170 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SO_1987 on replicon NC_004347
Organism: Shewanella oneidensis MR-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_004347  SO_1987  ATP-dependent protease La  100 
 
 
183 aa  379  1e-104  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2274  peptidase S16, lon domain-containing protein  84.7 
 
 
183 aa  332  1e-90  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2346  peptidase S16, lon domain-containing protein  83.06 
 
 
185 aa  327  4e-89  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.824022  normal  0.0665218 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2464  peptidase S16, lon domain-containing protein  82.51 
 
 
185 aa  326  1.0000000000000001e-88  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1750  peptidase S16 lon domain protein  74.32 
 
 
183 aa  296  1e-79  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.588781  hitchhiker  0.0015757 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2596  peptidase S16, lon domain-containing protein  74.32 
 
 
183 aa  295  4e-79  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.139162  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2710  peptidase S16 lon domain-containing protein  74.32 
 
 
183 aa  295  4e-79  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.586726  normal  0.94876 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2635  peptidase S16 lon domain-containing protein  73.77 
 
 
183 aa  294  6e-79  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.963975  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2321  peptidase S16, lon domain-containing protein  72.68 
 
 
183 aa  286  1e-76  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.504487  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2317  peptidase S16, lon domain-containing protein  56.12 
 
 
196 aa  236  9e-62  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2035  ATP-dependent protease La  48.63 
 
 
184 aa  180  1e-44  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00326778  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0994  peptidase S16, lon domain-containing protein  44.26 
 
 
182 aa  168  4e-41  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.336147  normal  0.798331 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1892  hypothetical protein  42.08 
 
 
193 aa  164  5e-40  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002698  hypothetical protein  45.57 
 
 
198 aa  151  5.9999999999999996e-36  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.268731  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03286  hypothetical protein  45.57 
 
 
198 aa  149  2e-35  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1331  peptidase S16, lon-like  36.17 
 
 
188 aa  133  1.9999999999999998e-30  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.178729  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2009  peptidase S16, lon domain-containing protein  33.16 
 
 
191 aa  103  1e-21  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0966504  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0505  ATP-dependent protease La  35.26 
 
 
191 aa  102  2e-21  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.865724 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1376  hypothetical protein  34.97 
 
 
193 aa  102  3e-21  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0602  peptidase S16, lon domain-containing protein  35.48 
 
 
196 aa  102  4e-21  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.607878  hitchhiker  0.0000000000989941 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0518  ATP-dependent protease La  32.95 
 
 
191 aa  100  2e-20  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2427  peptidase S16, lon domain-containing protein  33.16 
 
 
190 aa  99  3e-20  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.350159  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0444  peptidase S16 lon domain protein  31.72 
 
 
200 aa  99  4e-20  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1475  hypothetical protein  34.68 
 
 
229 aa  98.6  5e-20  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0699473  normal  0.900175 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3349  ATP-dependent protease La  32.95 
 
 
192 aa  97.8  8e-20  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.0250547 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3538  ATP-dependent protease La  32.37 
 
 
191 aa  96.7  2e-19  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0417  ATP-dependent protease La  32.37 
 
 
191 aa  96.7  2e-19  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3713  ATP-dependent protease La  32.37 
 
 
191 aa  96.7  2e-19  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.563365  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4182  ATP-dependent protease La  32.37 
 
 
191 aa  95.9  3e-19  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01436  hypothetical protein  31.76 
 
 
171 aa  95.1  5e-19  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0432  ATP-dependent protease La  31.21 
 
 
191 aa  94.7  6e-19  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3882  ATP-dependent protease La  31.21 
 
 
191 aa  94.7  6e-19  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0458  peptidase S16 lon domain protein  31.21 
 
 
191 aa  94.7  7e-19  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0444  ATP-dependent protease La  31.21 
 
 
191 aa  94  1e-18  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3375  hypothetical protein  34.39 
 
 
232 aa  93.2  2e-18  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4074  ATP-dependent protease La  31.21 
 
 
191 aa  90.5  1e-17  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0302  peptidase S16 lon domain protein  31.22 
 
 
196 aa  89.7  2e-17  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0361  peptidase S16 lon domain protein  31.47 
 
 
202 aa  90.1  2e-17  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.18902 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3558  peptidase S16, lon domain-containing protein  32 
 
 
192 aa  89  3e-17  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1650  peptidase S16, lon domain-containing protein  29.65 
 
 
214 aa  88.6  4e-17  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0525  peptidase S16  28.88 
 
 
194 aa  88.2  6e-17  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.198265  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3300  peptidase S16 lon domain protein  31.69 
 
 
192 aa  86.7  2e-16  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0571  ATP-dependent protease La  29.48 
 
 
191 aa  85.9  3e-16  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2781  hypothetical protein  30.25 
 
 
207 aa  85.9  3e-16  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.131469  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0548  ATP-dependent protease La  29.65 
 
 
197 aa  85.1  5e-16  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0066  peptidase S16, lon N-terminal  28.96 
 
 
210 aa  84.7  6e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.394074  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2421  peptidase S16, lon domain-containing protein  29.79 
 
 
193 aa  84.7  7e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02586  ATP-dependent protease La (LON) domain subfamily  30.11 
 
 
194 aa  84.3  9e-16  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3337  hypothetical protein  31.16 
 
 
207 aa  79  0.00000000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0458166  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4979  peptidase S16, lon-like  27.66 
 
