52 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SO_4152 on replicon NC_004347
Organism: Shewanella oneidensis MR-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004347  SO_4152  hypothetical protein  100 
 
 		 214 aa  437  9.999999999999999e-123  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3693  hypothetical protein  85.98 
 
 		 214 aa  359  2e-98  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0474  hypothetical protein  72.55 
 
 		 212 aa  301  7.000000000000001e-81  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0455  hypothetical protein  70.1 
 
 		 212 aa  290  2e-77  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1394  hypothetical protein  55.64 
 
 		 185 aa  159  3e-38  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.984832  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2801  protein of unknown function DUF1486  59.17 
 
 		 181 aa  157  8e-38  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.19615  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1261  protein of unknown function DUF1486  53.28 
 
 		 182 aa  157  1e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00537261  normal  0.341449 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1354  hypothetical protein  55.73 
 
 		 185 aa  155  5.0000000000000005e-37  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2394  protein of unknown function DUF1486  57.14 
 
 		 180 aa  153  1e-36  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1447  hypothetical protein  54.68 
 
 		 185 aa  151  7e-36  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0560331  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5397  hypothetical protein  53.95 
 
 		 187 aa  151  7e-36  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.255025  normal  0.733155 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4651  hypothetical protein  45.55 
 
 		 186 aa  150  1e-35  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.712908 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2604  hypothetical protein  52.67 
 
 		 186 aa  146  3e-34  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1469  hypothetical protein  53.96 
 
 		 185 aa  142  6e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1729  hypothetical protein  51.33 
 
 		 185 aa  141  6e-33  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0373687  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1703  hypothetical protein  51.33 
 
 		 185 aa  141  6e-33  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0987  hypothetical protein  53.96 
 
 		 185 aa  142  6e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.983826  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1882  hypothetical protein  51.33 
 
 		 185 aa  141  6e-33  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0563369  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1546  hypothetical protein  50.67 
 
 		 185 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0209  hypothetical protein  50.67 
 
 		 185 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0131745  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0955  hypothetical protein  50.67 
 
 		 185 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.949837  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1104  hypothetical protein  50.67 
 
 		 185 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0489751  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0837  putative lipoprotein  37.08 
 
 		 179 aa  112  5e-24  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.461005  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0797  putative lipoprotein  37.08 
 
 		 182 aa  112  6e-24  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.430815  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0892  putative lipoprotein  37.64 
 
 		 179 aa  111  8.000000000000001e-24  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4442  putative lipoprotein  37.64 
 
 		 179 aa  111  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.987994  normal  0.460875 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0749  hypothetical protein  41.1 
 
 		 179 aa  107  1e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1022  putative lipoprotein  36.52 
 
 		 179 aa  107  2e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0932  putative lipoprotein  34.08 
 
 		 179 aa  105  6e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.6654500000000002e-29 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0746  hypothetical protein  34.08 
 
 		 182 aa  105  7e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00470157  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0930  putative lipoprotein  37.35 
 
 		 179 aa  104  1e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0741  hypothetical protein  34.83 
 
 		 182 aa  104  1e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1710  hypothetical protein  35.54 
 
 		 142 aa  67.8  0.0000000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.518536  normal  0.0462427 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2545  protein of unknown function DUF1486  32.65 
 
 		 139 aa  51.6  0.000008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1283  protein of unknown function DUF1486  25.83 
 
 		 132 aa  51.6  0.000008  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3831  hypothetical protein  31.25 
 
 		 146 aa  51.2  0.00001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.709956  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2990  hypothetical protein  25.24 
 
 		 132 aa  51.2  0.00001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0316  protein of unknown function DUF1486  25.81 
 
 		 138 aa  49.3  0.00005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0996  protein of unknown function DUF1486  32.89 
 
 		 173 aa  48.1  0.00009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0915  protein of unknown function DUF1486  26.21 
 
 		 138 aa  47.8  0.0001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.282506  normal  0.0578966 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3974  hypothetical protein  26.6 
 
 		 131 aa  47  0.0002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6186  protein of unknown function DUF1486  29.79 
 
 		 146 aa  46.6  0.0003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2666  protein of unknown function DUF1486  30.7 
 
 		 142 aa  46.6  0.0003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4210  hypothetical protein  27.16 
 
 		 144 aa  46.2  0.0004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0441  hypothetical protein  23.91 
 
 		 144 aa  46.2  0.0004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.664223  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5540  protein of unknown function DUF1486  27.2 
 
 		 138 aa  45.8  0.0005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4678  protein of unknown function DUF1486  27.91 
 
 		 141 aa  45.4  0.0007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000675641 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0339  protein of unknown function DUF1486  27.05 
 
 		 137 aa  45.4  0.0007  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.175362  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3104  hypothetical protein  31.25 
 
 		 85 aa  45.4  0.0007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0633963  normal  0.35406 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0931  hypothetical protein  27.72 
 
 		 140 aa  44.7  0.001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7231  protein of unknown function DUF1486  23.08 
 
 		 149 aa  43.5  0.002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.390995  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2161  protein of unknown function DUF1486  32.47 
 
 		 123 aa  42.7  0.004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.395088  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>