62 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SO_3918 on replicon NC_004347
Organism: Shewanella oneidensis MR-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009831  Ssed_3937  hypothetical protein  47.03 
 
 
718 aa  679    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.631088  normal  0.946741 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3059  hypothetical protein  75 
 
 
729 aa  1156    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.0000942986  normal  0.160447 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0898  hypothetical protein  45.87 
 
 
718 aa  672    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3639  hypothetical protein  91.39 
 
 
732 aa  1405    Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00188388  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3279  hypothetical protein  79.02 
 
 
734 aa  1228    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00632369  unclonable  0.00000414607 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0757  hypothetical protein  92.08 
 
 
732 aa  1412    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.0000601769  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0917  hypothetical protein  46.55 
 
 
718 aa  682    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.14142  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0715  hypothetical protein  91.67 
 
 
732 aa  1406    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.295822  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3464  hypothetical protein  46.14 
 
 
718 aa  676    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0761  hypothetical protein  77.57 
 
 
740 aa  1201    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.0000133423  hitchhiker  0.0000000733664 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3187  hypothetical protein  47.83 
 
 
718 aa  681    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.828747 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0642  hypothetical protein  45.66 
 
 
718 aa  667    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.605544  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3582  hypothetical protein  77.12 
 
 
743 aa  1199    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.000000436948  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0745  hypothetical protein  91.53 
 
 
732 aa  1404    Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00110202  hitchhiker  0.000231819 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3587  hypothetical protein  46.28 
 
 
718 aa  676    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.115853  normal  0.956669 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3877  hypothetical protein  47.43 
 
 
718 aa  681    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.286815  hitchhiker  0.0000320991 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4208  hypothetical protein  76.35 
 
 
739 aa  1199    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.0000122811  hitchhiker  0.000560321 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3388  hypothetical protein  46.26 
 
 
718 aa  674    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01009  hypothetical protein  46 
 
 
721 aa  664    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  decreased coverage  0.00499323  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0736  Dipeptidyl-peptidase 7. Serine peptidase. MEROPS family S46  91.67 
 
 
732 aa  1407    Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00943685  hitchhiker  0.00000000353181 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3249  dipeptidyl-peptidase 7  97.27 
 
 
732 aa  1483    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0101755  hitchhiker  0.0000935307 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3918  hypothetical protein  100 
 
 
732 aa  1521    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0520  hypothetical protein  76.64 
 
 
731 aa  1183    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00489252  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0684  hypothetical protein  46.34 
 
 
718 aa  679    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0176519  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2938  hypothetical protein  47.37 
 
 
738 aa  673    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.733565  normal  0.0443843 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1075  hypothetical protein  46.07 
 
 
718 aa  684    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3025  dipeptidyl-peptidase 7  46.14 
 
 
718 aa  689    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0691  dipeptidyl-peptidase 7  97.13 
 
 
732 aa  1482    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000153124  hitchhiker  0.000504584 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0949  dipeptidyl-peptidase 7  46.14 
 
 
718 aa  689    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.0576142 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0573  hypothetical protein  46.88 
 
 
718 aa  663    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3347  hypothetical protein  75.34 
 
 
941 aa  1169    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.285717  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0712  dipeptidyl-peptidase 7  96.86 
 
 
732 aa  1479    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00861513  hitchhiker  0.000040961 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0913  dipeptidyl-peptidase 7  46.14 
 
 
718 aa  688    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.365403  normal  0.893813 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0692  hypothetical protein  43.8 
 
 
731 aa  623  1e-177  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0959  hypothetical protein  44 
 
 
716 aa  602  1.0000000000000001e-171  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.00114251  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0807  hypothetical protein  44.49 
 
 
720 aa  598  1e-169  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.661422  normal  0.0291008 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02510  hypothetical protein  44.25 
 
 
707 aa  597  1e-169  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1078  hypothetical protein  43.19 
 
 
716 aa  595  1e-168  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  hitchhiker  0.0000205718  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3979  hypothetical protein  40.17 
 
 
715 aa  495  9.999999999999999e-139  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.137716  normal  0.400863 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5484  Peptidase S46  37.47 
 
 
767 aa  482  1e-134  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.681553 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1344  hypothetical protein  38.13 
 
 
732 aa  481  1e-134  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.818075  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5731  Peptidase S46  35.8 
 
 
786 aa  413  1e-114  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.521337  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2038  hypothetical protein  32.94 
 
 
725 aa  358  9.999999999999999e-98  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.302869  hitchhiker  0.00293045 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2431  dipeptidyl-peptidase 7  29.78 
 
 
704 aa  319  1e-85  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0416  hypothetical protein  29.66 
 
 
714 aa  306  6e-82  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0905126  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0404  dipeptidyl-peptidase 7  31.22 
 
 
714 aa  303  8.000000000000001e-81  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2984  hypothetical protein  29.45 
 
 
722 aa  303  1e-80  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG0491  hypothetical protein  30.68 
 
 
712 aa  282  1e-74  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG1283  hypothetical protein  28.86 
 
 
720 aa  276  9e-73  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2277  dipeptidyl-peptidase 7  28.42 
 
 
701 aa  222  1.9999999999999999e-56  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3344  dipeptidyl-peptidase 7  28.65 
 
 
706 aa  220  6e-56  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3489  Dipeptidyl-peptidase 7. Serine peptidase. MEROPS family S46  28.71 
 
 
706 aa  217  5e-55  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3425  Dipeptidyl-peptidase 7. Serine peptidase. MEROPS family S46  28.71 
 
 
706 aa  217  5.9999999999999996e-55  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  unclonable  0.00839556  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2591  dipeptidyl-peptidase 7  28.25 
 
 
714 aa  212  2e-53  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1178  Dipeptidyl-peptidase 7  27.49 
 
 
751 aa  202  1.9999999999999998e-50  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0849  hypothetical protein  34.4 
 
 
718 aa  201  3.9999999999999996e-50  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1768  dipeptidyl-peptidase 7  33.62 
 
 
721 aa  192  2e-47  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0506828  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0494  hypothetical protein  27.74 
 
 
688 aa  191  4e-47  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0618  hypothetical protein  26.06 
 
 
710 aa  180  7e-44  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1179  dipeptidyl-peptidase 7  27.04 
 
 
759 aa  177  5e-43  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5737  Peptidase S46  27.75 
 
 
711 aa  169  2e-40  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.654767 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3411  hypothetical protein  29.38 
 
 
713 aa  150  9e-35  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.490577  normal  0.207662 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>