153 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SO_4085 on replicon NC_004347
Organism: Shewanella oneidensis MR-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004347  SO_4085  chitinase A  100 
 
 		 699 aa  1433    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00548  chitinase  58.01 
 
 		 729 aa  831    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05656  chitinase  65.7 
 
 		 565 aa  682    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05899  chitinase  58.01 
 
 		 729 aa  831    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3655  glycoside hydrolase family protein  72.1 
 
 		 727 aa  1085    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2205  glycosyl hydrolase family chitinase  55.49 
 
 		 492 aa  385  1e-105  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3568  glycosyl hydrolase family chitinase  58.41 
 
 		 353 aa  369  1e-101  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.285696 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1223  glycoside hydrolase family protein  56.1 
 
 		 484 aa  364  3e-99  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0824686  normal  0.0476273 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2949  chitinase  54.03 
 
 		 483 aa  361  2e-98  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.690144  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34870  chitinase  53.43 
 
 		 483 aa  359  9e-98  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0143949  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0400  chitinase  51.44 
 
 		 598 aa  350  4e-95  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  unclonable  0.0000106126  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4777  glycoside hydrolase family 18 protein  49.31 
 
 		 803 aa  345  2e-93  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.202282  normal  0.127676 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0611  glycosy hydrolase family protein  47.54 
 
 		 471 aa  288  2e-76  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0693  glycoside hydrolase family protein  47.21 
 
 		 471 aa  285  3.0000000000000004e-75  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl347  chitinase  36.16 
 
 		 1113 aa  171  3e-41  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000135445  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2184  Chitinase  28.38 
 
 		 1362 aa  164  4.0000000000000004e-39  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00723588 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3571  extracellular exochitinase Chi36  29.94 
 
 		 360 aa  126  1e-27  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.297633  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3469  chitinase  29.94 
 
 		 360 aa  126  1e-27  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3483  chitinase  30.09 
 
 		 360 aa  126  1e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.219436  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3854  extracellular exochitinase Chi36  29.94 
 
 		 360 aa  126  1e-27  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.063231  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3775  extracellular exochitinase Chi36  29.94 
 
 		 360 aa  120  6e-26  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000559542  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3753  extracellular exochitinase Chi36  29.94 
 
 		 360 aa  120  9e-26  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.007807  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2581  neutral protease  41.82 
 
 		 884 aa  120  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000011855 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3490  glycoside hydrolase family protein  30.24 
 
 		 360 aa  120  9.999999999999999e-26  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.678093  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1478  extracellular exochitinase Chi36  29.94 
 
 		 360 aa  119  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.17366  hitchhiker  0.000283046 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2393  thermolysin metallopeptidase  41.21 
 
 		 530 aa  118  5e-25  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3824  extracellular exochitinase Chi36  30.24 
 
 		 360 aa  117  5e-25  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0158065  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2310  bacillolysin  42.38 
 
 		 886 aa  117  6e-25  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.105645  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1540  chitinase  29.58 
 
 		 846 aa  112  2.0000000000000002e-23  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.987868  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1799  glycoside hydrolase family protein  29.58 
 
 		 551 aa  112  3e-23  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000760023  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1704  glycosyl hydrolase family chitinase  27.71 
 
 		 543 aa  110  1e-22  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.861913 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2571  neutral protease A, bacillolysin  36.81 
 
 		 891 aa  108  5e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000442231  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2534  neutral protease  42.28 
 
 		 887 aa  107  8e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.596256  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0757  endochitinase ChiA  27.13 
 
 		 846 aa  107  9e-22  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002720  chitinase  27.48 
 
 		 848 aa  107  1e-21  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.548595  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03258  chitinase  27.97 
 
 		 846 aa  107  1e-21  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2624  bacillolysin  37.72 
 
 		 891 aa  105  2e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000636329  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2348  bacillolysin (neutral protease)  38.36 
 
 		 890 aa  104  5e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00113983  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4555  glycoside hydrolase family protein  26.45 
 
 		 1578 aa  103  7e-21  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1220  Carbohydrate-binding CenC domain protein  29.9 
 
 		 510 aa  103  9e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7432  Chitinase-like protein  28.53 
 
 		 516 aa  102  2e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.894433 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2789  bacillolysin  38.24 
 
 		 893 aa  102  3e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.000716183  hitchhiker  0.000000152737 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5990  Carbohydrate-binding CenC domain protein  26.44 
 
 		 648 aa  95.5  3e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.793128  normal  0.422272 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3770  glycoside hydrolase family 18  25.87 
 
 		 420 aa  94.7  6e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4225  Carbohydrate-binding CenC domain protein  28.89 
 
 		 551 aa  92.4  2e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0637754 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1919  Chitinase-like protein  26.65 
 
 		 680 aa  93.2  2e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4053  glycoside hydrolase family 18  24.36 
 
 		 376 aa  86.7  0.000000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0226392 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1428  chitinase  66.67 
 
 		 972 aa  87  0.000000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0735  glycoside hydrolase family 18  27.78 
 
 		 341 aa  86.7  0.000000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1458  glycosyl hydrolase family chitinase  29.18 
 
 		 460 aa  86.3  0.000000000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0201  chitinase like protein  50.67 
 
