More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SO_3301 on replicon NC_004347
Organism: Shewanella oneidensis MR-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004347  SO_3301  flavocytochrome c flavin subunit  100 
 
 		 499 aa  1033    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0340  flavocytochrome c  70.56 
 
 		 500 aa  751    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3058  flavocytochrome c flavin subunit, putative  40.84 
 
 		 517 aa  370  1e-101  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1444  flavocytochrome c  42.55 
 
 		 512 aa  366  1e-100  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0344  flavocytochrome c flavin subunit, putative  41.82 
 
 		 519 aa  363  4e-99  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.892888 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1489  flavocytochrome c  39.84 
 
 		 517 aa  359  5e-98  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.803318 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1803  FAD binding domain-containing protein  40.27 
 
 		 521 aa  356  6.999999999999999e-97  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  unclonable  0.000300511  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2432  flavocytochrome c  39.29 
 
 		 517 aa  353  2.9999999999999997e-96  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.77876  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3368  flavocytochrome c  40.69 
 
 		 519 aa  350  3e-95  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0270  flavocytochrome c flavin subunit  40.82 
 
 		 511 aa  343  2.9999999999999997e-93  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0256  flavocytochrome c  39.52 
 
 		 506 aa  342  1e-92  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0273  flavocytochrome c  39.72 
 
 		 506 aa  337  2.9999999999999997e-91  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000188956 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3536  flavocytochrome c  39.52 
 
 		 506 aa  336  5e-91  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2281  flavocytochrome c  38.48 
 
 		 519 aa  336  5.999999999999999e-91  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2230  flavocytochrome c  39.72 
 
 		 506 aa  335  1e-90  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.158762 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0275  flavocytochrome c  38.91 
 
 		 506 aa  333  6e-90  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000326146 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4178  flavocytochrome c flavin subunit  39.6 
 
 		 500 aa  332  1e-89  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.630459 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0002  flavocytochrome c flavin subunit  39.19 
 
 		 518 aa  331  2e-89  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00000401985  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2153  flavocytochrome c  39.11 
 
 		 506 aa  330  3e-89  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0615938 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0136  flavocytochrome c flavin subunit  38.37 
 
 		 517 aa  330  3e-89  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.584631  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0943  flavocytochrome c  39.73 
 
 		 517 aa  330  4e-89  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3624  flavocytochrome c flavin subunit  39.34 
 
 		 494 aa  328  1.0000000000000001e-88  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3939  flavocytochrome c  38.91 
 
 		 506 aa  327  3e-88  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0511  flavocytochrome c  38.72 
 
 		 510 aa  325  1e-87  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2089  flavocytochrome c  39.92 
 
 		 519 aa  322  9.000000000000001e-87  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.455233  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3897  flavocytochrome c  39.14 
 
 		 506 aa  318  1e-85  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.513243  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2084  flavocytochrome c  39.24 
 
 		 520 aa  316  7e-85  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0139  radical SAM domain-containing protein  37.18 
 
 		 511 aa  310  4e-83  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3768  flavocytochrome c  40.13 
 
 		 515 aa  300  5e-80  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.226332  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0325  flavocytochrome c  35.61 
 
 		 507 aa  297  3e-79  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0003  flavocytochrome c flavin subunit  37.08 
 
 		 508 aa  295  1e-78  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  unclonable  0.00000666036  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4184  flavocytochrome c  33.98 
 
 		 503 aa  290  4e-77  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.159689 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2534  flavocytochrome c  34.67 
 
 		 506 aa  290  4e-77  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.135835  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0913  flavocytochrome c  38.17 
 
 		 483 aa  290  5.0000000000000004e-77  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.387235  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0276  flavocytochrome c  34.94 
 
 		 505 aa  288  1e-76  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00106606 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1414  flavocytochrome c flavin subunit, putative  35.57 
 
 		 506 aa  287  2.9999999999999996e-76  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0299  flavocytochrome c  35.14 
 
 		 506 aa  283  4.0000000000000003e-75  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0588345 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2511  flavocytochrome c  34.91 
 
 		 507 aa  276  5e-73  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.842513  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2933  flavocytochrome c  34.03 
 
 		 521 aa  271  2e-71  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1548  flavocytochrome c flavin subunit  35.56 
 
 		 501 aa  249  1e-64  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00203617  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2401  flavocytochrome c flavin subunit  32.81 
 
 		 505 aa  243  7e-63  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1643  FAD binding domain-containing protein  33.67 
 
 		 491 aa  239  1e-61  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0694  fumarate reductase, flavoprotein subunit precursor  34.39 
 
 		 584 aa  230  5e-59  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0254  flavocytochrome c  37.02 
 
 		 367 aa  224  3e-57  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0905  flavocytochrome c  32.32 
 
 		 597 aa  207  3e-52  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.604755  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4036  flavocytochrome c  31.89 
 
 		 598 aa  207  4e-52  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0970  fumarate reductase flavoprotein subunit precursor  33.84 
 
 		 596 aa  206  7e-52  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3433  flavocytochrome c  32.52 
 
 		 596 aa  205  1e-51  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3505  flavocytochrome c  32.52 
 
 		 596 aa  205  1e-51  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3318  flavocytochrome c  33.62 
 
