195 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SO_2860 on replicon NC_004347
Organism: Shewanella oneidensis MR-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004347  SO_2860  DsbA family thiol:disulfide interchange protein  100 
 
 		 207 aa  431  1e-120  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1512  DSBA oxidoreductase  91.3 
 
 		 207 aa  400  1e-111  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00919562 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1579  DSBA oxidoreductase  91.79 
 
 		 207 aa  402  1e-111  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.555105  hitchhiker  0.00803379 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1573  DSBA oxidoreductase  91.3 
 
 		 217 aa  399  9.999999999999999e-111  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000164919 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2640  DSBA oxidoreductase  84.88 
 
 		 206 aa  370  1e-101  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1709  DSBA oxidoreductase  84.88 
 
 		 206 aa  370  1e-101  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000128483 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2754  DSBA oxidoreductase  84.39 
 
 		 206 aa  366  1e-100  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000466804 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2675  DSBA oxidoreductase  84.39 
 
 		 206 aa  366  1e-100  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.26469  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2360  DSBA oxidoreductase  78.26 
 
 		 207 aa  350  5.9999999999999994e-96  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1742  DsbA oxidoreductase  61.33 
 
 		 210 aa  241  6e-63  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0147318  hitchhiker  0.0000164323 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1693  DSBA oxidoreductase  55.72 
 
 		 210 aa  238  5e-62  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2842  DSBA oxidoreductase  56.52 
 
 		 208 aa  225  3e-58  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000181204 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1521  DsbA family thiol:disulfide interchange protein  54.95 
 
 		 185 aa  217  1e-55  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0606575  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2373  DSBA oxidoreductase  50.48 
 
 		 210 aa  213  1.9999999999999998e-54  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.563434  hitchhiker  0.0000192462 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0410  DSBA oxidoreductase  38.46 
 
 		 205 aa  119  3e-26  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.247537  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0044  thiol/disulfide interchange protein DsbA precursor  34.78 
 
 		 207 aa  118  6e-26  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3321  thiol:disulfide interchange protein DsbA  37.77 
 
 		 204 aa  114  1.0000000000000001e-24  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0146564  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3642  DSBA oxidoreductase  36.32 
 
 		 203 aa  108  4.0000000000000004e-23  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.190488  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0302  DSBA oxidoreductase  36.32 
 
 		 203 aa  108  4.0000000000000004e-23  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.496912  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000576  periplasmic thiol:disulfide interchange protein DsbA  35.14 
 
 		 199 aa  108  7.000000000000001e-23  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0848173  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3838  DSBA oxidoreductase  35.98 
 
 		 203 aa  108  8.000000000000001e-23  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0333  thiol:disulfide interchange protein DsbA  36.13 
 
 		 202 aa  107  1e-22  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3958  DSBA oxidoreductase  35.52 
 
 		 202 aa  101  9e-21  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4153  DSBA oxidoreductase  35.52 
 
 		 202 aa  101  9e-21  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4060  DSBA oxidoreductase  35.52 
 
 		 202 aa  101  9e-21  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.154818  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4035  DSBA oxidoreductase  35.52 
 
 		 202 aa  101  9e-21  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0120  hypothetical protein  28.57 
 
 		 206 aa  100  1e-20  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3118  DSBA oxidoreductase  31.79 
 
 		 210 aa  100  1e-20  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.973295  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05306  thiol:disulfide interchange protein DsbA  34.03 
 
 		 211 aa  100  1e-20  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0129  DSBA oxidoreductase  28.57 
 
 		 206 aa  99.8  2e-20  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0265  DSBA oxidoreductase  32.43 
 
 		 203 aa  99.8  2e-20  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0786438  hitchhiker  0.00413273 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3656  DSBA oxidoreductase  35.14 
 
 		 202 aa  99.4  3e-20  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0285  DSBA oxidoreductase  35.16 
 
 		 203 aa  99  4e-20  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000000120149  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0137  thiol:disulfide interchange protein precursor DsbA  32.02 
 
