250 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SO_3800 on replicon NC_004347
Organism: Shewanella oneidensis MR-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004347  SO_3800  serine protease  100 
 
 		 1215 aa  2447    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3050  protease-associated PA  68.12 
 
 		 1220 aa  1662    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.0000558142  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3517  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  86.83 
 
 		 1212 aa  2013    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.183545 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3708  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  86.67 
 
 		 1212 aa  2010    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.342982  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0513  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  67.24 
 
 		 1212 aa  1648    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3585  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  86.75 
 
 		 1212 aa  2011    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.591718  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2562  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  31.52 
 
 		 1049 aa  295  3e-78  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.236427  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1721  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  30.57 
 
 		 1323 aa  224  9e-57  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00699469  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4252  minor extracellular protease VpR  27.63 
 
 		 917 aa  195  4e-48  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4584  minor extracellular protease VpR  27.63 
 
 		 917 aa  195  4e-48  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0593  peptidase S8 and S53 subtilisin kexin sedolisin  29.82 
 
 		 1383 aa  193  1e-47  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0312409 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0761  minor extracellular protease VpR  28.55 
 
 		 917 aa  193  2e-47  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00881527  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4090  minor extracellular protease  27.92 
 
 		 917 aa  193  2e-47  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.957358  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4437  minor extracellular protease VpR  27.78 
 
 		 917 aa  192  2.9999999999999997e-47  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4436  minor extracellular protease VpR  27.92 
 
 		 917 aa  192  2.9999999999999997e-47  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4101  minor extracellular protease  27.92 
 
 		 917 aa  189  2e-46  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4475  minor extracellular protease VpR  27.87 
 
 		 917 aa  190  2e-46  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4203  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  27.6 
 
 		 915 aa  187  8e-46  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4488  minor extracellular protease VpR  27.57 
 
 		 917 aa  187  1.0000000000000001e-45  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6015  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  28.66 
 
 		 1092 aa  186  3e-45  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5011  minor extracellular protease VPR  27.2 
 
 		 1407 aa  170  2e-40  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5031  subtilase domain-containing protein  27.04 
 
 		 1407 aa  169  2.9999999999999998e-40  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0669  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  27.59 
 
 		 728 aa  166  3e-39  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5001  hypothetical protein  28.49 
 
 		 1407 aa  165  6e-39  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2222  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  27.77 
 
 		 891 aa  165  6e-39  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25130  subtilase family protease  28.65 
 
 		 1221 aa  164  1e-38  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4623  subtilisin-like serine protease  25.84 
 
 		 1406 aa  163  2e-38  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3909  serine protease  25.57 
 
 		 1042 aa  154  1e-35  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.634  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0898  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  27.83 
 
 		 1234 aa  151  7e-35  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0732529  normal  0.544536 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2308  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  28.25 
 
 		 1776 aa  150  1.0000000000000001e-34  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0392  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  26.26 
 
 		 1075 aa  146  3e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.648824  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0781  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  27.36 
 
 		 1283 aa  145  6e-33  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.223596  hitchhiker  0.00753256 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0084  peptidase S8 and S53 subtilisin kexin sedolisin  28.01 
 
 		 860 aa  142  3e-32  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  decreased coverage  0.000306364  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0217  peptidase S8 and S53 subtilisin kexin sedolisin  28 
 
 		 883 aa  141  7e-32  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.161537  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0819  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  45.93 
 
 		 1286 aa  138  8e-31  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000454384 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2849  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  28.28 
 
 		 1160 aa  134  1.0000000000000001e-29  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00446023  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0468  peptidase S8 and S53 subtilisin kexin sedolisin  29.09 
 
 		 860 aa  129  4.0000000000000003e-28  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0832  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  52.82 
 
 		 1292 aa  128  6e-28  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2370  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  28.94 
 
 		 1124 aa  127  1e-27  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1123  cell wall-associated serine proteinase  25.81 
 
 		 1570 aa  117  1.0000000000000001e-24  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.677567  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0846  subtilisin-like serine protease  27.66 
 
 		 1618 aa  117  1.0000000000000001e-24  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1394  hypothetical protein  24.23 
 
 		 1109 aa  117  1.0000000000000001e-24  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.47721 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0968  cell wall-associated serine proteinase, lactocepin precursor  25.19 
 
 		 1570 aa  115  4.0000000000000004e-24  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2053  serine protease  26.79 
 
 		 1570 aa  115  6e-24  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.322612  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0393  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  26.57 
 
 		 660 aa  112  4.0000000000000004e-23  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.13824 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01952  serine protease, subtilase family protein  25.76 
 
 		 1321 aa  112  5e-23  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0728  protease domain-containing protein  30.75 
 
 		 1035 aa  110  2e-22  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1747  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  24.93 
 
 		 1565 aa  109  3e-22  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0213398  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0825  protease domain-containing protein  25.2 
 
 		 1258 aa  108  5e-22  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.184637  normal  1 
 
