More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SO_2715 on replicon NC_004347
Organism: Shewanella oneidensis MR-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004347  SO_2715  TonB-dependent receptor  100 
 
 		 733 aa  1513    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1660  TonB-dependent receptor  93.95 
 
 		 729 aa  1375    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.0000750921  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1841  TonB-dependent receptor  89.58 
 
 		 743 aa  1370    Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.000217461  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1828  TonB-dependent receptor  73.12 
 
 		 712 aa  1090    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.0000226653  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1794  TonB-dependent receptor  89.46 
 
 		 744 aa  1365    Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00000583553  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1802  TonB-dependent receptor  89.72 
 
 		 743 aa  1373    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2321  TonB-dependent receptor  65.4 
 
 		 744 aa  969    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.130994  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2484  TonB-dependent receptor  89.88 
 
 		 744 aa  1346    Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.0000223864  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1735  TonB-dependent receptor  72.44 
 
 		 713 aa  1103    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.00374581  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1451  TonB-dependent receptor  68.26 
 
 		 730 aa  1054    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.322984  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2310  TonB-dependent receptor  94.82 
 
 		 732 aa  1446    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0299343  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1886  TonB-dependent receptor plug  70 
 
 		 729 aa  1074    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.270024  normal  0.821548 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2380  TonB-dependent receptor  81.2 
 
 		 748 aa  1246    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.357323  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1526  TonB-dependent receptor  75.41 
 
 		 733 aa  1156    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.208571  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2500  TonB-dependent receptor  80.34 
 
 		 757 aa  1241    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0249349  hitchhiker  0.00279942 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2752  TonB-dependent receptor  72.55 
 
 		 736 aa  1104    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.000933457  normal  0.355865 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2064  TonB-dependent receptor  42.36 
 
 		 697 aa  520  1e-146  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.969634  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0067  TonB-dependent receptor  39.06 
 
 		 726 aa  493  9.999999999999999e-139  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1344  TonB-dependent receptor  34.83 
 
 		 687 aa  403  1e-111  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0341297  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3405  outer membrane protein  33.33 
 
 		 714 aa  395  1e-108  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.411389  normal  0.175669 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02805  TonB-dependent receptor  33.1 
 
 		 696 aa  346  7e-94  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00354555  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1672  TonB-dependent receptor  28.75 
 
 		 853 aa  233  9e-60  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0105669  normal  1 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0185  TonB-dependent receptor  28.61 
 
 		 851 aa  229  1e-58  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0681  TonB-dependent receptor  26.4 
 
 		 690 aa  210  1e-52  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0750  TonB-dependent receptor  26.22 
 
 		 690 aa  209  2e-52  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.921398  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0865  TonB-dependent receptor  27.08 
 
 		 720 aa  192  2e-47  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0447976  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2240  TonB-dependent siderophore receptor  26.88 
 
 		 695 aa  191  2.9999999999999997e-47  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.778513 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1600  receptor precursor-mostly Fe transport  25.2 
 
 		 715 aa  187  6e-46  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.147311  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0230  TonB-dependent receptor  24.51 
 
 		 729 aa  182  2e-44  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2663  TonB-dependent receptor  27.55 
 
 		 728 aa  177  4e-43  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0150828  normal  0.481934 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0429  TonB-dependent receptor  25.11 
 
 		 687 aa  177  5e-43  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.395875  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0478  TonB-dependent receptor  26.04 
 
 		 720 aa  176  1.9999999999999998e-42  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.742191  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2088  TonB-dependent receptor  26.41 
 
 		 764 aa  176  1.9999999999999998e-42  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.976356  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3348  TonB-dependent receptor  26.55 
 
 		 747 aa  173  1e-41  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0505  TonB-dependent receptor  25.99 
 
 		 713 aa  171  5e-41  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.742507 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0377  TonB-dependent receptor  25.44 
 
 		 783 aa  169  2e-40  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2471  TonB-dependent receptor  26.64 
 
 		 732 aa  167  5.9999999999999996e-40  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1776  TonB-dependent receptor  25.93 
 
 		 734 aa  165  2.0000000000000002e-39  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.00365566  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4781  TonB-dependent receptor  25.55 
 
 		 753 aa  162  2e-38  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.211672 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1343  TonB-dependent receptor  25.92 
 
 		 755 aa  161  4e-38  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2600  TonB-dependent receptor  24.93 
 
 		 773 aa  160  7e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.637909 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3635  TonB-dependent receptor, plug  25.51 
 
 		 751 aa  160  1e-37  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.0000221173  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2495  TonB-dependent receptor  25.9 
 
 		 712 aa  159  1e-37  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.237347 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0673  TonB-dependent receptor  24.81 
 
 		 761 aa  159  2e-37  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0939  TonB-dependent receptor  26.12 
 
 		 763 aa  159  2e-37  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.549215  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2433  TonB-dependent receptor  25.98 
 
 		 704 aa  158  4e-37  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.1738  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2522  TonB-dependent receptor  24.93 
 
 		 700 aa  158  4e-37  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.644124  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4197  TonB-dependent receptor  24.6 
 
 		 702 aa  157  6e-37  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.0000540128  normal  0.065151 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4173  TonB-dependent receptor  25.07 
 
 		 763 aa  157  7e-37  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  unclonable  0.000000000121747  normal  0.086797 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08200  TonB-dependent siderophore receptor  25.59 
 
 		 767 aa  155  2e-36  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1547  TonB-dependent receptor  25.22 
 
 		 794 aa  154  7e-36  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0831797 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2677  TonB-dependent receptor plug  26.85 
 
