179 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SO_2604.1 on replicon NC_004347
Organism: Shewanella oneidensis MR-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004347  SO_2604.1  hypothetical protein  100 
 
 		 161 aa  321  3e-87  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2206  paraquat-inducible protein A  88.12 
 
 		 210 aa  282  1.0000000000000001e-75  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.502465  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2564  paraquat-inducible protein A  86.88 
 
 		 210 aa  277  4e-74  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.794352  normal  0.0919283 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1900  Paraquat-inducible protein A  86.88 
 
 		 210 aa  277  4e-74  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00104452  normal  0.195982 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2451  paraquat-inducible protein A  86.88 
 
 		 210 aa  277  4e-74  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.356157  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2444  paraquat-inducible protein A  86.88 
 
 		 210 aa  277  4e-74  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0158328  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1744  paraquat-inducible protein A  93.79 
 
 		 211 aa  275  2e-73  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.457122  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1669  paraquat-inducible protein A  93.17 
 
 		 211 aa  274  3e-73  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00177227  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1774  paraquat-inducible protein A  92.55 
 
 		 211 aa  268  2e-71  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.233291  normal  0.160696 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1798  paraquat-inducible protein A  73.08 
 
 		 220 aa  234  5.0000000000000005e-61  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0764034  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1581  paraquat-inducible protein A  74.36 
 
 		 215 aa  228  3e-59  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.513887  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2129  paraquat-inducible protein A  68.59 
 
 		 208 aa  227  5e-59  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00475203  normal  0.0456447 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1931  paraquat-inducible protein A  66.88 
 
 		 209 aa  225  2e-58  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.29845  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2232  paraquat-inducible protein A  66.88 
 
 		 208 aa  216  1e-55  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2487  paraquat-inducible protein A  68.53 
 
 		 208 aa  209  2e-53  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00109447  normal  0.337329 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1718  paraquat-inducible protein A  72.26 
 
 		 209 aa  177  5.999999999999999e-44  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000000634197  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5398  PqiA family protein  32.48 
 
 		 218 aa  84.3  6e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0407212  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62040  putative paraquat-inducible protein  32.08 
 
 		 235 aa  81.6  0.000000000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0218232 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3044  paraquat-inducible protein A  25.97 
 
 		 204 aa  70.1  0.00000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.123343 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44080  PqiA family protein  27.78 
 
 		 208 aa  68.9  0.00000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.179105  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0638  paraquat-inducible protein A  30 
 
 		 219 aa  68.6  0.00000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.205765 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2221  paraquat-inducible protein A  30.71 
 
 		 198 aa  68.6  0.00000000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.00681473  normal  0.119322 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42470  Paraquat-inducible protein A  29.53 
 
 		 219 aa  66.6  0.0000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4782  paraquat-inducible protein A  30.41 
 
 		 219 aa  67  0.0000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0653757 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02655  integral membrane protein, PqiA family  25.64 
 
 		 380 aa  66.6  0.0000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.399105  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2933  PqiA family integral membrane protein  27.92 
 
 		 423 aa  67  0.0000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1324  integral membrane protein, PqiA family  25.17 
 
 		 489 aa  65.9  0.0000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.153858  normal  0.426119 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3076  PqiA family integral membrane protein  26.28 
 
 		 405 aa  65.5  0.0000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1013  paraquat-inducible protein A  30.41 
 
 		 219 aa  64.3  0.0000000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.473399  normal  0.115279 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4565  paraquat-inducible protein A  27.03 
 
 		 219 aa  64.3  0.0000000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.947001  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3289  paraquat-inducible protein A  27.27 
 
 		 214 aa  63.9  0.0000000008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1108  hypothetical protein  31.45 
 
 		 419 aa  63.9  0.0000000008  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000845315  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3140  paraquat-inducible protein A  26.62 
 
 		 209 aa  63.9  0.0000000008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0650  PqiA family integral membrane protein  25.32 
 
 		 449 aa  63.9  0.000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0149918  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4089  paraquat-inducible protein A  28.29 
 
 		 423 aa  63.2  0.000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.645916  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00954  paraquat-inducible membrane protein A  24.22 
 
 		 417 aa  62.8  0.000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.000174021  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2693  integral membrane protein, PqiA family  24.22 
 
 		 417 aa  62.8  0.000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.098958  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2367  paraquat-inducible protein A  24.22 
 
 		 417 aa  62.8  0.000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.658309  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1989  paraquat-inducible protein A  24.84 
 
 		 428 aa  62.4  0.000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0643  paraquat-inducible protein A  27.03 
 
 		 219 aa  62.8  0.000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.766224  hitchhiker  0.00309021 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00961  hypothetical protein  24.22 
 
 		 417 aa  62.8  0.000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.000262211  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2639  PqiA family integral membrane protein  24.84 
 
 		 428 aa  62.4  0.000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3375  paraquat-inducible protein A  25 
 
 		 212 aa  63.2  0.000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0541727 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1114  paraquat-inducible protein A  24.22 
 
 		 417 aa  62.8  0.000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0100863  normal  0.917256 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2646  PqiA family integral membrane protein  24.22 
 
 		 417 aa  62.8  0.000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00999711  hitchhiker  0.00049713 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2169  paraquat-inducible protein A  24.22 
 
 		 417 aa  62.8  0.000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000394614  normal  0.228835 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2550  paraquat-inducible protein A  24.84 
 
 		 428 aa  62.4  0.000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.731619  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1059  paraquat-inducible protein A  24.22 
 
 		 417 aa  62.8  0.000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000508779  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1065  paraquat-inducible protein A  24.22 
 
