86 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SO_1880 on replicon NC_004347
Organism: Shewanella oneidensis MR-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009052  Sbal_2551  NlpB/DapX family lipoprotein  86.3 
 
 		 365 aa  662    Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000648805  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1703  NlpB/DapX family lipoprotein  87.4 
 
 		 365 aa  671    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.00000363681  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2589  NlpB/DapX family lipoprotein  86.3 
 
 		 365 aa  661    Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.000000786749  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1880  lipoprotein-34 NlpB  100 
 
 		 365 aa  751    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1657  NlpB/DapX family lipoprotein  90.14 
 
 		 365 aa  686    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00297866  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1793  NlpBDapX family lipoprotein  86.3 
 
 		 365 aa  661    Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.0000000036858  hitchhiker  0.0000000180087 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2411  NlpB/DapX family lipoprotein  90.68 
 
 		 365 aa  689    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.00389139  hitchhiker  0.00606094 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2339  NlpB/DapX family lipoprotein  90.41 
 
 		 365 aa  688    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.014226  hitchhiker  0.00000293311 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2666  NlpB/DapX family lipoprotein  86.85 
 
 		 365 aa  663    Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000276307  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2429  NlpB/DapX family lipoprotein  62.47 
 
 		 373 aa  493  9.999999999999999e-139  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.000000329618  hitchhiker  0.0000381817 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1865  NlpB/DapX family lipoprotein  60.55 
 
 		 365 aa  488  1e-137  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.0000000807402  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2178  NlpB/DapX family lipoprotein  59.52 
 
 		 371 aa  473  1e-132  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00000219579  normal  0.501785 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1849  NlpB/DapX family lipoprotein  58.78 
 
 		 373 aa  470  1.0000000000000001e-131  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00809428  normal  0.047859 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1981  NlpB/DapX family lipoprotein  60.11 
 
 		 365 aa  468  1.0000000000000001e-131  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000195989  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1907  lipoprotein-34 NlpB  58.64 
 
 		 354 aa  454  1e-127  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.00617793  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1736  NlpBDapX lipoprotein  54.92 
 
 		 372 aa  437  1e-121  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000422629  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2477  NlpBDapX lipoprotein  30.9 
 
 		 368 aa  187  2e-46  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.893949  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02135  lipoprotein-34 NlpB  27.89 
 
 		 367 aa  171  2e-41  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00349153  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1861  NlpB/DapX family lipoprotein  25.34 
 
 		 374 aa  116  6e-25  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.127123  normal  0.13379 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1140  lipoprotein  27.9 
 
 		 345 aa  116  6.9999999999999995e-25  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3178  lipoprotein  27.35 
 
 		 345 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0463443  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1073  lipoprotein  26.33 
 
 		 346 aa  110  4.0000000000000004e-23  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2983  lipoprotein  27.22 
 
 		 346 aa  108  2e-22  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2973  lipoprotein  25.83 
 
 		 344 aa  105  1e-21  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.500746 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3508  lipoprotein  25.42 
 
 		 350 aa  105  2e-21  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2854  lipoprotein  24.09 
 
 		 344 aa  99  1e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1192  NlpBDapX family lipoprotein  23.81 
 
 		 344 aa  98.2  2e-19  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2681  lipoprotein  24.09 
 
 		 344 aa  98.6  2e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.284296  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1248  lipoprotein  28.71 
 
 		 352 aa  97.8  2e-19  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2609  lipoprotein  23.81 
 
 		 344 aa  98.2  2e-19  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2759  lipoprotein  23.81 
 
 		 344 aa  98.2  2e-19  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02331  hypothetical protein  23.81 
 
 		 344 aa  98.2  2e-19  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2633  lipoprotein  24.09 
 
 		 344 aa  98.6  2e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2722  lipoprotein  24.09 
 
 		 344 aa  98.6  2e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.12688  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2747  lipoprotein  24.09 
 
 		 344 aa  98.6  2e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3133  lipoprotein  28.71 
 
 		 352 aa  98.2  2e-19  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1199  lipoprotein  23.81 
 
 		 344 aa  98.2  2e-19  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2624  lipoprotein  23.81 
 
 		 344 aa  98.2  2e-19  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02369  lipoprotein  23.81 
 
 		 344 aa  98.2  2e-19  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1363  lipoprotein  28.71 
 
 		 352 aa  97.8  3e-19  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.206221  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3699  lipoprotein  23.53 
 
 		 344 aa  95.9  9e-19  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2849  lipoprotein  23.53 
 
 		 344 aa  95.5  1e-18  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2378  lipoprotein  26.39 
 
 		 350 aa  95.1  2e-18  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1737  lipoprotein  27.68 
 
