67 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SO_3623 on replicon NC_004347
Organism: Shewanella oneidensis MR-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004347  SO_3623  tetraheme cytochrome c  100 
 
 		 116 aa  243  4.9999999999999997e-64  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4179  tetraheme cytochrome c  76.72 
 
 		 120 aa  195  2.0000000000000003e-49  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.717177 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0276  tetraheme cytochrome c  50.86 
 
 		 117 aa  135  2e-31  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000156346 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2152  tetraheme cytochrome c  47.41 
 
 		 117 aa  134  5e-31  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.738839  normal  0.0741814 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2229  tetraheme cytochrome c  46.55 
 
 		 117 aa  132  1.9999999999999998e-30  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.257402 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3938  tetraheme cytochrome c  50 
 
 		 117 aa  130  6e-30  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0274  tetraheme cytochrome c  47.41 
 
 		 117 aa  124  3e-28  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00010475 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3535  tetraheme cytochrome c  51.38 
 
 		 119 aa  124  6e-28  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0255  tetraheme cytochrome c  52.53 
 
 		 101 aa  115  1.9999999999999998e-25  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0257  tetraheme cytochrome c  47.37 
 
 		 117 aa  114  5e-25  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3896  tetraheme cytochrome c  47.41 
 
 		 117 aa  114  5e-25  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.486536  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3056  tetraheme cytochrome c  35.71 
 
 		 127 aa  82  0.000000000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1491  tetraheme cytochrome c  36.51 
 
 		 127 aa  82  0.000000000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3370  tetraheme cytochrome c  36 
 
 		 126 aa  81.3  0.000000000000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.656549  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2402  tetraheme cytochrome c, putative  38.71 
 
 		 122 aa  81.6  0.000000000000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2279  tetraheme cytochrome c  45.54 
 
 		 126 aa  80.9  0.000000000000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0855381  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2430  tetraheme cytochrome c  34.92 
 
 		 135 aa  80.9  0.000000000000006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.439789  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0342  tetraheme cytochrome c  39.64 
 
 		 126 aa  75.9  0.0000000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4185  tetraheme cytochrome c, putative  40 
 
 		 122 aa  73.9  0.0000000000007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.17754 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2510  tetraheme cytochrome c  36.97 
 
 		 122 aa  72.8  0.000000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2535  tetraheme cytochrome c, putative  33.04 
 
 		 122 aa  71.2  0.000000000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.091656  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0275  tetraheme cytochrome c, putative  37.35 
 
 		 122 aa  68.9  0.00000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000173309 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1413  tetraheme cytochrome c, putative  37.35 
 
 		 123 aa  67.4  0.00000000006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0324  tetraheme cytochrome c, putative  36.47 
 
 		 122 aa  67.4  0.00000000007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0300  tetraheme cytochrome c, putative  34.48 
 
 		 123 aa  65.1  0.0000000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.42786  normal  0.0669072 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3617  hypothetical protein  38.96 
 
 		 137 aa  60.8  0.000000006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3300  cytochrome c  34.71 
 
 		 126 aa  60.5  0.000000007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3776  flavocytochrome c  31.15 
 
 		 596 aa  59.7  0.00000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00235124 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0339  cytochrome c  36.67 
 
 		 116 aa  59.7  0.00000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3683  hypothetical protein  37.66 
 
 		 137 aa  58.2  0.00000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0611  fumarate reductase flavoprotein subunit precursor  38.61 
 
 		 593 aa  58.2  0.00000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.755689 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0942  hypothetical protein  40.26 
 
 		 172 aa  56.2  0.0000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3693  hypothetical protein  33.04 
 
 		 118 aa  55.8  0.0000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.799168  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1004  hypothetical protein  35.24 
 
 		 165 aa  53.9  0.0000007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3690  flavocytochrome c  28.83 
 
 		 583 aa  52.8  0.000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3769  hypothetical protein  35.11 
 
 		 155 aa  52.8  0.000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0970  fumarate reductase flavoprotein subunit precursor  28.33 
 
 		 596 aa  51.6  0.000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3215  flavocytochrome c  28.33 
 
 		 596 aa  51.2  0.000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.57421 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0808  flavocytochrome c  28.33 
 
 		 596 aa  51.2  0.000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.587828  normal  0.0624147 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3182  hypothetical protein  31.3 
 
 		 118 aa  51.2  0.000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2786  hypothetical protein  27.78 
 
 		 113 aa  51.2  0.000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.12053 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3318  flavocytochrome c  27.5 
 
 		 596 aa  49.7  0.00001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.5959  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0905  flavocytochrome c  27.5 
 
 		 597 aa  49.7  0.00001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.604755  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1158  hypothetical protein  29.09 
 
 		 114 aa  49.3  0.00002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3597  flavocytochrome c  31.03 
 
 		 591 aa  48.9  0.00002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3112  flavocytochrome c  30.63 
 
 		 596 aa  48.9  0.00002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000541974 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3628  flavocytochrome c  29.75 
 
 		 596 aa  48.5  0.00003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0859  flavocytochrome c  29.75 
 
 		 596 aa  48.5  0.00003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3433  flavocytochrome c  29.75 
 
 		 596 aa  48.5  0.00003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3505  flavocytochrome c  29.75 
 
 		 596 aa  48.5  0.00003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3541  flavocytochrome c  34.52 
 
 		 589 aa  48.1  0.00004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000144139  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1830  flavocytochrome c heme subunit  34.85 
 
 		 144 aa  48.1  0.00004  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3388  hypothetical protein  31.62 
 
 		 116 aa  47.8  0.00005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0722  flavocytochrome c  28.18 
 
 		 596 aa  47.4  0.00006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3877  succinate dehydrogenase  32.73 
 
 		 596 aa  47  0.00008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00000270258  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0946  fumarate reductase flavoprotein subunit precursor  30 
 
 		 122 aa  46.6  0.0001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1445  flavocytochrome c heme subunit  36.36 
 
 		 153 aa  46.2  0.0002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.390446  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0509  tetraheme cytochrome c  31.17 
 
 		 118 aa  45.8  0.0002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3625  flavocytochrome c  30.85 
 
 		 596 aa  45.1  0.0003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2085  flavocytochrome c heme subunit  44.26 
 
 		 146 aa  44.7  0.0004  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.952774  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0627  hypothetical protein  39.24 
 
 		 125 aa  44.7  0.0004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.593343 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1421  fumarate reductase flavoprotein subunit  32.26 
 
 		 589 aa  44.3  0.0006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0887  hypothetical protein  31.19 
 
 		 136 aa  43.1  0.001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.590211  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04270  hypothetical protein  41.94 
 
 		 182 aa  42  0.003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.379993  normal  0.356103 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0137  fumarate reductase flavoprotein subunit  31.9 
 
 		 130 aa  41.6  0.003  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.100425  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4036  flavocytochrome c  35 
 
 		 598 aa  41.2  0.005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2892  hypothetical protein  42.86 
 
 		 122 aa  40.8  0.007  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>