 		 417 aa  62.8  0.000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000565994  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2440  paraquat-inducible protein A  24.84 
 
 		 223 aa  61.6  0.000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.226744 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1651  integral membrane protein, PqiA family  24.84 
 
 		 422 aa  61.2  0.000000006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1462  PqiA family integral membrane protein  22.84 
 
 		 417 aa  61.2  0.000000006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.103115  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1864  PqiA family integral membrane protein  25.83 
 
 		 426 aa  60.5  0.000000008  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0424283 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1021  paraquat-inducible protein A  24.22 
 
 		 417 aa  60.5  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00323586  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1705  PqiA family integral membrane protein  22.93 
 
 		 402 aa  60.1  0.00000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2114  PqiA family integral membrane protein  25.83 
 
 		 426 aa  60.1  0.00000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.387585  normal  0.0225112 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1138  paraquat-inducible protein A  24.22 
 
 		 417 aa  60.5  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.946739  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1104  paraquat-inducible protein A  24.22 
 
 		 417 aa  60.5  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.163733 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1172  paraquat-inducible protein A  24.22 
 
 		 417 aa  60.5  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.718604  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1126  Pqi5  24.22 
 
 		 417 aa  60.5  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.865331  normal  0.906807 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36030  paraquat-inducible protein A  23.18 
 
 		 206 aa  59.7  0.00000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000103971 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2222  paraquat-inducible protein A  27.1 
 
 		 207 aa  59.7  0.00000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.00958061  normal  0.12527 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0258  paraquat-inducible protein A  25 
 
 		 212 aa  59.3  0.00000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5397  paraquat-inducible protein A  23.84 
 
 		 206 aa  59.3  0.00000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.563787  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0402  paraquat-inducible protein A  25.62 
 
 		 213 aa  58.9  0.00000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42460  Paraquat-inducible protein A  24.84 
 
 		 207 aa  58.5  0.00000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1999  Paraquat-inducible protein A  27.95 
 
 		 215 aa  58.5  0.00000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62030  paraquat-inducible protein A-like protein  23.18 
 
 		 206 aa  58.2  0.00000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0197125 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1745  PqiA family integral membrane protein  23.75 
 
 		 414 aa  58.2  0.00000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0758068  hitchhiker  0.0000336386 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4781  paraquat-inducible protein A  23.84 
 
 		 207 aa  57.8  0.00000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0611001 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6817  paraquat-inducible protein A  27.15 
 
 		 215 aa  57.8  0.00000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.776794 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0039  putative paraquat-inducible protein  29.87 
 
 		 220 aa  57.4  0.00000009  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.355976  normal  0.169833 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2534  paraquat-inducible protein A  27.56 
 
 		 224 aa  56.2  0.0000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2581  paraquat-inducible protein A  24.66 
 
 		 214 aa  56.2  0.0000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.502508 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003427  paraquat-inducible protein A  23.9 
 
 		 416 aa  55.8  0.0000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0651922  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1919  PqiA family integral membrane protein  26.11 
 
 		 427 aa  55.5  0.0000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2073  PqiA family integral membrane protein  23.68 
 
 		 406 aa  55.8  0.0000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.225141  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2673  paraquat-inducible protein A  25.49 
 
 		 209 aa  55.5  0.0000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.44394  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0531  Paraquat-inducible protein A  27.67 
 
 		 245 aa  55.1  0.0000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5277  PqiA family integral membrane protein  26.32 
 
 		 460 aa  55.1  0.0000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.340363  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0644  paraquat-inducible protein A  23.18 
 
 		 207 aa  55.1  0.0000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00578555 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0639  paraquat-inducible protein A  23.18 
 
 		 207 aa  55.1  0.0000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.224706 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1682  integral membrane protein, PqiA family  23.18 
 
 		 422 aa  55.1  0.0000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0518  Paraquat-inducible protein A  27.67 
 
 		 245 aa  55.1  0.0000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4564  paraquat-inducible protein A  23.18 
 
 		 207 aa  54.7  0.0000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1014  paraquat-inducible protein A  23.18 
 
 		 205 aa  54.7  0.0000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.586652  normal  0.11146 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3243  Paraquat-inducible protein A  27.16 
 
 		 212 aa  54.3  0.0000007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2007  hypothetical protein  22.78 
 
 		 444 aa  54.3  0.0000007  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0329  Paraquat-inducible protein A  24.18 
 
 		 210 aa  54.3  0.0000007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0401  paraquat-inducible protein A  26.32 
 
 		 221 aa  53.9  0.0000009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3536  PqiA family integral membrane protein  22.38 
 
 		 449 aa  53.1  0.000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.281669  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1570  paraquat-inducible protein A  22.73 
 
 		 204 aa  53.5  0.000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1793  integral membrane protein, PqiA family  22.64 
 
 		 458 aa  53.5  0.000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1351  paraquat-inducible protein A  23.9 
 
 		 434 aa  53.1  0.000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00603606  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0365  PqiA family integral membrane protein  21.6 
 
 		 415 aa  53.1  0.000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4852  PqiA family integral membrane protein  21.6 
 
 		 415 aa  53.1  0.000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000220019 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1899  Paraquat-inducible protein A  23.38 
 
 		 205 aa  53.1  0.000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00518093  normal  0.194371 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2066  integral membrane protein, PqiA family  22.64 
 
 		 448 aa  53.1  0.000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2488  paraquat-inducible protein A  22.93 
 
 		 213 aa  52.8  0.000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0028453  normal  0.335201 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5801  PqiA family integral membrane protein  25.17 
 
 		 462 aa  52  0.000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0413945  hitchhiker  0.00262359 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>