 		 204 aa  98.2  7e-20  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0748  DSBA oxidoreductase  29.7 
 
 		 206 aa  98.2  7e-20  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.309813  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0311  DSBA oxidoreductase  35.14 
 
 		 203 aa  98.2  8e-20  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.126539  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0122  thiol:disulfide interchange protein precursor DsbA  33.17 
 
 		 204 aa  98.2  8e-20  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0400  DSBA oxidoreductase  32.97 
 
 		 203 aa  97.1  2e-19  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0037  DSBA oxidoreductase  27.36 
 
 		 210 aa  96.3  3e-19  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.763782 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3156  thiol:disulfide interchange protein DsbA  28.57 
 
 		 200 aa  95.5  5e-19  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0142  DSBA oxidoreductase  32.02 
 
 		 210 aa  95.1  6e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4193  DsbA oxidoreductase  32.07 
 
 		 203 aa  92.4  4e-18  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.000377702  normal  0.608674 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4165  periplasmic protein disulfide isomerase I  31.8 
 
 		 207 aa  92  5e-18  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0407831  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4228  DSBA oxidoreductase  32.24 
 
 		 221 aa  91.7  8e-18  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.210811 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2116  DSBA oxidoreductase  27.78 
 
 		 213 aa  91.7  8e-18  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0268  DSBA oxidoreductase  29.85 
 
 		 214 aa  90.1  2e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3620  thiol:disulfide interchange protein DsbA  34.39 
 
 		 202 aa  90.1  2e-17  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3703  DSBA oxidoreductase  29.51 
 
 		 220 aa  90.5  2e-17  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.393937  normal  0.783834 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2485  thiol:disulfide interchange protein  30.15 
 
 		 200 aa  90.1  2e-17  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.721337  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2675  DSBA oxidoreductase  34.97 
 
 		 211 aa  89.7  3e-17  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6288  thiol:disulfide interchange protein DsbA  29.21 
 
 		 211 aa  89.7  3e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.833111  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4518  periplasmic protein disulfide isomerase I  32.69 
 
 		 207 aa  89  4e-17  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72450  thiol:disulfide interchange protein DsbA  28.91 
 
 		 211 aa  89  4e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.568444  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5101  DSBA oxidoreductase  30.73 
 
 		 211 aa  89.4  4e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0488086 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0341  thiol:disulfide interchange protein DsbA  29.78 
 
 		 214 aa  88.6  5e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0551  DSBA oxidoreductase  29.05 
 
 		 220 aa  89  5e-17  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00404  disulfide bond formation protein  30.16 
 
 		 200 aa  89  5e-17  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002045  periplasmic thiol:disulfide interchange protein DsbA  30.16 
 
 		 200 aa  88.6  6e-17  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4228  periplasmic protein disulfide isomerase I  31.1 
 
 		 207 aa  88.2  9e-17  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01990  Thiol:disulfide interchange protein DsbA  29.35 
 
 		 214 aa  87.8  1e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0127  DsbA family thiol:disulfide interchange protein  30.34 
 
 		 210 aa  85.9  4e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3968  periplasmic protein disulfide isomerase I  33.33 
 
 		 207 aa  84.3  0.000000000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  unclonable  0.000000322053  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4889  periplasmic protein disulfide isomerase I  31.19 
 
 		 207 aa  84.3  0.000000000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000000138937  hitchhiker  0.000000639801 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0144  DSBA oxidoreductase  29.78 
 
 		 210 aa  84.7  0.000000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4488  DSBA oxidoreductase  28.33 
 
 		 220 aa  82.8  0.000000000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.147797 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3575  DSBA oxidoreductase  28.42 
 
 		 207 aa  83.2  0.000000000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0022  periplasmic protein disulfide isomerase I  29.21 
 
 		 207 aa  82  0.000000000000006  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00595683  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4196  periplasmic protein disulfide isomerase I  29.21 
 
