172 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SO_3503 on replicon NC_004347
Organism: Shewanella oneidensis MR-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003910  CPS_1028  glucose/galactose transporter family protein  75.86 
 
 		 433 aa  649    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3503  glucose/galactose transporter  100 
 
 		 435 aa  859    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2702  glucose/galactose transporter  83.37 
 
 		 433 aa  725    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0791256  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3207  glucose/galactose transporter  93.06 
 
 		 432 aa  808    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2931  glucose/galactose transporter  93.52 
 
 		 432 aa  789    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000470631  normal  0.974041 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3013  glucose/galactose transporter  93.52 
 
 		 432 aa  789    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0638848  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3110  glucose/galactose transporter  93.75 
 
 		 432 aa  790    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0409592  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1088  glucose/galactose transporter  92.82 
 
 		 432 aa  807    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.307429  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1119  glucose/galactose transporter  87.35 
 
 		 418 aa  683    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.00000391013  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1080  glucose/galactose transporter  93.29 
 
 		 432 aa  805    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000174019  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1148  glucose/galactose transporter  92.82 
 
 		 432 aa  808    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0988235  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1215  glucose/galactose transporter  85.42 
 
 		 434 aa  727    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.00000975208  normal  0.526597 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1182  glucose/galactose transporter  92.36 
 
 		 432 aa  802    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.884299  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1315  glucose/galactose transporter  85.22 
 
 		 435 aa  746    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0258067  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1104  glucose/galactose transporter  52.05 
 
 		 437 aa  428  1e-118  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0045785  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0948  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  52.06 
 
 		 441 aa  417  9.999999999999999e-116  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.000625246  normal  0.50538 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3038  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  50.7 
 
 		 443 aa  410  1e-113  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000693301 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1199  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  49.08 
 
 		 438 aa  409  1e-113  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.985389  normal  0.598645 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2077  glucose/galactose transporter  49.65 
 
 		 426 aa  400  9.999999999999999e-111  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4175  glucose/galactose transporter  48.21 
 
 		 446 aa  398  1e-109  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2696  major facilitator transporter  51.24 
 
 		 452 aa  382  1e-105  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2530  major facilitator transporter  50.68 
 
 		 452 aa  380  1e-104  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2597  major facilitator transporter  50.45 
 
 		 452 aa  380  1e-104  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.802084  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4488  glucose/galactose transporter  38.15 
 
 		 440 aa  318  7.999999999999999e-86  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.797276  normal  0.125839 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1696  glucose/galactose transporter  39.58 
 
 		 444 aa  318  1e-85  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0309117  normal  0.239808 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0875  glucose/galactose transporter  40.77 
 
 		 429 aa  309  5e-83  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.742352  hitchhiker  0.000720356 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3397  glucose/galactose transporter  39.4 
 
 		 419 aa  309  6.999999999999999e-83  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0776  glucose/galactose transporter  39.77 
 
 		 441 aa  309  6.999999999999999e-83  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.747868  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6560  glucose/galactose transporter  39.15 
 
 		 438 aa  298  1e-79  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.13532  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0466  glucose/galactose transporter  40.55 
 
 		 408 aa  293  5e-78  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.187531  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1002  glucose/galactose transporter  39.49 
 
 		 406 aa  291  2e-77  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00935633  normal  0.690968 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4115  glucose/galactose transporter  40.29 
 
 		 429 aa  290  5.0000000000000004e-77  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.312497  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04321  glucose-galactose transporter  40.81 
 
 		 407 aa  289  7e-77  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3114  glucose/galactose transporter  40.77 
 
 		 430 aa  285  2.0000000000000002e-75  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  0.00000902202  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3424  glucose/galactose transporter  41.51 
 
 		 429 aa  284  3.0000000000000004e-75  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.640609  normal  0.0976131 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0716  glucose/galactose transporter  41.46 
 
 		 429 aa  280  3e-74  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0805  glucose/galactose transporter  41.23 
 
 		 429 aa  278  1e-73  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3687  glucose/galactose transporter  39.55 
 
 		 413 aa  275  1.0000000000000001e-72  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.202302  normal  0.04252 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6211  glucose/galactose transporter  36.45 
 
 		 431 aa  272  7e-72  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01229  glucose-galactose transporter  33.64 
 
 		 427 aa  194  3e-48  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0194609  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1396  glucose/galactose transporter  33.64 
 
 		 1140 aa  193  5e-48  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.866269  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2389  glucose/galactose transporter family protein  33.18 
 
 		 436 aa  186  7e-46  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.706169  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1317  glucose/galactose transporter  31.41 
 
 		 435 aa  180  4.999999999999999e-44  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1259  L-fucose transporter  30.28 
 
 		 417 aa  180  4.999999999999999e-44  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4021  L-fucose transporter  31.66 
 
 		 417 aa  179  5.999999999999999e-44  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5644  L-fucose transporter  30.05 
 
 		 417 aa  179  1e-43  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.183274  normal  0.735779 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2040  glucose/galactose transporter  34.21 
 
 		 423 aa  179  1e-43  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.441952  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2298  glucose/galactose transporter  34.13 
 
 		 423 aa  177  2e-43  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00747197  normal  1 
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_4572  hypothetical protein  34.13 
 
 		 423 aa  177  2e-43  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2286  glucose/galactose transporter  34.13 
 
 		 423 aa  177  2e-43  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2087  glucose/galactose transporter  34.13 
 
