More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SO_2012 on replicon NC_004347
Organism: Shewanella oneidensis MR-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004347  SO_2012  adenine phosphoribosyltransferase  100 
 
 		 181 aa  362  2e-99  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2327  adenine phosphoribosyltransferase  97.79 
 
 		 183 aa  354  5e-97  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00000891458  hitchhiker  0.00045964 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2255  adenine phosphoribosyltransferase  97.79 
 
 		 183 aa  353  5.999999999999999e-97  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000000237286  normal  0.265408 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2447  adenine phosphoribosyltransferase  97.79 
 
 		 183 aa  353  5.999999999999999e-97  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.00000000745159  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2303  adenine phosphoribosyltransferase  96.13 
 
 		 184 aa  350  8e-96  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00000264279  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2575  adenine phosphoribosyltransferase  95.03 
 
 		 184 aa  345  2e-94  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000000328192  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2691  adenine phosphoribosyltransferase  95.03 
 
 		 184 aa  345  2e-94  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000000304189  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2616  adenine phosphoribosyltransferase  95.03 
 
 		 184 aa  345  2e-94  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.00000000000754481  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1768  adenine phosphoribosyltransferase  95.03 
 
 		 184 aa  345  2e-94  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.000000000883945  hitchhiker  0.0047086 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1507  adenine phosphoribosyltransferase  82.87 
 
 		 183 aa  308  4e-83  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00667399  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2853  adenine phosphoribosyltransferase  81.77 
 
 		 184 aa  305  3e-82  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.22702  hitchhiker  0.000000299091 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1792  adenine phosphoribosyltransferase  81.77 
 
 		 181 aa  304  5.0000000000000004e-82  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.347967  hitchhiker  0.00000118045 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2408  adenine phosphoribosyltransferase  79.01 
 
 		 182 aa  299  2e-80  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.0000000607797  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1309  adenine phosphoribosyltransferase  79.01 
 
 		 181 aa  298  3e-80  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.107555  normal  0.0516553 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2236  adenine phosphoribosyltransferase  79.56 
 
 		 197 aa  294  5e-79  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.0000000133357  hitchhiker  0.000161546 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2382  adenine phosphoribosyltransferase  79.01 
 
 		 185 aa  292  2e-78  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000868696  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0571  adenine phosphoribosyltransferase  77.78 
 
 		 181 aa  287  5.0000000000000004e-77  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000300234  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002884  adenine phosphoribosyltransferase  76.8 
 
 		 181 aa  284  5.999999999999999e-76  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0439897  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1084  adenine phosphoribosyltransferase  75.69 
 
 		 181 aa  282  2.0000000000000002e-75  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.954514  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03088  adenine phosphoribosyltransferase  76.24 
 
 		 181 aa  281  3.0000000000000004e-75  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1134  adenine phosphoribosyltransferase  76.4 
 
 		 198 aa  277  5e-74  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.397131  unclonable  0.0000000192445 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3060  adenine phosphoribosyltransferase  74.16 
 
 		 187 aa  268  4e-71  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3199  adenine phosphoribosyltransferase  74.16 
 
 		 187 aa  268  4e-71  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.954761  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2888  adenine phosphoribosyltransferase  74.16 
 
 		 187 aa  267  5.9999999999999995e-71  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.716655  normal  0.100922 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1018  adenine phosphoribosyltransferase  72.63 
 
 		 182 aa  265  2e-70  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.14395  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1075  adenine phosphoribosyltransferase  71.84 
 
 		 185 aa  261  6e-69  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  decreased coverage  0.00248791  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3040  adenine phosphoribosyltransferase  70.39 
 
 		 182 aa  260  8e-69  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3236  adenine phosphoribosyltransferase  71.84 
 
 		 185 aa  257  7e-68  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0483226  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00420  adenine phosphoribosyltransferase  70.79 
 
 		 183 aa  251  4.0000000000000004e-66  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00707641  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3141  adenine phosphoribosyltransferase  70.79 
 
 		 183 aa  251  4.0000000000000004e-66  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.000274738  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0506  adenine phosphoribosyltransferase  70.79 
 
 		 183 aa  251  4.0000000000000004e-66  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00345089  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0546  adenine phosphoribosyltransferase  70.79 
 
