88 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SO_3164 on replicon NC_004347
Organism: Shewanella oneidensis MR-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004347  SO_3164  hypothetical protein  100 
 
 		 255 aa  530  1e-149  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1388  hypothetical protein  65.86 
 
 		 253 aa  330  2e-89  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0920868  hitchhiker  0.00023617 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1335  hypothetical protein  59.9 
 
 		 216 aa  239  2.9999999999999997e-62  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.212049  hitchhiker  0.00175338 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1400  hypothetical protein  59.9 
 
 		 217 aa  237  2e-61  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0282645 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2870  hypothetical protein  43.95 
 
 		 235 aa  184  1.0000000000000001e-45  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.290412  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3016  hypothetical protein  43.95 
 
 		 237 aa  182  4.0000000000000006e-45  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0731118 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1489  protein of unknown function DUF886  43.05 
 
 		 235 aa  176  3e-43  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.409079  normal  0.364485 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2887  hypothetical protein  42.79 
 
 		 227 aa  175  7e-43  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1036  hypothetical protein  40.71 
 
 		 197 aa  122  6e-27  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.257872 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1431  hypothetical protein  33.5 
 
 		 195 aa  117  1.9999999999999998e-25  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5955  hypothetical protein  33.16 
 
 		 190 aa  115  8.999999999999998e-25  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2853  hypothetical protein  40.94 
 
 		 191 aa  114  1.0000000000000001e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.642703  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1294  hypothetical protein  31.18 
 
 		 194 aa  113  3e-24  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.070134  normal  0.0207913 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2714  hypothetical protein  41.73 
 
 		 197 aa  111  1.0000000000000001e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.630107  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5931  protein of unknown function DUF886  38.06 
 
 		 191 aa  106  4e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.810198  normal  0.153687 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0875  hypothetical protein  34.38 
 
 		 207 aa  105  6e-22  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0933  hypothetical protein  34.38 
 
 		 207 aa  105  6e-22  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0151  hypothetical protein  39.23 
 
 		 192 aa  104  2e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.217217 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2588  hypothetical protein  35.82 
 
 		 197 aa  102  7e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.248563 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6926  protein of unknown function DUF886  36.57 
 
 		 191 aa  101  1e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0684944  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0163  protein of unknown function DUF886  43.59 
 
 		 189 aa  101  1e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.602522  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2080  hypothetical protein  43.1 
 
 		 187 aa  99  7e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2794  protein of unknown function DUF886  35.06 
 
 		 193 aa  97.8  1e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1811  hypothetical protein  37.9 
 
 		 205 aa  97.1  2e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.120207  normal  0.474402 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2387  protein of unknown function DUF886  41.53 
 
 		 192 aa  94  2e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2522  hypothetical protein  41.53 
 
 		 200 aa  94  2e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0835202  normal  0.0112976 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2944  hypothetical protein  35.61 
 
 		 212 aa  94  2e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.690468 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2169  hypothetical protein  37.3 
 
 		 207 aa  93.6  3e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5908  hypothetical protein  37.3 
 
 		 207 aa  93.6  3e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2186  hypothetical protein  39.2 
 
 		 207 aa  93.2  4e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.153791  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2982  hypothetical protein  39.34 
 
 		 191 aa  92.4  6e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.920883  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1533  protein of unknown function DUF886  35.38 
 
 		 208 aa  92  8e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2962  hypothetical protein  36.36 
 
 		 202 aa  92  9e-18  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.541543  normal  0.713874 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3760  hypothetical protein  38.06 
 
 		 210 aa  91.7  1e-17  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1823  hypothetical protein  35.26 
 
 		 222 aa  90.9  2e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5479  hypothetical protein  37.6 
 
 		 191 aa  90.1  3e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.898836  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0325  hypothetical protein  35.16 
 
 		 187 aa  89.7  4e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4074  hypothetical protein  41.18 
 
 		 197 aa  87  2e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4629  hypothetical protein  33.33 
 
 		 181 aa  86.7  4e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.355004  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1255  protein of unknown function DUF886  33.79 
 
 		 182 aa  86.3  5e-16  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2110  putative cold inducible protein Ves  29.07 
 
 		 190 aa  85.5  7e-16  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.560471  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2219  hypothetical protein  29.07 
 
 		 190 aa  85.5  7e-16  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2653  protein of unknown function DUF886  35.26 
 
 		 181 aa  85.5  8e-16  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0159203  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5084  hypothetical protein  33.68 
 
