59 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SO_3770 on replicon NC_004347
Organism: Shewanella oneidensis MR-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004347  SO_3770  hypothetical protein  100 
 
 		 226 aa  454  1e-127  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0822  hypothetical protein  96.9 
 
 		 226 aa  443  1e-123  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000109083  normal  0.209568 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3119  hypothetical protein  96.9 
 
 		 226 aa  443  1e-123  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000717729  normal  0.542025 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0853  hypothetical protein  96.9 
 
 		 226 aa  443  1e-123  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000459273  normal  0.62908 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3096  hypothetical protein  95.58 
 
 		 226 aa  439  9.999999999999999e-123  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.000000106475  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0907  protein of unknown function DUF47  94.25 
 
 		 226 aa  433  1e-121  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000556938  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0883  hypothetical protein  94.25 
 
 		 226 aa  433  1e-121  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000129781  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0917  hypothetical protein  94.25 
 
 		 226 aa  433  1e-121  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00343614  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3455  hypothetical protein  94.25 
 
 		 226 aa  433  1e-121  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000227297  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3843  hypothetical protein  83.19 
 
 		 226 aa  394  1e-109  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000724256  hitchhiker  0.0000000283379 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3487  hypothetical protein  84.96 
 
 		 226 aa  394  1e-109  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000126131  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0692  hypothetical protein  82.22 
 
 		 226 aa  385  1e-106  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000000130211  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0618  hypothetical protein  81.86 
 
 		 226 aa  382  1e-105  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.357102  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0565  hypothetical protein  80.89 
 
 		 226 aa  380  1e-105  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0717  hypothetical protein  80.53 
 
 		 226 aa  378  1e-104  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.0000000253337  unclonable  0.0000000117044 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2673  hypothetical protein  75.22 
 
 		 226 aa  359  2e-98  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.241271  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2681  hypothetical protein  68 
 
 		 226 aa  325  4.0000000000000003e-88  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0612362  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00863  hypothetical protein  67.11 
 
 		 228 aa  322  3e-87  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2019  hypothetical protein  66.67 
 
 		 228 aa  317  7e-86  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000582127  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3638  hypothetical protein  64 
 
 		 226 aa  298  5e-80  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.1465  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3320  hypothetical protein  62.05 
 
 		 225 aa  295  3e-79  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.915489  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0181  hypothetical protein  60.89 
 
 		 226 aa  292  3e-78  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1190  phosphate transport regulator  58.22 
 
 		 226 aa  283  2.0000000000000002e-75  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.967179  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004528  phosphate transport regulator  67.53 
 
 		 195 aa  278  5e-74  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.327148  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0351  hypothetical protein  54.22 
 
 		 225 aa  257  8e-68  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_68800  hypothetical protein  52 
 
 		 225 aa  254  1.0000000000000001e-66  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5953  hypothetical protein  51.56 
 
 		 225 aa  253  2.0000000000000002e-66  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0634  hypothetical protein  50.67 
 
 		 223 aa  238  4e-62  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0618  hypothetical protein  50.67 
 
 		 223 aa  238  5.999999999999999e-62  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2827  hypothetical protein  49.54 
 
 		 224 aa  230  2e-59  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.245918  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2470  hypothetical protein  49.55 
 
 		 226 aa  221  4.9999999999999996e-57  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0141  Putitive phosphate transport regulator  48.21 
 
 		 226 aa  220  9.999999999999999e-57  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.572504  normal  0.330321 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0711  hypothetical protein  51.57 
 
 		 226 aa  219  1.9999999999999999e-56  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2188  hypothetical protein  47.75 
 
 		 226 aa  218  3.9999999999999997e-56  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.839701  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0138  putative pit accessory protein  46.85 
 
 		 238 aa  214  9e-55  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1052  hypothetical protein  47.47 
 
 		 224 aa  203  2e-51  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  hitchhiker  0.00170442  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0228  hypothetical protein  44 
 
 		 227 aa  173  1.9999999999999998e-42  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.775061  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1146  Putitive phosphate transport regulator  30.91 
 
 		 227 aa  127  1.0000000000000001e-28  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.266401  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0063  hypothetical protein  28.7 
 
 		 224 aa  114  1.0000000000000001e-24  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2044  hypothetical protein  28.7 
 
 		 228 aa  99  6e-20  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00000405279  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3224  hypothetical protein  27.15 
 
 		 222 aa  94.7  1e-18  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1625  hypothetical protein  27.49 
 
 		 217 aa  77.8  0.0000000000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.109704  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0285  hypothetical protein  25.82 
 
 		 217 aa  72.4  0.000000000005  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0788  hypothetical protein  22.75 
 
 		 212 aa  69.3  0.00000000004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0036  Putitive phosphate transport regulator  24.32 
 
 		 218 aa  63.2  0.000000003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3780  phosphate transport regulator-like  26.62 
 
 		 226 aa  61.2  0.00000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0688  hypothetical protein  23.71 
 
 		 222 aa  58.9  0.00000006  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.00000115743  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0664  hypothetical protein  23.2 
 
 		 222 aa  57.8  0.0000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000019589  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1923  hypothetical protein  23.77 
 
 		 223 aa  57.4  0.0000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  decreased coverage  0.00116502  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0013  hypothetical protein  22.44 
 
 		 213 aa  53.5  0.000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0013  hypothetical protein  22.44 
 
 		 213 aa  53.5  0.000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0493  hypothetical protein  20.75 
 
 		 224 aa  48.1  0.0001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  decreased coverage  0.000000213235  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1332  hypothetical protein  23.08 
 
 		 215 aa  43.5  0.003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1377  hypothetical protein  22.51 
 
 		 206 aa  42.7  0.004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00000152766  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3836  hypothetical protein  22.51 
 
 		 206 aa  42.7  0.004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.103602  hitchhiker  0.0000000000851308 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1615  hypothetical protein  21.99 
 
 		 206 aa  41.6  0.01  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000502331  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1509  hypothetical protein  21.99 
 
 		 206 aa  41.6  0.01  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.0044058  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1335  hypothetical protein  21.99 
 
 		 206 aa  41.6  0.01  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000652491  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1577  hypothetical protein  21.99 
 
 		 206 aa  41.6  0.01  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.0000193859  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>