 		 183 aa  251  4.0000000000000004e-66  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3147  adenine phosphoribosyltransferase  70.79 
 
 		 183 aa  251  4.0000000000000004e-66  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0333667  normal  0.241044 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00425  hypothetical protein  70.79 
 
 		 183 aa  251  4.0000000000000004e-66  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00912156  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0401  adenine phosphoribosyltransferase  70.79 
 
 		 183 aa  251  4.0000000000000004e-66  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0547967  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0512  adenine phosphoribosyltransferase  70.79 
 
 		 183 aa  251  4.0000000000000004e-66  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00096873  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0559  adenine phosphoribosyltransferase  70.22 
 
 		 183 aa  249  1e-65  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.100039  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01096  adenine phosphoribosyltransferase  67.23 
 
 		 178 aa  248  3e-65  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0381093  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3745  adenine phosphoribosyltransferase  66.3 
 
 		 181 aa  248  3e-65  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.370359  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1201  adenine phosphoribosyltransferase  66.67 
 
 		 174 aa  246  9e-65  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0533  adenine phosphoribosyltransferase  68.54 
 
 		 183 aa  244  4e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0543  adenine phosphoribosyltransferase  68.54 
 
 		 183 aa  244  4e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0527  adenine phosphoribosyltransferase  68.54 
 
 		 183 aa  244  4e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0949  adenine phosphoribosyltransferase  68.72 
 
 		 183 aa  244  4e-64  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.431291  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0527  adenine phosphoribosyltransferase  68.54 
 
 		 183 aa  244  4e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.11259  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0587  adenine phosphoribosyltransferase  67.98 
 
 		 183 aa  242  1.9999999999999999e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.852789  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2898  adenine phosphoribosyltransferase  64.57 
 
 		 178 aa  234  7e-61  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2278  adenine phosphoribosyltransferase  61.33 
 
 		 181 aa  230  7.000000000000001e-60  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2246  adenine phosphoribosyltransferase  54.34 
 
 		 175 aa  198  3.9999999999999996e-50  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.111495  normal  0.31564 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6008  adenine phosphoribosyltransferase  51.93 
 
 		 181 aa  195  3e-49  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.937813  hitchhiker  0.00561119 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1836  adenine phosphoribosyltransferase  55.81 
 
 		 178 aa  194  6e-49  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.820901  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7279  adenine phosphoribosyltransferase  50.83 
 
 		 181 aa  192  2e-48  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0158728  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1789  adenine phosphoribosyltransferase  52 
 
 		 177 aa  191  3e-48  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.935669  normal  0.019006 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0485  adenine phosphoribosyltransferase  55.23 
 
 		 178 aa  191  4e-48  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.994648  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2310  adenine phosphoribosyltransferase  52.02 
 
 		 179 aa  190  8e-48  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2325  adenine phosphoribosyltransferase  52.27 
 
 		 179 aa  190  1e-47  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.915682  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2619  adenine phosphoribosyltransferase  52.02 
 
 		 173 aa  190  1e-47  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0611  adenine phosphoribosyltransferase  50.28 
 
 		 181 aa  189  2e-47  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.112864 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4387  adenine phosphoribosyltransferase  50.29 
 
 		 199 aa  189  2e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0100341 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0625  adenine phosphoribosyltransferase  52.91 
 
 		 178 aa  189  2e-47  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0743  adenine phosphoribosyltransferase  51.16 
 
 		 175 aa  189  2e-47  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.0465531 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0600  adenine phosphoribosyltransferase  50.28 
 
 		 181 aa  189  2e-47  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.102638  normal  0.0226618 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1995  adenine phosphoribosyltransferase  51.43 
 
 		 177 aa  189  2e-47  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.14545  normal  0.153368 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0575  adenine phosphoribosyltransferase  50.83 
 
 		 181 aa  189  2e-47  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.641386  hitchhiker  0.00758657 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2163  adenine phosphoribosyltransferase  52.35 
 
 		 181 aa  189  2.9999999999999997e-47  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0935  adenine phosphoribosyltransferase  55.81 
 
 		 175 aa  187  7e-47  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4990  adenine phosphoribosyltransferase  48.62 
 
