213 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SO_2576 on replicon NC_004347
Organism: Shewanella oneidensis MR-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_004347  SO_2576  septum formation inhibitor  100 
 
 
221 aa  442  1e-123  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2173  septum formation inhibitor  95.02 
 
 
221 aa  424  1e-118  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000000273215  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2250  septum formation inhibitor  95.02 
 
 
221 aa  424  1e-118  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.0000125523  normal  0.706037 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2382  septum formation inhibitor  95.48 
 
 
221 aa  426  1e-118  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.00000000920942  normal  0.215798 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1765  septum formation inhibitor  93.67 
 
 
221 aa  418  1e-116  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000000919  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2424  septum formation inhibitor  90.5 
 
 
221 aa  407  1e-113  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.000000000361193  hitchhiker  0.00999646 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1902  septum formation inhibitor  90.5 
 
 
221 aa  407  1e-113  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000000746493  normal  0.873963 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1868  septum formation inhibitor  90.5 
 
 
221 aa  407  1e-113  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.00000000040137  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1895  septum formation inhibitor  90.5 
 
 
221 aa  407  1e-113  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.0000000000124722  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2184  septum formation inhibitor  74.21 
 
 
221 aa  338  4e-92  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.0000000257088  unclonable  0.00000164505 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2519  septum formation inhibitor  73.76 
 
 
221 aa  337  9.999999999999999e-92  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000141313  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2444  septum formation inhibitor  72.4 
 
 
236 aa  329  2e-89  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000352986  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1629  septum formation inhibitor  70.45 
 
 
221 aa  320  9.000000000000001e-87  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000164279  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2114  septum formation inhibitor  70.59 
 
 
221 aa  320  9.999999999999999e-87  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.0000000440493  normal  0.228236 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1930  septum formation inhibitor  70.98 
 
 
224 aa  312  1.9999999999999998e-84  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.000000656846  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1737  septum formation inhibitor  67.73 
 
 
221 aa  308  5e-83  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1545  septum formation inhibitor  45.33 
 
 
220 aa  182  4.0000000000000006e-45  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000716221  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01386  septum formation inhibitor  43.58 
 
 
220 aa  182  5.0000000000000004e-45  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004086  septum site-determining protein MinC  44.5 
 
 
220 aa  182  5.0000000000000004e-45  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000371161  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2581  septum formation inhibitor  44.09 
 
 
239 aa  171  6.999999999999999e-42  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.150935  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2399  septum formation inhibitor  40.35 
 
 
228 aa  166  2e-40  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000153282  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2121  septum formation inhibitor  40.35 
 
 
228 aa  166  2e-40  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.000192978  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2010  septum formation inhibitor  40.35 
 
 
228 aa  166  2e-40  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000000596174  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2371  septum formation inhibitor  39.57 
 
 
235 aa  165  4e-40  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000657693  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1276  septum formation inhibitor  38.1 
 
 
236 aa  164  9e-40  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000289797  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01151  septum formation inhibitor  38.1 
 
 
231 aa  164  1.0000000000000001e-39  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.129311  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2472  septum site-determining protein MinC  38.1 
 
 
231 aa  164  1.0000000000000001e-39  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000733034  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01161  hypothetical protein  38.1 
 
 
231 aa  164  1.0000000000000001e-39  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0900971  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2449  septum formation inhibitor  38.1 
 
 
231 aa  164  1.0000000000000001e-39  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00348167  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1067  septum formation inhibitor  41.01 
 
 
221 aa  162  3e-39  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  decreased coverage  0.00667924  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1940  septum formation inhibitor  41.01 
 
 
228 aa  161  6e-39  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.0000371298  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1503  septum formation inhibitor  39.57 
 
 
235 aa  160  1e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.00645654  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1319  septum formation inhibitor  39.57 
 
 
235 aa  160  1e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.000000000246885  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2756  septum formation inhibitor  40.48 
 
 
233 aa  160  1e-38  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  unclonable  0.00000000039542  hitchhiker  0.00154059 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1956  septum formation inhibitor  39.57 
 
 
235 aa  160  1e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.000234823  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2013  septum formation inhibitor  39.57 
 
 
235 aa  160  1e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  decreased coverage  0.00337935  normal  0.267553 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1952  septum formation inhibitor  39.57 
 
 
235 aa  160  1e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  decreased coverage  0.00224738  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1997  septum formation inhibitor  37.93 
 
 
232 aa  160  1e-38  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.000933113  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2236  septum formation inhibitor  41.01 
 
 
228 aa  160  1e-38  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  unclonable  0.00000399265  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2006  septum formation inhibitor  41.33 
 
 
225 aa  160  1e-38  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.406679  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1661  septum formation inhibitor  36.64 
 
 
231 aa  154  1e-36  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.0000000772871  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1973  septum formation inhibitor  36.64 
 
 
231 aa  154  1e-36  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  decreased coverage  0.000000684881  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1320  septum formation inhibitor  36.64 
 
 
231 aa  154  1e-36  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000146927  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1329  septum formation inhibitor  36.64 
 
 
236 aa  154  1e-36  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  decreased coverage  0.0000408843  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0444  septum formation inhibitor  37.39 
 
 
231 aa  150  1e-35  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.66341  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0925  septum site-determining protein MinC  37.92 
 
 
243 aa  149  4e-35  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.00858984  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1998  septum site-determining protein MinC  37.5 
 
