131 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SO_3025 on replicon NC_004347
Organism: Shewanella oneidensis MR-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_004347  SO_3025  hypothetical protein  100 
 
 
330 aa  680    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1514  putative esterase  82.01 
 
 
351 aa  566  1e-160  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00321061  normal  0.816657 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2144  putative esterase  31.85 
 
 
400 aa  149  5e-35  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.536761  normal  0.363467 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2109  putative esterase  30.87 
 
 
421 aa  145  1e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.000499047  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2146  putative esterase  32.94 
 
 
288 aa  142  7e-33  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6036  putative esterase  31.11 
 
 
404 aa  142  9.999999999999999e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00000538936  normal  0.87316 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0619  putative esterase  33.11 
 
 
307 aa  139  7e-32  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2437  putative esterase  31.87 
 
 
462 aa  131  2.0000000000000002e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.580514  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4375  putative esterase  32.79 
 
 
288 aa  127  4.0000000000000003e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.649215  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3542  putative esterase  31.18 
 
 
412 aa  125  1e-27  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.0209702 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2349  putative esterase  30 
 
 
460 aa  125  1e-27  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.705233  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1666  putative esterase  33.73 
 
 
445 aa  124  2e-27  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0598325  normal  0.0397493 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1518  putative esterase  30.31 
 
 
442 aa  123  4e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0711  putative esterase  31.75 
 
 
448 aa  122  9.999999999999999e-27  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.000000000350604  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1658  putative esterase  30.36 
 
 
430 aa  120  3e-26  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.125907  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1530  putative esterase  31.54 
 
 
384 aa  119  6e-26  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000509673  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2821  putative esterase  31.27 
 
 
384 aa  119  9.999999999999999e-26  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000598865  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1563  putative esterase  31.27 
 
 
384 aa  118  1.9999999999999998e-25  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.476528  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2085  putative esterase  30.22 
 
 
423 aa  116  6.9999999999999995e-25  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0737  putative esterase  32.13 
 
 
437 aa  115  1.0000000000000001e-24  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2307  putative esterase  28.28 
 
 
439 aa  114  3e-24  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.686614 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4960  putative esterase  28.37 
 
 
420 aa  111  1.0000000000000001e-23  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2630  putative esterase  29.13 
 
 
386 aa  111  2.0000000000000002e-23  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2737  putative esterase  29.02 
 
 
386 aa  111  2.0000000000000002e-23  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2563  putative esterase  28.63 
 
 
357 aa  110  3e-23  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3277  putative esterase  29.64 
 
 
273 aa  110  4.0000000000000004e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.294344  normal  0.0259177 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1813  putative esterase  27.52 
 
 
399 aa  108  1e-22  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1862  putative esterase  27.52 
 
 
399 aa  107  2e-22  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.416354  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2988  alpha/beta fold family hydrolase-like protein  31.37 
 
 
374 aa  101  2e-20  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000107918 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3112  putative esterase  31.13 
 
 
280 aa  99  1e-19  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.127997  normal  0.511793 
 
 
-
 
NC_006365  plpp0079  hypothetical protein  32.28 
 
 
298 aa  97.4  3e-19  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  0.0868984  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3504  putative esterase  26.62 
 
 
405 aa  87.4  3e-16  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1265  putative esterase  29.92 
 
 
287 aa  83.2  0.000000000000006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0827  putative esterase  33.51 
 
 
388 aa  78.2  0.0000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2182  putative esterase  29.92 
 
 
287 aa  77.8  0.0000000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000263766  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2405  putative esterase  28.99 
 
 
273 aa  78.2  0.0000000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000464858  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4870  putative esterase  32.93 
 
 
335 aa  77.4  0.0000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.533976  normal  0.155936 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3925  putative esterase  31.22 
 
 
477 aa  77  0.0000000000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1819  TPR repeat-containing protein  25.8 
 
 
378 aa  75.9  0.0000000000008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.66884 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0723  putative esterase  30.68 
 
 
200 aa  75.9  0.0000000000009  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.173587  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0471  putative esterase  32.46 
 
 
339 aa  74.3  0.000000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3502  putative esterase  29.84 
 
 
272 aa  74.3  0.000000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3719  putative esterase  26.3 
 
 
285 aa  73.2  0.000000000005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1825  putative esterase  34.57 
 
 
276 aa  73.2  0.000000000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.261111  normal  0.167809 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4516  putative esterase  33.5 
 
 
422 aa  73.2  0.000000000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.380381 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2868  cysteine synthase A  35.76 
 
 
309 aa  73.2  0.000000000006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.965819  normal  0.710891 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5261  putative esterase  31.79 
 
 
370 aa  73.2  0.000000000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.59544  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3791  putative esterase  34.13 
 
 
262 aa  71.2  0.00000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3767  hypothetical protein  33.73 
 
