More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SO_3413 on replicon NC_004347
Organism: Shewanella oneidensis MR-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009052  Sbal_1229  threonine synthase  88.76 
 
 		 427 aa  783    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.117065  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3413  threonine synthase  100 
 
 		 427 aa  878    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3084  threonine synthase  88.99 
 
 		 427 aa  785    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.823168  hitchhiker  0.00247535 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2733  threonine synthase  90.61 
 
 		 427 aa  797    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1273  threonine synthase  88.76 
 
 		 427 aa  783    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.270121  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1068  threonine synthase  74.71 
 
 		 428 aa  659    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1177  threonine synthase  77 
 
 		 426 aa  686    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.300194  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1081  threonine synthase  78.69 
 
 		 427 aa  694    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.301795 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1140  threonine synthase  95.32 
 
 		 427 aa  835    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1211  threonine synthase  95.08 
 
 		 427 aa  834    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2904  threonine synthase  79.81 
 
 		 427 aa  710    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.869101  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1306  threonine synthase  88.06 
 
 		 427 aa  779    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1272  threonine synthase  77.46 
 
 		 426 aa  685    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0268749 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1141  threonine synthase  95.78 
 
 		 427 aa  840    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.212689  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0907  threonine synthase  76.53 
 
 		 428 aa  657    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2738  threonine synthase  71.66 
 
 		 426 aa  633  1e-180  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00144538  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1212  threonine synthase  62.17 
 
 		 425 aa  539  9.999999999999999e-153  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.13484  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3578  threonine synthase  59.62 
 
 		 427 aa  520  1e-146  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004455  threonine synthase  59.29 
 
 		 426 aa  515  1.0000000000000001e-145  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.892545  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00941  threonine synthase  59.29 
 
 		 426 aa  513  1e-144  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1941  threonine synthase  59.06 
 
 		 426 aa  514  1e-144  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0392149  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3602  threonine synthase  59.95 
 
 		 429 aa  508  1e-143  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0806  threonine synthase  60.09 
 
 		 426 aa  508  1e-143  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.196525 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3474  threonine synthase  59.95 
 
 		 429 aa  509  1e-143  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2554  threonine synthase  58.69 
 
 		 427 aa  510  1e-143  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03326  threonine synthase  58.92 
 
 		 427 aa  504  9.999999999999999e-143  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4289  threonine synthase  58.29 
 
 		 434 aa  503  1e-141  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0574  threonine synthase  60.42 
 
 		 429 aa  502  1e-141  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0535  threonine synthase  59.67 
 
 		 429 aa  502  1e-141  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0566  threonine synthase  59.86 
 
 		 428 aa  498  1e-140  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0685  threonine synthase  59.02 
 
 		 429 aa  498  1e-139  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0750067  normal  0.0576613 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1277  threonine synthase  56.24 
 
 		 425 aa  491  9.999999999999999e-139  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.507773  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0004  threonine synthase  59.62 
 
 		 428 aa  485  1e-136  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0004  threonine synthase  59.38 
 
 		 428 aa  483  1e-135  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.66148  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0004  threonine synthase  59.38 
 
 		 428 aa  484  1e-135  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0004  threonine synthase  59.38 
 
 		 428 aa  484  1e-135  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.153937  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0004  threonine synthase  59.38 
 
 		 428 aa  484  1e-135  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.70048  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0003  threonine synthase  58.91 
 
 		 428 aa  478  1e-134  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00004  threonine synthase  58.91 
 
 		 428 aa  479  1e-134  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.863935  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3592  threonine synthase  58.91 
 
 		 428 aa  479  1e-134  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0003  threonine synthase  58.91 
 
 		 428 aa  479  1e-134  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3651  threonine synthase  58.91 
 
 		 428 aa  479  1e-134  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3861  threonine synthase  57.61 
 
 		 429 aa  478  1e-134  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00004  hypothetical protein  58.91 
 
 		 428 aa  479  1e-134  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.902262  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0005  threonine synthase  58.91 
 
 		 428 aa  479  1e-134  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.674616  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0004  threonine synthase  58.91 
 
 		 428 aa  479  1e-134  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.412725  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0005  threonine synthase  58.67 
 
 		 428 aa  477  1e-133  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.817747  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3666  threonine synthase  58.08 
 
 		 429 aa  476  1e-133  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0075  threonine synthase  44.6 
 
 		 434 aa  354  2e-96  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.293948 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0260  threonine synthase  42.56 
 
 		 438 aa  344  2e-93  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.0450617 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2573  threonine synthase  42.23 
 
 		 429 aa  343  2.9999999999999997e-93  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.965745  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3802  threonine synthase  43.52 
 
