More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SO_4191 on replicon NC_004347
Organism: Shewanella oneidensis MR-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004347  SO_4191  DedA family protein  100 
 
 		 192 aa  385  1e-106  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0453  SNARE associated Golgi protein  87.96 
 
 		 204 aa  344  4e-94  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0427  SNARE associated Golgi protein  86.91 
 
 		 204 aa  342  2e-93  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.160448  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0439  SNARE associated Golgi protein  86.39 
 
 		 204 aa  341  5e-93  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0969745 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3543  DedA family protein  88.54 
 
 		 203 aa  341  5e-93  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0412  DedA family protein  88.54 
 
 		 203 aa  341  5e-93  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3718  DedA family protein  88.02 
 
 		 203 aa  339  2e-92  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.913537  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3887  SNARE associated Golgi protein  86.39 
 
 		 204 aa  337  4e-92  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0514  DedA family protein  81.68 
 
 		 204 aa  327  6e-89  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01105  hypothetical protein  47.28 
 
 		 191 aa  166  2e-40  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004319  membrane protein  44.57 
 
 		 195 aa  157  1e-37  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2056  hypothetical protein  36.42 
 
 		 203 aa  93.2  2e-18  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.0000098362  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0439  dedA family protein  34.38 
 
 		 197 aa  88.2  7e-17  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0432  dedA family protein  34.38 
 
 		 172 aa  87.8  8e-17  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0543  SNARE associated Golgi protein  33.75 
 
 		 172 aa  85.9  3e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.582875  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0628  hypothetical protein  35.46 
 
 		 199 aa  83.2  0.000000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.341746 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5318  hypothetical protein  30 
 
 		 206 aa  81.3  0.000000000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.745456  normal  0.776913 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2559  DEDA DSG-1 protein transmembrane  34.64 
 
 		 218 aa  79.7  0.00000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0105855  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2070  SNARE associated Golgi protein-related protein  34.25 
 
 		 215 aa  79  0.00000000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.000366664  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2429  SNARE associated Golgi protein  34.08 
 
 		 215 aa  78.2  0.00000000000007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2835  SNARE associated Golgi protein  33.52 
 
 		 215 aa  77.4  0.0000000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.691658  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0812  DedA family protein  31.68 
 
 		 204 aa  75.5  0.0000000000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.0000122435  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0704  SNARE associated Golgi protein  35.66 
 
 		 202 aa  75.5  0.0000000000005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.693025  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0509  SNARE associated Golgi protein-related protein  39.06 
 
 		 239 aa  75.1  0.0000000000006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0566  DedA family protein  33.79 
 
 		 206 aa  74.7  0.0000000000007  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.180728 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1626  SNARE associated Golgi protein  34.01 
 
 		 216 aa  73.9  0.000000000001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0186  SNARE associated Golgi protein  33.33 
 
 		 209 aa  74.3  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0010  hypothetical protein  32.64 
 
 		 208 aa  73.9  0.000000000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.163704  normal  0.0549348 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1291  SNARE associated Golgi protein  34.51 
 
 		 212 aa  74.3  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.677756  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1922  hypothetical protein  35.83 
 
 		 218 aa  73.9  0.000000000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.0000155723  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2069  hypothetical protein  35.46 
 
 		 209 aa  73.6  0.000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.873256  normal  0.0385471 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1260  SNARE associated Golgi protein  33.33 
 
 		 212 aa  73.2  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3975  hypothetical protein  34.69 
 
 		 245 aa  73.6  0.000000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4889  SNARE associated Golgi protein-like protein  34.04 
 
 		 209 aa  72.8  0.000000000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5989  hypothetical protein  27.51 
 
 		 196 aa  72  0.000000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1810  SNARE associated Golgi protein  33.33 
 
 		 206 aa  72  0.000000000005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0089  SNARE associated Golgi protein  31.33 
 
 		 214 aa  72  0.000000000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.061617 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0232  phosphoesterase, PA-phosphatase related  31.34 
 
 		 457 aa  71.6  0.000000000007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5041  hypothetical protein  31.47 
 
 		 214 aa  71.2  0.000000000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.273824  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3867  DedA family protein  23.9 
 
 		 198 aa  71.6  0.000000000007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.537439 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3914  SNARE associated Golgi protein  30.27 
 
 		 213 aa  71.2  0.000000000009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.148472 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5019  SNARE associated Golgi protein  30.2 
 
 		 214 aa  70.9  0.00000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.432695  normal  0.972374 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5218  DedA family protein  31.29 
 
 		 214 aa  70.5  0.00000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.488895  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5127  hypothetical protein  31.97 
 
 		 214 aa  70.9  0.00000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5252  DedA family protein  27.23 
 
 		 220 aa  70.9  0.00000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0592  DedA family protein  32.79 
 
 		 219 aa  70.5  0.00000000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0487  hypothetical protein  31.21 
 
 		 232 aa  69.7  0.00000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000202069  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0074  dedA protein  25 
 
 		 204 aa  69.7  0.00000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1108  hypothetical protein  31.21 
 
 		 232 aa  69.7  0.00000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00139496  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4503  SNARE associated Golgi protein  29.01 
 
 		 214 aa  70.1  0.00000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.711425  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2482  dedA protein  32.76 
 