 		 423 aa  177  2e-43  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2027  glucose/galactose transporter  32.69 
 
 		 415 aa  177  4e-43  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1890  glucose/galactose transporter  32.63 
 
 		 421 aa  176  8e-43  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.621908  normal  0.769175 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1017  glucose/galactose transporter  30.87 
 
 		 428 aa  176  9.999999999999999e-43  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3705  glucose/galactose transporter family protein  30.88 
 
 		 407 aa  175  1.9999999999999998e-42  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3761  glucose/galactose transporter  32.88 
 
 		 410 aa  175  1.9999999999999998e-42  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.807951 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2211  glucose/galactose transporter  31.41 
 
 		 424 aa  174  3.9999999999999995e-42  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.17788  hitchhiker  0.00147708 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2132  glucose/galactose transporter  33.89 
 
 		 423 aa  172  1e-41  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2208  glucose/galactose transporter  34.06 
 
 		 423 aa  171  2e-41  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1789  glucose/galactose transporter  34.84 
 
 		 421 aa  172  2e-41  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0540025  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1241  glucose/galactose transporter  31.24 
 
 		 426 aa  170  5e-41  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.184837  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2310  glucose/galactose transporter  33.97 
 
 		 423 aa  169  1e-40  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.788662  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1776  glucose/galactose transporter  33.72 
 
 		 437 aa  169  1e-40  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.223071  normal  0.453321 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0292  glucose/galactose transporter  33.81 
 
 		 389 aa  167  4e-40  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1273  glucose/galactose transporter  31.24 
 
 		 426 aa  167  4e-40  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3173  glucose/galactose transporter  31.63 
 
 		 431 aa  167  5e-40  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.0000854879  normal  0.83373 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1663  glucose/galactose transporter  32.13 
 
 		 415 aa  167  5e-40  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.24323  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1217  glucose/galactose transporter  31.29 
 
 		 431 aa  166  6.9999999999999995e-40  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.00556902  normal  0.207324 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1403  glucose/galactose transporter  31.89 
 
 		 415 aa  166  9e-40  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000325262  normal  0.0455356 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1656  glucose/galactose transporter  29.39 
 
 		 458 aa  165  1.0000000000000001e-39  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0119  glucose/galactose transporter  31.53 
 
 		 425 aa  165  2.0000000000000002e-39  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5388  glucose/galactose transporter  32.03 
 
 		 424 aa  164  3e-39  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1132  glucose/galactose transporter  31.29 
 
 		 431 aa  164  3e-39  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.165253  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1266  L-fucose-proton symporter  31.57 
 
 		 403 aa  164  3e-39  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1148  glucose/galactose transporter  31.26 
 
 		 428 aa  164  3e-39  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0931456  normal  0.671302 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03795  glucose/galactose transporter family protein  31.98 
 
 		 420 aa  162  8.000000000000001e-39  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.268682  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2606  glucose/galactose transporter  29.2 
 
 		 435 aa  161  2e-38  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.246448  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2986  glucose/galactose transporter  29.55 
 
 		 412 aa  160  4e-38  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3606  fucose permease  30.57 
 
 		 425 aa  159  1e-37  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4128  L-fucose transporter  28.29 
 
 		 431 aa  159  1e-37  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2125  glucose/galactose transporter  30.53 
 
 		 468 aa  158  2e-37  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.957571 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3671  glucose/galactose transporter  31.85 
 
 		 435 aa  157  3e-37  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08721  glucose/galactose transporter  29.09 
 
 		 440 aa  157  3e-37  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.066118  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2750  L-fucose transporter  30.68 
 
 		 431 aa  155  2e-36  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0773  fucose permease  30.3 
 
 		 485 aa  153  7e-36  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.380581 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3930  glucose/galactose transporter  32.05 
 
 		 436 aa  152  8.999999999999999e-36  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.121013  normal  0.215751 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0562  glucose/galactose transporter  33.64 
 
 		 413 aa  151  2e-35  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.336996 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3386  glucose/galactose transporter  32.79 
 
 		 412 aa  151  3e-35  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.134569 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2649  glucose/galactose transporter family protein  30.95 
 
 		 428 aa  150  5e-35  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  unclonable  0.000985214  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1994  L-fucose transporter  27.58 
 
 		 432 aa  150  6e-35  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.486095 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2311  glucose/galactose transporter  28.48 
 
 		 471 aa  147  3e-34  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0619981  normal  0.0518008 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1324  glucose/galactose transporter  30.02 
 
 		 413 aa  140  3.9999999999999997e-32  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.927631  normal  0.568114 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3292  glucose/galactose transporter  30 
 
 		 428 aa  139  1e-31  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1448  L-fucose permease  26.32 
 
 		 418 aa  135  9.999999999999999e-31  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5334  glucose/galactose transporter  26.54 
 
 		 405 aa  134  3e-30  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.120939  normal  0.764594 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0536  L-fucose permease  26.32 
 
 		 418 aa  133  6.999999999999999e-30  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.186143  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2428  L-fucose permease  27.79 
 
 		 433 aa  131  2.0000000000000002e-29  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1052  L-fucose permease  26.67 
 
 		 444 aa  131  2.0000000000000002e-29  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.682471  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0364  glucose/galactose transporter family protein  28.47 
 
 		 408 aa  131  2.0000000000000002e-29  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000000442276  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0887  L-fucose transporter  28.84 
 
 		 438 aa  130  4.0000000000000003e-29  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>