156 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SO_3035 on replicon NC_004347
Organism: Shewanella oneidensis MR-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_004347  SO_3035  intracellular septation protein A  100 
 
 
181 aa  360  5.0000000000000005e-99  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1515  intracellular septation protein A  98.9 
 
 
181 aa  358  2e-98  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0000828296  normal  0.796513 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1505  intracellular septation protein A  98.34 
 
 
181 aa  355  9.999999999999999e-98  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.158049  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1449  intracellular septation protein A  98.34 
 
 
181 aa  355  1.9999999999999998e-97  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0709413  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2416  intracellular septation protein A  95.58 
 
 
181 aa  350  8e-96  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.519009  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2814  intracellular septation protein A  93.92 
 
 
203 aa  344  3e-94  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.00000562978  normal  0.587051 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2735  intracellular septation protein A  93.92 
 
 
203 aa  344  3e-94  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00000556336  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2713  intracellular septation protein A  93.92 
 
 
203 aa  344  4e-94  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.115352  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1651  intracellular septation protein A  93.92 
 
 
181 aa  343  8e-94  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000000729517  hitchhiker  0.0000000000499095 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2925  intracellular septation protein A  85.08 
 
 
182 aa  313  6e-85  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.00510175  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1670  intracellular septation protein A  83.98 
 
 
183 aa  311  2.9999999999999996e-84  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.000000643505  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1640  intracellular septation protein A  82.87 
 
 
181 aa  309  1e-83  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2260  intracellular septation protein A  83.98 
 
 
181 aa  291  4e-78  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000102415  normal  0.0781423 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2137  intracellular septation protein A  76.24 
 
 
181 aa  286  2e-76  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1467  intracellular septation protein A  76.7 
 
 
181 aa  283  8e-76  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0118188  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1422  intracellular septation protein A  75.98 
 
 
183 aa  283  1.0000000000000001e-75  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.329571  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1997  intracellular septation protein A  63.89 
 
 
188 aa  238  4e-62  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1304  intracellular septation protein A  60.34 
 
 
181 aa  238  4e-62  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0013936  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02768  intracellular septation protein A  58.66 
 
 
190 aa  236  9e-62  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1147  intracellular septation protein A  59.22 
 
 
181 aa  235  3e-61  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2677  intracellular septation protein A  64.8 
 
 
179 aa  233  8e-61  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.123035  hitchhiker  0.000370071 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003075  intracellular septation protein  59.22 
 
 
187 aa  231  3e-60  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2297  intracellular septation protein A  61.93 
 
 
188 aa  230  1e-59  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2326  intracellular septation protein A  61.11 
 
 
180 aa  223  1e-57  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.440646  normal  0.885808 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2053  intracellular septation protein A  61.11 
 
 
180 aa  223  1e-57  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.32056  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1944  intracellular septation protein A  61.11 
 
 
180 aa  223  1e-57  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.843191  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1593  intracellular septation protein A  57.54 
 
 
179 aa  212  1.9999999999999998e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.876339 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1411  intracellular septation protein A  57.54 
 
 
179 aa  211  5.999999999999999e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.70012  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1925  intracellular septation protein A  57.54 
 
 
179 aa  211  5.999999999999999e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0043562 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1868  intracellular septation protein A  57.54 
 
 
179 aa  211  5.999999999999999e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.833804  normal  0.875088 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1862  intracellular septation protein A  57.54 
 
 
179 aa  211  5.999999999999999e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2285  intracellular septation protein A  57.87 
 
 
179 aa  210  7e-54  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.62002  normal  0.722126 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1878  intracellular septation protein A  56.98 
 
 
179 aa  210  7.999999999999999e-54  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000132435 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01228  intracellular septation protein A  56.98 
 
 
179 aa  209  1e-53  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2394  intracellular septation protein A  56.98 
 
 
179 aa  209  1e-53  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0231984  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01238  hypothetical protein  56.98 
 
 
179 aa  209  1e-53  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2373  intracellular septation protein A  56.98 
 
 
179 aa  209  1e-53  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.107095  hitchhiker  0.00000140578 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1741  intracellular septation protein A  56.98 
 
 
179 aa  209  1e-53  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  0.00000000411048  hitchhiker  0.00414437 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1423  intracellular septation protein A  56.98 
 
 
179 aa  209  1e-53  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0811962  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1363  intracellular septation protein A  56.98 
 
 
179 aa  209  1e-53  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000298699  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1412  intracellular septation protein A  56.98 
 
 
179 aa  209  1e-53  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.393823  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1942  intracellular septation protein A  55.87 
 
 
186 aa  202  2e-51  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2183  intracellular septation protein A  56.98 
 
 
186 aa  198  3.9999999999999996e-50  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0652722  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1054  intracellular septation protein A  55.49 
 
 
189 aa  196  2.0000000000000003e-49  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1267  intracellular septation protein A  43.02 
 
 
179 aa  153  1e-36  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0529442  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2397  intracellular septation protein A  44.13 
 
 
179 aa  149  3e-35  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0809918  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2937  intracellular septation protein A  41.81 
 
 
179 aa  143  1e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.553384  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0706  intracellular septation protein A  42.94 
 
 
189 aa  140  9.999999999999999e-33  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.102671  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3300  intracellular septation protein A  35.75 
 
 
199 aa  140  9.999999999999999e-33  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.646604  normal  0.427683 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2317  intracellular septation protein A  40.45 
 
