87 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SO_2602 on replicon NC_004347
Organism: Shewanella oneidensis MR-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004347  SO_2602  putative solute/DNA competence effector  100 
 
 		 213 aa  431  1e-120  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2203  putative solute/DNA competence effector  90.7 
 
 		 213 aa  344  7e-94  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.702868  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1672  putative solute/DNA competence effector  97.65 
 
 		 214 aa  338  4e-92  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000366609  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1747  putative solute/DNA competence effector  97.65 
 
 		 214 aa  338  4e-92  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.144322  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1777  putative solute/DNA competence effector  97.18 
 
 		 214 aa  337  9.999999999999999e-92  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.205752  normal  0.103228 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2561  putative solute/DNA competence effector  84.98 
 
 		 209 aa  324  7e-88  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.33836  normal  0.0763092 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1903  putative solute/DNA competence effector  82.24 
 
 		 209 aa  319  1.9999999999999998e-86  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0351843  normal  0.135941 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2448  putative solute/DNA competence effector  82.24 
 
 		 210 aa  319  1.9999999999999998e-86  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.268471  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2441  putative solute/DNA competence effector  82.24 
 
 		 210 aa  319  1.9999999999999998e-86  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.254744  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1934  putative solute/DNA competence effector  76.85 
 
 		 212 aa  308  5e-83  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.854531  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2229  putative solute/DNA competence effector  76.06 
 
 		 203 aa  305  3e-82  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.180207  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1721  putative solute/DNA competence effector  73.71 
 
 		 228 aa  305  4.0000000000000004e-82  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.00000000000511987  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1584  putative solute/DNA competence effector  70.35 
 
 		 219 aa  300  9e-81  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.107555  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1801  putative solute/DNA competence effector  75 
 
 		 215 aa  287  7e-77  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00925744  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2484  putative solute/DNA competence effector  71.83 
 
 		 217 aa  286  2e-76  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.0000000695377  normal  0.223616 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2132  putative solute/DNA competence effector  73.24 
 
 		 214 aa  286  2e-76  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.00000562228  normal  0.054689 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1543  putative solute/DNA competence effector  50.24 
 
 		 210 aa  214  9e-55  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1105  putative solute/DNA competence effector  52.58 
 
 		 208 aa  205  5e-52  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000947436  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003430  ProQ protein  51.92 
 
 		 208 aa  200  9.999999999999999e-51  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.000000470709  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02347  putative solute/DNA competence effector  51.66 
 
 		 220 aa  199  3e-50  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2118  putative solute/DNA competence effector  44.02 
 
 		 236 aa  192  4e-48  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00110468  hitchhiker  0.0000659128 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1844  putative solute/DNA competence effector  43.8 
 
 		 243 aa  187  1e-46  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.790888  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1671  putative solute/DNA competence effector  43.51 
 
 		 237 aa  184  1.0000000000000001e-45  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000024891  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1782  putative solute/DNA competence effector  43.51 
 
 		 237 aa  184  1.0000000000000001e-45  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0742372  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2664  putative solute/DNA competence effector  43.51 
 
 		 237 aa  184  1.0000000000000001e-45  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000000000764643  normal  0.0215757 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1811  ProQ activator of osmoprotectant transporter ProP  43.1 
 
 		 232 aa  182  2.0000000000000003e-45  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.179036  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1992  putative solute/DNA competence effector  44.44 
 
 		 216 aa  182  5.0000000000000004e-45  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00025199  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02001  putative solute/DNA competence effector  44.05 
 
 		 222 aa  181  6e-45  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.101702  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2140  putative solute/DNA competence effector  42 
 
 		 252 aa  179  2.9999999999999997e-44  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1852  putative solute/DNA competence effector  42 
 
 		 252 aa  179  2.9999999999999997e-44  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.106932  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2060  putative solute/DNA competence effector  40.52 
 
 		 232 aa  176  3e-43  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.000000000000898248  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2401  putative solute/DNA competence effector  41.67 
 
 		 227 aa  175  4e-43  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01802  putative solute/DNA competence effector  38.21 
 
 		 232 aa  175  4e-43  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1922  putative solute/DNA competence effector  38.21 
 
 		 232 aa  175  4e-43  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  1.31825e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1801  putative solute/DNA competence effector  38.21 
 
 		 232 aa  175  4e-43  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.304179  normal  0.0872497 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1356  putative solute/DNA competence effector  38.21 
 
 		 232 aa  175  4e-43  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  decreased coverage  0.0000000120043  normal  0.2491 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01790  hypothetical protein  38.21 
 
 		 232 aa  175  4e-43  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2564  putative solute/DNA competence effector  40.52 
 
 		 232 aa  174  9e-43  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  0.00000000584376  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1469  putative solute/DNA competence effector  42.06 
 
 		 228 aa  173  9.999999999999999e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.00111252  normal  0.239206 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1285  putative solute/DNA competence effector  42.06 
 
 		 228 aa  173  9.999999999999999e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.000000538186  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1989  putative solute/DNA competence effector  42.06 
 
 		 228 aa  173  9.999999999999999e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  decreased coverage  0.00261686  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2047  putative solute/DNA competence effector  42.06 
 
 		 228 aa  173  9.999999999999999e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.24524  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2099  putative solute/DNA competence effector  37.8 
 
