71 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SO_2575 on replicon NC_004347
Organism: Shewanella oneidensis MR-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004347  SO_2575  hypothetical protein  100 
 
 		 92 aa  190  7e-48  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2381  hypothetical protein  95.65 
 
 		 92 aa  183  6e-46  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000000571137  normal  0.19582 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2249  hypothetical protein  95.65 
 
 		 92 aa  182  2.0000000000000003e-45  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.00000322271  normal  0.666936 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2172  hypothetical protein  95.65 
 
 		 92 aa  182  2.0000000000000003e-45  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000119171  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1766  hypothetical protein  80.43 
 
 		 92 aa  164  4e-40  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000510205  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1869  hypothetical protein  82.61 
 
 		 105 aa  163  6.9999999999999995e-40  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000143556  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1903  hypothetical protein  82.61 
 
 		 105 aa  163  6.9999999999999995e-40  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00038231  normal  0.870775 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1896  hypothetical protein  82.61 
 
 		 92 aa  163  8e-40  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.00000000000145586  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2423  protein of unknown function DUF709  82.61 
 
 		 92 aa  163  8e-40  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000000116329  hitchhiker  0.00842429 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1738  hypothetical protein  64.84 
 
 		 92 aa  133  8e-31  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1929  hypothetical protein  64.13 
 
 		 92 aa  129  1.0000000000000001e-29  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000893078  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1630  hypothetical protein  64.44 
 
 		 95 aa  127  4.0000000000000003e-29  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00174664  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2115  hypothetical protein  64.04 
 
 		 93 aa  127  7.000000000000001e-29  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00113125  normal  0.206363 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2443  hypothetical protein  63.33 
 
 		 93 aa  124  3e-28  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000239167  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2518  hypothetical protein  61.8 
 
 		 93 aa  124  4.0000000000000003e-28  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000104865  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2183  hypothetical protein  58.43 
 
 		 93 aa  116  9.999999999999999e-26  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000467377  unclonable  0.00000159603 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3517  hypothetical protein  57.65 
 
 		 97 aa  111  4.0000000000000004e-24  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.103901  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2802  hypothetical protein  53.26 
 
 		 95 aa  106  1e-22  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01139  hypothetical protein  53.33 
 
 		 98 aa  105  3e-22  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.118354  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2755  hypothetical protein  55.95 
 
 		 90 aa  103  6e-22  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  unclonable  0.0000000000827128  hitchhiker  0.0000961265 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2370  hypothetical protein  48.31 
 
 		 127 aa  98.2  3e-20  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0000770648  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1941  hypothetical protein  53.09 
 
 		 85 aa  97.4  6e-20  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.000022159  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2469  protein of unknown function DUF709  48.35 
 
 		 97 aa  97.1  8e-20  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00179552  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1970  hypothetical protein  48.35 
 
 		 97 aa  97.1  8e-20  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000354905  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1665  hypothetical protein  48.35 
 
 		 108 aa  97.1  8e-20  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00000283207  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01154  hypothetical protein  48.35 
 
 		 108 aa  96.3  1e-19  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0106801  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2446  hypothetical protein  48.35 
 
 		 97 aa  96.3  1e-19  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000294082  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01164  hypothetical protein  48.35 
 
 		 108 aa  96.3  1e-19  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00805067  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1323  hypothetical protein  48.35 
 
 		 97 aa  96.3  1e-19  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000000127874  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1279  hypothetical protein  48.35 
 
 		 97 aa  96.3  1e-19  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000635197  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1076  hypothetical protein  52.33 
 
 		 98 aa  96.3  1e-19  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.000579005  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1334  hypothetical protein  48.35 
 
 		 97 aa  96.3  1e-19  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0109557  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1953  hypothetical protein  47.19 
 
 		 144 aa  96.3  1e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.192868  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2012  hypothetical protein  47.19 
 
 		 144 aa  96.3  1e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.203579  normal  0.159587 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1955  protein YcgL  47.19 
 
 		 144 aa  96.3  1e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.00440976  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1504  hypothetical protein  47.19 
 
 		 144 aa  96.3  1e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0307428  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1320  protein YcgL  47.19 
 
 		 136 aa  95.9  2e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000000000604608  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2237  protein of unknown function DUF709  52.44 
 
 		 85 aa  95.1  3e-19  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  unclonable  0.00000163331  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2005  protein of unknown function DUF709  47.73 
 
 		 97 aa  92  2e-18  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.420178  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2009  hypothetical protein  48.81 
 
 		 90 aa  92  2e-18  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000361388  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2398  hypothetical protein  48.81 
 
 		 90 aa  92  2e-18  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00129219  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2120  hypothetical protein  48.81 
 
 		 90 aa  92  2e-18  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0317797  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1998  protein of unknown function DUF709  49.4 
 
 		 90 aa  91.7  3e-18  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.0000810525  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1544  hypothetical protein  46.51 
 
 		 102 aa  89  2e-17  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000390367  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004085  protein YcgL  48.28 
 
 		 93 aa  89.4  2e-17  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000171174  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01387  hypothetical protein  48.28 
 
 		 93 aa  88.6  3e-17  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1068  hypothetical protein  44.83 
 
 		 93 aa  87  8e-17  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.25959  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0805  hypothetical protein  45.45 
 
 		 92 aa  86.3  1e-16  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.594534  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32960  hypothetical protein  40.79 
 
 		 97 aa  71.6  0.000000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.916832  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4096  hypothetical protein  44.59 
 
 		 97 aa  70.9  0.000000000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.469146  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47450  hypothetical protein  44.59 
 
 		 97 aa  70.9  0.000000000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0203  protein of unknown function DUF709  38.96 
 
 		 82 aa  69.7  0.00000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.947238  normal  0.166866 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0238  hypothetical protein  36.17 
 
 		 97 aa  69.7  0.00000000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000167483  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3906  protein of unknown function DUF709  41.67 
 
 		 86 aa  69.7  0.00000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3126  protein of unknown function DUF709  40 
 
 		 81 aa  68.6  0.00000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.679303  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1462  hypothetical protein  40 
 
 		 96 aa  65.1  0.0000000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4590  hypothetical protein  40.54 
 
 		 97 aa  63.9  0.0000000008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1298  hypothetical protein  40.54 
 
 		 97 aa  63.2  0.000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1609  hypothetical protein  35.63 
 
 		 97 aa  63.2  0.000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1339  hypothetical protein  33.73 
 
 		 91 aa  63.2  0.000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4120  hypothetical protein  39.19 
 
 		 97 aa  62  0.000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1774  hypothetical protein  38.16 
 
 		 97 aa  62  0.000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0857455  normal  0.437219 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3899  hypothetical protein  40.54 
 
 		 97 aa  60.8  0.000000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.999369 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2718  HAD family hydrolase  39.44 
 
 		 371 aa  59.7  0.00000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1389  hypothetical protein  34.21 
 
 		 97 aa  57.8  0.00000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3921  hypothetical protein  35.14 
 
 		 97 aa  54.7  0.0000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2277  hypothetical protein  37.5 
 
 		 96 aa  54.3  0.0000006  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02884  hypothetical protein  35.9 
 
 		 122 aa  53.9  0.0000007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1564  hypothetical protein  33.78 
 
 		 97 aa  53.1  0.000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.976199  hitchhiker  0.00432704 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2530  hypothetical protein  31.17 
 
 		 97 aa  52.4  0.000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.923078  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1721  hypothetical protein  24.73 
 
 		 106 aa  40.4  0.008  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000976518  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>