 		 1204 aa  84.7  0.000000000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.137759 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06955  chitinase  32.79 
 
 		 855 aa  83.2  0.00000000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000945  chitinase  32.97 
 
 		 848 aa  82  0.00000000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0106  chitinase  32.24 
 
 		 848 aa  81.6  0.00000000000005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_24870  predicted xylanase/chitin deacetylase  36.36 
 
 		 503 aa  81.3  0.00000000000006  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2383  putative surface protein  35.62 
 
 		 929 aa  80.5  0.00000000000009  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.13211  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2965  cellulose-binding family II protein  26.28 
 
 		 468 aa  79.7  0.0000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.432243  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1917  Chitinase-like protein  27.41 
 
 		 613 aa  76.6  0.000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3605  glycosyl hydrolase family chitinase  30 
 
 		 792 aa  75.9  0.000000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000852085  hitchhiker  0.0070526 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0423  N-acetylglucosamine-binding protein A  34.12 
 
 		 485 aa  74.3  0.000000000006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0208095  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0947  N-acetylglucosamine-binding protein A  32.3 
 
 		 491 aa  72  0.00000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.809737  normal  0.0565044 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3735  extracellular exochitinase Chi36  33.85 
 
 		 189 aa  72  0.00000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.72466e-18 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4108  N-acetylglucosamine-binding protein A  28.48 
 
 		 473 aa  70.9  0.00000000008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1072  N-acetylglucosamine-binding protein A  30.54 
 
 		 491 aa  70.5  0.00000000009  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4667  chitin-binding protein CbpD precursor  56.25 
 
 		 388 aa  70.5  0.0000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.353514  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0647  chitinase-related protein  37.66 
 
 		 105 aa  69.3  0.0000000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1101  chitinase  46.75 
 
 		 565 aa  69.3  0.0000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3027  N-acetylglucosamine-binding protein A  31.06 
 
 		 491 aa  68.6  0.0000000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.483728 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53250  chitin-binding protein CbpD precursor  65.96 
 
 		 389 aa  67.8  0.0000000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.889986 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0896  N-acetylglucosamine-binding protein A  32.56 
 
 		 481 aa  67.4  0.0000000009  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3466  N-acetylglucosamine-binding protein A  32.37 
 
 		 481 aa  67.4  0.0000000009  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.266116  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3589  N-acetylglucosamine-binding protein A  32.56 
 
 		 481 aa  67.4  0.0000000009  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3390  N-acetylglucosamine-binding protein A  32.56 
 
 		 481 aa  66.2  0.000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003394  putative trypsin  50 
 
 		 443 aa  66.2  0.000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0257  hypothetical protein  36.72 
 
 		 378 aa  65.1  0.000000004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3186  cellulose-binding family II protein  27.42 
 
 		 467 aa  65.1  0.000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00151543 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3879  N-acetylglucosamine-binding protein A  31.4 
 
 		 477 aa  65.1  0.000000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.000000531215  unclonable  0.0000000195953 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0260  basic endochitinase  47.17 
 
 		 553 aa  64.7  0.000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.361835 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1122  hypothetical protein  36.36 
 
 		 105 aa  63.5  0.00000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0136739  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1144  hypothetical protein  36.36 
 
 		 105 aa  63.5  0.00000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0791111  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0255  endochitinase  45.28 
 
 		 587 aa  62.8  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.931196 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0271  endochitinase  45.28 
 
 		 587 aa  62.8  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.527688  normal  0.775272 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0274  endochitinase  45.28 
 
 		 587 aa  62.8  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0255  endochitinase  45.28 
 
 		 587 aa  62.8  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.942643 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0636  carbohydrate-binding family V/XII protein  34.13 
 
 		 765 aa  61.6  0.00000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.393474  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1137  putative chitinase  43.06 
 
 		 402 aa  61.6  0.00000005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000021802  n/a   
 
 
-
 
NC_006687  CNE01990  hypothetical protein  24.54 
 
 		 582 aa  60.5  0.0000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1368  Cellulase  48.98 
 
 		 426 aa  60.1  0.0000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.828638 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4306  Chitinase  48.98 
 
 		 772 aa  59.7  0.0000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.594159  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1030  N-acetylglucosamine-binding protein A  26.9 
 
 		 481 aa  58.2  0.0000005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1087  pullulanase family protein  37.21 
 
 		 2638 aa  58.2  0.0000006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2888  glycosyl hydrolase family chitinase  27.48 
 
 		 868 aa  58.2  0.0000006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1505  Glycoside hydrolase, family 20, catalytic core  27.54 
 
 		 816 aa  56.6  0.000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.869244  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4875  carbohydrate-binding family V/XII protein  33.04 
 
 		 647 aa  57.4  0.000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000541612 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4648  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  39.02 
 
 		 699 aa  57  0.000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000907  spindolin-related protein  51.16 
 
 		 392 aa  56.6  0.000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.841793  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02194  hypothetical protein  37.5 
 
 		 985 aa  55.5  0.000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0622  PKD domain containing protein  34.94 
 
 		 1057 aa  55.8  0.000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.40107 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2805  glycosyl hydrolase family chitinase  26.82 
 
 		 868 aa  55.1  0.000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2684  Endo-1,4-beta-xylanase  47.83 
 
 		 1242 aa  55.5  0.000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>