 		 207 aa  82  0.000000000000006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.693505  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0020  periplasmic protein disulfide isomerase I  29.21 
 
 		 207 aa  82  0.000000000000006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000268168  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2784  thiol:disulfide interchange protein DsbA  28.08 
 
 		 216 aa  81.6  0.000000000000007  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.957137  normal  0.939169 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2602  thiol:disulfide interchange protein DsbA  29.06 
 
 		 216 aa  80.9  0.00000000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.405724  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0151  thiol:disulfide interchange protein  30.72 
 
 		 214 aa  80.9  0.00000000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.517517  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03746  periplasmic protein disulfide isomerase I  30.81 
 
 		 208 aa  80.1  0.00000000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.468717  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4126  DSBA oxidoreductase  30.81 
 
 		 208 aa  80.1  0.00000000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5300  periplasmic protein disulfide isomerase I  30.81 
 
 		 208 aa  80.1  0.00000000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.038843  normal  0.694911 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2454  DSBA oxidoreductase  28.5 
 
 		 215 aa  80.5  0.00000000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4083  periplasmic protein disulfide isomerase I  30.81 
 
 		 208 aa  80.1  0.00000000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000727288  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4155  periplasmic protein disulfide isomerase I  30.81 
 
 		 208 aa  80.1  0.00000000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00383633  hitchhiker  0.0000667168 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4241  periplasmic protein disulfide isomerase I  30.81 
 
 		 208 aa  80.1  0.00000000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0131889  normal  0.281037 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4332  periplasmic protein disulfide isomerase I  30.81 
 
 		 208 aa  80.1  0.00000000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03695  hypothetical protein  30.81 
 
 		 208 aa  80.1  0.00000000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.459554  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4378  periplasmic protein disulfide isomerase I  30.81 
 
 		 208 aa  80.1  0.00000000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000586255  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4348  thiol:disulfide interchange protein DsbA  31.22 
 
 		 214 aa  79.7  0.00000000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.259812  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4228  periplasmic protein disulfide isomerase I  31.9 
 
 		 207 aa  79.7  0.00000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000000157644  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3404  DSBA oxidoreductase  31.48 
 
 		 216 aa  79.3  0.00000000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.766013  normal  0.487769 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4324  periplasmic protein disulfide isomerase I  31.9 
 
 		 207 aa  79.7  0.00000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.954337 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4207  periplasmic protein disulfide isomerase I  31.9 
 
 		 207 aa  79.7  0.00000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0195163  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4385  periplasmic protein disulfide isomerase I  31.9 
 
 		 207 aa  79.7  0.00000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.25464  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4278  periplasmic protein disulfide isomerase I  31.9 
 
 		 207 aa  79.7  0.00000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.744084  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04433  disulfide oxidoreductase  29.84 
 
 		 216 aa  79  0.00000000000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0052  DSBA oxidoreductase  30.83 
 
 		 213 aa  78.2  0.00000000000008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.176181 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4104  periplasmic protein disulfide isomerase I  31.1 
 
 		 207 aa  78.2  0.00000000000009  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00283227  normal  0.288365 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2167  DSBA oxidoreductase  31.06 
 
 		 233 aa  77.4  0.0000000000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0158  DSBA oxidoreductase  28.14 
 
 		 216 aa  77.8  0.0000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.699641  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0383  DSBA oxidoreductase  30.77 
 
 		 212 aa  76.6  0.0000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.290436 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3864  twin-arginine translocation pathway signal  27.53 
 
 		 218 aa  76.3  0.0000000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.387076  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2970  DSBA oxidoreductase  30.13 
 
 		 213 aa  76.3  0.0000000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2833  DSBA oxidoreductase  30.13 
 
 		 213 aa  76.3  0.0000000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.483213 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2936  DSBA oxidoreductase  30.13 
 
 		 212 aa  75.9  0.0000000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0092  DSBA oxidoreductase  28.4 
 
 		 216 aa  75.9  0.0000000000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>