 		 439 aa  340  2e-92  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07410  threonine synthase  41.34 
 
 		 453 aa  337  2.9999999999999997e-91  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0295  threonine synthase  41.8 
 
 		 439 aa  335  1e-90  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.212464 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3806  threonine synthase  42.47 
 
 		 435 aa  334  2e-90  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0398302  normal  0.207163 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2707  threonine synthase  40.88 
 
 		 438 aa  331  2e-89  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.207551  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2334  threonine synthase  41.59 
 
 		 437 aa  325  1e-87  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2546  threonine synthase  40.74 
 
 		 438 aa  318  1e-85  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.229703  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1987  threonine synthase  42.56 
 
 		 438 aa  317  2e-85  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0138  threonine synthase  39.91 
 
 		 439 aa  312  6.999999999999999e-84  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.135778  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5431  threonine synthase  40.69 
 
 		 435 aa  309  5e-83  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.418256  normal  0.890668 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5522  threonine synthase  40.23 
 
 		 435 aa  300  4e-80  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.000125532  normal  0.439141 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1587  threonine synthase  38.57 
 
 		 448 aa  291  1e-77  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.34277  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1263  threonine synthase  39.95 
 
 		 436 aa  288  1e-76  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.904932  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2402  threonine synthase  43.03 
 
 		 432 aa  283  4.0000000000000003e-75  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0457  L-threonine synthase  36.85 
 
 		 447 aa  278  1e-73  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1360  threonine synthase  41 
 
 		 428 aa  273  5.000000000000001e-72  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.489161  normal  0.105086 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3254  threonine synthase  36.08 
 
 		 470 aa  253  4.0000000000000004e-66  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0242603 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3578  threonine synthase  35.63 
 
 		 470 aa  250  4e-65  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1751  threonine synthase  36.47 
 
 		 428 aa  248  2e-64  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.182156 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2330  threonine synthase  33.33 
 
 		 463 aa  247  3e-64  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.351518  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4315  threonine synthase  34.43 
 
 		 462 aa  246  4e-64  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.236333  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0620  threonine synthase  34.14 
 
 		 461 aa  246  6e-64  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3450  threonine synthase  35.41 
 
 		 470 aa  244  1.9999999999999999e-63  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.182634  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3524  threonine synthase  34.84 
 
 		 470 aa  244  1.9999999999999999e-63  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.970017  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1588  threonine synthase  36 
 
 		 470 aa  241  2e-62  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.742925  normal  0.0416146 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0480  threonine synthase  34.14 
 
 		 461 aa  240  4e-62  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.475299  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1831  threonine synthase  34.35 
 
 		 461 aa  239  5e-62  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1146  threonine synthase  32.68 
 
 		 463 aa  238  1e-61  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0677  threonine synthase  34.86 
 
 		 467 aa  237  3e-61  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0874999  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1695  threonine synthase  33.55 
 
 		 461 aa  236  8e-61  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1398  threonine synthase  32.91 
 
 		 465 aa  235  1.0000000000000001e-60  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1356  threonine synthase  35 
 
 		 433 aa  235  1.0000000000000001e-60  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1251  threonine synthase  33.78 
 
 		 473 aa  234  2.0000000000000002e-60  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3233  threonine synthase  33.48 
 
 		 470 aa  233  4.0000000000000004e-60  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0760  threonine synthase  33.41 
 
 		 465 aa  233  6e-60  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2341  threonine synthase  34.79 
 
 		 471 aa  232  1e-59  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0268  threonine synthase  35.28 
 
 		 471 aa  231  2e-59  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.964457  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1423  threonine synthase  34.32 
 
 		 433 aa  231  2e-59  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00822  threonine synthase  38.93 
 
 		 434 aa  230  3e-59  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.00943473  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0489  threonine synthase  35.03 
 
 		 463 aa  230  4e-59  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.513608  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0484  threonine synthase  35.03 
 
 		 463 aa  229  5e-59  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.632525  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0635  threonine synthase  32.82 
 
 		 471 aa  229  9e-59  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.05572  normal  0.105186 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0692  threonine synthase  33.63 
 
 		 474 aa  228  1e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0722  threonine synthase  33.7 
 
 		 471 aa  228  2e-58  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.259471 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1613  threonine synthase  34.68 
 
 		 424 aa  226  4e-58  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1383  threonine synthase  34.68 
 
 		 422 aa  226  4e-58  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3149  threonine synthase  32.32 
 
 		 462 aa  226  4e-58  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.211768  normal  0.632693 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4498  threonine synthase  33.98 
 
 		 465 aa  226  9e-58  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.395589  normal  0.347683 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1892  threonine synthase  30.91 
 
 		 460 aa  224  2e-57  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.000000135451  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>