More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SO_3651 on replicon NC_004347
Organism: Shewanella oneidensis MR-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008577  Shewana3_3218  50S ribosomal protein L27  100 
 
 
84 aa  167  6e-41  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  2.70517e-06  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0980  50S ribosomal protein L27  100 
 
 
84 aa  167  6e-41  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  1.10997e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3651  50S ribosomal protein L27  100 
 
 
84 aa  167  6e-41  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0896  50S ribosomal protein L27  98.81 
 
 
84 aa  166  9e-41  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  8.37185e-05  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3124  50S ribosomal protein L27  98.81 
 
 
84 aa  166  9e-41  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000107863  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3088  50S ribosomal protein L27  98.81 
 
 
84 aa  166  1e-40  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2926  50S ribosomal protein L27  98.81 
 
 
84 aa  166  1e-40  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  3.09766e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2828  50S ribosomal protein L27  98.8 
 
 
84 aa  164  3e-40  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  1.13295e-07  normal  0.198807 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1005  50S ribosomal protein L27  98.8 
 
 
84 aa  164  3e-40  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  8.76711e-06  decreased coverage  3.56458e-06 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0870  50S ribosomal protein L27  98.81 
 
 
84 aa  164  3e-40  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  5.45576e-07  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0968  50S ribosomal protein L27  98.81 
 
 
84 aa  164  5e-40  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  1.60226e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1070  50S ribosomal protein L27  98.81 
 
 
84 aa  164  5e-40  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  1.53229e-06  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3322  50S ribosomal protein L27  98.81 
 
 
84 aa  164  5e-40  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  1.82867e-07  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1037  50S ribosomal protein L27  98.81 
 
 
84 aa  164  5e-40  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  9.11721e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0853  50S ribosomal protein L27  98.8 
 
 
84 aa  163  8e-40  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  1.52445e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0955  50S ribosomal protein L27  98.8 
 
 
84 aa  162  1e-39  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.455715  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2854  50S ribosomal protein L27  94.05 
 
 
86 aa  161  3e-39  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  2.34792e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001672  LSU ribosomal protein L27p  94.05 
 
 
85 aa  158  2e-38  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  2.26464e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00801  50S ribosomal protein L27  94.05 
 
 
85 aa  158  2e-38  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0362  50S ribosomal protein L27  91.67 
 
 
85 aa  157  5e-38  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.000249852  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3756  50S ribosomal protein L27  91.67 
 
 
85 aa  157  6e-38  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  1.37777e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3975  50S ribosomal protein L27  91.67 
 
 
85 aa  157  6e-38  Yersinia pestis Angola  Bacteria  unclonable  2.19143e-12  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3611  50S ribosomal protein L27  91.67 
 
 
85 aa  157  6e-38  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  decreased coverage  7.11047e-15  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3478  ribosomal protein L27  91.67 
 
 
85 aa  155  1e-37  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  6.53762e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0474  50S ribosomal protein L27  90.48 
 
 
85 aa  155  2e-37  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  unclonable  5.37628e-11  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03001  hypothetical protein  91.67 
 
 
85 aa  154  4e-37  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.0066535  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4507  50S ribosomal protein L27  91.67 
 
 
85 aa  154  4e-37  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  6.0246e-10  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3670  50S ribosomal protein L27  91.67 
 
 
85 aa  154  4e-37  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  9.67389e-14  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3378  50S ribosomal protein L27  91.67 
 
 
85 aa  154  4e-37  Escherichia coli HS  Bacteria  unclonable  1.4045e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3481  50S ribosomal protein L27  91.67 
 
 
85 aa  154  4e-37  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  4.91459e-09  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0522  ribosomal protein L27  91.67 
 
 
85 aa  154  4e-37  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  2.3922e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0515  50S ribosomal protein L27  91.67 
 
 
85 aa  154  4e-37  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  7.94781e-06  normal  0.0169565 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3585  50S ribosomal protein L27  91.67 
 
 
85 aa  154  4e-37  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  2.50774e-15  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03050  50S ribosomal protein L27  91.67 
 
 
85 aa  154  4e-37  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00726587  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0559  50S ribosomal protein L27  88.1 
 
 
85 aa  151  2e-36  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00191418  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0794  50S ribosomal protein L27  89.29 
 
 
85 aa  152  2e-36  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  2.03934e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3359  ribosomal protein L27  86.9 
 
 
85 aa  151  3e-36  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.000421163  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3621  50S ribosomal protein L27  89.29 
 
 
85 aa  150  6e-36  Enterobacter sp. 638  Bacteria  unclonable  3.51057e-09  normal  0.260967 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3737  50S ribosomal protein L27  86.9 
 
 
85 aa  150  8e-36  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.000346028  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3495  50S ribosomal protein L27  88.1 
 
 
85 aa  149  9e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  2.22447e-05  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3662  50S ribosomal protein L27  88.1 
 
 
85 aa  149  9e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  decreased coverage  3.24123e-05  normal  0.0701159 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3600  50S ribosomal protein L27  88.1 
 
 
85 aa  149  9e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  hitchhiker  0.00592088  normal  0.834432 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3564  50S ribosomal protein L27  88.1 
 
 
85 aa  149  9e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.00211833  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3493  50S ribosomal protein L27  88.1 
 
 
85 aa  149  9e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  3.10399e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03730  50S ribosomal protein L27  86.9 
 
 
85 aa  149  1e-35  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  decreased coverage  3.22672e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4511  50S ribosomal protein L27  85.71 
 
 
85 aa  149  2e-35  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0856  50S ribosomal protein L27  82.93 
 
