113 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SO_3648 on replicon NC_004347
Organism: Shewanella oneidensis MR-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004347  SO_3648  hypothetical protein  100 
 
 		 253 aa  516  1.0000000000000001e-145  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0898  hypothetical protein  95.65 
 
 		 253 aa  499  1e-140  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0152477  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3122  hypothetical protein  95.26 
 
 		 253 aa  498  1e-140  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.165656  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3216  hypothetical protein  94.47 
 
 		 253 aa  496  1e-139  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00414919  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0982  hypothetical protein  95.65 
 
 		 253 aa  494  1e-139  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.109631  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0970  hypothetical protein  92.09 
 
 		 253 aa  482  1e-135  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.215146  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1039  hypothetical protein  92.09 
 
 		 253 aa  483  1e-135  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000460827  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1072  hypothetical protein  92.09 
 
 		 253 aa  483  1e-135  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0112662  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3320  protein of unknown function DUF1212  92.09 
 
 		 253 aa  482  1e-135  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.231123  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0872  hypothetical protein  84.19 
 
 		 253 aa  444  1.0000000000000001e-124  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0121559  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2826  hypothetical protein  85.38 
 
 		 253 aa  441  1e-123  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.270543  normal  0.361668 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0957  hypothetical protein  86.96 
 
 		 253 aa  440  9.999999999999999e-123  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0855  hypothetical protein  82.14 
 
 		 252 aa  434  1e-121  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00301757  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1007  hypothetical protein  85.38 
 
 		 253 aa  435  1e-121  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.306388  hitchhiker  0.0000272829 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3086  hypothetical protein  80.95 
 
 		 252 aa  427  1e-119  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2924  hypothetical protein  79.45 
 
 		 253 aa  397  1e-109  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000395261  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1290  hypothetical protein  52.03 
 
 		 258 aa  274  9e-73  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.813938  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0364  membrane protein  51.41 
 
 		 259 aa  267  1e-70  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.171907  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00803  hypothetical protein  50.8 
 
 		 266 aa  261  4.999999999999999e-69  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0191  hypothetical protein  50.62 
 
 		 262 aa  258  9e-68  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.890079  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001670  hypothetical protein  50.2 
 
 		 266 aa  257  1e-67  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.131782  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4957  hypothetical protein  48.81 
 
 		 277 aa  249  2e-65  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000264038  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0522  hypothetical protein  49.21 
 
 		 258 aa  249  3e-65  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00205537 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04241  predicted inner membrane protein  48.41 
 
 		 256 aa  248  8e-65  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00100125  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3633  protein of unknown function DUF1212  48.41 
 
 		 256 aa  248  8e-65  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000233755  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3691  hypothetical protein  48.41 
 
 		 256 aa  248  8e-65  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00109237  hitchhiker  0.00166736 
 
 
-
 
NC_012892  B21_04207  hypothetical protein  48.41 
 
 		 256 aa  248  8e-65  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00106289  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4596  hypothetical protein  48.41 
 
 		 277 aa  248  9e-65  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  1.19778e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4904  hypothetical protein  48.41 
 
 		 277 aa  247  1e-64  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000992297  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5877  hypothetical protein  48.41 
 
 		 274 aa  247  1e-64  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00509244  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0718  hypothetical protein  51.23 
 
 		 266 aa  246  2e-64  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.372885 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4909  hypothetical protein  48.41 
 
 		 274 aa  245  6e-64  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000641021  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2856  hypothetical protein  48.19 
 
 		 289 aa  244  9.999999999999999e-64  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00225782  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4901  hypothetical protein  48.19 
 
 		 314 aa  242  3e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.528257  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4867  inner membrane protein YjjP  48.19 
 
 		 303 aa  242  3.9999999999999997e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.573654  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3580  hypothetical protein  50.2 
 
 		 266 aa  241  7e-63  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4960  hypothetical protein  47.79 
 
 		 314 aa  241  7e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0780  hypothetical protein  50.2 
 
 		 266 aa  241  7.999999999999999e-63  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.494899  normal  0.145093 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4800  hypothetical protein  47.79 
 
 		 314 aa  241  7.999999999999999e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.329645  normal  0.457693 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4954  hypothetical protein  47.79 
 
 		 314 aa  241  9e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3451  hypothetical protein  49.8 
 
 		 266 aa  238  5.999999999999999e-62  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0557  protein of unknown function DUF1212  48.58 
 
 		 260 aa  231  7.000000000000001e-60  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.936785  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3643  hypothetical protein  48.8 
 
 		 273 aa  231  7.000000000000001e-60  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3838  protein of unknown function DUF1212  48.8 
 
 		 279 aa  231  1e-59  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0597  protein of unknown function DUF1212  47.37 
 
 		 258 aa  226  4e-58  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.43168  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3691  hypothetical protein  44.9 
 
 		 261 aa  199  3e-50  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.411423  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0799  protein of unknown function DUF1212  45.34 
 
 		 239 aa  191  9e-48  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1964  hypothetical protein  39.29 
 
 		 268 aa  185  6e-46  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1691  ThrE family exporter large subunit  39.04 
 
 		 267 aa  184  2.0000000000000003e-45  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2002  hypothetical protein  39.84 
 
