61 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SO_3778 on replicon NC_004347
Organism: Shewanella oneidensis MR-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004347  SO_3778  adenylate cyclase CyaB, putative  100 
 
 		 194 aa  402  1e-111  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3104  putative adenylyl cyclase CyaB  80.31 
 
 		 197 aa  337  8e-92  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3125  putative adenylyl cyclase CyaB  87.68 
 
 		 204 aa  337  9e-92  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0842  putative adenylyl cyclase CyaB  87.19 
 
 		 204 aa  334  3.9999999999999995e-91  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.112196 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0814  putative adenylyl cyclase CyaB  90.72 
 
 		 213 aa  332  3e-90  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0910  putative adenylyl cyclase CyaB  80.73 
 
 		 195 aa  328  3e-89  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3461  putative adenylyl cyclase CyaB  80.73 
 
 		 195 aa  327  5.0000000000000004e-89  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0875  putative adenylyl cyclase CyaB  79.69 
 
 		 195 aa  326  1.0000000000000001e-88  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0901  adenylyl cyclase CyaB  80.21 
 
 		 195 aa  325  2.0000000000000001e-88  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1050  putative adenylate cyclase CyaB  66.1 
 
 		 185 aa  249  2e-65  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0024  adenylate cyclase  61.93 
 
 		 183 aa  243  9.999999999999999e-64  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0940  putative adenylyl cyclase CyaB  64.37 
 
 		 185 aa  242  1.9999999999999999e-63  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1665  putative adenylyl cyclase CyaB  60.12 
 
 		 183 aa  228  3e-59  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.248414  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1517  putative adenylyl cyclase CyaB  54.89 
 
 		 193 aa  219  3e-56  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000378541  normal  0.664583 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02204  hypothetical protein  57.95 
 
 		 182 aa  218  3.9999999999999997e-56  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1784  putative adenylyl cyclase CyaB  57.8 
 
 		 194 aa  216  1e-55  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1350  adenylate cyclase 2  50.57 
 
 		 179 aa  180  1e-44  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0174263 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2804  adenylate cyclase, class IV  50.57 
 
 		 179 aa  180  1e-44  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2407  adenylyl cyclase CyaB  47.98 
 
 		 179 aa  171  5e-42  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.308065  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2502  adenylyl cyclase CyaB  48.3 
 
 		 179 aa  171  7.999999999999999e-42  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1537  adenylyl cyclase CyaB  47.98 
 
 		 180 aa  167  7e-41  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.678182  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2924  adenylyl cyclase CyaB  47.98 
 
 		 180 aa  167  1e-40  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.880007  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0623  adenylyl cyclase CyaB  34.27 
 
 		 169 aa  79  0.00000000000004  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0735  putative adenylyl cyclase CyaB  28 
 
 		 184 aa  75.9  0.0000000000003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00219376 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1114  putative adenylyl cyclase CyaB  34.34 
 
 		 176 aa  74.7  0.0000000000009  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.643274 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0808  putative adenylyl cyclase CyaB  32.95 
 
 		 193 aa  65.1  0.0000000007  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0933  putative adenylyl cyclase CyaB  30.49 
 
 		 176 aa  63.9  0.000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.164628  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1326  putative adenylyl cyclase CyaB  30.86 
 
 		 175 aa  62.4  0.000000004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.422285 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0075  putative adenylyl cyclase CyaB  31.95 
 
 		 176 aa  62  0.000000005  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.109831  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0514  adenylyl cyclase CyaB  29.14 
 
 		 181 aa  60.5  0.00000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0805  adenylyl cyclase CyaB  26.98 
 
 		 200 aa  58.5  0.00000006  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.763555  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0548  adenylate cyclase  27.66 
 
 		 177 aa  58.2  0.00000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0067  adenylyl cyclase CyaB  30.3 
 
 		 176 aa  57  0.0000002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.160565  normal  0.206262 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1167  adenylyl cyclase CyaB, putative  24.32 
 
 		 175 aa  56.6  0.0000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1147  hypothetical protein  27.39 
 
 		 199 aa  55.8  0.0000004  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.903912 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0037  adenylate cyclase  32.74 
 
 		 176 aa  53.1  0.000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2305  adenylyl cyclase CyaB  26.28 
 
 		 181 aa  50.1  0.00002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0126885  normal  0.751604 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1572  adenylyl cyclase CyaB  26.92 
 
 		 175 aa  49.3  0.00003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.845661  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1935  adenylate cyclase  25.84 
 
 		 171 aa  49.3  0.00004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00466325  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1229  adenylyl cyclase CyaB  32.04 
 
 		 186 aa  48.5  0.00006  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1526  adenylate cyclase  28.47 
 
 		 176 aa  48.5  0.00006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0038  putative adenylyl cyclase CyaB  31.16 
 
 		 180 aa  48.1  0.00008  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.318646  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2432  adenylyl cyclase CyaB  28.72 
 
 		 195 aa  47.4  0.0001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.190501  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0056  adenylate cyclase  35 
 
 		 172 aa  47  0.0002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0006  adenylate cyclase  29.66 
 
 		 182 aa  45.1  0.0006  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.136902 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0631  adenylate cyclase  27.08 
 
 		 179 aa  45.1  0.0007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.446364  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0568  adenylate cyclase  26.71 
 
 		 179 aa  44.7  0.001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3053  adenylate cyclase  32.67 
 
 		 176 aa  43.5  0.002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0323  adenylyl cyclase CyaB  27.66 
 
 		 172 aa  43.1  0.002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.362109  normal  0.0195848 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0232  adenylyl cyclase CyaB  26.11 
 
 		 178 aa  43.5  0.002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0079  adenylate cyclase  31.82 
 
 		 177 aa  43.1  0.003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0071  adenylate cyclase  31.82 
 
 		 177 aa  43.1  0.003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0080  adenylate cyclase  33.33 
 
 		 177 aa  42.4  0.004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.678459  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0013  putative adenylate cyclase  40.62 
 
 		 178 aa  42.4  0.005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3919  adenylate cyclase  40.62 
 
 		 178 aa  42  0.006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.682505  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3261  adenylate cyclase  26.67 
 
 		 177 aa  42  0.006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.440818 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0080  adenylate cyclase  31.78 
 
 		 177 aa  42  0.006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2975  adenylate cyclase  31.78 
 
 		 177 aa  42  0.006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0098  adenylate cyclase  31.78 
 
 		 177 aa  41.6  0.007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3335  adenylate cyclase  29.81 
 
 		 176 aa  41.2  0.01  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2494  adenylate cyclase  31.17 
 
 		 179 aa  41.2  0.01  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.262125  normal  0.801077 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>