59 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SO_2360 on replicon NC_004347
Organism: Shewanella oneidensis MR-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004347  SO_2360  hypothetical protein  100 
 
 		 159 aa  332  2e-90  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2111  hypothetical protein  93.08 
 
 		 159 aa  317  3e-86  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0125675  normal  0.439118 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1965  hypothetical protein  91.82 
 
 		 159 aa  315  2e-85  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0441287  hitchhiker  0.00747997 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2010  hypothetical protein  91.82 
 
 		 159 aa  315  2e-85  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.7151  hitchhiker  0.0000000218476 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1955  hypothetical protein  83.65 
 
 		 159 aa  288  2e-77  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2218  FixH family protein  81.13 
 
 		 159 aa  279  1e-74  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.000000107723  normal  0.262881 
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_4491  hypothetical protein  80.5 
 
 		 159 aa  277  5e-74  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2205  hypothetical protein  80.5 
 
 		 159 aa  277  5e-74  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.0000000648455  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2216  hypothetical protein  79.87 
 
 		 159 aa  275  1e-73  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0316699  normal  0.253608 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2166  hypothetical protein  79.87 
 
 		 159 aa  275  1e-73  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.000514786  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2014  hypothetical protein  67.3 
 
 		 159 aa  237  5e-62  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0149983  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2215  hypothetical protein  64.78 
 
 		 159 aa  225  2e-58  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1989  hypothetical protein  66.67 
 
 		 159 aa  223  1e-57  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.667905  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1795  hypothetical protein  63.52 
 
 		 159 aa  222  1e-57  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.390885  normal  0.104999 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2421  hypothetical protein  61.01 
 
 		 159 aa  216  7.999999999999999e-56  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.000000019522  hitchhiker  0.0000597978 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1847  hypothetical protein  61.44 
 
 		 158 aa  209  9e-54  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.227491  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2218  hypothetical protein  58.49 
 
 		 159 aa  202  1e-51  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0257547  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0935  hypothetical protein  40.94 
 
 		 159 aa  131  3.9999999999999996e-30  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.742864 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1567  hypothetical protein  43.71 
 
 		 161 aa  130  5e-30  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003471  hypothetical protein  44.9 
 
 		 158 aa  127  4.0000000000000003e-29  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0601301  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2069  hypothetical protein  39.38 
 
 		 169 aa  128  4.0000000000000003e-29  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.860685  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02299  hypothetical protein  46.26 
 
 		 158 aa  126  1.0000000000000001e-28  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1049  hypothetical protein  42.31 
 
 		 158 aa  124  6e-28  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.146816  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1991  hypothetical protein  39.46 
 
 		 164 aa  122  2e-27  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0637  FixH family protein  37.16 
 
 		 166 aa  107  9.000000000000001e-23  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1282  FixH family protein  33.96 
 
 		 169 aa  97.1  8e-20  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1789  hypothetical protein  34.39 
 
 		 171 aa  93.2  1e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.200799  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19960  cytochrome c oxidase accessory protein CcoH  31.68 
 
 		 167 aa  93.6  1e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.177196  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0718  hypothetical protein  32.88 
 
 		 173 aa  92  3e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.388417  normal  0.280155 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0638  hypothetical protein  34.93 
 
 		 175 aa  91.7  4e-18  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0105694  normal  0.771152 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2609  hypothetical protein  33.12 
 
 		 172 aa  88.2  4e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00411707  normal  0.558054 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02059  hypothetical protein  38.46 
 
 		 136 aa  87  9e-17  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0309564  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3825  hypothetical protein  30.63 
 
 		 175 aa  79  0.00000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4260  hypothetical protein  31.25 
 
 		 176 aa  77.8  0.00000000000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1608  hypothetical protein  31.25 
 
 		 176 aa  77.8  0.00000000000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.148481  normal  0.0232786 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3578  hypothetical protein  30.19 
 
 		 175 aa  73.2  0.000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3782  hypothetical protein  30.67 
 
 		 179 aa  73.2  0.000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.222956  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1817  hypothetical protein  31.13 
 
 		 179 aa  71.6  0.000000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44430  hypothetical protein  30 
 
 		 179 aa  70.9  0.000000000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0337511  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1997  hypothetical protein  29.93 
 
 		 178 aa  69.7  0.00000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.591704  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3420  hypothetical protein  27.5 
 
 		 178 aa  65.5  0.0000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.300528  normal  0.0548017 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1876  hypothetical protein  29.73 
 
 		 185 aa  64.7  0.0000000005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2417  hypothetical protein  29.57 
 
 		 190 aa  58.9  0.00000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1935  hypothetical protein  30.86 
 
 		 95 aa  52.4  0.000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.235684  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4300  hypothetical protein  39.29 
 
 		 87 aa  49.7  0.00002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.486279  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1005  hypothetical protein  40 
 
 		 92 aa  46.6  0.0001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1089  hypothetical protein  40 
 
 		 92 aa  46.6  0.0001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1749  hypothetical protein  30.68 
 
 		 195 aa  46.6  0.0002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00173592 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2036  hypothetical protein  40 
 
 		 95 aa  45.8  0.0002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2823  hypothetical protein  40.38 
 
 		 98 aa  45.1  0.0004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.010351  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2351  hypothetical protein  20.69 
 
 		 168 aa  44.7  0.0005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000235101  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0773  hypothetical protein  32.1 
 
 		 193 aa  44.3  0.0006  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0360313  normal  0.913908 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1165  hypothetical protein  41.51 
 
 		 92 aa  43.5  0.001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1528  hypothetical protein  36.36 
 
 		 94 aa  43.9  0.001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0779  hypothetical protein  28 
 
 		 193 aa  43.9  0.001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.128656  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1109  putative lipoprotein transmembrane  27.45 
 
 		 75 aa  42.7  0.002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.862439  normal  0.605647 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1527  FixH family protein  24.44 
 
 		 171 aa  42  0.004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1358  hypothetical protein  38.89 
 
 		 67 aa  41.2  0.007  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.0957605 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1202  lipoprotein transmembrane  27.45 
 
 		 75 aa  40.8  0.008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>