 		 198 aa  70.1  0.00000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.323289  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1368  integral membrane protein  30.86 
 
 		 221 aa  70.1  0.00000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.377957  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4966  SNARE associated Golgi protein  29.01 
 
 		 214 aa  70.1  0.00000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.248557 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4907  SNARE associated Golgi protein  31.69 
 
 		 227 aa  70.1  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.703178 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0550  SNARE associated Golgi protein  31.21 
 
 		 232 aa  69.7  0.00000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3042  SNARE associated Golgi protein  26.18 
 
 		 208 aa  69.3  0.00000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.537249  normal  0.212415 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1169  SNARE associated Golgi protein  30.83 
 
 		 217 aa  68.9  0.00000000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.922899  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1269  SNARE associated Golgi protein  31.72 
 
 		 201 aa  68.9  0.00000000005  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0626  SNARE associated Golgi protein  30 
 
 		 215 aa  68.6  0.00000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.228359  decreased coverage  0.00442875 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2788  hypothetical protein  31.47 
 
 		 198 aa  68.9  0.00000000005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.719802  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2349  SNARE associated Golgi protein-like protein  26.29 
 
 		 194 aa  68.6  0.00000000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.913999  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0819  DedA family protein  26.53 
 
 		 202 aa  68.6  0.00000000005  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0132  SNARE associated Golgi protein  36.97 
 
 		 237 aa  68.6  0.00000000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.365407  decreased coverage  0.0000235996 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0191  hypothetical protein  30.98 
 
 		 220 aa  68.6  0.00000000006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0291  hypothetical protein  29.93 
 
 		 220 aa  68.6  0.00000000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1709  SNARE associated Golgi protein-related protein  30.2 
 
 		 217 aa  68.6  0.00000000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0127  hypothetical protein  36.97 
 
 		 237 aa  68.6  0.00000000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1362  rhodanese-like protein  27.88 
 
 		 334 aa  68.2  0.00000000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8388  SNARE associated Golgi protein  30.9 
 
 		 244 aa  68.6  0.00000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.880445 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3465  SNARE associated Golgi protein  34.03 
 
 		 222 aa  68.2  0.00000000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.133962  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4741  dedA protein  25 
 
 		 204 aa  68.2  0.00000000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.98218  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4856  SNARE associated Golgi protein  26.71 
 
 		 204 aa  68.2  0.00000000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5176  dedA protein  25 
 
 		 204 aa  68.2  0.00000000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5141  dedA protein  26.71 
 
 		 204 aa  67.8  0.00000000009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4897  dedA protein  26.71 
 
 		 204 aa  67.8  0.00000000009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4760  DedA family protein  26.71 
 
 		 204 aa  67.8  0.00000000009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5272  dedA protein  26.71 
 
 		 204 aa  67.8  0.00000000009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5170  dedA protein  25 
 
 		 204 aa  67.8  0.0000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1759  hypothetical protein  33.33 
 
 		 213 aa  67.4  0.0000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.335415  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3614  SNARE associated Golgi protein  24.73 
 
 		 204 aa  67.4  0.0000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5185  dedA protein  26.71 
 
 		 204 aa  67.4  0.0000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0915  hypothetical protein  30.51 
 
 		 206 aa  67.8  0.0000000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  hitchhiker  0.00745427  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2866  hypothetical protein  32.79 
 
 		 219 aa  67.4  0.0000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.416299 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1186  membrane-associated protein-like protein  30.25 
 
 		 355 aa  67.4  0.0000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0213  hypothetical protein  25.81 
 
 		 206 aa  66.6  0.0000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0105  SNARE associated Golgi protein  26.22 
 
 		 208 aa  66.6  0.0000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0360  hypothetical protein  31.97 
 
 		 220 aa  65.9  0.0000000004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0760  hypothetical protein  28.57 
 
 		 200 aa  65.5  0.0000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1530  hypothetical protein  31.97 
 
 		 220 aa  65.9  0.0000000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1321  hypothetical protein  33.33 
 
 		 253 aa  65.5  0.0000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.777218  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1421  hypothetical protein  31.97 
 
 		 220 aa  65.9  0.0000000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0766  hypothetical protein  28.57 
 
 		 200 aa  65.5  0.0000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0526  SNARE associated Golgi protein  31.25 
 
 		 204 aa  65.9  0.0000000004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.115863  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01570  uncharacterized membrane-associated protein  31.88 
 
 		 235 aa  65.9  0.0000000004  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00544447 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0780  hypothetical protein  28.57 
 
 		 200 aa  65.5  0.0000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.534019 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4069  SNARE associated Golgi protein  29.93 
 
 		 219 aa  65.5  0.0000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00208186  hitchhiker  0.00137396 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1452  hypothetical protein  32.64 
 
 		 237 aa  65.5  0.0000000005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  decreased coverage  0.00552947  normal  0.0731246 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2611  hypothetical protein  31.15 
 
 		 219 aa  65.1  0.0000000006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69250  hypothetical protein  29.86 
 
 		 196 aa  65.1  0.0000000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2311  SNARE associated Golgi protein  33.86 
 
 		 259 aa  65.1  0.0000000006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000000116146 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>