More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SO_3562 on replicon NC_004347
Organism: Shewanella oneidensis MR-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011663  Sbal223_3263  sodium:dicarboxylate symporter  92.93 
 
 		 419 aa  736    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.316295  normal  0.0437652 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1326  sodium:dicarboxylate symporter  84.2 
 
 		 427 aa  676    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.027246 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3562  proton/glutamate symporter, putative  100 
 
 		 413 aa  814    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1206  sodium:dicarboxylate symporter  84.24 
 
 		 416 aa  672    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1224  sodium:dicarboxylate symporter  85.43 
 
 		 416 aa  668    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1033  sodium:dicarboxylate symporter  92.44 
 
 		 419 aa  710    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1216  sodium:dicarboxylate symporter  83.41 
 
 		 441 aa  680    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1095  sodium:dicarboxylate symporter  92.68 
 
 		 419 aa  734    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2983  sodium:dicarboxylate symporter  94.42 
 
 		 417 aa  733    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.799074 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3065  sodium:dicarboxylate symporter  94.66 
 
 		 417 aa  735    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.715653 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1069  sodium:dicarboxylate symporter  85.78 
 
 		 416 aa  656    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3329  sodium:dicarboxylate symporter  84.35 
 
 		 426 aa  646    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00153247 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1129  sodium:dicarboxylate symporter  92.93 
 
 		 419 aa  736    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3163  sodium:dicarboxylate symporter  94.66 
 
 		 417 aa  737    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1055  sodium:dicarboxylate symporter  82.13 
 
 		 417 aa  668    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.637343 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1028  sodium:dicarboxylate symporter  92.68 
 
 		 419 aa  733    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0922  proton/glutamate symporter  48.9 
 
 		 424 aa  396  1e-109  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3549  sodium:dicarboxylate symporter  48.05 
 
 		 444 aa  393  1e-108  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3671  sodium:dicarboxylate symporter  48.29 
 
 		 444 aa  394  1e-108  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.154898 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0764  sodium:dicarboxylate symporter  47.95 
 
 		 435 aa  394  1e-108  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3259  sodium:dicarboxylate symporter  47.95 
 
 		 440 aa  394  1e-108  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3362  sodium:dicarboxylate symporter  47.95 
 
 		 440 aa  394  1e-108  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0768  sodium:dicarboxylate symporter  48.05 
 
 		 444 aa  393  1e-108  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3480  sodium:dicarboxylate symporter  47.56 
 
 		 444 aa  390  1e-107  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0775  sodium:dicarboxylate symporter  48.88 
 
 		 432 aa  390  1e-107  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0743  sodium:dicarboxylate symporter  46.94 
 
 		 433 aa  387  1e-106  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1904  sodium:dicarboxylate symporter  47.67 
 
 		 409 aa  384  1e-105  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.27759  normal  0.374206 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2768  proton/glutamate symporter  47.56 
 
 		 430 aa  383  1e-105  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0863  sodium:dicarboxylate symporter  47.06 
 
 		 443 aa  381  1e-104  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0862  sodium:dicarboxylate symporter  46.45 
 
 		 449 aa  377  1e-103  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0129  sodium:dicarboxylate symporter  48.28 
 
 		 417 aa  368  1e-100  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.957581  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1067  sodium:dicarboxylate symporter  47.54 
 
 		 410 aa  361  2e-98  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  decreased coverage  0.0000677504  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2889  sodium:dicarboxylate symporter  43.26 
 
 		 444 aa  352  5e-96  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.568975  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1656  glutamate symport protein  42.55 
 
 		 437 aa  345  8.999999999999999e-94  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.51516  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01901  glutamate symport protein  41.75 
 
 		 439 aa  343  2.9999999999999997e-93  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.876346  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1603  sodium:dicarboxylate symporter  42.32 
 
 		 437 aa  343  4e-93  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1191  sodium/dicarboxylate symporter family protein  40.66 
 
 		 435 aa  307  2.0000000000000002e-82  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.0028335  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1019  sodium:dicarboxylate symporter family protein  40.66 
 
 		 435 aa  306  3e-82  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00254139  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1800  sodium:dicarboxylate symporter  40.59 
 
 		 436 aa  290  4e-77  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0926897  hitchhiker  0.00000253529 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2612  sodium:dicarboxylate symporter  42.61 
 
 		 440 aa  290  5.0000000000000004e-77  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.821757  normal  0.0122814 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2492  sodium:dicarboxylate symporter  42.36 
 
 		 440 aa  288  1e-76  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.574734  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1532  sodium:dicarboxylate symporter  41.63 
 
 		 442 aa  288  1e-76  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.000000132104  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1852  sodium:dicarboxylate symporter  42.36 
 
 		 440 aa  288  1e-76  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000496305 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2499  sodium:dicarboxylate symporter  42.36 
 
 		 440 aa  287  2e-76  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.625769  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1726  sodium:dicarboxylate symporter  40.74 
 
 		 437 aa  286  7e-76  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.172911 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2844  sodium:dicarboxylate symporter  39.72 
 
 		 436 aa  284  2.0000000000000002e-75  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.00000693951  decreased coverage  0.00000000285663 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1657  sodium:dicarboxylate symporter  41.23 
 
 		 437 aa  283  4.0000000000000003e-75  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.188605  hitchhiker  0.000269021 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1319  sodium:dicarboxylate symporter  40.19 
 
 		 437 aa  283  5.000000000000001e-75  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0460332  normal  0.366599 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2349  sodium:dicarboxylate symporter  39.75 
 
 		 409 aa  282  7.000000000000001e-75  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3902  proton/glutamate symporter family protein  40.1 
 
 		 411 aa  282  7.000000000000001e-75  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1311  sodium:dicarboxylate symporter  40.35 
 
