189 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SO_2187 on replicon NC_004347
Organism: Shewanella oneidensis MR-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_004347  SO_0819  ISSod11, transposase  100 
 
 
318 aa  667    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1282  ISSod11, transposase  100 
 
 
318 aa  667    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1394  ISSod11, transposase  100 
 
 
318 aa  667    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1436  ISSod11, transposase  100 
 
 
318 aa  667    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1456  ISSod11, transposase  100 
 
 
318 aa  667    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1950  ISSod11, transposase  100 
 
 
318 aa  667    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2187  ISSod11, transposase  100 
 
 
318 aa  667    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2210  ISSod11, transposase  100 
 
 
318 aa  667    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2284  ISSod11, transposase  100 
 
 
306 aa  642    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2819  ISSod11, transposase  100 
 
 
318 aa  667    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3321  ISSod11, transposase  100 
 
 
318 aa  667    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4436  ISSod11, transposase  100 
 
 
306 aa  642    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3136  hypothetical protein  56.21 
 
 
323 aa  380  1e-104  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.491071  normal  0.0566917 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3166  hypothetical protein  56.21 
 
 
345 aa  380  1e-104  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.320291 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1964  hypothetical protein  52.34 
 
 
333 aa  365  1e-100  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2430  hypothetical protein  52.02 
 
 
333 aa  364  1e-99  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.762343 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2804  hypothetical protein  52.02 
 
 
333 aa  364  1e-99  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.323871 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4157  hypothetical protein  52.02 
 
 
333 aa  364  1e-99  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5836  hypothetical protein  55.02 
 
 
329 aa  362  4e-99  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1543  hypothetical protein  46.5 
 
 
359 aa  303  3.0000000000000004e-81  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.165042 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3177  hypothetical protein  46.5 
 
 
366 aa  303  3.0000000000000004e-81  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0357941  normal  0.042708 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3230  hypothetical protein  46.5 
 
 
356 aa  303  3.0000000000000004e-81  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3779  hypothetical protein  46.5 
 
 
334 aa  303  3.0000000000000004e-81  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.603966 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5775  hypothetical protein  46.5 
 
 
334 aa  303  3.0000000000000004e-81  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0230783 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2507  hypothetical protein  46.18 
 
 
333 aa  297  2e-79  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.953553 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5545  hypothetical protein  45.54 
 
 
334 aa  296  5e-79  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.040244 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5066  hypothetical protein  45.54 
 
 
334 aa  296  5e-79  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1956  hypothetical protein  46.54 
 
 
255 aa  202  9e-51  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3333  hypothetical protein  33.94 
 
 
338 aa  182  5.0000000000000004e-45  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.664615  n/a   
 
 
-
 
NC_009469  Acry_3539  hypothetical protein  33.94 
 
 
338 aa  182  5.0000000000000004e-45  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0781  hypothetical protein  33.94 
 
 
338 aa  182  5.0000000000000004e-45  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2206  hypothetical protein  33.94 
 
 
338 aa  182  5.0000000000000004e-45  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.48827  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1505  ISSod11, transposase  44.63 
 
 
193 aa  169  5e-41  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0000861665  hitchhiker  0.00324548 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3308  putative transposase  37.71 
 
 
238 aa  144  2e-33  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2134  hypothetical protein  30.98 
 
 
319 aa  141  9.999999999999999e-33  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0915  hypothetical protein  30.98 
 
 
319 aa  141  9.999999999999999e-33  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2666  hypothetical protein  30.98 
 
 
319 aa  141  9.999999999999999e-33  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0069  hypothetical protein  31.29 
 
 
318 aa  139  7e-32  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2509  hypothetical protein  31.29 
 
 
318 aa  139  7e-32  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000139438  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3178  hypothetical protein  31.29 
 
 
318 aa  139  7e-32  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06059  ISXo5 transposase  30.53 
 
 
338 aa  135  6.0000000000000005e-31  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.000704128  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00868  ISXo5 transposase  30.53 
 
 
338 aa  135  6.0000000000000005e-31  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.16246  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03338  ISXo5 transposase  30.84 
 
 
338 aa  136  6.0000000000000005e-31  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03367  ISXo5 transposase  31.85 
 
 
338 aa  134  9.999999999999999e-31  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000263373  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02578  ISXo5 transposase  31.85 
 
 
338 aa  135  9.999999999999999e-31  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01857  ISXo5 transposase  31.51 
 
 
338 aa  134  9.999999999999999e-31  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01861  ISXo5 transposase  31.85 
 
 
338 aa  135  9.999999999999999e-31  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.485604  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00331  ISXo5 transposase  31.51 
 
 
338 aa  134  1.9999999999999998e-30  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00484  ISXo5 transposase  31.51 
 
 
338 aa  134  1.9999999999999998e-30  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.741552  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03560  ISXo5 transposase  31.85 
 
 
341 aa  134  1.9999999999999998e-30  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.81013  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01725  ISXo5 transposase  31.85 
 