 		 181 aa  187  8e-47  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3506  adenine phosphoribosyltransferase  48.62 
 
 		 181 aa  187  8e-47  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.660561  normal  0.0396544 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4317  adenine phosphoribosyltransferase  47.51 
 
 		 181 aa  187  8e-47  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.867387 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2775  adenine phosphoribosyltransferase  50.28 
 
 		 181 aa  185  3e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.781756  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4212  adenine phosphoribosyltransferase  47.51 
 
 		 181 aa  185  3e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2613  adenine phosphoribosyltransferase  48.55 
 
 		 179 aa  185  4e-46  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.666832 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3237  adenine phosphoribosyltransferase  48.55 
 
 		 179 aa  183  1.0000000000000001e-45  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.97458  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2270  adenine phosphoribosyltransferase  49.71 
 
 		 180 aa  183  1.0000000000000001e-45  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.739798  normal  0.613668 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3039  adenine phosphoribosyltransferase  50.83 
 
 		 180 aa  182  2.0000000000000003e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.350672  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3212  adenine phosphoribosyltransferase  50.58 
 
 		 179 aa  181  4.0000000000000006e-45  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.699753  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0159  adenine phosphoribosyltransferase  51.45 
 
 		 179 aa  181  6e-45  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.577979  normal  0.21366 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3812  adenine phosphoribosyltransferase  49.71 
 
 		 196 aa  181  7e-45  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.526341 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4379  adenine phosphoribosyltransferase  55.41 
 
 		 172 aa  179  1e-44  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.401827  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04860  adenine phosphoribosyltransferase  57.64 
 
 		 177 aa  179  2.9999999999999997e-44  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.289931  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2146  adenine phosphoribosyltransferase  49.71 
 
 		 186 aa  177  4.999999999999999e-44  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3620  adenine phosphoribosyltransferase  51.74 
 
 		 187 aa  177  8e-44  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2383  adenine phosphoribosyltransferase  54.39 
 
 		 176 aa  177  9e-44  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.106176  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0460  adenine phosphoribosyltransferase  52.57 
 
 		 177 aa  176  1e-43  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.249659  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1466  adenine phosphoribosyltransferase  51.72 
 
 		 173 aa  177  1e-43  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000161835  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1422  adenine phosphoribosyltransferase  52.87 
 
 		 171 aa  176  2e-43  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000550543  normal  0.533063 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0938  adenine phosphoribosyltransferase  49.41 
 
 		 170 aa  174  8e-43  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3610  adenine phosphoribosyltransferase  51.79 
 
 		 170 aa  173  9.999999999999999e-43  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000029573  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1727  adenine phosphoribosyltransferase  53.14 
 
 		 177 aa  173  9.999999999999999e-43  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.190477  normal  0.0498652 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0565  adenine phosphoribosyltransferase  52.57 
 
 		 197 aa  173  9.999999999999999e-43  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.911559  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3492  adenine phosphoribosyltransferase  45.71 
 
 		 184 aa  172  1.9999999999999998e-42  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12200  adenine phosphoribosyltransferase  51.59 
 
 		 170 aa  172  1.9999999999999998e-42  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000836015  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0423  adenine phosphoribosyltransferase  52 
 
 		 177 aa  172  1.9999999999999998e-42  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0145815  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2814  adenine phosphoribosyltransferase  46.24 
 
 		 180 aa  172  1.9999999999999998e-42  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1540  adenine phosphoribosyltransferase  52.02 
 
 		 186 aa  171  3.9999999999999995e-42  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.44123  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1489  adenine phosphoribosyltransferase  52.02 
 
 		 181 aa  171  3.9999999999999995e-42  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.610841  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2194  adenine phosphoribosyltransferase  47.95 
 
 		 172 aa  171  3.9999999999999995e-42  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1905  adenine phosphoribosyltransferase  47.95 
 
 		 172 aa  171  3.9999999999999995e-42  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.637099  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2616  adenine phosphoribosyltransferase  51.57 
 
 		 171 aa  171  5e-42  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00797468  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4134  adenine phosphoribosyltransferase  45.14 
 
 		 184 aa  171  6.999999999999999e-42  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.488945 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>