216 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SO_3242 on replicon NC_004347
Organism: Shewanella oneidensis MR-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009665  Shew185_2955  flagellar basal body P-ring protein  93.66 
 
 		 363 aa  689    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.667376  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3242  flagellar basal body P-ring protein  100 
 
 		 363 aa  731    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1423  flagellar basal body P-ring protein  93.66 
 
 		 363 aa  689    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.769389  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1347  flagellar basal body P-ring protein  86.78 
 
 		 364 aa  644    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1266  flagellar basal body P-ring protein  96.97 
 
 		 363 aa  709    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1336  flagellar basal body P-ring protein  97.25 
 
 		 363 aa  711    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.525149  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1328  flagellar basal body P-ring protein  92.56 
 
 		 363 aa  681    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0568829 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2940  flagellar basal body P-ring protein  93.66 
 
 		 363 aa  689    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1352  flagellar basal body P-ring protein  88.43 
 
 		 363 aa  650    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3093  flagellar basal body P-ring protein  93.66 
 
 		 363 aa  689    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2590  flagellar basal body P-ring protein  92.29 
 
 		 363 aa  680    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1168  flagellar basal body P-ring protein  84.24 
 
 		 368 aa  629  1e-179  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0244391  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3080  flagellar basal body P-ring protein  87.09 
 
 		 363 aa  622  1e-177  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1604  flagellar basal body P-ring protein  88.7 
 
 		 363 aa  623  1e-177  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0616045  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2311  flagellar basal body P-ring protein  83.75 
 
 		 363 aa  624  1e-177  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.373446 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1310  flagellar basal body P-ring protein  83.61 
 
 		 366 aa  618  1e-176  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02921  flagellar basal body P-ring protein  65.76 
 
 		 370 aa  491  1e-137  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1484  flagellar basal body P-ring protein  65.36 
 
 		 363 aa  483  1e-135  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.313129  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3093  flagellar basal body P-ring protein  64.05 
 
 		 370 aa  478  1e-134  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01294  flagellar basal body P-ring protein  64.46 
 
 		 363 aa  476  1e-133  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1785  flagellar basal body P-ring protein  67.34 
 
 		 361 aa  478  1e-133  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2331  flagellar basal body P-ring protein  64.62 
 
 		 373 aa  469  1.0000000000000001e-131  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1109  flagellar basal body P-ring protein  63.89 
 
 		 365 aa  459  9.999999999999999e-129  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3944  flagellar basal body P-ring protein  61.26 
 
 		 371 aa  442  1e-123  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4383  flagellar basal body P-ring protein  60.71 
 
 		 369 aa  439  9.999999999999999e-123  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.849303 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1472  flagellar basal body P-ring protein  60.71 
 
 		 369 aa  439  9.999999999999999e-123  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.01106  normal  0.415851 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1942  flagellar P-ring protein FlgI  61.54 
 
 		 369 aa  436  1e-121  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.152396  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3473  flagellar basal body P-ring protein  61.54 
 
 		 369 aa  435  1e-121  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.813313  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2843  flagellar basal body P-ring protein  60.44 
 
 		 386 aa  437  1e-121  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.251575  normal  0.108847 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1504  flagellar basal body P-ring protein  63.14 
 
 		 362 aa  434  1e-120  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3724  flagellar basal body P-ring protein  59.62 
 
 		 369 aa  432  1e-120  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50410  flagellar basal body P-ring protein  62.54 
 
 		 369 aa  429  1e-119  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000700308 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4293  flagellar basal body P-ring protein  62.54 
 
 		 369 aa  429  1e-119  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3576  flagellar P-ring protein  58.79 
 
 		 362 aa  424  1e-117  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.453837  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1224  flagellar P-ring protein  58.47 
 
 		 380 aa  417  9.999999999999999e-116  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.794178  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1467  flagellar basal body P-ring protein  57.85 
 
 		 366 aa  411  1e-113  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2206  flagellar basal body P-ring protein  57.73 
 
 		 379 aa  411  1e-113  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.988864  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2371  flagellar basal body P-ring protein  55.49 
 
 		 367 aa  405  1.0000000000000001e-112  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1899  flagellar basal body P-ring protein  54.52 
 
 		 376 aa  402  1e-111  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.046577 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06161  flagellar basal body P-ring protein  55.43 
 
 		 372 aa  389  1e-107  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0591048  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01005  flagellar basal body P-ring protein  55.43 
 
 		 372 aa  389  1e-107  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.185766  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0933  flagellar P-ring protein  56.65 
 
 		 401 aa  390  1e-107  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.382619  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0900  flagellar basal body P-ring protein  55.68 
 
 		 376 aa  387  1e-106  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004166  flagellar P-ring protein FlgI  66.79 
 
 		 278 aa  381  1e-105  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1769  flagellar P-ring protein  56.2 
 
 		 372 aa  384  1e-105  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1665  flagellar basal body P-ring protein  52.01 
 
 		 371 aa  368  1e-101  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.231572  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04916  flagellar basal body P-ring protein  50 
 
 		 378 aa  363  3e-99  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1231  flagellar basal body P-ring protein  52.34 
 
 		 367 aa  362  5.0000000000000005e-99  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1231  flagellar basal body P-ring protein  52.34 
 
 		 367 aa  362  6e-99  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1264  flagellar basal body P-ring protein  49.31 
 
 		 367 aa  354  1e-96  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.236282  normal  0.846398 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1712  flagellar basal body P-ring protein  51.98 
 
 		 371 aa  351  8.999999999999999e-96  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.405686  normal  0.248733 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0213  flagellar basal body P-ring protein  49.86 
 