 
196 aa  78.6  0.00000000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.043652  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5247  peptidase S16 lon domain-containing protein  28.79 
 
 
224 aa  77.8  0.00000000000008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.469364  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1097  hypothetical protein  33.82 
 
 
197 aa  77.8  0.00000000000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  hitchhiker  0.000805098  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11940  hypothetical protein  26.98 
 
 
197 aa  77  0.0000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000538  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4864  peptidase S16, lon domain-containing protein  30.26 
 
 
209 aa  76.3  0.0000000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.156504 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0349  peptidase S16, lon N-terminal  29.08 
 
 
220 aa  75.9  0.0000000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1411  peptidase S16 lon domain protein  28.98 
 
 
223 aa  75.5  0.0000000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4867  peptidase S16 lon domain-containing protein  35.29 
 
 
196 aa  75.1  0.0000000000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.39375  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0481  ATP-dependent protease La  26.29 
 
 
192 aa  72.4  0.000000000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1828  peptidase S16, lon-like  29.61 
 
 
230 aa  71.2  0.000000000007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4127  hypothetical protein  30.23 
 
 
210 aa  70.5  0.00000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3619  peptidase S16, lon-like  27.93 
 
 
229 aa  70.1  0.00000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0638  peptidase S16, lon N-terminal  31.62 
 
 
196 aa  68.9  0.00000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00383335  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3491  peptidase S16 lon domain-containing protein  28.88 
 
 
209 aa  68.9  0.00000000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000806385 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0591  peptidase S16 lon domain protein  30 
 
 
211 aa  68.9  0.00000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0555706  hitchhiker  0.00255975 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0296  peptidase S16, lon-like protein  32.37 
 
 
217 aa  68.6  0.00000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3807  peptidase S16, lon domain-containing protein  32.35 
 
 
194 aa  68.2  0.00000000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4689  peptidase S16, lon domain-containing protein  35.34 
 
 
196 aa  68.2  0.00000000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0321  peptidase S16 lon domain-containing protein  27.75 
 
 
211 aa  68.6  0.00000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0737  ATP-dependent protease La domain protein  31.62 
 
 
196 aa  68.2  0.00000000007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.825638  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3113  ATP-dependent protease La  29.65 
 
 
210 aa  67.4  0.0000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0760  ATP-dependent protease La  29.65 
 
 
210 aa  67.4  0.0000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0519  peptidase S16 lon domain-containing protein  30.29 
 
 
211 aa  67.4  0.0000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3049  peptidase S16, lon domain-containing protein  26.32 
 
 
234 aa  67.4  0.0000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0081  ATP-dependent protease La  29.65 
 
 
210 aa  67.4  0.0000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1509  ATP-dependent protease La  29.65 
 
 
210 aa  67.4  0.0000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0576  ATP-dependent protease La  29.65 
 
 
210 aa  67.4  0.0000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0592  ATP-dependent protease La  29.65 
 
 
210 aa  67.4  0.0000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2937  ATP-dependent protease La  29.65 
 
 
210 aa  67.4  0.0000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4814  ATP-dependent protease La  34.48 
 
 
197 aa  66.6  0.0000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.344958  normal  0.796434 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0481  ATP-dependent protease La  29.07 
 
 
210 aa  66.2  0.0000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2856  peptidase S16, lon domain-containing protein  29.07 
 
 
211 aa  66.2  0.0000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1211  peptidase S16, lon domain-containing protein  28.65 
 
 
222 aa  66.2  0.0000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.0186807 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2714  peptidase S16 lon domain-containing protein  29.07 
 
 
211 aa  66.2  0.0000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.17765 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0607  peptidase S16 lon domain-containing protein  35.34 
 
 
196 aa  65.9  0.0000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1639  peptidase S16, lon-like protein  31.82 
 
 
111 aa  65.9  0.0000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.194614  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1979  peptidase S16 lon domain protein  30.77 
 
 
185 aa  65.5  0.0000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.537677  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2345  ATP-dependent protease La domain protein  30.77 
 
 
185 aa  65.5  0.0000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6126  peptidase S16, lon-like  29.14 
 
 
211 aa  64.7  0.0000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0230092  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08320  Peptidase S16, lon N-terminal  30.83 
 
 
196 aa  65.1  0.0000000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2807  peptidase S16 lon domain-containing protein  29.14 
 
 
211 aa  64.7  0.0000000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.885555 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2182  peptidase S16, lon-like  29.14 
 
 
211 aa  64.7  0.0000000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0235961  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2796  peptidase S16, lon domain-containing protein  29.14 
 
 
211 aa  64.7  0.0000000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.549382  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2596  peptidase S16 lon domain protein  28 
 
 
215 aa  63.5  0.000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3243  peptidase S16, lon domain-containing protein  28 
 
 
215 aa  63.5  0.000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2024  peptidase S16, lon-like  32.03 
 
 
217 aa  62  0.000000005  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.835929  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3703  peptidase S16 lon domain-containing protein  29.32 
 
 
213 aa  61.6  0.000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.597101  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0257  peptidase S16 lon domain protein  23.16 
 
 
217 aa  61.6  0.000000007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.575451  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0402  hypothetical protein  25.67 
 
 
216 aa  59.7  0.00000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.927343 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1072  ATP-dependent protease La (LON) domain  35.87 
 
 
220 aa  58.9  0.00000003  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.281275  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0284  peptidase S16 lon domain protein  22.87 
 
 
217 aa  59.3  0.00000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>