 
86 aa  141  3e-33  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.701213  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3207  ribosomal protein L27  79.27 
 
 
85 aa  140  5e-33  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0246  50S ribosomal protein L27  82.14 
 
 
85 aa  140  5e-33  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  9.45082e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1009  50S ribosomal protein L27  80.95 
 
 
85 aa  139  1e-32  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  9.11893e-12  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0526  50S ribosomal protein L27  83.33 
 
 
85 aa  139  2e-32  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0846  50S ribosomal protein L27  79.27 
 
 
86 aa  136  8e-32  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0475  50S ribosomal protein L27  79.27 
 
 
85 aa  135  1e-31  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0828621  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2006  ribosomal protein L27  75 
 
 
86 aa  134  5e-31  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.962508  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0269  50S ribosomal protein L27  78.05 
 
 
85 aa  134  5e-31  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.876975  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0865  50S ribosomal protein L27  79.52 
 
 
87 aa  134  6e-31  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.437144  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2247  50S ribosomal protein L27  78.05 
 
 
85 aa  132  1e-30  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  hitchhiker  4.79005e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60450  50S ribosomal protein L27  77.38 
 
 
85 aa  130  7e-30  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0112062 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5207  50S ribosomal protein L27  77.38 
 
 
85 aa  130  7e-30  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.121929  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1847  50S ribosomal protein L27  75 
 
 
85 aa  129  1e-29  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0497  50S ribosomal protein L27  75 
 
 
90 aa  129  2e-29  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  3.67607e-14  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1632  50S ribosomal protein L27  75.61 
 
 
87 aa  128  3e-29  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.848306  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4237  50S ribosomal protein L27  73.81 
 
 
85 aa  127  4e-29  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  7.65087e-06  hitchhiker  1.8706e-07 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1682  50S ribosomal protein L27  75 
 
 
90 aa  127  4e-29  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  2.49957e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0892  50S ribosomal protein L27  73.49 
 
 
85 aa  127  6e-29  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.0670599 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1051  50S ribosomal protein L27  72.29 
 
 
89 aa  126  1e-28  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.212456  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4859  50S ribosomal protein L27  70.24 
 
 
85 aa  124  4e-28  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.606604 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0310  50S ribosomal protein L27  71.95 
 
 
89 aa  124  4e-28  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0702  50S ribosomal protein L27  69.51 
 
 
91 aa  124  4e-28  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.616074 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0798  ribosomal protein L27  69.51 
 
 
91 aa  124  4e-28  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40780  50S ribosomal protein L27  74.39 
 
 
85 aa  124  4e-28  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3460  50S ribosomal protein L27  73.17 
 
 
89 aa  124  5e-28  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.159862  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0461  50S ribosomal protein L27  69.51 
 
 
86 aa  124  5e-28  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00297252 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0284  50S ribosomal protein L27  69.51 
 
 
86 aa  124  5e-28  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.349085  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4496  50S ribosomal protein L27  72.62 
 
 
85 aa  124  6e-28  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.191975  normal  0.508112 
 
 
-
 
NC_004310  BR1849  50S ribosomal protein L27  71.95 
 
 
89 aa  123  7e-28  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4211  50S ribosomal protein L27  70.73 
 
 
93 aa  123  7e-28  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.121619 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1781  50S ribosomal protein L27  71.95 
 
 
89 aa  123  7e-28  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.810643  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0512  50S ribosomal protein L27  72.29 
 
 
85 aa  123  8e-28  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0535164 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3471  50S ribosomal protein L27  69.51 
 
 
87 aa  122  1e-27  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00282639  normal  0.386116 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2143  50S ribosomal protein L27  69.51 
 
 
90 aa  123  1e-27  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.672881 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3006  50S ribosomal protein L27  73.17 
 
 
89 aa  122  1e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.549132 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3034  50S ribosomal protein L27  70.73 
 
 
85 aa  122  2e-27  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2651  50S ribosomal protein L27  70.73 
 
 
86 aa  122  2e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0231869  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3681  50S ribosomal protein L27  71.95 
 
 
85 aa  122  2e-27  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0417  50S ribosomal protein L27  71.95 
 
 
91 aa  121  3e-27  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.302693 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1572  50S ribosomal protein L27  69.05 
 
 
85 aa  121  4e-27  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.355414  normal  0.759943 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1754  50S ribosomal protein L27  69.05 
 
 
85 aa  121  4e-27  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.163114  normal  0.0575884 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0643  50S ribosomal protein L27  76.83 
 
 
84 aa  120  5e-27  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.301948  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3870  50S ribosomal protein L27  69.51 
 
 
89 aa  120  5e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.403314  normal  0.0137956 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4287  50S ribosomal protein L27  70.73 
 
 
90 aa  120  5e-27  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.835773  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4194  50S ribosomal protein L27  69.51 
 
 
89 aa  120  5e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0721  50S ribosomal protein L27  70.24 
 
 
85 aa  120  7e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.71975 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0750  50S ribosomal protein L27  66.67 
 
 
85 aa  120  7e-27  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00233026 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0689  50S ribosomal protein L27  70.24 
 
 
85 aa  120  7e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0721  50S ribosomal protein L27  70.24 
 
 
85 aa  120  7e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.980566  normal  0.0233999 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2957  50S ribosomal protein L27  69.51 
 
 
86 aa  120  8e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.668202  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3276  50S ribosomal protein L27  69.51 
 
 
85 aa  120  8e-27  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000212602 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2703  50S ribosomal protein L27  70.73 
 
 
92 aa  119  1e-26  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2575  50S ribosomal protein L27  70.73 
 
 
92 aa  119  1e-26  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>