 		 759 aa  154  8e-36  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.126717  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4826  TonB-dependent receptor:TonB box, N-terminal  25.07 
 
 		 755 aa  153  8.999999999999999e-36  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3080  TonB-dependent receptor  25.66 
 
 		 710 aa  153  8.999999999999999e-36  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0680  TonB-dependent receptor  25.68 
 
 		 753 aa  153  1e-35  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.915685  normal  0.983563 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1436  TonB-dependent receptor  25.06 
 
 		 749 aa  150  6e-35  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000358025  decreased coverage  0.0000102915 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0007  TonB-dependent receptor  24.74 
 
 		 641 aa  150  1.0000000000000001e-34  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3538  TonB-dependent receptor  24.21 
 
 		 771 aa  149  2.0000000000000003e-34  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.25784  normal  0.393051 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0563  TonB-dependent receptor  25.28 
 
 		 737 aa  148  4.0000000000000006e-34  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.354996  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1458  TonB-dependent receptor  24.3 
 
 		 694 aa  146  1e-33  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.552636  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1574  TonB-dependent receptor  24.14 
 
 		 695 aa  146  1e-33  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.000000898905  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08150  TonB-dependent receptor  25.31 
 
 		 803 aa  147  1e-33  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2646  TonB-dependent receptor plug  25.06 
 
 		 771 aa  146  1e-33  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.994259 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3981  TonB-dependent receptor  24.07 
 
 		 773 aa  146  1e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.139446 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5256  TonB-dependent receptor  26.16 
 
 		 731 aa  146  2e-33  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.650389  hitchhiker  0.000349677 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0895  TonB-dependent receptor  25.51 
 
 		 769 aa  145  2e-33  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0618302  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4030  TonB-dependent receptor  24.93 
 
 		 732 aa  145  2e-33  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.667101 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0429  TonB-dependent receptor  25.16 
 
 		 738 aa  145  3e-33  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4114  TonB-dependent receptor  25.1 
 
 		 703 aa  145  3e-33  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0250  TonB-dependent receptor  24.82 
 
 		 741 aa  144  6e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.513773 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2744  TonB-dependent receptor  26.74 
 
 		 686 aa  144  6e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.339912  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0924  TonB-dependent receptor  23.8 
 
 		 795 aa  144  6e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1977  TonB-dependent receptor  25.59 
 
 		 769 aa  143  9.999999999999999e-33  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.357712  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1862  TonB-dependent receptor plug  24.26 
 
 		 799 aa  143  9.999999999999999e-33  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1672  TonB-dependent receptor  23.62 
 
 		 761 aa  142  1.9999999999999998e-32  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.295189  normal  0.636127 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1656  TonB-dependent receptor  23.77 
 
 		 764 aa  142  1.9999999999999998e-32  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  unclonable  0.0000000000345148  decreased coverage  0.00188078 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0899  TonB-dependent receptor  25.13 
 
 		 764 aa  140  6e-32  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.00548484  normal  0.114309 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3007  TonB-dependent siderophore receptor  25.03 
 
 		 692 aa  140  6e-32  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0304198  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0914  TonB-dependent receptor  22.86 
 
 		 802 aa  140  7e-32  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0760  TonB-dependent receptor  25.55 
 
 		 746 aa  140  7e-32  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0393  TonB-dependent receptor  24.07 
 
 		 670 aa  140  8.999999999999999e-32  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.431607  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3336  TonB-dependent receptor  23.14 
 
 		 741 aa  140  1e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0286811 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3147  TonB-dependent receptor  24.87 
 
 		 775 aa  140  1e-31  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.774521  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1534  TonB-dependent receptor  25.63 
 
 		 771 aa  140  1e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00336206 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2351  TonB-dependent receptor  25.06 
 
 		 761 aa  139  2e-31  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.639687 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0765  TonB-dependent receptor  24.77 
 
 		 779 aa  138  3.0000000000000003e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.305  normal  0.367736 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1691  TonB-dependent receptor  24.33 
 
 		 743 aa  138  5e-31  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0224052  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4611  TonB-dependent receptor, plug  23.78 
 
 		 784 aa  137  7.000000000000001e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2500  TonB-dependent receptor  24.21 
 
 		 733 aa  137  9e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0709  TonB-dependent receptor  24.26 
 
 		 790 aa  136  9.999999999999999e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.072981  hitchhiker  0.00423974 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1910  TonB-dependent receptor  24.86 
 
 		 736 aa  137  9.999999999999999e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0250  TonB-dependent receptor  23.54 
 
 		 763 aa  135  1.9999999999999998e-30  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0516  TonB-dependent receptor  23.06 
 
 		 773 aa  136  1.9999999999999998e-30  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.756879  normal  1 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5045  TonB-dependent receptor  24.02 
 
 		 726 aa  136  1.9999999999999998e-30  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0895856  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3466  TonB-dependent receptor  24.09 
 
 		 718 aa  135  3e-30  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55050  TonB-dependent receptor  24.26 
 
 		 684 aa  135  3e-30  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000000501937  unclonable  1.04288e-20 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1583  TonB-dependent receptor  24.51 
 
 		 724 aa  134  3.9999999999999996e-30  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3171  TonB-dependent receptor  25.22 
 
 		 759 aa  134  5e-30  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0174506  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0235  TonB-dependent receptor  25.07 
 
 		 778 aa  134  6e-30  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01003  TonB-dependent receptor  23.97 
 
 		 758 aa  134  6e-30  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.000984291  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>