 		 232 aa  174  9.999999999999999e-43  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000516503  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2811  putative solute/DNA competence effector  46.64 
 
 		 220 aa  171  7.999999999999999e-42  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  decreased coverage  0.00532714  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2188  putative solute/DNA competence effector  45.79 
 
 		 207 aa  171  1e-41  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.345813  normal  0.724108 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1985  putative solute/DNA competence effector  41.63 
 
 		 228 aa  171  1e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  decreased coverage  0.000228326  hitchhiker  0.0069158 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1070  putative solute/DNA competence effector  47.27 
 
 		 211 aa  167  2e-40  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.265506  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0754  ProP effector  40.82 
 
 		 119 aa  67  0.0000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0862  ProQ activator of osmoprotectant transporter ProP  45.35 
 
 		 295 aa  66.2  0.0000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3447  hypothetical protein  42.39 
 
 		 279 aa  62.4  0.000000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3139  ProQ activator of osmoprotectant transporter ProP  40.79 
 
 		 152 aa  61.6  0.000000008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.144488  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0182  ProQ activator of osmoprotectant transporter ProP  36.04 
 
 		 138 aa  60.5  0.00000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.247211  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0169  ProQ activator of osmoprotectant transporter ProP  40 
 
 		 289 aa  59.7  0.00000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0459261  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0187  ProQ activator of osmoprotectant transporter ProP  40 
 
 		 289 aa  59.7  0.00000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.261785  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1033  hypothetical protein  40.7 
 
 		 239 aa  59.7  0.00000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0842196 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2570  hypothetical protein  38.71 
 
 		 253 aa  55.5  0.0000006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.000198661  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2080  ProQ activator of osmoprotectant transporter ProP  33.96 
 
 		 284 aa  55.1  0.0000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0898874  normal  0.808229 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1492  ProQ activator of osmoprotectant transporter ProP  31.25 
 
 		 222 aa  54.7  0.000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0307  ProQ activator of osmoprotectant transporter ProP  39.77 
 
 		 288 aa  54.3  0.000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.406422  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2177  ProQ activator of osmoprotectant transporter ProP  36.36 
 
 		 251 aa  54.7  0.000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0121  hypothetical protein  33.66 
 
 		 280 aa  53.5  0.000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0127527 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1657  hypothetical protein  36.19 
 
 		 123 aa  53.9  0.000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1663  hypothetical protein  36.19 
 
 		 121 aa  53.9  0.000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3812  activator of osmoprotectant transporter  39.56 
 
 		 228 aa  53.1  0.000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.31951  n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8137  hypothetical protein  42.35 
 
 		 144 aa  51.2  0.00001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0148  hypothetical protein  34.34 
 
 		 230 aa  50.1  0.00002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2615  ProQ activator of osmoprotectant transporter ProP  33.02 
 
 		 178 aa  49.7  0.00003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0133  hypothetical protein  33.33 
 
 		 230 aa  49.7  0.00003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2274  Fertility inhibition FinO-like protein  28.44 
 
 		 260 aa  49.3  0.00004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4697  ProQ family protein  33.33 
 
 		 114 aa  49.3  0.00004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0034  hypothetical protein  41.27 
 
 		 200 aa  49.3  0.00004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  decreased coverage  0.00139041  normal  0.0848547 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0245  hypothetical protein  39.53 
 
 		 319 aa  48.9  0.00006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6155  ProQ activator of osmoprotectant transporter ProP  32.43 
 
 		 398 aa  47  0.0002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.168417  normal  0.179511 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3083  ProQ activator of osmoprotectant transporter ProP  30.36 
 
 		 169 aa  47.4  0.0002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2182  ProQ activator of osmoprotectant transporter ProP  32.67 
 
 		 171 aa  45.8  0.0005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3555  ProQ activator of osmoprotectant transporter ProP  32.67 
 
 		 173 aa  45.8  0.0005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.586954  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1323  ProP effector  30.77 
 
 		 171 aa  45.1  0.0009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.929512  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6008  ProQ activator of osmoprotectant transporter ProP  33.33 
 
 		 284 aa  44.7  0.001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5764  ProQ activator of osmoprotectant transporter ProP  33.04 
 
 		 224 aa  45.1  0.001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.733693  normal  0.933198 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1789  ProQ activator of osmoprotectant transporter ProP  32.67 
 
 		 179 aa  44.3  0.002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1453  ProP effector  33.98 
 
 		 179 aa  43.5  0.002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.853961  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30710  putative activator of osmoprotectant transporter  31.25 
 
 		 177 aa  43.1  0.003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00174135  hitchhiker  0.0000189108 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1540  ProP effector  33.98 
 
 		 183 aa  43.1  0.003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.178573  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5820  ProQ activator of osmoprotectant transporter ProP  33.33 
 
 		 223 aa  42.7  0.004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.231664  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6185  ProQ activator of osmoprotectant transporter ProP  33.33 
 
 		 223 aa  42.7  0.004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.942163  normal  0.876638 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0041  ProQ protein  33.98 
 
 		 200 aa  42.7  0.004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011991  Avi_9559  hypothetical protein  38.1 
 
 		 159 aa  41.6  0.008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.766042  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>