 		 339 aa  93.6  4e-18  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002794  NlpB lipoprotein component of the protein assembly complex  25.84 
 
 		 339 aa  93.2  6e-18  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3182  putative lipoprotein  23.38 
 
 		 389 aa  91.7  2e-17  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0809995  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03186  lipoprotein  25.91 
 
 		 339 aa  85.1  0.000000000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0847  NlpBDapX lipoprotein  22.22 
 
 		 374 aa  65.9  0.000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00165438 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1539  NlpBDapX lipoprotein  21.84 
 
 		 374 aa  65.1  0.000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.591947  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1099  uncharacterized lipoprotein  21.82 
 
 		 367 aa  63.2  0.000000007  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.822383  normal  0.47194 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3433  NlpBDapX family lipoprotein  20.71 
 
 		 364 aa  62  0.00000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5090  NlpB/DapX family lipoprotein  20.26 
 
 		 385 aa  60.8  0.00000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.010697 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3171  NlpBDapX lipoprotein  20.93 
 
 		 383 aa  58.5  0.0000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0338919  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1069  hypothetical protein  20.47 
 
 		 413 aa  56.6  0.0000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.700306 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1084  NlpBDapX family lipoprotein  19.2 
 
 		 398 aa  55.8  0.000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.170875  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0842  uncharacterized lipoprotein  20.6 
 
 		 412 aa  55.1  0.000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00443208  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0988  NlpBDapX family lipoprotein  18.91 
 
 		 398 aa  54.7  0.000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.359862  normal  0.208847 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3006  putative lipoprotein  21.5 
 
 		 381 aa  54.7  0.000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.169613  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1146  hypothetical protein  19.02 
 
 		 398 aa  54.7  0.000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0438045  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0986  uncharacterized lipoprotein  20.6 
 
 		 412 aa  55.1  0.000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00100518  normal  0.616376 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1586  putative lipoprotein  22.81 
 
 		 379 aa  54.7  0.000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.498001 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2547  putative lipoprotein  22.81 
 
 		 379 aa  52.8  0.00001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00204284  normal  0.0198608 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1180  uncharacterized lipoprotein  21.17 
 
 		 381 aa  50.4  0.00005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.420715  hitchhiker  0.0000123532 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2004  NlpB/DapX family lipoprotein  21.36 
 
 		 380 aa  49.7  0.00007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.547215  decreased coverage  0.00000000202263 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2131  NlpB/DapX family lipoprotein  21.36 
 
 		 380 aa  49.7  0.00007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.598239  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1105  transmembrane protein  19.24 
 
 		 411 aa  49.7  0.00008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1426  putative lipoprotein  20.7 
 
 		 382 aa  48.1  0.0002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.600004  normal  0.242531 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1195  NlpB/DapX family lipoprotein  20.8 
 
 		 386 aa  48.1  0.0002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.621133 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1009  NlpB/DapX family lipoprotein  22.02 
 
 		 380 aa  48.1  0.0002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1677  putative lipoprotein  20.66 
 
 		 380 aa  47.8  0.0003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.466833  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3138  putative lipoprotein  20.66 
 
 		 380 aa  47.8  0.0003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0923  NlpBDapX family lipoprotein  22.02 
 
 		 362 aa  47.8  0.0003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1452  putative lipoprotein  20.66 
 
 		 380 aa  47.8  0.0003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.477634  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2179  putative lipoprotein  20.66 
 
 		 380 aa  47.8  0.0003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0381414  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1907  putative lipoprotein  20.66 
 
 		 418 aa  47.4  0.0004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2697  putative lipoprotein  20.66 
 
 		 418 aa  47  0.0005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2564  putative lipoprotein  20.66 
 
 		 380 aa  47  0.0005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.601002  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2618  putative lipoprotein  20.66 
 
 		 380 aa  47  0.0005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2475  NlpBDapX lipoprotein  22.18 
 
 		 346 aa  46.6  0.0008  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0409  putative lipoprotein  23.22 
 
 		 388 aa  46.2  0.001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.961142  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2621  hypothetical protein  21.88 
 
 		 395 aa  43.9  0.005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.493949  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1770  uncharacterized lipoprotein-like protein  29.27 
 
 		 401 aa  43.9  0.005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.402849  normal  0.123085 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1201  NlpB/DapX family lipoprotein  20.45 
 
 		 365 aa  43.9  0.005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5400  uncharacterized lipoprotein  20.92 
 
 		 381 aa  43.5  0.006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.00915986  normal  0.289961 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2564  putative transmembrane protein  22.22 
 
 		 389 aa  43.1  0.008  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.178184  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1523  putative exported lipoprotein  26.83 
 
 		 410 aa  42.7  0.009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.62403  normal  0.196689 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>