133 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SO_2566 on replicon NC_004347
Organism: Shewanella oneidensis MR-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004347  SO_2566  asmA protein  100 
 
 		 606 aa  1209    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2331  AsmA family protein  75.21 
 
 		 607 aa  912    Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00854787  hitchhiker  0.00634925 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2164  AsmA family protein  88.14 
 
 		 606 aa  1030    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0565997  normal  0.411123 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2241  AsmA family protein  88.3 
 
 		 606 aa  1033    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.104222  normal  0.355768 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2209  AsmA family protein  54.71 
 
 		 606 aa  681    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2372  AsmA protein  88.63 
 
 		 606 aa  1030    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00905663  normal  0.0519979 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1993  AsmA family protein  74.46 
 
 		 607 aa  900    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2116  AsmA family protein  50.97 
 
 		 614 aa  637    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.738267  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1773  AsmA family protein  75.38 
 
 		 608 aa  885    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000090206  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2008  AsmA family protein  74.46 
 
 		 607 aa  892    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0960641  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1985  AsmA family protein  54.5 
 
 		 611 aa  647    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0885974  normal  0.0733894 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2409  AsmA family protein  53.56 
 
 		 612 aa  646    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.278474  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2056  AsmA family protein  74.46 
 
 		 607 aa  899    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.399142  hitchhiker  0.00088344 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2614  AsmA family protein  54.95 
 
 		 606 aa  686    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.745873  normal  0.322867 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1887  AsmA protein  50.41 
 
 		 604 aa  598  1e-169  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.510755  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2024  AsmA  47.56 
 
 		 614 aa  551  1e-156  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000524921  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0557  asmA protein  32.31 
 
 		 703 aa  335  1e-90  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.00432882  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02923  hypothetical protein  31.66 
 
 		 695 aa  324  4e-87  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002984  AsmA protein  31.25 
 
 		 695 aa  322  9.000000000000001e-87  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1019  outer membrane protein assembly protein AsmA  31.21 
 
 		 640 aa  291  2e-77  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2229  putative outer membrane assembly protein  29.47 
 
 		 719 aa  283  9e-75  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.87964  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2694  AsmA family protein  29.61 
 
 		 699 aa  241  2.9999999999999997e-62  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.264  normal  0.390099 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0552  AsmA family protein  27.38 
 
 		 677 aa  204  3e-51  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.259696  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1332  AsmA family protein  25.75 
 
 		 696 aa  187  4e-46  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.176392  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2265  hypothetical protein  32.02 
 
 		 812 aa  185  2.0000000000000003e-45  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2948  AsmA family protein  38.28 
 
 		 712 aa  182  2e-44  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.50394  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2483  AsmA family protein  30.34 
 
 		 742 aa  170  6e-41  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1851  AsmA family protein  25.33 
 
 		 709 aa  167  5e-40  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.997541 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2526  AsmA  32.68 
 
 		 893 aa  160  5e-38  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01970  predicted assembly protein  25.37 
 
 		 617 aa  160  8e-38  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01959  hypothetical protein  25.37 
 
 		 617 aa  160  8e-38  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1953  AsmA family protein  31.14 
 
 		 682 aa  159  1e-37  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.279291  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1168  putative assembly protein  25.37 
 
 		 617 aa  159  1e-37  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2451  putative assembly protein  24.92 
 
 		 618 aa  157  4e-37  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3193  putative assembly protein  24.92 
 
 		 618 aa  157  4e-37  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.182103  normal  0.0103225 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2550  putative assembly protein  24.92 
 
 		 618 aa  157  4e-37  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.208031  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1593  AsmA family protein  25.2 
 
 		 617 aa  157  5.0000000000000005e-37  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.00514431  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2357  putative assembly protein  25.2 
 
 		 617 aa  157  5.0000000000000005e-37  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1577  putative assembly protein  25.2 
 
 		 617 aa  157  5.0000000000000005e-37  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.190719  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1140  AsmA family protein  30.4 
 
 		 732 aa  157  6e-37  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.999799  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0996  putative assembly protein  25.04 
 
 		 617 aa  157  6e-37  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3001  putative assembly protein  25.04 
 
 		 617 aa  157  7e-37  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.352254 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2204  putative assembly protein  24.88 
 
 		 617 aa  152  2e-35  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1852  AsmA family protein  28.05 
 
 		 797 aa  145  2e-33  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2678  putative assembly protein  23.44 
 
 		 615 aa  137  4e-31  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.462778  normal  0.273138 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3040  putative assembly protein  24.28 
 
 		 611 aa  136  9.999999999999999e-31  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1291  putative assembly protein  24.72 
 
 		 611 aa  133  1.0000000000000001e-29  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2863  AsmA family protein  24.48 
 
 		 711 aa  126  9e-28  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2006  hypothetical protein  24.49 
 
 		 660 aa  124  5e-27  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0368531  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1578  putative assembly protein  21.84 
 
