598529  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3546  cell division protein FtsW  41.42 
 
 
462 aa  280  4e-74  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.980156  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2495  cell cycle protein  41.71 
 
 
386 aa  278  1e-73  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3090  cell division protein FtsW  41.96 
 
 
413 aa  277  2e-73  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.812659  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2725  cell division protein FtsW  41.96 
 
 
413 aa  277  2e-73  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.669489  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3129  cell cycle protein  41.42 
 
 
413 aa  276  5e-73  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1117  cell division protein FtsW  40.6 
 
 
462 aa  276  7e-73  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>