 		 364 aa  351  1e-95  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.613431  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3964  flagellar basal body P-ring protein  47.7 
 
 		 370 aa  348  7e-95  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0076  flagellar basal body P-ring protein  51.41 
 
 		 371 aa  348  1e-94  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.322423  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000733  flagellar P-ring protein FlgI  48.11 
 
 		 370 aa  347  1e-94  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3461  flagellar basal body P-ring protein  49.15 
 
 		 372 aa  348  1e-94  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0062  flagellar basal body P-ring protein  48.74 
 
 		 375 aa  341  1e-92  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0220  flagellar basal body P-ring protein  46.72 
 
 		 391 aa  335  5e-91  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0646  flagellar basal body P-ring protein  47.49 
 
 		 372 aa  335  1e-90  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4678  flagellar P-ring protein  48.87 
 
 		 374 aa  333  2e-90  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000218644 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1630  flagellar basal body P-ring protein  49.73 
 
 		 365 aa  332  7.000000000000001e-90  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.891214  normal  0.646517 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0513  flagellar basal body P-ring protein  49.86 
 
 		 371 aa  332  7.000000000000001e-90  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.164737  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2917  flagellar basal body P-ring protein  51.92 
 
 		 374 aa  329  4e-89  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0476897  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3571  flagellar basal body P-ring protein  47.09 
 
 		 368 aa  328  9e-89  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3644  flagellar basal body P-ring protein  49 
 
 		 371 aa  328  1.0000000000000001e-88  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.185096  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2727  flagellar basal body P-ring protein  48.36 
 
 		 392 aa  327  2.0000000000000001e-88  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000228637 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0068  flagellar basal body P-ring protein  48.43 
 
 		 376 aa  327  2.0000000000000001e-88  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0191  flagellar basal body P-ring protein  47.5 
 
 		 387 aa  323  2e-87  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.774706  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4192  flagellar P-ring protein  49.3 
 
 		 377 aa  323  3e-87  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2914  flagellar basal body P-ring protein  46.58 
 
 		 371 aa  323  3e-87  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.193418  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0244  flagellar basal body P-ring protein  47.22 
 
 		 387 aa  322  7e-87  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1328  flagellar basal body P-ring protein  48.22 
 
 		 377 aa  320  1.9999999999999998e-86  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1971  flagellar basal body P-ring protein  49.57 
 
 		 369 aa  315  7e-85  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2404  flagellar basal body P-ring protein  47.86 
 
 		 391 aa  313  2.9999999999999996e-84  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3018  flagellar basal body P-ring protein  47.86 
 
 		 391 aa  313  2.9999999999999996e-84  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0546214  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3037  flagellar basal body P-ring protein  47.59 
 
 		 391 aa  312  5.999999999999999e-84  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0270  flagellar basal body P-ring protein  47.68 
 
 		 371 aa  312  6.999999999999999e-84  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.830393 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0349  flagellar basal body P-ring protein  46.03 
 
 		 369 aa  311  1e-83  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.196884  normal  0.238944 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3721  flagellar basal body P-ring protein  50.28 
 
 		 381 aa  310  2e-83  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.143633  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2406  flagellar basal body P-ring protein  47.86 
 
 		 371 aa  310  2.9999999999999997e-83  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4428  flagellar basal body P-ring protein  50.14 
 
 		 388 aa  310  2.9999999999999997e-83  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5632  flagellar basal body P-ring protein  49 
 
 		 392 aa  309  5e-83  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.347995  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1677  flagellar basal body P-ring protein  46.29 
 
 		 373 aa  309  5e-83  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0126044 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3794  flagellar basal body P-ring protein  46.65 
 
 		 373 aa  309  5.9999999999999995e-83  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.132686  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3364  flagellar basal body P-ring protein  47.41 
 
 		 366 aa  308  1.0000000000000001e-82  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2004  flagellar basal body P-ring protein  47.63 
 
 		 370 aa  306  4.0000000000000004e-82  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3013  flagellar basal body P-ring protein  46.51 
 
 		 390 aa  306  5.0000000000000004e-82  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2928  flagellar basal body P-ring protein  48.08 
 
 		 394 aa  305  5.0000000000000004e-82  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0626  flagellar basal body P-ring protein  46.63 
 
 		 382 aa  305  6e-82  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6364  flagellar basal body P-ring protein  47.22 
 
 		 392 aa  305  7e-82  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3063  flagellar basal body P-ring protein  47.8 
 
 		 392 aa  304  1.0000000000000001e-81  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1497  flagellar basal body P-ring protein  45.51 
 
 		 378 aa  303  2.0000000000000002e-81  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0248717 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5520  flagellar basal body P-ring protein  44.75 
 
 		 374 aa  303  4.0000000000000003e-81  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3066  flagellar basal body P-ring protein  44.32 
 
 		 384 aa  301  8.000000000000001e-81  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.405902  normal  0.219474 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3001  flagellar basal body P-ring protein  47.62 
 
 		 401 aa  301  9e-81  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3707  flagellar basal body P-ring protein  48.14 
 
 		 372 aa  301  1e-80  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0982974 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4432  flagellar basal body P-ring protein  45.77 
 
 		 373 aa  301  1e-80  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2955  flagellar basal body P-ring protein  47.21 
 
 		 395 aa  301  1e-80  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.468199 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4784  flagellar basal body P-ring protein  48.14 
 
 		 372 aa  301  1e-80  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.341084 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3347  flagellar basal body P-ring protein  47.62 
 
 		 394 aa  301  1e-80  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>