 
272 aa  70.5  0.00000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1466  IroE protein  34.67 
 
 
272 aa  70.1  0.00000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000298906 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3783  hypothetical protein  27.8 
 
 
275 aa  69.7  0.00000000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0159518  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3612  putative esterase  33.71 
 
 
306 aa  69.7  0.00000000007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.0832475 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2064  alpha/beta fold family hydrolase  28.88 
 
 
283 aa  69.7  0.00000000007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00685345 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1979  IroE protein  28.28 
 
 
273 aa  69.3  0.00000000008  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3491  esterase  33.12 
 
 
275 aa  69.3  0.00000000009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.254505  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0079  putative esterase  25.49 
 
 
324 aa  69.3  0.00000000009  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3479  esterase  33.12 
 
 
275 aa  68.9  0.0000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.706284  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3111  putative esterase  32.92 
 
 
312 aa  68.9  0.0000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.597643  normal  0.667044 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3579  hypothetical protein  31.74 
 
 
275 aa  68.6  0.0000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0266188  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3863  hypothetical protein  31.74 
 
 
275 aa  68.6  0.0000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.763594  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0242  putative esterase  28.29 
 
 
310 aa  67.8  0.0000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01445  putative esterase  25.07 
 
 
381 aa  68.2  0.0000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.676403  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3745  hypothetical protein  31.74 
 
 
275 aa  68.2  0.0000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000059605 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36990  esterase  31.49 
 
 
318 aa  67  0.0000000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0582234  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0681  putative esterase  25.66 
 
 
284 aa  66.6  0.0000000006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3833  IroE protein  33.11 
 
 
272 aa  66.6  0.0000000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.934207  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0696  putative esterase  32.53 
 
 
304 aa  66.2  0.0000000007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.665195  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3395  alpha/beta fold family hydrolase  27.18 
 
 
305 aa  65.9  0.000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.981621  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1341  putative esterase  32.73 
 
 
279 aa  65.9  0.000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.459048 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2538  putative esterase  27.92 
 
 
312 aa  64.7  0.000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1097  putative esterase  28.41 
 
 
295 aa  64.3  0.000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.808292 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4495  putative esterase  30.05 
 
 
294 aa  63.5  0.000000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1939  putative esterase  31.71 
 
 
342 aa  63.5  0.000000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.240589 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2741  putative esterase  28.43 
 
 
318 aa  63.2  0.000000006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07801  putative siderophore-degrading esterase (Eurofung)  31.76 
 
 
303 aa  62.8  0.000000007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.332933 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0973  putative esterase  30.59 
 
 
296 aa  61.6  0.00000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2707  putative esterase  27.81 
 
 
285 aa  61.2  0.00000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.427697 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0583  putative esterase  29.94 
 
 
296 aa  61.6  0.00000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.397071  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1192  putative esterase  31.45 
 
 
329 aa  60.8  0.00000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00663281  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21170  esterase  26.27 
 
 
365 aa  60.8  0.00000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.165865  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29340  hypothetical protein  31.29 
 
 
304 aa  60.1  0.00000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0083  putative esterase  28.14 
 
 
379 aa  60.1  0.00000005  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3083  putative esterase  31.54 
 
 
294 aa  60.1  0.00000005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00394287  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3040  putative esterase  26.52 
 
 
291 aa  59.7  0.00000008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.91008 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3074  hypothetical protein  28.88 
 
 
309 aa  59.3  0.00000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.00155869  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6337  putative esterase  31.82 
 
 
434 aa  58.9  0.0000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3796  putative esterase  29.79 
 
 
298 aa  57.8  0.0000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2918  IroE  28.86 
 
 
311 aa  58.5  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.683256  normal  0.0962519 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2888  IroE  28.36 
 
 
311 aa  57.4  0.0000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4525  putative esterase  31.51 
 
 
277 aa  57.4  0.0000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0383068  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1694  putative esterase  30.06 
 
 
313 aa  55.5  0.000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.286431  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3965  hypothetical protein  29.25 
 
 
304 aa  55.5  0.000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.956387  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0577  putative esterase  29.51 
 
 
296 aa  55.1  0.000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2971  hypothetical protein  27.86 
 
 
311 aa  54.7  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.0184375 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2952  hypothetical protein  27.86 
 
 
311 aa  54.7  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000000136091 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0975  putative esterase  36.17 
 
 
321 aa  55.1  0.000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.527064 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1067  putative esterase  31.21 
 
 
306 aa  54.3  0.000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.928127  normal  0.256453 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1484  alpha/beta fold family hydrolase-like protein  28.95 
 
 
329 aa  53.9  0.000003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.12659  normal  0.285322 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1038  putative esterase  31.21 
 
 
306 aa  54.3  0.000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4452  hypothetical protein  23.29 
 
 
394 aa  53.9  0.000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>