 
194 aa  139  1.9999999999999998e-32  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.222647  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1394  intracellular septation protein A  37.64 
 
 
179 aa  139  1.9999999999999998e-32  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.249115  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1458  intracellular septation protein A  38.76 
 
 
191 aa  139  1.9999999999999998e-32  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1232  intracellular septation protein A  37.7 
 
 
214 aa  136  2e-31  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000058039  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1025  intracellular septation protein A  36.93 
 
 
176 aa  134  6.0000000000000005e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.452488  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1039  intracellular septation protein A  38.37 
 
 
181 aa  134  8e-31  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1646  intracellular septation protein A  40 
 
 
177 aa  133  9.999999999999999e-31  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.117216  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1922  intracellular septation protein A  38.64 
 
 
176 aa  133  9.999999999999999e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0586627  normal  0.794115 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0975  intracellular septation protein A  38.37 
 
 
181 aa  133  9.999999999999999e-31  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.240197  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2278  intracellular septation protein A  38.64 
 
 
176 aa  132  1.9999999999999998e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.170928 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1866  intracellular septation protein A  35.75 
 
 
179 aa  133  1.9999999999999998e-30  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.321665 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3397  intracellular septation protein A  43.09 
 
 
178 aa  132  3e-30  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000000148944  normal  0.569394 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1802  intracellular septation protein A  39.33 
 
 
178 aa  129  2.0000000000000002e-29  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2949  intracellular septation protein A  36.72 
 
 
189 aa  127  7.000000000000001e-29  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.979363 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1255  intracellular septation protein A  38.89 
 
 
181 aa  126  1.0000000000000001e-28  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1256  intracellular septation protein A  38.89 
 
 
181 aa  126  2.0000000000000002e-28  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1746  intracellular septation protein A  32.8 
 
 
186 aa  125  3e-28  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.468315  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1834  intracellular septation protein A  33.66 
 
 
208 aa  125  4.0000000000000003e-28  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.462521 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4501  intracellular septation protein A  38.86 
 
 
197 aa  122  2e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.211364  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2261  intracellular septation protein A  34.65 
 
 
202 aa  123  2e-27  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.054881  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1411  intracellular septation protein A  38.86 
 
 
197 aa  122  2e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0302697  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3790  intracellular septation protein A  38.86 
 
 
210 aa  122  2e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000185516 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4007  intracellular septation protein A  38.34 
 
 
197 aa  121  5e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000336537 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1809  intracellular septation protein A  35.86 
 
 
198 aa  120  9.999999999999999e-27  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2029  intracellular septation protein A  34.62 
 
 
186 aa  120  9.999999999999999e-27  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22800  intracellular septation protein A  34.9 
 
 
195 aa  120  9.999999999999999e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0697517 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1675  intracellular septation protein A  34.62 
 
 
186 aa  120  9.999999999999999e-27  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.321266  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1925  intracellular septation protein A  35.42 
 
 
195 aa  120  9.999999999999999e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.139599  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3587  intracellular septation protein A  35.68 
 
 
198 aa  119  3e-26  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.92433  normal  0.454348 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0973  intracellular septation protein A  36.11 
 
 
182 aa  119  3e-26  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1458  intracellular septation protein A  33.14 
 
 
190 aa  118  3.9999999999999996e-26  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0637661  hitchhiker  0.00000681861 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1499  intracellular septation protein A  33.14 
 
 
190 aa  118  3.9999999999999996e-26  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0994252  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2903  intracellular septation protein A  34.16 
 
 
202 aa  117  9.999999999999999e-26  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.130707  normal  0.228899 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1486  intracellular septation protein A  37.57 
 
 
198 aa  117  9.999999999999999e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00672895  normal  0.720307 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5211  intracellular septation protein A  32.95 
 
 
176 aa  116  9.999999999999999e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.18607 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1898  intracellular septation protein A  32.95 
 
 
176 aa  116  1.9999999999999998e-25  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1828  intracellular septation protein A  32.95 
 
 
176 aa  116  1.9999999999999998e-25  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.332077  normal  0.800874 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6169  intracellular septation protein A  32.95 
 
 
176 aa  115  3e-25  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1910  intracellular septation protein A  32.95 
 
 
176 aa  115  3e-25  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1933  intracellular septation protein A  32.95 
 
 
176 aa  115  3e-25  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.212071  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2111  intracellular septation protein A  36.11 
 
 
181 aa  114  6e-25  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.00323597  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2018  Intracellular septation protein A  32.21 
 
 
212 aa  113  1.0000000000000001e-24  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0839964  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1766  intracellular septation protein A  31.4 
 
 
207 aa  114  1.0000000000000001e-24  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0828979 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0667  intracellular septation protein A  33.33 
 
 
185 aa  113  2.0000000000000002e-24  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0816  intracellular septation protein A  33.33 
 
 
185 aa  113  2.0000000000000002e-24  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3451  intracellular septation protein A  36.07 
 
 
197 aa  112  3e-24  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15630  intracellular septation protein A  32.99 
 
 
199 aa  111  5e-24  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  decreased coverage  0.00979591  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0317  intracellular septation protein A  38.04 
 
 
200 aa  110  1.0000000000000001e-23  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1364  intracellular septation protein A  33.52 
 
 
186 aa  108  3e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1529  intracellular septation protein A  31.43 
 
 
210 aa  107  1e-22  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.0663803 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2385  intracellular septation protein A  33.5 
 
 
204 aa  105  3e-22  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.746787  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>