More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SO_3144 on replicon NC_004347
Organism: Shewanella oneidensis MR-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_004347  SO_3144  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  100 
 
 
308 aa  606  1e-172  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2865  electron transfer flavoprotein alpha subunit  92.51 
 
 
308 aa  565  1e-160  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  1.68731e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2510  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  92.53 
 
 
308 aa  565  1e-160  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  4.27922e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2994  electron transfer flavoprotein alpha subunit  91.86 
 
 
308 aa  560  1e-159  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0210477  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1512  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  91.86 
 
 
308 aa  561  1e-159  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000305192  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2846  electron transfer flavoprotein alpha subunit  91.53 
 
 
308 aa  559  1e-158  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  9.85781e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1418  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  96.74 
 
 
308 aa  556  1e-157  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0628091  normal  0.474151 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1353  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  96.74 
 
 
308 aa  556  1e-157  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000384606  hitchhiker  0.00895875 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1406  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  96.09 
 
 
308 aa  551  1e-156  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  4.28424e-07  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2538  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  78.83 
 
 
307 aa  476  1e-133  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  4.12152e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2747  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  81.19 
 
 
307 aa  476  1e-133  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  4.76091e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1170  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  80.46 
 
 
307 aa  472  1e-132  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000857296  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3235  electron transfer flavoprotein alpha subunit  77.3 
 
 
307 aa  460  1e-128  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.320471 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2583  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  73.62 
 
 
307 aa  453  1e-126  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  7.11397e-05  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2854  electron transfer flavoprotein alpha subunit  72.96 
 
 
307 aa  443  1e-123  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1446  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  73.03 
 
 
307 aa  444  1e-123  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0198023  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00997  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  68.51 
 
 
308 aa  415  1e-115  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.325031  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1577  electron transfer flavoprotein alpha subunit  66.67 
 
 
309 aa  402  1e-111  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00519055 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3688  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  67.43 
 
 
308 aa  404  1e-111  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16420  Electron transfer flavoprotein, alpha subunit  69.84 
 
 
309 aa  394  1e-108  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0845524  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2145  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  63.96 
 
 
308 aa  392  1e-108  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.104749  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0655  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  64.92 
 
 
309 aa  388  1e-107  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.304729  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6871  electron transfer flavoprotein alpha subunit  67.31 
 
 
310 aa  388  1e-107  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.496098  normal  0.308845 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3159  electron transfer flavoprotein alpha subunit  65.25 
 
 
309 aa  384  1e-106  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3078  electron transfer flavoprotein  66.02 
 
 
311 aa  387  1e-106  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3525  electron transfer flavoprotein alpha subunit  67.54 
 
 
309 aa  383  1e-105  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1607  electron transfer flavoprotein alpha subunit  64.74 
 
 
313 aa  380  1e-104  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3773  electron transfer flavoprotein alpha subunit  66.89 
 
 
309 aa  379  1e-104  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2210  electron transfer flavoprotein alpha-subunit  68.52 
 
 
309 aa  380  1e-104  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1652  electron transfer flavoprotein, alpha subunit-like protein  67.21 
 
 
309 aa  380  1e-104  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4201  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  67.21 
 
 
309 aa  380  1e-104  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1470  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  66.23 
 
 
313 aa  375  1e-103  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0862538  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7299  electron transfer flavoprotein subunit alpha/beta  66.24 
 
 
314 aa  377  1e-103  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0555297  normal  0.847795 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2186  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  67.87 
 
 
309 aa  376  1e-103  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25880  electron transfer flavoprotein alpha-subunit  68.85 
 
 
309 aa  371  1e-102  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.272339  normal  0.0503737 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1212  electron transfer flavoprotein beta-subunit:electron transfer flavoprotein, alpha subunit  67.31 
 
 
310 aa  369  1e-101  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0943  electron transfer flavoprotein alpha subunit  64.84 
 
 
311 aa  369  1e-101  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.94647  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1614  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  65.58 
 
 
308 aa  368  1e-101  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.455824  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05549  acyl-CoA dehydrogenase, short-chain specific  61.02 
 
 
321 aa  370  1e-101  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0939  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  65.48 
 
 
311 aa  369  1e-101  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14290  Electron transfer flavoprotein, alpha subunit  67.54 
 
 
310 aa  370  1e-101  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2241  electron transfer flavoprotein alpha subunit  65.16 
 
 
311 aa  371  1e-101  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4176  electron transfer flavoprotein alpha and beta-subunits  66.13 
 
 
311 aa  370  1e-101  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0387842  normal  0.412867 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0584  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  65.18 
 
 
311 aa  365  1e-100  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.292903  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1063  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  65.18 
 
 
311 aa  365  1e-100  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.760076  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1022  electron transfer flavoprotein alpha subunit  65.16 
 
 
311 aa  367  1e-100  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1996  electron transfer flavoprotein subunit alpha  66.23 
 
 
309 aa  367  1e-100  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.569896  normal  0.163293 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1997  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  64.5 
 
 
312 aa  367  1e-100  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.11647  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15190  Electron transfer flavoprotein, alpha subunit  67.21 
 