 
241 aa  146  2.0000000000000003e-34  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.256846  normal  0.258962 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0508  septum formation inhibitor MinC  34.32 
 
 
244 aa  144  1e-33  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA3066  septum site-determining protein MinC  38.43 
 
 
240 aa  143  2e-33  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1164  septum site-determining protein MinC  37.61 
 
 
228 aa  142  3e-33  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000238053  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4713  septum site-determining protein MinC  38.89 
 
 
248 aa  142  3e-33  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0342769  decreased coverage  0.00921136 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1077  septum site-determining protein MinC  38.98 
 
 
233 aa  142  3e-33  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.00582076  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3341  septum site-determining protein MinC  36.28 
 
 
227 aa  142  4e-33  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0065  septum site-determining protein MinC  34.27 
 
 
255 aa  139  3e-32  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0084  septum site-determining protein MinC  34.27 
 
 
255 aa  139  3e-32  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3345  septum site-determining protein MinC  37.04 
 
 
253 aa  139  3.9999999999999997e-32  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.23046  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0032  septum site-determining protein MinC  35.71 
 
 
263 aa  139  3.9999999999999997e-32  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.410574 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1936  septum site-determining protein MinC  37.08 
 
 
242 aa  138  4.999999999999999e-32  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1473  hypothetical protein  35.84 
 
 
236 aa  135  6.0000000000000005e-31  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1591  septum site-determining protein MinC  32.63 
 
 
247 aa  135  6.0000000000000005e-31  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.153495  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1510  hypothetical protein  35.84 
 
 
236 aa  135  7.000000000000001e-31  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1284  septum formation inhibitor  35.07 
 
 
248 aa  134  8e-31  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2354  septum site-determining protein MinC  37.14 
 
 
241 aa  134  8e-31  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0186227  normal  0.309008 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3872  septum site-determining protein MinC  34.86 
 
 
246 aa  134  9.999999999999999e-31  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1613  septum formation inhibitor  34.4 
 
 
246 aa  133  3e-30  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.216529 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1882  septum formation inhibitor  33.99 
 
 
263 aa  131  6.999999999999999e-30  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1695  septum formation inhibitor  34.78 
 
 
245 aa  130  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.337254  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22040  septum formation inhibitor  33.6 
 
 
263 aa  130  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.517212  hitchhiker  0.0000000000000594989 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0009  septum site-determining protein MinC  35.37 
 
 
256 aa  129  5.0000000000000004e-29  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.274749 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3985  septum formation inhibitor  33.94 
 
 
255 aa  128  6e-29  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.441904  normal  0.387462 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1734  septum formation inhibitor  33.8 
 
 
275 aa  127  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.597956 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1326  septum formation inhibitor  33.19 
 
 
253 aa  127  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2335  septum formation inhibitor  34.87 
 
 
249 aa  127  2.0000000000000002e-28  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.782568  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1235  septum formation inhibitor  33.8 
 
 
242 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0560003  normal  0.567033 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5650  septum formation inhibitor  35.5 
 
 
240 aa  126  3e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.177009  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35110  septum formation inhibitor  35.35 
 
 
238 aa  125  4.0000000000000003e-28  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0965  septum formation inhibitor  34.65 
 
 
231 aa  125  4.0000000000000003e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3027  septum site-determining protein MinC  31.17 
 
 
242 aa  124  9e-28  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.218288  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0014  septum site-determining protein MinC  39.41 
 
 
243 aa  124  1e-27  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.062849 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0013  septum site-determining protein MinC  39.59 
 
 
227 aa  123  2e-27  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.838268  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6586  septum formation inhibitor  34.78 
 
 
239 aa  122  5e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00249532 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01604  septum site-determining protein MinC  32.95 
 
 
257 aa  121  7e-27  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00110922  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3376  septum formation inhibitor  33.78 
 
 
247 aa  120  9.999999999999999e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2970  septum formation inhibitor  35.17 
 
 
242 aa  120  1.9999999999999998e-26  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.869143  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0067  septum site-determining protein MinC  34 
 
 
257 aa  118  7e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0319  septum formation inhibitor  31.51 
 
 
268 aa  117  9.999999999999999e-26  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0321  septum formation inhibitor  33.61 
 
 
253 aa  116  1.9999999999999998e-25  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0934288  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0036  septum site-determining protein MinC  35.92 
 
 
261 aa  117  1.9999999999999998e-25  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1838  septum site-determining protein MinC  30.36 
 
 
259 aa  116  3e-25  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00106899 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1632  septum site-determining protein MinC  32.64 
 
 
251 aa  116  3e-25  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2416  septum formation inhibitor  32.02 
 
 
257 aa  115  3.9999999999999997e-25  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0124  septum site-determining protein MinC  32.13 
 
 
257 aa  115  3.9999999999999997e-25  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0943  septum formation inhibitor  32.3 
 
 
261 aa  115  6e-25  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0504  septum formation inhibitor  32.3 
 
 
261 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.694203  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0983  septum formation inhibitor  32.3 
 
 
261 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0501  septum formation inhibitor  31.3 
 
 
237 aa  114  1.0000000000000001e-24  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.0711428 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1424  septum formation inhibitor  32.5 
 
 
242 aa  113  3e-24  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4340  septum formation inhibitor  31.02 
 
 
262 aa  112  3e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.255105 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4087  septum formation inhibitor  31.23 
 
 
257 aa  112  5e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.379648  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0843  septum formation inhibitor  31.2 
 
 
254 aa  111  1.0000000000000001e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.709272  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>