 
338 aa  134  1.9999999999999998e-30  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02971  ISXo5 transposase  31.51 
 
 
338 aa  134  3e-30  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03976  ISXo5 transposase  31.51 
 
 
338 aa  134  3e-30  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.84431  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02455  ISXo5 transposase  31.51 
 
 
338 aa  133  3e-30  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03119  ISXo5 transposase  31.51 
 
 
338 aa  133  3.9999999999999996e-30  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01918  ISXo5 transposase  31.51 
 
 
338 aa  133  3.9999999999999996e-30  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.684506  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04224  ISXo5 transposase  31.51 
 
 
338 aa  132  5e-30  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0733056  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06250  ISXo5 transposase  31.51 
 
 
338 aa  132  5e-30  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.00625171  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04081  ISXo5 transposase  31.51 
 
 
338 aa  133  5e-30  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03315  ISXo5 transposase  31.51 
 
 
338 aa  132  5e-30  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03214  ISXo5 transposase  31.51 
 
 
338 aa  132  5e-30  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04595  ISXo5 transposase  31.51 
 
 
338 aa  133  5e-30  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03664  ISXo5 transposase  31.51 
 
 
338 aa  133  5e-30  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02591  ISXo5 transposase  31.51 
 
 
338 aa  133  5e-30  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.317416  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03012  ISXo5 transposase  31.51 
 
 
338 aa  132  5e-30  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03695  ISXo5 transposase  31.51 
 
 
338 aa  133  5e-30  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00429  ISXo5 transposase  31.51 
 
 
338 aa  133  5e-30  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.901373  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00947  ISXo5 transposase  31.51 
 
 
338 aa  133  5e-30  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.0000842303  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01069  ISXo5 transposase  31.51 
 
 
338 aa  132  5e-30  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.168183  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01807  ISXo5 transposase  31.51 
 
 
338 aa  133  5e-30  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.156782  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03780  ISXo5 transposase  31.51 
 
 
338 aa  133  5e-30  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06219  ISXo5 transposase  31.51 
 
 
338 aa  133  5e-30  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0124141  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_05836  ISXo5 transposase  31.85 
 
 
338 aa  132  6e-30  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.979452  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06092  ISXo5 transposase  31.85 
 
 
338 aa  132  6e-30  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02306  ISXo5 transposase  31.51 
 
 
338 aa  132  6e-30  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00592  ISXo5 transposase  31.51 
 
 
338 aa  132  6.999999999999999e-30  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.820948  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03597  ISXo5 transposase  31.16 
 
 
338 aa  131  1.0000000000000001e-29  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1278  ISSpo3, transposase  34.55 
 
 
292 aa  131  1.0000000000000001e-29  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.38837  normal  0.274857 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1109  hypothetical protein  32.47 
 
 
341 aa  131  1.0000000000000001e-29  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03353  ISXo5 transposase  31.16 
 
 
338 aa  131  2.0000000000000002e-29  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02827  ISXo5 transposase  31.29 
 
 
338 aa  130  2.0000000000000002e-29  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04330  ISXo5 transposase  31.16 
 
 
338 aa  131  2.0000000000000002e-29  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.00000810616  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00040  ISXo5 transposase  31.16 
 
 
338 aa  131  2.0000000000000002e-29  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.765513  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03228  ISXo5 transposase  31.51 
 
 
338 aa  130  3e-29  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02759  ISXo5 transposase  31.16 
 
 
338 aa  130  3e-29  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.890391  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02023  ISXo5 transposase  31.16 
 
 
338 aa  130  3e-29  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.273323  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02486  ISXo5 transposase  31.16 
 
 
338 aa  130  3e-29  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02617  ISXo5 transposase  31.16 
 
 
338 aa  130  4.0000000000000003e-29  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01473  ISXo5 transposase  31.16 
 
 
338 aa  130  4.0000000000000003e-29  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04634  ISXo5 transposase  31.16 
 
 
338 aa  129  4.0000000000000003e-29  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06032  ISXo5 transposase  31.16 
 
 
338 aa  129  5.0000000000000004e-29  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.978605  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02993  ISXo5 transposase  31.16 
 
 
338 aa  129  5.0000000000000004e-29  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.528498  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02593  ISXo5 transposase  31.16 
 
 
338 aa  129  6e-29  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1156  ISSpo8, transposase  32.26 
 
 
312 aa  129  7.000000000000001e-29  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0302963  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04014  ISXo5 transposase  30.82 
 
 
338 aa  127  3e-28  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03974  ISXo5 transposase  30.48 
 
 
338 aa  125  9e-28  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02702  ISXo5 transposase  31.16 
 
 
338 aa  124  1e-27  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.222301  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01870  ISXo5 transposase  30.82 
 
 
338 aa  125  1e-27  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06214  ISXo2 putative transposase  28.52 
 
 
333 aa  124  3e-27  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01966  ISXo2 putative transposase  28.52 
 
 
353 aa  123  3e-27  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.0000253564  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>