 		 262 aa  183  2.0000000000000003e-45  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0269225 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1962  protein of unknown function DUF1212  30.11 
 
 		 258 aa  101  1e-20  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0150285  hitchhiker  0.00184472 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0380  putative integral membrane protein  30.05 
 
 		 211 aa  98.2  1e-19  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1824  phosphoglycerate kinase  25.79 
 
 		 259 aa  92  7e-18  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2927  hypothetical protein  28.22 
 
 		 267 aa  90.9  2e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.483755  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2893  hypothetical protein  28.45 
 
 		 269 aa  90.9  2e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.135065  normal  0.152358 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1616  hypothetical protein  36.43 
 
 		 260 aa  90.5  2e-17  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0908  protein of unknown function DUF1212  27.13 
 
 		 256 aa  90.9  2e-17  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.395602  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1085  conserved hypothetical integral membrane protein (DUF1212 domain protein)  25.84 
 
 		 258 aa  87.8  1e-16  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.451526  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2818  protein of unknown function DUF1212  27.2 
 
 		 268 aa  85.9  6e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.166061  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2542  hypothetical protein  27.39 
 
 		 267 aa  84.3  0.000000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1300  hypothetical protein  24.86 
 
 		 258 aa  82  0.000000000000009  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.0681274  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1181  hypothetical protein  24.86 
 
 		 258 aa  82  0.000000000000009  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2596  hypothetical protein  30.65 
 
 		 281 aa  79.3  0.00000000000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.517735  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02000  hypothetical protein  29.46 
 
 		 420 aa  79  0.00000000000008  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.603412  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1842  hypothetical protein  25.73 
 
 		 256 aa  75.5  0.0000000000008  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4593  protein of unknown function DUF1212  29.28 
 
 		 422 aa  75.1  0.0000000000009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1561  hypothetical protein  25.31 
 
 		 256 aa  71.6  0.00000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0286  protein of unknown function DUF1212  27.52 
 
 		 440 aa  70.5  0.00000000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.153937  normal  0.0652843 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0712  hypothetical protein  27.31 
 
 		 260 aa  69.3  0.00000000005  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0658885  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0887  protein of unknown function DUF1212  26.94 
 
 		 511 aa  66.6  0.0000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1317  hypothetical protein  25.2 
 
 		 451 aa  66.2  0.0000000005  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0825512  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2185  hypothetical protein  25.81 
 
 		 256 aa  65.5  0.0000000008  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1896  hypothetical protein  26.21 
 
 		 256 aa  65.1  0.000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1059  protein of unknown function DUF1212  22.04 
 
 		 250 aa  65.1  0.000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.22587  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0554  protein of unknown function DUF1212  24.89 
 
 		 261 aa  64.7  0.000000001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04050  hypothetical protein  22.54 
 
 		 634 aa  63.5  0.000000003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1527  hypothetical protein  25.2 
 
 		 455 aa  62.4  0.000000006  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8725  protein of unknown function DUF1212  24.69 
 
 		 461 aa  62  0.000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0908337 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0175  protein of unknown function DUF1212  27.8 
 
 		 433 aa  61.6  0.00000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1476  protein of unknown function DUF1212  25.12 
 
 		 468 aa  61.2  0.00000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.783892  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0855  protein of unknown function DUF1212  20.66 
 
 		 260 aa  58.9  0.00000008  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.570744 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0517  protein of unknown function DUF1212  26.38 
 
 		 422 aa  58.2  0.0000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0133361  hitchhiker  0.00000293243 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0870  hypothetical protein  24.02 
 
 		 415 aa  57.4  0.0000002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0412  hypothetical protein  23.83 
 
 		 253 aa  57  0.0000003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3914  hypothetical protein  20.8 
 
 		 531 aa  56.6  0.0000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.631878  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3988  hypothetical protein  20.8 
 
 		 531 aa  56.6  0.0000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.911951  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13769  transmembrane protein  21.14 
 
 		 529 aa  56.2  0.0000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0234  hypothetical protein  25.35 
 
 		 254 aa  55.8  0.0000006  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0019  hypothetical protein  32.09 
 
 		 573 aa  55.8  0.0000007  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.0694356 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5838  hypothetical protein  20.63 
 
 		 529 aa  55.5  0.0000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.245056 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3929  hypothetical protein  20.4 
 
 		 531 aa  54.7  0.000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0854628 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0850  hypothetical protein  24.9 
 
 		 458 aa  53.9  0.000002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000674483  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3700  hypothetical protein  27.64 
 
 		 473 aa  53.9  0.000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.296209  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3002  hypothetical protein  21.01 
 
 		 418 aa  53.5  0.000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.682044  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6449  hypothetical protein  24 
 
 		 448 aa  53.9  0.000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0151051  normal  0.0379764 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1546  protein of unknown function DUF1212  23.87 
 
 		 426 aa  52.8  0.000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0822  protein of unknown function DUF1212  21.91 
 
 		 250 aa  52.4  0.000006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00000371019  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1048  hypothetical protein  23.32 
 
 		 410 aa  52.4  0.000007  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0526443  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0609  hypothetical protein  24.2 
 
 		 254 aa  52  0.000009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0623  hypothetical protein  24.2 
 
 		 254 aa  52  0.000009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>