63 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SO_2940 on replicon NC_004347
Organism: Shewanella oneidensis MR-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010159  YpAngola_A2374  fibronectin type III domain-containing protein  54.13 
 
 		 1067 aa  986    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.213672  normal  0.639425 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2426  type III fibronectin  51.35 
 
 		 1188 aa  1093    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.506749  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0785  carbohydrate-binding family V/XII protein  48.28 
 
 		 1221 aa  1047    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2576  Protein of unknown function DUF1983  89.97 
 
 		 1816 aa  2083    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.191174 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2219  fibronectin, type III domain-containing protein  52.69 
 
 		 1061 aa  942    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3927  hypothetical protein  52.39 
 
 		 2007 aa  1057    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.202078  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3882  hypothetical protein  46.99 
 
 		 1100 aa  783    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.673506  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08300  putative phage-related protein, tail component  44.94 
 
 		 1219 aa  1039    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0627181  hitchhiker  0.0000838912 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1062  host specificity protein J  48.82 
 
 		 1101 aa  801    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1694  hypothetical protein  48.7 
 
 		 1092 aa  795    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1634  hypothetical protein  39.9 
 
 		 1133 aa  709    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.154038  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0443  putative prophage LambdaSo, host specificity protein J  43.33 
 
 		 1057 aa  702    Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2772  fibronectin, type III  51.36 
 
 		 1194 aa  1065    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00979345 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2940  prophage LambdaSo, host specificity protein J, putative  100 
 
 		 1341 aa  2735    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1698  bacteriophage protein  46.36 
 
 		 1051 aa  800    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0606223  normal  0.0762686 
 
 
-
 
NC_010158  YpAngola_0094  fibronectin type III domain-containing protein  31.11 
 
 		 1543 aa  582  1e-164  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000020422 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7024  Fibronectin type III domain protein  36.44 
 
 		 3006 aa  438  1e-121  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6222  Fibronectin type III domain protein  36.59 
 
 		 2140 aa  436  1e-120  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3382  Phage-related protein tail component-like protein  34.79 
 
 		 1103 aa  435  1e-120  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000619193 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3882  Fibronectin type III domain protein  35.63 
 
 		 3238 aa  421  1e-116  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3527  Fibronectin type III domain protein  34.35 
 
 		 3521 aa  413  1e-113  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4057  Fibronectin type III domain protein  34.07 
 
 		 2900 aa  409  1.0000000000000001e-112  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5047  Fibronectin type III domain protein  34.07 
 
 		 2899 aa  407  1.0000000000000001e-112  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5750  Fibronectin type III domain protein  34.34 
 
 		 3286 aa  401  9.999999999999999e-111  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1638  hypothetical protein  33.26 
 
 		 1132 aa  393  1e-107  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.498718 
 
 
-
 
CP001509  ECD_10054  tail:host specificity protein  33.1 
 
 		 1132 aa  390  1e-107  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1203  fibronectin type III domain-containing protein  32.37 
 
 		 1159 aa  392  1e-107  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.272473  normal  0.0174889 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00750  hypothetical protein  33.1 
 
 		 1132 aa  390  1e-107  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0913  hypothetical protein  32.68 
 
 		 1137 aa  387  1e-106  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2109  hypothetical protein  32.22 
 
 		 1159 aa  385  1e-105  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  0.000420238  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1158  host specificity protein J  31.77 
 
 		 1116 aa  385  1e-105  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.410108  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2796  host specificity protein  31.44 
 
 		 1120 aa  378  1e-103  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1086  host specificity protein J  31.62 
 
 		 1116 aa  379  1e-103  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1201  hypothetical protein  31.49 
 
 		 1157 aa  376  1e-102  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0708  host specificity protein  30.86 
 
 		 1120 aa  376  1e-102  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.024039 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2873  hypothetical protein  31.05 
 
 		 1159 aa  369  1e-100  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00489128 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2762  hypothetical protein  31.16 
 
 		 1159 aa  369  1e-100  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.619674 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3120  hypothetical protein  30.54 
 
 		 1157 aa  364  5.0000000000000005e-99  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0703076 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0880  host specificity protein  30.25 
 
 		 1157 aa  358  3.9999999999999996e-97  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1878  hypothetical protein  30.5 
 
 		 1158 aa  355  2.9999999999999997e-96  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.1744 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3188  hypothetical protein  30.5 
 
 		 1158 aa  355  2.9999999999999997e-96  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000183265 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0663  gp29  29.95 
 
 		 1059 aa  336  2e-90  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000117932 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1474  fibronectin type III domain protein  31.49 
 
 		 1012 aa  309  2.0000000000000002e-82  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2168  host specificity protein  35.31 
 
 		 522 aa  306  1.0000000000000001e-81  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.524267  normal  0.854577 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1639  fibronectin type III domain-containing protein  30.3 
 
 		 881 aa  222  3e-56  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.994447  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4041  host specificity protein J, internal deletion  46.29 
 
 		 1093 aa  220  1e-55  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0753321  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2089  host specificity protein J, internal deletion  46.29 
 
 		 1093 aa  220  1e-55  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0154474  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1802  hypothetical protein  35.64 
 
 		 951 aa  182  4e-44  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0582533 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3498  Phage-related protein tail component-like protein  25.2 
 
 		 960 aa  171  1e-40  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2167  hypothetical protein  27.26 
 
 		 837 aa  157  1e-36  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.981242  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1583  hypothetical protein  34.14 
 
 		 1329 aa  110  1e-22  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.917708 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1353  hypothetical protein  31.97 
 
 		 1830 aa  109  3e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.169876 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3094  hypothetical protein  42.61 
 
 		 348 aa  99.8  3e-19  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3392  hypothetical protein  32.83 
 
 		 2400 aa  80.9  0.0000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000447967 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1893  Phage-related protein tail component-like  22.84 
 
 		 1644 aa  72.4  0.00000000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0293426 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2176  hypothetical protein  27.45 
 
 		 971 aa  64.3  0.00000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00011574 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1874  hypothetical protein  38.46 
 
 		 885 aa  63.5  0.00000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.556351 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1641  hypothetical protein  38.46 
 
 		 885 aa  63.2  0.00000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.118631 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2398  accumulation associated protein  22.73 
 
 		 2397 aa  58.2  0.000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.53067  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0298  hypothetical protein  29.06 
 
 		 1570 aa  58.2  0.000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.620939  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3503  hypothetical protein  29.5 
 
 		 404 aa  51.2  0.0001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2232  Phage-related protein tail component-like protein  24.44 
 
 		 1915 aa  46.2  0.005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1764  hypothetical protein  34.48 
 
 		 771 aa  45.1  0.01  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0992615  normal  0.125596 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>