 		 596 aa  205  1e-51  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.5959  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3625  flavocytochrome c  32.91 
 
 		 596 aa  206  1e-51  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0859  flavocytochrome c  32.52 
 
 		 596 aa  205  1e-51  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3628  flavocytochrome c  32.52 
 
 		 596 aa  205  1e-51  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0808  flavocytochrome c  33.41 
 
 		 596 aa  202  8e-51  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.587828  normal  0.0624147 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3215  flavocytochrome c  32.11 
 
 		 596 aa  202  9.999999999999999e-51  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.57421 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4127  flavocytochrome c  32.33 
 
 		 598 aa  202  9.999999999999999e-51  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.431024 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3885  flavocytochrome c  32.55 
 
 		 609 aa  202  9.999999999999999e-51  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.000688641  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1530  flavocytochrome c  29.91 
 
 		 464 aa  200  3.9999999999999996e-50  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000593943  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3795  flavocytochrome c  32.61 
 
 		 582 aa  198  2.0000000000000003e-49  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.343394  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3912  flavocytochrome c  32.18 
 
 		 586 aa  196  9e-49  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4620  fumarate reductase, flavoprotein subunit precursor  32.18 
 
 		 582 aa  195  1e-48  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0378  flavocytochrome c  31.91 
 
 		 591 aa  194  3e-48  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000382997  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3574  flavocytochrome c  32.4 
 
 		 586 aa  194  3e-48  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3299  flavocytochrome c  31.32 
 
 		 597 aa  193  5e-48  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1226  fumarate reductase flavoprotein subunit  29.18 
 
 		 502 aa  192  9e-48  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.00121043  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3877  succinate dehydrogenase  32.44 
 
 		 596 aa  192  1e-47  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00000270258  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3112  flavocytochrome c  32 
 
 		 596 aa  192  1e-47  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000541974 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4193  flavocytochrome c  32.18 
 
 		 582 aa  191  2e-47  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4325  flavocytochrome c  32.18 
 
 		 582 aa  191  2e-47  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4309  flavocytochrome c  32.4 
 
 		 598 aa  192  2e-47  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.0000000000651715  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3541  flavocytochrome c  32.65 
 
 		 589 aa  191  2.9999999999999997e-47  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000144139  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2586  flavocytochrome c  29.29 
 
 		 588 aa  189  8e-47  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.110511  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2466  flavocytochrome c  30.43 
 
 		 599 aa  189  8e-47  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3776  flavocytochrome c  31.11 
 
 		 596 aa  187  3e-46  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00235124 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4004  flavocytochrome c  32.61 
 
 		 582 aa  187  4e-46  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0810  flavocytochrome c  29.92 
 
 		 589 aa  187  5e-46  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3597  flavocytochrome c  31.9 
 
 		 591 aa  186  8e-46  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0848  fumarate reductase, flavoprotein subunit  28.33 
 
 		 457 aa  186  8e-46  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.0000000988882  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0722  flavocytochrome c  31.11 
 
 		 596 aa  184  3e-45  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0138  flavocytochrome c  30.09 
 
 		 608 aa  184  4.0000000000000006e-45  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000254788  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11650  flavocytochrome c  29.75 
 
 		 504 aa  182  1e-44  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1545  putative flavocytochrome c flavin subunit  27.02 
 
 		 447 aa  182  1e-44  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2096  flavocytochrome c  33.26 
 
 		 515 aa  181  2e-44  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.148795  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0098  fumarate reductase, flavoprotein subunit  30.8 
 
 		 465 aa  181  2.9999999999999997e-44  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1861  flavocytochrome c  33.05 
 
 		 515 aa  181  2.9999999999999997e-44  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1782  flavocytochrome c  32.84 
 
 		 515 aa  179  9e-44  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.283775  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0611  fumarate reductase flavoprotein subunit precursor  32.03 
 
 		 593 aa  179  1e-43  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.755689 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3690  flavocytochrome c  30.44 
 
 		 583 aa  177  5e-43  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0488  flavocytochrome c  30.67 
 
 		 606 aa  172  1e-41  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.203471 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10160  flavocytochrome c  29.46 
 
 		 603 aa  171  3e-41  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.23612  normal  0.0211586 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1421  fumarate reductase flavoprotein subunit  29.25 
 
 		 589 aa  168  2e-40  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0107  flavocytochrome c  30.22 
 
 		 605 aa  168  2e-40  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01543  hypothetical fumarate reductase (Eurofung)  30.53 
 
 		 627 aa  166  6.9999999999999995e-40  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  decreased coverage  0.000554356  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2625  flavocytochrome c  30.8 
 
 		 957 aa  166  1.0000000000000001e-39  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.809387  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3126  flavocytochrome c  30.21 
 
 		 925 aa  162  9e-39  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2741  flavocytochrome c  30.64 
 
 		 637 aa  162  2e-38  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3495  flavocytochrome c  30.69 
 
 		 925 aa  160  7e-38  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2558  flavocytochrome c  28.86 
 
 		 926 aa  159  1e-37  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0327685 
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_27122  predicted protein  30.37 
 
 		 587 aa  157  6e-37  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.0188056 
 
 
-
 
NC_009375  OSTLU_52061  predicted protein  30.37 
 
 		 587 aa  157  6e-37  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>