 		 190 aa  83.2  0.000000000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.932324  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0359  hypothetical protein  37.12 
 
 		 189 aa  83.6  0.000000000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1101  hypothetical protein  31.43 
 
 		 217 aa  83.6  0.000000000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0858704  normal  0.979961 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1080  hypothetical protein  36.92 
 
 		 194 aa  83.6  0.000000000000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.62386  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2509  hypothetical protein  28.49 
 
 		 190 aa  83.2  0.000000000000004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000356687 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2085  hypothetical protein  35.34 
 
 		 212 aa  82.4  0.000000000000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.181968  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0365  hypothetical protein  36.36 
 
 		 198 aa  82  0.000000000000008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2208  hypothetical protein  33.58 
 
 		 200 aa  81.6  0.00000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4156  hypothetical protein  34.33 
 
 		 186 aa  81.3  0.00000000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.737957  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5173  hypothetical protein  36.36 
 
 		 206 aa  80.9  0.00000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3489  protein of unknown function DUF886  32.09 
 
 		 191 aa  80.9  0.00000000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5034  hypothetical protein  32.8 
 
 		 190 aa  79.3  0.00000000000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0430  hypothetical protein  35.61 
 
 		 190 aa  79  0.00000000000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.359855  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4908  hypothetical protein  35.61 
 
 		 190 aa  78.6  0.00000000000009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.565857 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0982  protein of unknown function DUF886  34.75 
 
 		 203 aa  78.6  0.00000000000009  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.429638  normal  0.105211 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3647  hypothetical protein  37.38 
 
 		 233 aa  78.2  0.0000000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67410  hypothetical protein  32.89 
 
 		 196 aa  78.6  0.0000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1702  hypothetical protein  36.75 
 
 		 185 aa  77.4  0.0000000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5837  hypothetical protein  31.58 
 
 		 196 aa  77  0.0000000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2664  hypothetical protein  36.64 
 
 		 219 aa  73.9  0.000000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1678  hypothetical protein  35.88 
 
 		 219 aa  72.8  0.000000000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2720  hypothetical protein  35.88 
 
 		 219 aa  72.8  0.000000000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2922  hypothetical protein  35.88 
 
 		 219 aa  72.8  0.000000000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2363  hypothetical protein  35.88 
 
 		 219 aa  72.8  0.000000000005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.472112  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0248  hypothetical protein  36.97 
 
 		 198 aa  72.8  0.000000000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2793  hypothetical protein  35.88 
 
 		 212 aa  72.4  0.000000000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0648  hypothetical protein  35.88 
 
 		 212 aa  72.4  0.000000000006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5071  protein of unknown function DUF886  29.17 
 
 		 181 aa  68.9  0.00000000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0070  hypothetical protein  31.2 
 
 		 195 aa  68.2  0.0000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1985  hypothetical protein  34.26 
 
 		 191 aa  66.6  0.0000000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.280808  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01699  hypothetical protein  34.26 
 
 		 191 aa  65.9  0.0000000006  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4558  protein of unknown function DUF886  31.93 
 
 		 183 aa  65.9  0.0000000006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.996981  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01711  hypothetical protein  34.26 
 
 		 191 aa  65.9  0.0000000006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1824  hypothetical protein  34.26 
 
 		 191 aa  65.9  0.0000000006  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1900  protein of unknown function DUF886  34.26 
 
 		 191 aa  65.9  0.0000000006  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.290117  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1890  hypothetical protein  34.26 
 
 		 191 aa  65.9  0.0000000007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0233049 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2459  hypothetical protein  34.26 
 
 		 191 aa  65.5  0.0000000008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.984469  normal  0.742679 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1962  hypothetical protein  34.26 
 
 		 191 aa  65.5  0.0000000008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1450  hypothetical protein  33.33 
 
 		 191 aa  63.5  0.000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.499518 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7804  electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  34.78 
 
 		 446 aa  60.8  0.00000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.55949  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0164  hypothetical protein  29.1 
 
 		 201 aa  59.3  0.00000006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3904  hypothetical protein  29.32 
 
 		 204 aa  55.5  0.0000008  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.664963  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02254  hypothetical protein  36.84 
 
 		 273 aa  55.1  0.000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2575  hypothetical protein  34.4 
 
 		 204 aa  53.1  0.000004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00880643  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_3002  hypothetical protein  32 
 
 		 176 aa  52.4  0.000007  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.530397  normal  0.657426 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>