 		 411 aa  282  8.000000000000001e-75  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1508  proton/glutamate symporter family protein  40.1 
 
 		 411 aa  281  1e-74  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1300  proton/glutamate symporter family protein  39.95 
 
 		 411 aa  281  1e-74  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.643511  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1273  sodium:dicarboxylate symporter family protein  39.95 
 
 		 411 aa  281  1e-74  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1274  sodium:dicarboxylate symporter family protein  40.1 
 
 		 411 aa  281  1e-74  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1479  proton/glutamate symporter family protein  39.95 
 
 		 411 aa  281  1e-74  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1408  proton/glutamate symporter family protein  39.95 
 
 		 411 aa  281  1e-74  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1582  sodium:dicarboxylate symporter  40.99 
 
 		 437 aa  281  1e-74  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.147509 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2481  sodium:dicarboxylate symporter  39.53 
 
 		 436 aa  281  1e-74  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1547  proton/glutamate symporter family protein  40.1 
 
 		 411 aa  281  2e-74  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0277859  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0052  proton/glutamate symporter  42.78 
 
 		 433 aa  281  2e-74  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1441  proton/glutamate symporter family protein  39.85 
 
 		 411 aa  280  4e-74  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.221753  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1948  sodium:dicarboxylate symporter family protein  40.64 
 
 		 437 aa  280  4e-74  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0616  sodium:dicarboxylate symporter  40 
 
 		 413 aa  278  1e-73  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1571  sodium:dicarboxylate symporter  41.73 
 
 		 402 aa  278  1e-73  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.0000275384  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0681  sodium:dicarboxylate symporter family protein  40.2 
 
 		 409 aa  277  2e-73  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.442764  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2253  sodium:dicarboxylate symporter  41.43 
 
 		 441 aa  277  2e-73  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1281  sodium/dicarboxylate symporter  40.14 
 
 		 434 aa  277  2e-73  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.14269  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2359  sodium:dicarboxylate symporter  42.33 
 
 		 449 aa  275  7e-73  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0747418  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04867  glutamate-aspartate symport protein  42.66 
 
 		 434 aa  275  1.0000000000000001e-72  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2227  sodium:dicarboxylate symporter  38.83 
 
 		 439 aa  274  2.0000000000000002e-72  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.49503  hitchhiker  0.00495377 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001114  proton/glutamate symporter  42.66 
 
 		 434 aa  273  3e-72  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.602578  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1114  sodium:dicarboxylate symporter  40.05 
 
 		 411 aa  272  1e-71  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.819191  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2890  sodium:dicarboxylate symporter  37.35 
 
 		 424 aa  266  5.999999999999999e-70  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2331  sodium:dicarboxylate symporter  38.68 
 
 		 438 aa  264  2e-69  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.712611  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1771  sodium:dicarboxylate symporter  39.36 
 
 		 437 aa  264  2e-69  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.975695  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1194  putative proton/glutamate symporter  39.58 
 
 		 447 aa  263  4.999999999999999e-69  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.17283  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1033  proton/sodium-glutamate symport protein (glutamate-aspartate carrierprotein)  38.83 
 
 		 430 aa  261  1e-68  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.0000352201  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1338  proton/glutamate symporter  38.01 
 
 		 445 aa  261  1e-68  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1613  proton/sodium-glutamate symport protein  35.89 
 
 		 423 aa  259  8e-68  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1846  proton/sodium-glutamate symporter  35.89 
 
 		 423 aa  259  8e-68  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00724946 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0137  glutamate/aspartate:proton symporter  38.42 
 
 		 442 aa  259  9e-68  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.926861 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1648  proton/sodium-glutamate symport protein  36.12 
 
 		 423 aa  258  1e-67  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3531  proton/sodium-glutamate symporter  36.12 
 
 		 423 aa  258  1e-67  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1810  proton/sodium-glutamate symporter  36.12 
 
 		 423 aa  258  1e-67  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1666  proton/sodium-glutamate symporter  35.65 
 
 		 423 aa  257  2e-67  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1799  proton/sodium-glutamate symporter  35.65 
 
 		 423 aa  257  2e-67  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72340  glutamate/aspartate:proton symporter  38.74 
 
 		 444 aa  258  2e-67  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1920  proton/sodium-glutamate symporter  36.12 
 
 		 423 aa  257  3e-67  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11810  Na+/H+ dicarboxylate symporter  38.08 
 
 		 440 aa  257  3e-67  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.0215347 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6277  glutamate/aspartate:proton symporter  38.74 
 
 		 444 aa  256  3e-67  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1555  proton/glutamate symporter family protein  38.82 
 
 		 423 aa  256  7e-67  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000000396651  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1593  proton/glutamate symporter family protein  38.57 
 
 		 423 aa  256  7e-67  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000481335  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1664  sodium:dicarboxylate symporter  36.14 
 
 		 423 aa  255  9e-67  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1450  proton/glutamate symporter family protein  38.08 
 
 		 423 aa  255  9e-67  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.000000000273308  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1524  proton/glutamate symporter family protein  38.08 
 
 		 423 aa  255  9e-67  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    decreased coverage  4.0675800000000005e-55 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1314  proton/sodium-glutamate symport protein  38.33 
 
 		 423 aa  254  1.0000000000000001e-66  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.00000000288738  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1315  proton/sodium-glutamate symport protein  38.08 
 
 		 423 aa  254  2.0000000000000002e-66  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  2.63752e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1487  proton/glutamate symporter family protein  38.08 
 
 		 424 aa  254  2.0000000000000002e-66  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000311717  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1153  sodium:dicarboxylate symporter  38.96 
 
 		 423 aa  254  2.0000000000000002e-66  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.00000424647  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>