 
-
 
NC_008505  LACR_C42  lactocepin I  26.9 
 
 		 1962 aa  107  1e-21  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3768  protease domain-containing protein  25.65 
 
 		 1265 aa  105  5e-21  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000500867  hitchhiker  0.00925065 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3335  serine protease  26.13 
 
 		 983 aa  101  9e-20  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3430  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  24.08 
 
 		 1649 aa  100  1e-19  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.433791  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3545  hypothetical protein  25.27 
 
 		 1639 aa  100  1e-19  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0423  PA domain protein  25.6 
 
 		 2042 aa  100  2e-19  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.0201874 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0579  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  26.73 
 
 		 1638 aa  100  2e-19  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0935  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  23.7 
 
 		 1199 aa  98.2  9e-19  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.755252  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_05530  cell wall-binding protein  27.53 
 
 		 1312 aa  97.4  1e-18  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0876125  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3374  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  26.44 
 
 		 1638 aa  97.4  1e-18  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0744  serine protease  23.56 
 
 		 1725 aa  97.1  2e-18  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006670  CNA01380  peptidase, putative  27.66 
 
 		 950 aa  94.7  1e-17  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2616  hypothetical protein  24.62 
 
 		 1406 aa  93.2  3e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0177484  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1500  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  24.02 
 
 		 1293 aa  93.2  3e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23940  subtilisin-like serine protease  26.11 
 
 		 1809 aa  92.4  5e-17  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2960  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  25.66 
 
 		 1659 aa  91.3  9e-17  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.929351  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3885  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  28.9 
 
 		 1465 aa  91.3  9e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.265158 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1566  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  30.26 
 
 		 1191 aa  90.9  1e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0151  serine protease  28.57 
 
 		 1638 aa  90.5  2e-16  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0555  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  26.68 
 
 		 1399 aa  90.5  2e-16  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.0581373 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1513  protease domain-containing protein  27.38 
 
 		 1116 aa  90.5  2e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0327061 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1542  protease-associated PA domain protein  24.13 
 
 		 1298 aa  90.1  3e-16  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.689219  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1915  serine protease  24.05 
 
 		 1300 aa  89.7  3e-16  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3175  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  24.88 
 
 		 1649 aa  89  5e-16  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0229  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  25.59 
 
 		 1312 aa  88.2  9e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.83599  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1035  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  23.16 
 
 		 1474 aa  87.8  0.000000000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.310715  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2239  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  26.29 
 
 		 1099 aa  87.4  0.000000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00131913  normal  0.475839 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0416  protease, putative  24.66 
 
 		 1233 aa  86.7  0.000000000000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.504082  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2834  protease domain-containing protein  23.84 
 
 		 1298 aa  87  0.000000000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2959  protease domain-containing protein  23.98 
 
 		 1298 aa  86.7  0.000000000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.161686 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0501  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  23.66 
 
 		 1648 aa  87.4  0.000000000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3529  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  23.66 
 
 		 1648 aa  87  0.000000000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0502  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  23.34 
 
 		 1648 aa  86.3  0.000000000000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2816  protease domain-containing protein  23.84 
 
 		 1298 aa  85.9  0.000000000000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.738271  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0556  hypothetical protein  29.06 
 
 		 1261 aa  84.7  0.000000000000009  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.170539  normal  0.101449 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0936  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  25.24 
 
 		 1251 aa  84.7  0.000000000000009  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3302  serine protease  24.62 
 
 		 1287 aa  84.3  0.00000000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3301  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  25.04 
 
 		 1669 aa  84  0.00000000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2937  protease-associated PA  51.28 
 
 		 730 aa  84  0.00000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1690  protease domain-containing protein  24.78 
 
 		 1300 aa  84  0.00000000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.983324  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3304  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  23.99 
 
 		 1706 aa  83.6  0.00000000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.876918  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0635  serine protease  23.75 
 
 		 1683 aa  83.6  0.00000000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3152  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  22.5 
 
 		 1645 aa  82.4  0.00000000000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0822  cell wall anchor domain-containing protein  26.49 
 
 		 1705 aa  80.5  0.0000000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.658117  decreased coverage  0.00000160097 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3201  cell wall anchor domain-containing protein  26.49 
 
 		 1705 aa  80.5  0.0000000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.151365 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3034  hypothetical protein  26.87 
 
 		 1099 aa  79.3  0.0000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.487731  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0544  protease domain-containing protein  27.62 
 
 		 1045 aa  79  0.0000000000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3035  protease domain-containing protein  58.9 
 
 		 1053 aa  78.6  0.0000000000007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.559762  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3417  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  31 
 
 		 1191 aa  78.2  0.0000000000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2274  protease domain-containing protein  26.39 
 
 		 1115 aa  78.2  0.0000000000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0667485  unclonable  0.00000000204116 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3141  protease domain-containing protein  37.97 
 
 		 1393 aa  76.3  0.000000000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>