54 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SO_2064 on replicon NC_004347
Organism: Shewanella oneidensis MR-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009997  Sbal195_2545  hypothetical protein  56.81 
 
 		 1120 aa  1169    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.960719  normal  0.0399031 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2427  hypothetical protein  56.29 
 
 		 1154 aa  1181    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0924938  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2064  hypothetical protein  100 
 
 		 1086 aa  2189    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2187  hypothetical protein  56.79 
 
 		 1108 aa  1175    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.87239  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1924  hypothetical protein  56.3 
 
 		 1164 aa  1186    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0787497  normal  0.0260112 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2434  hypothetical protein  57.21 
 
 		 1148 aa  1205    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.491363  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1791  hypothetical protein  70.54 
 
 		 1070 aa  1507    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.684722  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2186  hypothetical protein  69.9 
 
 		 1066 aa  1481    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.222967  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1845  hypothetical protein  72.05 
 
 		 1068 aa  1500    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.725746  normal  0.580829 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1636  hypothetical protein  31.61 
 
 		 1058 aa  487  1e-136  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0361894  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1849  hypothetical protein  30.16 
 
 		 1104 aa  417  9.999999999999999e-116  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2698  hypothetical protein  43.79 
 
 		 1205 aa  374  1e-102  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.737361  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1914  hypothetical protein  42.46 
 
 		 1134 aa  340  9.999999999999999e-92  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.167412  normal  0.675287 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2110  hypothetical protein  34.52 
 
 		 1222 aa  312  2e-83  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2166  hypothetical protein  39.65 
 
 		 1307 aa  300  1e-79  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.678719 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1481  hypothetical protein  37.78 
 
 		 1100 aa  292  2e-77  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.342651  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2136  hypothetical protein  30.86 
 
 		 863 aa  109  2e-22  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.233841  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3336  hypothetical protein  32.77 
 
 		 860 aa  101  7e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.658956  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4714  hypothetical protein  30.06 
 
 		 882 aa  88.2  8e-16  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0618  hypothetical protein  33.12 
 
 		 673 aa  87.8  0.000000000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70070  hypothetical protein  31.84 
 
 		 854 aa  86.7  0.000000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35270  hypothetical protein  26.34 
 
 		 863 aa  85.5  0.000000000000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.786077  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6081  hypothetical protein  31.28 
 
 		 847 aa  83.6  0.00000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.82344  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1045  hypothetical protein  28.24 
 
 		 857 aa  71.6  0.00000000008  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0251387  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1472  hypothetical protein  28.57 
 
 		 712 aa  70.1  0.0000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1917  hypothetical protein  25.84 
 
 		 510 aa  66.6  0.000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1084  hypothetical protein  28.48 
 
 		 888 aa  65.9  0.000000004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1553  hypothetical protein  27.95 
 
 		 891 aa  65.5  0.000000006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0122844  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2291  hypothetical protein  26.9 
 
 		 863 aa  62  0.00000006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0813621  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1619  hypothetical protein  27.72 
 
 		 879 aa  60.5  0.0000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01366  hypothetical protein  27.72 
 
 		 879 aa  60.5  0.0000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2264  conserved hypothetical protein  27.72 
 
 		 879 aa  60.5  0.0000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0095574  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1770  hypothetical protein  27.72 
 
 		 879 aa  60.1  0.0000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.930224 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2274  hypothetical protein  27.72 
 
 		 879 aa  60.5  0.0000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01353  hypothetical protein  27.72 
 
 		 879 aa  60.5  0.0000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1566  hypothetical protein  27.72 
 
 		 879 aa  60.1  0.0000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1468  hypothetical protein  27.72 
 
 		 879 aa  60.5  0.0000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2003  hypothetical protein  27.72 
 
 		 879 aa  59.7  0.0000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1372  hypothetical protein  26.44 
 
 		 707 aa  58.9  0.0000006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.709287  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1205  hypothetical protein  23.6 
 
 		 702 aa  58.2  0.0000009  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00968103 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1919  hypothetical protein  26.71 
 
 		 904 aa  58.2  0.0000009  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1766  hypothetical protein  28.65 
 
 		 878 aa  57.4  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.916643  normal  0.0307934 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2591  hypothetical protein  26.32 
 
 		 863 aa  57.8  0.000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1120  hypothetical protein  29.81 
 
 		 688 aa  57.8  0.000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.000538221  normal  0.614169 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1693  hypothetical protein  28.65 
 
 		 878 aa  57.4  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00190171 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1510  hypothetical protein  28.65 
 
 		 878 aa  57.4  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1826  hypothetical protein  28.65 
 
 		 878 aa  57.4  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1763  hypothetical protein  28.65 
 
 		 878 aa  57.4  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0322713 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2599  hypothetical protein  27.65 
 
 		 870 aa  57.8  0.000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1943  hypothetical protein  26.32 
 
 		 879 aa  56.6  0.000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  decreased coverage  0.00013464  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1809  hypothetical protein  26.71 
 
 		 910 aa  57  0.000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.903538  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2213  hypothetical protein  26.71 
 
 		 898 aa  57  0.000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.139058 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1780  hypothetical protein  24.86 
 
 		 867 aa  50.1  0.0002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0209  hypothetical protein  26.05 
 
 		 1131 aa  47.4  0.001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>