 
309 aa  367  1e-100  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4116  electron transfer flavoprotein alpha and beta-subunits  68.85 
 
 
309 aa  364  1e-99  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.146576 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2554  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  64.84 
 
 
311 aa  362  3e-99  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0410  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  64.84 
 
 
311 aa  362  3e-99  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2927  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  64.84 
 
 
311 aa  362  3e-99  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2976  electron transfer flavoprotein alpha-subunit  64.84 
 
 
311 aa  362  3e-99  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2173  electron transfer flavoprotein subunit alpha  68.2 
 
 
309 aa  363  3e-99  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.734786  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0219  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  64.84 
 
 
311 aa  362  3e-99  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0930  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  64.84 
 
 
311 aa  362  3e-99  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0422  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  66.67 
 
 
310 aa  362  5e-99  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5231  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  63.11 
 
 
314 aa  361  1e-98  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0165926  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1654  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  64.52 
 
 
311 aa  360  1e-98  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1751  electron transfer flavoprotein alpha subunit  61.61 
 
 
311 aa  360  1e-98  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.0899131 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2267  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  66.13 
 
 
310 aa  361  1e-98  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0336576  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2866  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  64.19 
 
 
311 aa  360  2e-98  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.786227  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0615  electron transfer flavoprotein, alpha subunit-like protein  61.94 
 
 
310 aa  359  4e-98  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0862731  normal  0.336717 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0763  electron transfer flavoprotein alpha subunit  63.9 
 
 
311 aa  358  5e-98  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0528  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  62.26 
 
 
310 aa  358  6e-98  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  decreased coverage  0.000381048  hitchhiker  0.00976807 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4916  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  63.43 
 
 
309 aa  358  7e-98  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3562  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  63.43 
 
 
309 aa  357  1e-97  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.17521  normal  0.383199 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4189  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  63.26 
 
 
310 aa  357  1e-97  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000806502 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0533  electron transportr flavoprotein, alpha subunit  63.31 
 
 
310 aa  357  1e-97  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2984  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  63.26 
 
 
311 aa  357  2e-97  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0824213  decreased coverage  0.00070323 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0999  electron transfer flavoprotein subunit alpha  63.09 
 
 
315 aa  357  2e-97  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2364  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  62.34 
 
 
309 aa  354  1e-96  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2557  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  62.18 
 
 
308 aa  354  1e-96  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0954  electron transfer flavoprotein subunit alpha  58.9 
 
 
312 aa  354  1e-96  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2809  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  64.52 
 
 
310 aa  353  2e-96  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.22973  normal  0.220187 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0985  electron transfer flavoprotein subunit alpha  58.58 
 
 
312 aa  353  2e-96  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3569  putative electron transfer flavoprotein, alpha subunit  62.3 
 
 
311 aa  353  2e-96  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2706  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  68.2 
 
 
309 aa  352  4e-96  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.796213  normal  0.172174 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6308  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  60.78 
 
 
310 aa  352  5e-96  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9248  electron transfer flavoprotein alpha subunit  62.9 
 
 
319 aa  350  2e-95  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0619808  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3142  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  62.58 
 
 
313 aa  350  2e-95  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.372397  normal  0.0252106 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2298  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  63.55 
 
 
310 aa  348  9e-95  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4828  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  62.62 
 
 
309 aa  347  1e-94  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.142803  normal  0.92553 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001582  electron transfer flavoprotein alpha subunit  57.59 
 
 
321 aa  347  1e-94  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2391  electron transfer flavoprotein alpha subunit  62.9 
 
 
310 aa  346  3e-94  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.41107  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1297  electron transfer flavoprotein alpha-subunit  63.11 
 
 
309 aa  346  4e-94  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0755964 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3730  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  63.23 
 
 
310 aa  345  5e-94  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1466  electron transfer flavoprotein subunit alpha/beta  63.38 
 
 
314 aa  345  7e-94  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.180547  normal  0.50057 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2539  electron transfer flavoprotein alpha subunit  61.49 
 
 
308 aa  344  1e-93  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000608168 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0754  electron transfer flavoprotein alpha and beta-subunits  60.19 
 
 
314 aa  344  1e-93  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0323  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  60.06 
 
 
308 aa  344  1e-93  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.501158  normal  0.94208 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1690  electron transfer flavoprotein subunit alpha  60.06 
 
 
308 aa  343  2e-93  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1990  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  60.83 
 
 
311 aa  343  2e-93  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3011  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  62.9 
 
 
310 aa  343  3e-93  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2729  electron transfer flavoprotein subunit alpha  61.31 
 
 
314 aa  341  8e-93  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7803  electron transfer flavoprotein alpha subunit  60.26 
 
 
309 aa  341  1e-92  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0251  electron transfer flavoprotein, alpha subunit, EtfA  60.19 
 
 
327 aa  341  1e-92  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1403  electron transfer flavoprotein alpha subunit  63.23 
 
 
310 aa  340  2e-92  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4012  electron transfer flavoprotein alpha subunit  63.61 
 
 
309 aa  340  2e-92  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>