 		 611 aa  124  5e-27  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.976931  normal  0.530891 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0716  AsmA family protein  24.34 
 
 		 660 aa  122  1.9999999999999998e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.194292 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3609  AsmA  24.67 
 
 		 640 aa  121  3.9999999999999996e-26  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2461  putative assembly protein  21.9 
 
 		 618 aa  119  9.999999999999999e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.45795 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2354  putative assembly protein  22.01 
 
 		 618 aa  119  9.999999999999999e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.827623  normal  0.53573 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2303  putative assembly protein  21.9 
 
 		 618 aa  119  1.9999999999999998e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2247  putative assembly protein  21.84 
 
 		 618 aa  117  5e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2162  AsmA family protein  22.93 
 
 		 701 aa  116  1.0000000000000001e-24  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.152966  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2347  putative assembly protein  21.68 
 
 		 618 aa  115  2.0000000000000002e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1016  AsmA  22.96 
 
 		 656 aa  113  1.0000000000000001e-23  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.620407  normal  0.697565 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3033  hypothetical protein  23.67 
 
 		 649 aa  108  2e-22  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0689945  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0892  AsmA  23.1 
 
 		 655 aa  109  2e-22  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3103  AsmA family protein  28.37 
 
 		 675 aa  108  2e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.596916  normal  0.117573 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0560  putative AsmA-like protein  23.83 
 
 		 705 aa  108  3e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.748944 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0159  AsmA family protein  25.65 
 
 		 794 aa  107  8e-22  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1134  ASMA  28.29 
 
 		 508 aa  103  8e-21  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.038364  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1004  AsmA family protein  28.29 
 
 		 502 aa  103  8e-21  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000644102  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5162  AsmA family protein  23.02 
 
 		 602 aa  103  1e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.63495  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1199  putative assembly protein  22.3 
 
 		 599 aa  103  1e-20  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0651  AsmA  22.64 
 
 		 646 aa  99  2e-19  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.639423 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4258  AsmA family protein  24.84 
 
 		 741 aa  98.6  3e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000475178 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0590  uncharacterized protein involved in outer membrane biogenesis  25.25 
 
 		 826 aa  97.4  6e-19  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_5009  AsmA family protein  25.07 
 
 		 1013 aa  96.7  1e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0536968 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4921  AsmA family protein  23 
 
 		 747 aa  96.3  1e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00010257 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0521  AsmA  25.64 
 
 		 789 aa  95.9  2e-18  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0110  AsmA family protein  24.08 
 
 		 704 aa  95.1  3e-18  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0321  AsmA  24.18 
 
 		 740 aa  94.4  5e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.188121  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5341  hypothetical protein  22.98 
 
 		 741 aa  93.2  1e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4900  AsmA  22.65 
 
 		 741 aa  92  3e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1004  AsmA  25.89 
 
 		 649 aa  90.5  9e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.478001  normal  0.298922 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2869  putative assembly protein  22.69 
 
 		 604 aa  85.5  0.000000000000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0312  AsmA family protein  21.15 
 
 		 748 aa  84.7  0.000000000000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0287  AsmA family protein  22.29 
 
 		 748 aa  83.6  0.000000000000009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000233767 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1428  hypothetical protein  22.39 
 
 		 711 aa  83.6  0.00000000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0307  AsmA family protein  22.12 
 
 		 748 aa  83.6  0.00000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0304017 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2254  hypothetical protein  23.27 
 
 		 632 aa  82.8  0.00000000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.134961  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04540  hypothetical protein  22.37 
 
 		 748 aa  81.6  0.00000000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67975  hypothetical protein  23.25 
 
 		 750 aa  82  0.00000000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.302933  normal  0.0556453 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0919  hypothetical protein  24.85 
 
 		 611 aa  81.3  0.00000000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0754  AsmA family protein  24.88 
 
 		 745 aa  79.7  0.0000000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1028  hypothetical protein  23.61 
 
 		 725 aa  78.6  0.0000000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.632611  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5883  hypothetical protein  22.61 
 
 		 750 aa  79  0.0000000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3175  AsmA family protein  25.37 
 
 		 741 aa  78.2  0.0000000000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0077  AsmA  27.81 
 
 		 506 aa  75.5  0.000000000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0118  AsmA  27.03 
 
 		 762 aa  74.7  0.000000000004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.413911  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3293  AsmA family protein  22.2 
 
 		 656 aa  73.2  0.00000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.187573  normal  0.760873 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4644  AsmA family protein  21.3 
 
 		 649 aa  73.2  0.00000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0752121  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1327  hypothetical protein  23.08 
 
 		 599 aa  71.2  0.00000000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.158025  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0711  AsmA family protein  31.1 
 
 		 609 aa  67.4  0.0000000008  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6831  putative asmA protein, assembly of outer membrane proteins  22.46 
 
 		 645 aa  65.5  0.000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0946528  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2209  AsmA  23.67 
 
 		 1077 aa  61.2  0.00000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>